KEGG   ENZYME: 5.4.99.27Help
Entry
EC 5.4.99.27                Enzyme                                 

Name
tRNA pseudouridine13 synthase;
TruD;
YgbO;
tRNA PSI13 synthase;
RNA:PSI-synthase Pus7p;
Pus7p;
RNA:pseudouridine-synthase Pus7p;
Pus7 protein
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Transferring other groups
BRITE hierarchy
Sysname
tRNA-uridine13 uracil mutase
Reaction(IUBMB)
tRNA uridine13 = tRNA pseudouridine13
Substrate
tRNA uridine13
Product
tRNA pseudouridine13
Comment
Pseudouridine synthase TruD from Escherichia coli specifically acts on uridine13 in tRNA [2,3]. The Pus7 protein from Saccharomyces cerevisiae is a multisite-multisubstrate pseudouridine synthase that is able to modify uridine13 in several yeast tRNAs, uridine35 in the pre-tRNATyr, uridine35 in U2 small nuclear RNA, and uridine50 in 5S rRNA [5].
History
EC 5.4.99.27 created 2011
Orthology
K06176  
tRNA pseudouridine13 synthase
Genes
HSA: 
54517(PUS7) 83448(PUS7L)
PTR: 
466961(PUS7L) 472481(PUS7)
PPS: 
100967615(PUS7L) 100984627(PUS7)
GGO: 
101139872(PUS7L) 101151571(PUS7)
PON: 
100173954(PUS7) 100445492(PUS7L)
MCC: 
697463(PUS7) 700448(PUS7L)
MCF: 
102137970(PUS7)
MMU: 
78697(Pus7) 78895(Pus7l)
RNO: 
296751(Pus7) 315264(Pus7l)
CGE: 
100751602(Pus7l) 100763044(Pus7)
HGL: 
TUP: 
102487247(PUS7) 102489649(PUS7L)
CFA: 
100856353(PUS7) 477637(PUS7L)
AML: 
FCA: 
101081058(PUS7L) 101083412(PUS7)
PTG: 
102950179(PUS7) 102961890(PUS7L)
BTA: 
505464(PUS7L) 615644(PUS7)
BOM: 
102279945(PUS7) 102287315(PUS7L)
PHD: 
102316173(PUS7) 102344787(PUS7L)
CHX: 
102169827(PUS7) 102170947(PUS7L)
OAS: 
101115198(PUS7L) 101122688(PUS7)
SSC: 
CFR: 
102515253(PUS7) 102518219(PUS7L)
BACU: 
103012263(PUS7L) 103020682(PUS7)
LVE: 
103073188(PUS7) 103080422(PUS7L)
ECB: 
100054808(PUS7L) 100059013(PUS7)
MYB: 
102245299(PUS7) 102262149(PUS7L)
MYD: 
102758048(PUS7) 102771198(PUS7L)
PALE: 
102881297(PUS7L) 102887726(PUS7)
MDO: 
100018668(PUS7)
SHR: 
100924417(PUS7)
OAA: 
100077414(PUS7) 100085424(PUS7L)
GGA: 
417709(PUS7) 417795(PUS7L)
MGP: 
TGU: 
FAB: 
PHI: 
APLA: 
FPG: 
FCH: 
CLV: 
ASN: 
AMJ: 
PSS: 
102444542(PUS7L)
CMY: 
ACS: 
100557028(pus7l) 100560457(pus7)
PBI: 
103051570(PUS7) 103053995(PUS7L)
XLA: 
431837(pus7l) 734727(pus7)
XTR: 
100127797(pus7l) 549638(pus7)
DRE: 
402995(pus7) 561376(pus7l)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
CMK: 
103176973(pus7) 103190444(pus7l)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
BMY: 
LOA: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0773000-01(Os01g0773000) Os05t0509300-01(Os05g0509300)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_02g040320(SORBIDRAFT_02g040320) SORBI_09g025030(SORBIDRAFT_09g025030)
ZMA: 
100191435(si618009d05) 100280058
SITA: 
ATR: 
s00002p00271620(AMTR_s00002p00271620)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YOR243C(PUS7)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B01610(NCAS0B01610)
NDI: 
NDAI_0E01180(NDAI0E01180)
TPF: 
TPHA_0D01220(TPHA0D01220)
TBL: 
TBLA_0C01830(TBLA0C01830)
TDL: 
TDEL_0A06170(TDEL0A06170)
KAF: 
KAFR_0A03840(KAFR0A03840)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1780174(AO090005001018)
ANG: 
ANI_1_1390014(An01g10270)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
DSQ: 
SHS: 
PCO: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT120164(AGABI1DRAFT_120164)
ABV: 
AGABI2DRAFT203148(AGABI2DRAFT_203148)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
NCE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_05965(pus7)
EHI: 
EHI_199620(45.t00007)
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_I000450(16.m00730)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
ECO: 
b2745(truD)
ECJ: 
Y75_p2683(truD)
ECD: 
EBW: 
BWG_2481(truD)
ECOK: 
ECE: 
Z4053(truD)
ECS: 
ECs3599(truD)
ECF: 
ETW: 
ECSP_3693(truD)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c3312(truD)
ECP: 
ECP_2727(truD)
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECSE_2997(truD)
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_3170(truD)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
O3O_19845(truD)
ESM: 
O3M_05850(truD)
ESL: 
O3K_05805(truD)
ECL: 
EBR: 
ECB_02595(truD)
EBD: 
ECBD_0979(truD)
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m2951(truD)
ELL: 
WFL_14410(truD)
ELC: 
i14_3039(truD)
ELD: 
i02_3039(truD)
ELP: 
EBL: 
ECD_02595(ygbO)
EBE: 
B21_02560(truD)
ELF: 
LF82_2321(truD)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_0323(truD)
STY: 
STT: 
t2829(truD)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2928(truD)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA2784(ygbO)
SEK: 
SSPA2596(truD)
SPQ: 
SEI: 
SPC_2971(truD)
SEC: 
SC2860(truD)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A3238(truD)
SEG: 
SG2831(truD)
SEL: 
SPUL_2927(truD)
SEGA: 
SET: 
SEN2767(truD)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_29720(SBOV29561)
SENE: 
IA1_14030(truD)
SES: 
SBG: 
SBZ: 
YPE: 
YPO3359(truD)
YPK: 
y0830(truD)
YPA: 
YPA_2784(truD)
YPN: 
YPN_0734(truD)
YPM: 
YP_0328(truD)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPT: 
YPD: 
YPX: 
YPH: 
YPC_3678(truD)
YPS: 
YPTB0772(truD)
YPI: 
YPY: 
YPK_3429(truD)
YPB: 
YPTS_0806(truD)
YEN: 
YE0771(truD)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YSI: 
SFL: 
SF2768(truD)
SFX: 
S2961(truD)
SFV: 
SFV_2753(truD)
SFE: 
SFxv_3036(truD)
SSN: 
SSON_2893(truD)
SSJ: 
SBO: 
SBO_2775(truD)
SBC: 
SDY: 
SDY_2944(truD)
SDZ: 
ECA: 
ECA3533(truD)
PATR: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
ETA_26990(truD)
EPY: 
EpC_28200(truD)
EPR: 
EAM: 
EAMY_0761(ygbO)
EAY: 
EAM_2683(truD)
EBI: 
EbC_35260(truD)
ERJ: 
PLU: 
plu0715(truD)
PAY: 
PAU_00688(truD)
SOD: 
Sant_3246(truD)
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAE_01865(truD)
EAR: 
ENR: 
ESA: 
ESA_00546(truD)
CSK: 
ES15_0803(truD)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_33190(truD)
KPN: 
KPN_03107(truD)
KPU: 
KP1_4377(truD)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_1016(truD)
KPO: 
KPR: 
KPR_4104(truD)
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOX_01050(truD)
KOE: 
KOY: 
CKO: 
CKO_04106(truD)
CRO: 
ROD_30641(truD)
CFD: 
SPE: 
Spro_0828(truD)
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
PMR: 
PMI2240(truD)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_2877(truD)
ETD: 
ETC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XBJ1_3601(truD)
XNE: 
XNC1_3850(truD)
PAM: 
PANA_3046(truD)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_2321(truD)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_2442(ygbO)
PAO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
Q7S_03145(truD)
PSI: 
S70_05620(truD)
EBT: 
MMK: 
ROR: 
EBF: 
PSTS: 
HIN: 
HI0701(truD)
HIT: 
NTHI0824(truD)
HIP: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HPAZ: 
HPR: 
HSO: 
HS_1499(truD)
HSM: 
HSM_0502(truD)
PMU: 
PM1610(truD)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
Pmu_18780(truD)
MSU: 
MS2273(truD)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APL_1926(truD)
APJ: 
APJL_1973(truD)
APA: 
ASU: 
Asuc_2053(truD)
ASI: 
AAP: 
AAT: 
D11S_0372(truD)
AAO: 
AAN: 
AAH: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XCC: 
XCC1704(truD)
XCB: 
XC_2527(truD)
XCA: 
XCP: 
XCR_1940(truD)
XCV: 
XCV1756(truD)
XAC: 
XAC1723(truD)
XCI: 
XAX: 
XACM_1744(truD)
XAO: 
XOO: 
XOO2959(truD)
XOM: 
XOO_2810(truD)
XOP: 
PXO_00167(truD)
XOR: 
XOC_2790(truD)
XAL: 
XALc_1155(truD)
XFU: 
SML: 
Smlt1719(truD)
SMT: 
Smal_1456(truD)
BUJ: 
SMZ: 
SMD_1659(truD)
PSU: 
PSD: 
DSC_10670(truD)
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VC0530(truD)
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
O3Y_02505(truD)
VCL: 
VVU: 
VVY: 
VV2813(truD)
VVM: 
VPA: 
VP2557(truD)
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VS_2603(truD)
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VFI: 
VF_2071(truD)
VFM: 
VSA: 
PPR: 
PBPRA3075(truD)
PAE: 
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PPU: 
PP_1619(truD)
PPF: 
Pput_4158(truD)
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_4970(truD)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_41490(truD)
PPUU: 
PST: 
PSB: 
Psyr_1370(truD)
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_1203(truD)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFLU1298(truD)
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN4193(truD)
PMY: 
Pmen_3025(truD)
PMK: 
PSA: 
PST_1567(truD)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PKB_1246(truD)
PCH: 
CJA: 
CJA_2221(truD)
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PAR: 
PCR: 
PRW: 
PSO: 
MCT: 
MCR_1251(truD)
MCS: 
SON: 
SO_3436(truD)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
SVI_3171(truD)
ILO: 
ILI: 
CPS: 
PHA: 
PSHAa0686(truD)
PAT: 
PSM: 
PSM_A2375(truD)
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MARHY2363(truD)
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
GNIT_2918(truD)
GPS: 
PIN: 
PSY: 
TTU: 
FBL: 
LPN: 
LPH: 
LPO: 
LPU: 
LPM: 
LPF: 
LPP: 
LPC: 
LPA: 
LPE: 
LLO: 
MCA: 
MCA2519(truD)
MMT: 
MAH: 
TCX: 
TCY: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
CZA: 
NOC: 
Noc_0856(truD)
NHL: 
NWA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
AEH: 
Mlg_1835(truD)
HHA: 
Hhal_1433(truD)
HHC: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_2963(truD_[H])
SSAL: 
SPIU: 
HNA: 
HCH: 
CSA: 
HEL: 
HELO_3615(truD)
HCS: 
ABO: 
ADI: 
KKO: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHA_0825(truD)
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
ASA: 
ASA_3471(truD)
AVR: 
AMED: 
TAU: 
OCE: 
DNO: 
AFE: 
AFR: 
AFE_0372(truD)
ACU: 
AFI: 
GAP: 
SAGA: 
GPB: 
HPY: 
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 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:15135053]
  Authors
Ericsson UB, Nordlund P, Hallberg BM
  Title
X-ray structure of tRNA pseudouridine synthase TruD reveals an inserted domain with a novel fold.
  Journal
FEBS. Lett. 565 (2004) 59-64.
  Sequence
[eco:b2745]
Reference
2  [PMID:19664587]
  Authors
Chan CM, Huang RH
  Title
Enzymatic characterization and mutational studies of TruD--the fifth family of pseudouridine synthases.
  Journal
Arch. Biochem. Biophys. 489 (2009) 15-9.
  Sequence
[eco:b2745]
Reference
3  [PMID:12756329]
  Authors
Kaya Y, Ofengand J
  Title
A novel unanticipated type of pseudouridine synthase with homologs in bacteria, archaea, and eukarya.
  Journal
RNA. 9 (2003) 711-21.
  Sequence
[eco:b2745]
Reference
4  [PMID:14561887]
  Authors
Behm-Ansmant I, Urban A, Ma X, Yu YT, Motorin Y, Branlant C
  Title
The Saccharomyces cerevisiae U2 snRNA:pseudouridine-synthase Pus7p is a novel multisite-multisubstrate RNA:Psi-synthase also acting on tRNAs.
  Journal
RNA. 9 (2003) 1371-82.
  Sequence
[sce:YOR243C]
Reference
5  [PMID:19114708]
  Authors
Urban A, Behm-Ansmant I, Branlant C, Motorin Y
  Title
RNA sequence and two-dimensional structure features required for efficient substrate modification by the Saccharomyces cerevisiae RNA:{Psi}-synthase Pus7p.
  Journal
J. Biol. Chem. 284 (2009) 5845-58.
  Sequence
[sce:YOR243C]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
430429-15-5

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