KEGG   ENZYME: 5.4.99.28Help
Entry
EC 5.4.99.28                Enzyme                                 

Name
tRNA pseudouridine32 synthase;
RluA (ambiguous);
pseudouridine synthase RluA (ambiguous);
Pus9p;
Rib2/Pus8p
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Transferring other groups
BRITE hierarchy
Sysname
tRNA-uridine32 uracil mutase
Reaction(IUBMB)
tRNA uridine32 = tRNA pseudouridine32
Substrate
tRNA uridine32
Product
tRNA pseudouridine32
Comment
The dual-specificity enzyme from Escherichia coli also catalyses the formation of pseudouridine746 in 23S rRNA [5]. cf. EC 5.4.99.29 (23S rRNA pseudouridine746 synthase).
History
EC 5.4.99.28 created 2011, modified 2011
Orthology
K06177  
tRNA pseudouridine32 synthase / 23S rRNA pseudouridine746 synthase
Genes
ECO: 
b0058(rluA)
ECJ: 
Y75_p0058(rluA)
ECD: 
EBW: 
BWG_0054(rluA)
ECOK: 
ECE: 
Z0066(yabO)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_0062(rluA)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c0069(yabO)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_0059(rluA)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_00060(rluA)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m0056(rluA)
ELL: 
WFL_00280(rluA)
ELC: 
i14_0060(yabO)
ELD: 
i02_0060(yabO)
ELP: 
EBL: 
ECD_00060(rluA)
EBE: 
B21_00059(rluA)
ELF: 
LF82_1897(rluA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_0067(rluA)
STY: 
STY0110(rluA)
STT: 
t0098(rluA)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM0095(rluA)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA0096(rluA)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_0103(rluA)
SEC: 
SC0090(rluA)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG0097(rluA)
SEL: 
SPUL_0101(rluA)
SEGA: 
SET: 
SEN0097(rluA)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_990(SBOV00431)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBG_0083(rluA)
SBZ: 
SBV: 
YPE: 
YPO0497(rluA)
YPK: 
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_3682(rluA3)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_0482(rluA)
YPT: 
YPD: 
YPD4_0434(rluA)
YPX: 
YPD8_0435(rluA)
YPH: 
YPC_4009(rluA)
YPS: 
YPTB0638(rluA)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
YEN: 
YE0635(rluA) YE2636(rluA)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YSI: 
SFL: 
SF0053(yabO)
SFX: 
S0055(yabO)
SFV: 
SFV_0050(yabO)
SFE: 
SFxv_0055(rluA)
SFN: 
SFS: 
SSN: 
SSON_0064(yabO)
SSJ: 
SBO: 
SBO_0045(yabO)
SBC: 
SDY: 
SDY_0082(yabO)
SDZ: 
ECA: 
ECA3854(rluA)
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
EPY: 
EpC_07160(rluA) EpC_10740(rluA)
EPR: 
EAM: 
EAMY_2556(rluA) EAMY_2921(yabO)
EAY: 
EBI: 
ERJ: 
PLU: 
plu0614(rluA)
PAY: 
PAU_00572(rluA)
SGL: 
SOD: 
Sant_3380(rluA)
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLA: 
ECLC: 
ECLG: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_06890(rluA)
KPN: 
KPU: 
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
PMK1_02365(rluA_1) PMK1_04633(rluA_2)
KPB: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOM: 
CKO: 
CRO: 
ROD_00631(rluA)
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SOD_c05950(rluA1) SOD_c39000(rluA)
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
SERF: 
SERS: 
PMR: 
PMI2329(rluA) PMI2985(rluA)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_0605(rluA)
ETD: 
ETE: 
ETC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XBJ1_1797(rluA)
XNE: 
XNC1_4060(rluA)
PAM: 
PANA_0688(rluA) PANA_1819(rluA)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_0034(rluA) PAJ_1155(rluA)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_0096(yabO) Pvag_1912(rluA)
PAO: 
KLN: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
PSX: 
EBT: 
MMK: 
ROR: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
HAV: 
EBF: 
PSTS: 
HIN: 
HIT: 
NTHI0050(rluA2) NTHI0874(rluA)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HIA: 
HDU: 
HD1762(rluA)
HAP: 
HAPS_2249(rluA)
HPAZ: 
HPAS: 
HPAK: 
HPR: 
HSO: 
HS_1515(rluA)
HSM: 
PMU: 
PM0633 PM1836(rsuA_2)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
PMUL: 
MSU: 
MS0231(rluA) MS1170(rluA)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APL_0229(rluA) APL_0315(rluA)
APJ: 
APJL_0234(rluA) APJL_0330(rluA)
APA: 
ASU: 
ASI: 
ASS: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XCI: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XFU: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_0820(rluA) SMD_1817(rluA2)
PSU: 
PSD: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VCQ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VCY: 
VTU: 
VFI: 
VFM: 
VSA: 
PPR: 
PAE: 
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUD: 
PMOS: 
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PPZ: 
PEN: 
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PCH: 
PCP: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
CJA: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PAR: 
Psyc_1988(rluA)
PCR: 
PRW: 
PSO: 
ACI: 
ACD: 
ACB: 
ABM: 
ABY: 
ABC: 
ABN: 
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ABK: 
ABAU: 
ABAA: 
ABW: 
ACC: 
MCT: 
MCS: 
MCAT: 
SON: 
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
SVI_1570(rluA-1) SVI_2132(rluA-2) SVI_3039 SVI_3127(rluA-3) SVI_3591(rluA-4) SVI_3757 SVI_4237
ILO: 
ILI: 
CPS: 
PHA: 
PAT: 
PSM: 
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
GPS: 
PIN: 
PSY: 
TTU: 
FBL: 
MCA: 
MCA1592(rluA)
TCX: 
TCY: 
MEJ: 
MEC: 
HNA: 
HCH: 
ABO: 
ABO_1194(rluA)
ADI: 
B5T_02251(rluA)
KKO: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
ASA: 
AVR: 
AMED: 
TAU: 
OCE: 
DNO: 
DNO_0294(rluA)
GAP: 
SAGA: 
GPB: 
NMA: 
NME: 
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMN: 
NMT: 
NMI: 
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMZ: 
NMX: 
NGO: 
NGK: 
NGT: 
NLA: 
CVI: 
LHK: 
PSE: 
NH8B_1024(rluA)
PNU: 
TEQ: 
TEA: 
TEG: 
TAS: 
TAT: 
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
BPSI: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
Rta_12040(rluA)
MPT: 
HAR: 
MMS: 
JAG: 
HSE: 
CFU: 
LCH: 
RGE: 
RGE_14260(rluA)
AZO: 
azo0013(rluA1) azo1862(rluA2)
AZA: 
AZKH_0044(rluA) AZKH_2561(rluA)
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
TBD: 
APP: 
SLT: 
GCA: 
BPRC: 
SKU: 
SULR: 
GUR: 
GBM: 
GEM: 
GEB: 
PPD: 
DDN: 
DSA: 
DAS: 
DHY: 
DPI: 
BN4_11557(rluA)
DBA: 
DRT: 
BBA: 
Bd1424(rluA) Bd2820(rluA)
BBAT: 
Bdt_1407(rluA)
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
BMX: 
DPS: 
DPR: 
DSF: 
DAT: 
HRM2_26520(rluD2)
ADE: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
COCOR_03500(rluA1) COCOR_04291(rluD4) COCOR_05795(rluA)
SUR: 
PACA: 
PLA: 
ATU: 
Atu4041(rluA)
AGR: 
RIR: 
OAN: 
OAH: 
BJA: 
BJU: 
BRA: 
BBT: 
BRS: 
AOL: 
RPA: 
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
NWI: 
NHA: 
OCA: 
OCG: 
OCO: 
XAU: 
AZC: 
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MNO: 
MOR: 
BID: 
MSL: 
PHL: 
MSC: 
CCR: 
AEX: 
SIL: 
SPO3392(rluA)
SIT: 
RSP: 
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
RCP: 
JAN: 
RDE: 
RD1_0016(rluA)
RLI: 
PDE: 
PAMI: 
DSH: 
Dshi_3106(rluA)
KVU: 
KVL: 
KVU_2325(rluA)
PSF: 
PSE_1330(rluA)
PGA: 
PGL: 
PGD: 
OAT: 
OAR: 
LMD: 
RED: 
PTP: 
MMR: 
HNE: 
HBA: 
ZMO: 
ZMN: 
ZMM: 
ZMB: 
ZMI: 
ZMC: 
ZMR: 
ZMP: 
NAR: 
NPP: 
NPN: 
SAL: 
SWI: 
SPHM: 
STAX: 
SJP: 
SCH: 
SSY: 
ELI: 
GOX: 
GOH: 
GBE: 
GBH: 
GBC: 
GBS: 
ACR: 
AMV: 
GDI: 
GDJ: 
GXY: 
GLX_18970(rluA)
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
RCE: 
MAG: 
MGY: 
ALI: 
ABS: 
ABQ: 
TMO: 
PBR: 
MGM: 
MAI: 
MICA_1358(yabO)
MAN: 
PGV: 
OIH: 
BBE: 
SGO: 
LCA: 
LCZ: 
TTE: 
TTE1780(RluA2)
MTU: 
MTV: 
MTC: 
MRA: 
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTZ: 
MTI: 
MTE: 
MTUR: 
MTL: 
MTO: 
MTD: 
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
MTUC: 
MTUE: 
MTX: 
MTUH: 
MTUL: 
MTUT: 
MTUU: 
MTQ: 
MBO: 
MBB: 
MBT: 
MBM: 
MBK: 
MBZ: 
MAF: 
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MPA: 
MAO: 
MAV: 
MAVR: 
MAVD: 
MIT: 
MIR: 
MIA: 
MIE: 
MID: 
MYO: 
MSM: 
MSG: 
MSB: 
MSA: 
MSN: 
MSH: 
MUL: 
MVA: 
MGI: 
MSP: 
MAB: 
MABB: 
MMV: 
MAK: 
MAY: 
MAZ: 
MMC: 
MKM: 
MJL: 
MJD: 
MMI: 
MRH: 
MMM: 
MCB: 
MLI: 
MKN: 
MNE: 
ASD: 
CGL: 
NCgl2844(Cgl2945)
CGB: 
cg3258(rluC2)
CGU: 
WA5_2844(RluC2)
CGT: 
CGS: 
CGG: 
CGM: 
cgp_3258(rluC2)
CGJ: 
CGQ: 
CEF: 
CDI: 
CDP: 
CDH: 
CDT: 
CDE: 
CDR: 
CDA: 
CDZ: 
CDB: 
CDS: 
CDD: 
CDW: 
CDV: 
CJK: 
CUR: 
CUA: 
CAR: 
CKP: 
CPU: 
CPL: 
CPG: 
CPP: 
CPK: 
CPQ: 
CPX: 
CPZ: 
COR: 
COP: 
Cp31_2013(rluC)
COD: 
COS: 
COI: 
COE: 
COU: 
CRD: 
CUL: 
CUC: 
CUE: 
CUN: 
CUS: 
CUQ: 
CUZ: 
CVA: 
CHN: 
CCN: 
CTER: 
CMD: 
CAZ: 
CFN: 
CCG: 
CVT: 
CGY: 
CII: 
CUV: 
COA: 
CDO: 
NFA: 
NCY: 
NBR: 
NNO: 
RHA: 
RER: 
REY: 
ROP: 
ROA: 
REQ: 
RPY: 
GBR: 
GPO: 
GOR: 
TPR: 
SCO: 
SCO1625(SCI41.08)
SMA: 
SGR: 
SCB: 
SSX: 
SFA: 
SHY: 
SHO: 
SVE: 
SDV: 
SALB: 
STRP: 
SFI: 
SCI: 
SLV: 
SGU: 
KSK: 
ART: 
AAU: 
ACH: 
AAI: 
APN: 
ARR: 
RSA: 
KRH: 
MLU: 
RMU: 
RDN: 
BFA: 
JDE: 
KSE: 
XCE: 
IVA: 
SKE: 
CFL: 
ICA: 
PAC: 
PAK: 
PAV: 
PAX: 
PAZ: 
PAW: 
PAD: 
PCN: 
PACC: 
PACH: 
PPC: 
PBO: 
PRA: 
FAL: 
NML: 
SEN: 
AMD: 
AMN: 
AMM: 
AMZ: 
AOI: 
AJA: 
AMQ: 
PDX: 
AMI: 
SESP: 
KAL: 
SNA: 
AHE: 
TPY: 
BLO: 
BLJ: 
BLD_0932(rluA2)
BLN: 
BLON: 
BLF: 
BLL: 
BLB: 
BBMN68_936(rluA2)
BLM: 
BLK: 
BLG: 
BLZ: 
BLX: 
BAD: 
BADL: 
BLA: 
BLC: 
BLT: 
BBB: 
BBC: 
BNM: 
BLV: 
BLW: 
BLS: 
BANI: 
BANL: 
BNI: 
BDE: 
BBI: 
BBP: 
BBF: 
BBV: 
BBRU: 
BBRE: 
BBRV: 
BBRJ: 
BBRC: 
BBRN: 
BBRS: 
BAST: 
BTP: 
BCOR: 
PCU: 
pc0131(rluA)
TSU: 
TBE: 
SBU: 
SGP: 
GAU: 
GAU_3690(rluA)
RBA: 
RB2141(rluA)
SYW: 
SYNW0737(rluA)
SYC: 
syc0182_d(rluA)
SYF: 
SYD: 
SYE: 
SYG: 
SYX: 
SYP: 
SYNR: 
SYND: 
MAR: 
CYP: 
CYC: 
CYH: 
CYJ: 
CAN: 
CSN: 
CMP: 
LEP: 
ONI: 
CEP: 
MIC: 
ANA: 
NPU: 
NOS: 
NOP: 
AVA: 
ANB: 
ACY: 
CSG: 
CALO: 
CALT: 
RIV: 
PMT: 
PMT1112(rluA)
PMF: 
CTHE: 
BTH: 
BFR: 
BFS: 
BFG: 
BVU: 
BHL: 
BSA: 
BXY: 
BDO: 
BDH: 
PDI: 
PRU: 
PRU_2661(rluA)
PMZ: 
PDN: 
PIT: 
PDT: 
PRO: 
SRU: 
SRU_1743(rluA)
RMG: 
CPI: 
NKO: 
PSN: 
SHT: 
SCN: 
BBD: 
CHU: 
CHU_0734(rluD)
LBY: 
FLI: 
MTT: 
FCO: 
FIN: 
WVI: 
NDO: 
POM: 
FTE: 
OHO: 
MRO: 
ATM: 
CNI: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:17188032]
  Authors
Hoang C, Chen J, Vizthum CA, Kandel JM, Hamilton CS, Mueller EG, Ferre-D'Amare AR
  Title
Crystal structure of pseudouridine synthase RluA: indirect sequence readout through protein-induced RNA structure.
  Journal
Mol. Cell. 24 (2006) 535-45.
Reference
2  [PMID:10924141]
  Authors
Spedaliere CJ, Hamilton CS, Mueller EG
  Title
Functional importance of motif I of pseudouridine synthases: mutagenesis of aligned lysine and proline residues.
  Journal
Biochemistry. 39 (2000) 9459-65.
  Sequence
[eco:b0058]
Reference
3  [PMID:10383384]
  Authors
Raychaudhuri S, Niu L, Conrad J, Lane BG, Ofengand J
  Title
Functional effect of deletion and mutation of the Escherichia coli ribosomal RNA  and tRNA pseudouridine synthase RluA.
  Journal
J. Biol. Chem. 274 (1999) 18880-6.
  Sequence
[eco:b0058]
Reference
4  [PMID:10529181]
  Authors
Ramamurthy V, Swann SL, Spedaliere CJ, Mueller EG
  Title
Role of cysteine residues in pseudouridine synthases of different families.
  Journal
Biochemistry. 38 (1999) 13106-11.
  Sequence
[eco:b0058]
Reference
5  [PMID:7493321]
  Authors
Wrzesinski J, Nurse K, Bakin A, Lane BG, Ofengand J
  Title
A dual-specificity pseudouridine synthase: an Escherichia coli synthase purified  and cloned on the basis of its specificity for psi 746 in 23S RNA is also specific for psi 32 in tRNA(phe).
  Journal
RNA. 1 (1995) 437-48.
  Sequence
[eco:b0058]
Reference
6  [PMID:15466869]
  Authors
Behm-Ansmant I, Grosjean H, Massenet S, Motorin Y, Branlant C
  Title
Pseudouridylation at position 32 of mitochondrial and cytoplasmic tRNAs requires  two distinct enzymes in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
J. Biol. Chem. 279 (2004) 52998-3006.
  Sequence
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
430429-15-5

KEGG   ENZYME: 5.4.99.29Help
Entry
EC 5.4.99.29                Enzyme                                 

Name
23S rRNA pseudouridine746 synthase;
RluA (ambiguous);
23S RNA PSI746 synthase;
23S rRNA pseudouridine synthase;
pseudouridine synthase RluA (ambiguous)
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Transferring other groups
BRITE hierarchy
Sysname
23S rRNA-uridine746 uracil mutase
Reaction(IUBMB)
23S rRNA uridine746 = 23S rRNA pseudouridine746
Substrate
23S rRNA uridine746
Product
23S rRNA pseudouridine746
Comment
RluA is the sole protein responsible for the in vivo formation of 23S RNA pseudouridine746 [2]. The dual-specificity enzyme also catalyses the formation of uridine32 in tRNA [3]. cf. EC 5.4.99.28 (tRNA pseudouridine32 synthase).
History
EC 5.4.99.29 created 2011
Orthology
K06177  
tRNA pseudouridine32 synthase / 23S rRNA pseudouridine746 synthase
Genes
ECO: 
b0058(rluA)
ECJ: 
Y75_p0058(rluA)
ECD: 
EBW: 
BWG_0054(rluA)
ECOK: 
ECE: 
Z0066(yabO)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_0062(rluA)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c0069(yabO)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_0059(rluA)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_00060(rluA)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m0056(rluA)
ELL: 
WFL_00280(rluA)
ELC: 
i14_0060(yabO)
ELD: 
i02_0060(yabO)
ELP: 
EBL: 
ECD_00060(rluA)
EBE: 
B21_00059(rluA)
ELF: 
LF82_1897(rluA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
EFER_0067(rluA)
STY: 
STY0110(rluA)
STT: 
t0098(rluA)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM0095(rluA)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA0096(rluA)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SPC_0103(rluA)
SEC: 
SC0090(rluA)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG0097(rluA)
SEL: 
SPUL_0101(rluA)
SEGA: 
SET: 
SEN0097(rluA)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_990(SBOV00431)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBG_0083(rluA)
SBZ: 
SBV: 
YPE: 
YPO0497(rluA)
YPK: 
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_3682(rluA3)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_0482(rluA)
YPT: 
YPD: 
YPD4_0434(rluA)
YPX: 
YPD8_0435(rluA)
YPH: 
YPC_4009(rluA)
YPS: 
YPTB0638(rluA)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
YEN: 
YE0635(rluA) YE2636(rluA)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YSI: 
SFL: 
SF0053(yabO)
SFX: 
S0055(yabO)
SFV: 
SFV_0050(yabO)
SFE: 
SFxv_0055(rluA)
SFN: 
SFS: 
SSN: 
SSON_0064(yabO)
SSJ: 
SBO: 
SBO_0045(yabO)
SBC: 
SDY: 
SDY_0082(yabO)
SDZ: 
ECA: 
ECA3854(rluA)
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
EPY: 
EpC_07160(rluA) EpC_10740(rluA)
EPR: 
EAM: 
EAMY_2556(rluA) EAMY_2921(yabO)
EAY: 
EBI: 
ERJ: 
PLU: 
plu0614(rluA)
PAY: 
PAU_00572(rluA)
SGL: 
SOD: 
Sant_3380(rluA)
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ECLA: 
ECLC: 
ECLG: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_06890(rluA)
KPN: 
KPU: 
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPQ: 
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KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
PMK1_02365(rluA_1) PMK1_04633(rluA_2)
KPB: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
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KOK: 
KOM: 
CKO: 
CRO: 
ROD_00631(rluA)
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SOD_c05950(rluA1) SOD_c39000(rluA)
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
SERF: 
SERS: 
PMR: 
PMI2329(rluA) PMI2985(rluA)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETAE_0605(rluA)
ETD: 
ETE: 
ETC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XBJ1_1797(rluA)
XNE: 
XNC1_4060(rluA)
PAM: 
PANA_0688(rluA) PANA_1819(rluA)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_0034(rluA) PAJ_1155(rluA)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_0096(yabO) Pvag_1912(rluA)
PAO: 
KLN: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
PSX: 
EBT: 
MMK: 
ROR: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
HAV: 
EBF: 
PSTS: 
HIN: 
HIT: 
NTHI0050(rluA2) NTHI0874(rluA)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HIA: 
HDU: 
HD1762(rluA)
HAP: 
HAPS_2249(rluA)
HPAZ: 
HPAS: 
HPAK: 
HPR: 
HSO: 
HS_1515(rluA)
HSM: 
PMU: 
PM0633 PM1836(rsuA_2)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
PMUL: 
MSU: 
MS0231(rluA) MS1170(rluA)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APL_0229(rluA) APL_0315(rluA)
APJ: 
APJL_0234(rluA) APJL_0330(rluA)
APA: 
ASU: 
ASI: 
ASS: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XCI: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XFU: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_0820(rluA) SMD_1817(rluA2)
PSU: 
PSD: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VCQ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
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VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VCY: 
VTU: 
VFI: 
VFM: 
VSA: 
PPR: 
PAE: 
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUD: 
PMOS: 
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PPZ: 
PEN: 
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
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PCH: 
PCP: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
CJA: 
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AVL: 
AVD: 
PAR: 
Psyc_1988(rluA)
PCR: 
PRW: 
PSO: 
ACI: 
ACD: 
ACB: 
ABM: 
ABY: 
ABC: 
ABN: 
ABB: 
ABX: 
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ABD: 
ABH: 
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ABAZ: 
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ABW: 
ACC: 
MCT: 
MCS: 
MCAT: 
SON: 
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
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SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
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SHN: 
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SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
SVI_1570(rluA-1) SVI_2132(rluA-2) SVI_3039 SVI_3127(rluA-3) SVI_3591(rluA-4) SVI_3757 SVI_4237
ILO: 
ILI: 
CPS: 
PHA: 
PAT: 
PSM: 
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
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AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
GPS: 
PIN: 
PSY: 
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FBL: 
MCA: 
MCA1592(rluA)
TCX: 
TCY: 
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MEC: 
HNA: 
HCH: 
ABO: 
ABO_1194(rluA)
ADI: 
B5T_02251(rluA)
KKO: 
MMW: 
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MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
ASA: 
AVR: 
AMED: 
TAU: 
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DNO: 
DNO_0294(rluA)
GAP: 
SAGA: 
GPB: 
NMA: 
NME: 
NMP: 
NMH: 
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NMT: 
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NMD: 
NMM: 
NMS: 
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NMW: 
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NGO: 
NGK: 
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NLA: 
CVI: 
LHK: 
PSE: 
NH8B_1024(rluA)
PNU: 
TEQ: 
TEA: 
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TAT: 
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VPD: 
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MMS: 
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azo0013(rluA1) azo1862(rluA2)
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AZKH_0044(rluA) AZKH_2561(rluA)
DAR: 
TMZ: 
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TBD: 
APP: 
SLT: 
GCA: 
BPRC: 
SKU: 
SULR: 
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PPD: 
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DAS: 
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DPI: 
BN4_11557(rluA)
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Bd1424(rluA) Bd2820(rluA)
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Bdt_1407(rluA)
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DAT: 
HRM2_26520(rluD2)
ADE: 
ACP: 
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COCOR_03500(rluA1) COCOR_04291(rluD4) COCOR_05795(rluA)
SUR: 
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PLA: 
ATU: 
Atu4041(rluA)
AGR: 
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OCO: 
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MEA: 
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MPO: 
MNO: 
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MSL: 
PHL: 
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SIL: 
SPO3392(rluA)
SIT: 
RSP: 
RSH: 
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RSK: 
RCP: 
JAN: 
RDE: 
RD1_0016(rluA)
RLI: 
PDE: 
PAMI: 
DSH: 
Dshi_3106(rluA)
KVU: 
KVL: 
KVU_2325(rluA)
PSF: 
PSE_1330(rluA)
PGA: 
PGL: 
PGD: 
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OAR: 
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RED: 
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MMR: 
HNE: 
HBA: 
ZMO: 
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ZMM: 
ZMB: 
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ZMC: 
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ZMP: 
NAR: 
NPP: 
NPN: 
SAL: 
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SCH: 
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GBH: 
GBC: 
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AMV: 
GDI: 
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GLX_18970(rluA)
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
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APK: 
RCE: 
MAG: 
MGY: 
ALI: 
ABS: 
ABQ: 
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MAI: 
MICA_1358(yabO)
MAN: 
PGV: 
OIH: 
BBE: 
SGO: 
LCA: 
LCZ: 
TTE: 
TTE1780(RluA2)
MTU: 
MTV: 
MTC: 
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MTZ: 
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MTE: 
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MTD: 
MTN: 
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MTUB: 
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MTUH: 
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MTUT: 
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MBO: 
MBB: 
MBT: 
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MAF: 
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MPA: 
MAO: 
MAV: 
MAVR: 
MAVD: 
MIT: 
MIR: 
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MIE: 
MID: 
MYO: 
MSM: 
MSG: 
MSB: 
MSA: 
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MSH: 
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MVA: 
MGI: 
MSP: 
MAB: 
MABB: 
MMV: 
MAK: 
MAY: 
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MMC: 
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MMM: 
MCB: 
MLI: 
MKN: 
MNE: 
ASD: 
CGL: 
NCgl2844(Cgl2945)
CGB: 
cg3258(rluC2)
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CGT: 
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CGG: 
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Reference
1  [PMID:17188032]
  Authors
Hoang C, Chen J, Vizthum CA, Kandel JM, Hamilton CS, Mueller EG, Ferre-D'Amare AR
  Title
Crystal structure of pseudouridine synthase RluA: indirect sequence readout through protein-induced RNA structure.
  Journal
Mol. Cell. 24 (2006) 535-45.
Reference
2  [PMID:10383384]
  Authors
Raychaudhuri S, Niu L, Conrad J, Lane BG, Ofengand J
  Title
Functional effect of deletion and mutation of the Escherichia coli ribosomal RNA  and tRNA pseudouridine synthase RluA.
  Journal
J. Biol. Chem. 274 (1999) 18880-6.
  Sequence
[eco:b0058]
Reference
3  [PMID:7493321]
  Authors
Wrzesinski J, Nurse K, Bakin A, Lane BG, Ofengand J
  Title
A dual-specificity pseudouridine synthase: an Escherichia coli synthase purified  and cloned on the basis of its specificity for psi 746 in 23S RNA is also specific for psi 32 in tRNA(phe).
  Journal
RNA. 1 (1995) 437-48.
  Sequence
[eco:b0058]
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