KEGG   ORTHOLOGY: K01148Help
Entry
K01148                      KO                                     

Name
PARN, PNLDC1
Definition
poly(A)-specific ribonuclease [EC:3.1.13.4]
Pathway
RNA degradation
Disease
H00507  
Dyskeratosis congenita (DC)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.4  poly(A)-specific ribonuclease
     K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Other 3'-5' decay factors
     K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
BRITE hierarchy
Other DBs
GO: 
Genes
HSA: 
154197(PNLDC1) 5073(PARN)
PTR: 
453936(PARN) 463111(PNLDC1)
PPS: 
100986002(PARN) 100992111(PNLDC1)
GGO: 
101146526(PNLDC1) 101150804(PARN)
PON: 
100172259(PARN) 100173475(PNLDC1) 100435399(PNLDC1)
NLE: 
100586640(PNLDC1) 100598246(PARN)
MCC: 
707835(PNLDC1) 712984(PARN)
MCF: 
102118442(PNLDC1) 102119460(PARN)
CSAB: 
103228729(PARN) 103240827(PNLDC1)
RRO: 
RBB: 
108516170(PNLDC1) 108523758(PARN)
CJC: 
100388797(PNLDC1) 100394289(PARN)
SBQ: 
101034109(PARN) 101052910(PNLDC1)
MMU: 
240023(Pnldc1) 74108(Parn)
RNO: 
360464(Parn) 361478(Pnldc1)
CGE: 
100762328(Pnldc1) 100771839(Parn)
NGI: 
103731559(Parn) 103734800(Pnldc1)
HGL: 
101709845(Pnldc1) 101715275(Parn)
CCAN: 
OCU: 
100351489(PARN) 100357330(PNLDC1)
TUP: 
102473091(PARN) 102498089(PNLDC1)
CFA: 
479839(PARN) 484065(PNLDC1)
AML: 
100469832(PARN) 100478756(PNLDC1)
UMR: 
103660901(PNLDC1) 103668616(PARN)
FCA: 
101097241(PNLDC1) 101100021(PARN)
PTG: 
102950961(PNLDC1) 102959344(PARN)
AJU: 
106965974(PNLDC1) 106970567(PARN)
BTA: 
524155(PARN) 615807(PNLDC1)
BOM: 
102283407(PNLDC1) 102287848(PARN)
BIU: 
109563599(PNLDC1) 109578580(PARN)
PHD: 
102314991(PARN) 102327831(PNLDC1)
CHX: 
102171479(PARN) 102183329(PNLDC1)
OAS: 
101111555(PNLDC1) 101112185(PARN)
SSC: 
100152694(PNLDC1) 100515887(PARN)
CFR: 
102505693(PARN) 102510511(PNLDC1)
CDK: 
105091385(PARN) 105100384(PNLDC1)
BACU: 
103009247(PNLDC1) 103017586(PARN)
LVE: 
103076055(PARN) 103076640(PNLDC1)
ECB: 
100050655(PARN) 100058786(PNLDC1)
EPZ: 
103551167(PARN) 103558455(PNLDC1)
EAI: 
106842041(PNLDC1) 106847167(PARN)
MYB: 
102243649(PARN) 102262108(PNLDC1)
MYD: 
102753760(PARN) 102756543(PNLDC1)
HAI: 
109394002(PNLDC1) 109395237(PARN)
RSS: 
109433865(PARN) 109457042(PNLDC1)
PALE: 
102887262(PNLDC1) 102891690(PARN)
LAV: 
100654816(PARN) 100663740(PNLDC1)
MDO: 
100024540(PARN) 100032453(PNLDC1)
SHR: 
100915402(PARN) 100925885(PNLDC1)
OAA: 
GGA: 
416423(PARN) 428595(PNLDC1)
MGP: 
100544728(PARN) 100550227(PNLDC1)
CJO: 
107311529(PNLDC1) 107320526(PARN)
APLA: 
101793853(PARN) 101795326(PNLDC1)
ACYG: 
106039548(PNLDC1) 106041221(PARN)
TGU: 
100219669(PARN) 100225677(PNLDC1)
GFR: 
102035929(PNLDC1) 102040201(PARN)
FAB: 
101813477(PNLDC1) 101816393(PARN)
PHI: 
102100419(PARN) 102104864(PNLDC1)
PMAJ: 
107201941(PNLDC1) 107211023(PARN)
CCW: 
104684717(PARN) 104690370(PNLDC1)
FPG: 
101913740(PARN) 101917319(PNLDC1)
FCH: 
102047367(PNLDC1) 102055624(PARN)
CLV: 
102086728(PARN) 102087047(PNLDC1)
AAM: 
106482599(PARN) 106486820(PNLDC1)
ASN: 
102378208(PNLDC1) 102379982(PARN)
AMJ: 
102562455(PARN) 102564350(PNLDC1)
PSS: 
102445710(PNLDC1) 102459670(PARN)
CMY: 
102934548(PARN) 102934939(PNLDC1)
CPIC: 
101944137(PNLDC1) 101945694(PARN)
ACS: 
100560800(parn) 100561016(pnldc1)
PVT: 
110087522(PNLDC1) 110089115(PARN)
PBI: 
103052772(PARN) 103065585(PNLDC1)
GJA: 
107109308(PARN) 107111944(PNLDC1)
XLA: 
108703108(parn.S) 394409(parn.L)
XTR: 
733861(parn)
NPR: 
DRE: 
791461(parn)
SRX: 
107758387(parn)
SANH: 
107678313(parn)
SGH: 
IPU: 
AMEX: 
103033684(parn)
TRU: 
TNG: 
LCO: 
104921157(parn)
NCC: 
104965444(parn)
MZE: 
OLA: 
101157188(parn)
XMA: 
102229964(parn)
CSEM: 
103383457(parn)
LCF: 
HCQ: 
109511437(parn)
BPEC: 
110168537(parn)
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105029847(parn)
SFM: 
108929598(parn)
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CMK: 
103187090(parn)
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SPU: 
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SKO: 
AGA: 
AAG: 
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408626(GB12931) 551033(GB14260)
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CEL: 
CELE_K10C8.1(parn-1)
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 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Gao M, Fritz DT, Ford LP, Wilusz J
  Title
Interaction between a poly(A)-specific ribonuclease and the 5' cap influences mRNA deadenylation rates in vitro.
  Journal
Mol Cell 5:479-88 (2000)
DOI:10.1016/S1097-2765(00)80442-6
  Sequence
[hsa:5073]
Reference
  Authors
Anastasakis D, Skeparnias I, Shaukat AN, Grafanaki K, Kanellou A, Taraviras S, Papachristou DJ, Papakyriakou A, Stathopoulos C
  Title
Mammalian PNLDC1 is a novel poly(A) specific exonuclease with discrete expression during early development.
  Journal
Nucleic Acids Res 44:8908-8920 (2016)
DOI:10.1093/nar/gkw709
  Sequence
[hsa:154197]

DBGET integrated database retrieval system