KEGG   ORTHOLOGY: K01971Help
Entry
K01971                      KO                                     

Name
E6.5.1.1, lig
Definition
DNA ligase (ATP) [EC:6.5.1.1]
Pathway
Base excision repair
Nucleotide excision repair
Mismatch repair
Non-homologous end-joining
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Replication and repair
   03410 Base excision repair
    K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
   03420 Nucleotide excision repair
    K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
   03430 Mismatch repair
    K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
   03450 Non-homologous end-joining
    K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
Enzymes [BR:ko01000]
 6. Ligases
  6.5  Forming phosphoric-ester bonds
   6.5.1  Ligases that form phosphoric-ester bonds (only sub-subclass identified to date)
    6.5.1.1  DNA ligase (ATP)
     K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic Type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA ligase
     K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
   MMR (mismatch exicision repair)
    DNA ligase
     K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    Two-component NHEJ DNA repair complex
     K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
    SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
     RecET pathway
      K01971  E6.5.1.1, lig; DNA ligase (ATP)
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
GO: 
Genes
LGI: 
AFM: 
TML: 
SHS: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT127415(AGABI1DRAFT_127415)
ABV: 
AGABI2DRAFT122838(AGABI2DRAFT_122838)
PFP: 
MGL: 
MBR: 
ACAN: 
TET: 
PTM: 
PIF: 
EHX: 
TBR: 
Tb11.02.4580 Tb927.7.600(Tb07.29K4.770) Tb927.7.610(Tb07.29K4.760)
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
HIT: 
NTHI1352(ligA)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HIA: 
HPR: 
HSO: 
HS_1324(ligA)
HSM: 
MSU: 
MS0939(cDC9)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHH_c10480(ligA1)
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
ASU: 
ASI: 
ASS: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XCC: 
XCC0105 XCC1290(lig2) XCC2307(lig3)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XAC1341(lig2) XAC2414(lig3)
XCI: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOO1875(lig2)
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XFU: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
PSU: 
PSD: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VC0395_A1148(ligA-2)
VCR: 
VC395_1659(ligA-2)
VCM: 
VCM66_1483(ligA-2)
VCI: 
VCL: 
VCQ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VCY: 
VTU: 
VFI: 
VFM: 
VSA: 
PPR: 
PAE: 
PAEV: 
N297_2205(ligD)
PAEI: 
N296_2205(ligD)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
M802_2202(ligD)
PAEO: 
M801_2204(ligD)
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUD: 
PMOS: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN2767(ligD)
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PCH: 
PCP: 
PRH: 
PSW: 
ABR: 
ABAZ: 
SON: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
ILO: 
ILI: 
CPS: 
PHA: 
PAT: 
PSM: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
GPS: 
PIN: 
FBL: 
CBU: 
CBS: 
CBG: 
CBC: 
LPC: 
LPA: 
LLO: 
MAH: 
TCX: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
CZA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
SSAL: 
SPIU: 
ABO: 
ABO_2702(ligA)
ADI: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
OCE: 
NMA: 
NME: 
NMB2048(ligA-2)
NMP: 
NMBB_2353(ligA-2)
NMH: 
NMC: 
NMN: 
NMT: 
NMI: 
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMZ: 
NMX: 
NGO: 
NGK: 
NGT: 
NLA: 
RSC: 
RSL: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
CNC: 
CTI: 
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPSE: 
BDL_5683(ligD)
BPSM: 
BBQ_3897(ligD)
BPSU: 
BBN_5703(ligD)
BPSD: 
BBX_4850(ligD)
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BBK_4987(ligD)
BPSH: 
DR55_5522(ligD)
BTD: 
BUT: 
X994_1381(a544R) X994_4842(ligD)
BVI: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCEN: 
DM39_7047(ligD)
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
DM80_5695(ligD)
BCED: 
DM42_7098(ligD)
BXE: 
BXB: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BRH: 
BGD: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
BBR: 
BB2845(ligD)
BBM: 
BBH: 
BPT: 
BHO: 
D560_3422(ligD)
BHM: 
D558_3396(ligD)
AXY: 
AXYL_00438(ligD1) AXYL_06730(ligD2)
AXO: 
AXN: 
AXS: 
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
MPT: 
HAR: 
JAG: 
HSE: 
CFU: 
LCH: 
THI: 
RGE: 
NMU: 
EBA: 
AZO: 
azo0444(lig2) azo1741(ligD) azo3130(dnaL)
AZA: 
AZKH_2968(ligD)
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
TBD: 
SDR: 
MEH: 
MEI: 
APP: 
HCP: 
HCB: 
TDN: 
CJE: 
CJB: 
CJJ: 
CJU: 
CJN: 
CJI: 
CJM: 
CJM1_1615(ligA-2)
CJS: 
CJP: 
CJEJ: 
CJEU: 
CJEN: 
CJEI: 
CJER: 
CJV: 
CJR: 
CJD: 
CJZ: 
CJX: 
CFF: 
CFV: 
CFX: 
CAMP: 
CCV: 
CHA: 
CCO: 
CLA: 
CCOL: 
CCC: 
CCQ: 
CCF: 
CCY: 
CCOI: 
CAJ: 
ABU: 
Abu_0698(ligA)
ABT: 
ABL: 
ANT: 
ARC: 
SDL: 
SBA: 
SMUL: 
SMUL_2485(ligA2)
GME: 
GUR: 
GBM: 
Gbem_0128(ligD)
GEO: 
GEM: 
GEB: 
DAF: 
BBA: 
Bd2252(lig)
BBAT: 
BBW: 
BBAC: 
DAT: 
HRM2_32340(ligA2)
ADE: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
SCU: 
HOH: 
DAO: 
DTI: 
DPB: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
PLA: 
SME: 
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMER: 
SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
EAD: 
ATU: 
ARA: 
AVI: 
AGR: 
RET: 
REC: 
REL: 
REI: 
RLE: 
RLT: 
RLG: 
RLB: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
RHL: 
NGL: 
NGG: 
OAN: 
OAH: 
BJA: 
BJU: 
BRA: 
BBT: 
BRS: 
AOL: 
RPA: 
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
NWI: 
NHA: 
OCA: 
OCG: 
OCO: 
XAU: 
AZC: 
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MDI: 
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MNO: 
MOR: 
BID: 
MSL: 
Msil_1736(ligD) Msil_3719(ligC)
HDN: 
HDT: 
HMC: 
HNI: 
RVA: 
PHL: 
MSC: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
PZU: 
BSB: 
AEX: 
RSP: 
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
JAN: 
RDE: 
RD1_1817(dnlI)
RLI: 
PDE: 
PAMI: 
DSH: 
PGA: 
PGL: 
PGD: 
OAT: 
OAR: 
RED: 
HNE: 
NAR: 
SAL: 
SWI: 
SPHM: 
STAX: 
SJP: 
SCH: 
SSY: 
ELI: 
GOH: 
GBE: 
GBH: 
GBC: 
GBS: 
ACR: 
AMV: 
GDI: 
GDJ: 
GXL: 
RCE: 
RPM: 
AZL: 
ALI: 
ABS: 
ABQ: 
TMO: 
PBR: 
PGV: 
BSU: 
BSU13400(ligD) BSU20500(ligB)
BSR: 
I33_1508(ykoU)
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSUT: 
BSUL: 
BSS: 
BST: 
GYO_1664(ykoU)
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSX: 
C663_1379(ykoU)
BSP: 
BLI: 
BL00865(ligB) BL03626(ligD)
BLD: 
BLi01494(ykoU) BLi01538(ligB)
BLH: 
BAO: 
BAMF_0926(ligB) BAMF_1421(ykoU)
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
RBAU_1296(ykoU) RBAU_2060(ligB)
BAMN: 
BASU_1275(ykoU)
BAMB: 
BAMT: 
BAZ: 
BQL: 
LL3_01440(ykoU) LL3_02285(ligB)
BXH: 
BQY: 
MUS_1417(ligD) MUS_2008(ligB)
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAMY: 
BAE: 
BHA: 
BH2209(ligD)
BCL: 
ABC1601(ligD) ABC2809(ligB)
BPU: 
BPUM_1666(ligD)
BPUM: 
BPF: 
BCO: 
BCK: 
BAG: 
BJS: 
BACI: 
BIF: 
BLE: 
BMET: 
BMP: 
OIH: 
OB3034(ligD)
GST: 
LSP: 
LGY: 
HHD: 
TAP: 
VIR: 
SUW: 
SAUZ: 
SER: 
BBE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_0359(lig) PPM_1132(ykoU) PPM_2737(ligB3) PPM_p0233(ligB)
PPOL: 
PPQ: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
PDU: 
PBD: 
PGM: 
POD: 
PAEN: 
PAEF: 
PAEQ: 
PSTE: 
PAEA: 
PAEE: 
PAEH: 
PAEJ: 
TCO: 
AAC: 
AAD: 
SIV: 
LSJ: 
CCE: 
CLB: 
CSS: 
CSD: 
Clst_1549(ligD1) Clst_1550(ligD2)
FPA: 
CPY: 
CSH: 
STH: 
SWO: 
SLP: 
DSY: 
DHD: 
DDH: 
DDL: 
DRM: 
DCA: 
DKU: 
DRU: 
DGI: 
PTH: 
DAU: 
TJR: 
SGY: 
DOR: 
DAI: 
DMI: 
DED: 
DEC: 
DRS: 
HMO: 
TMR: 
SAY: 
SAP: 
TEX: 
THX: 
TPD: 
TIT: 
TMT: 
TBO: 
TWI: 
TKI: 
CHY: 
MTA: 
TPZ: 
Tph_c08080(ligD1) Tph_c09930(ligD2)
TOC: 
TTM: 
TTO: 
TXY: 
TSH: 
NTH: 
HOR: 
PUF: 
MTU: 
Rv0938(ligD) Rv3062(ligB) Rv3730c Rv3731(ligC)
MTV: 
MTC: 
MRA: 
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTZ: 
MTG: 
MTI: 
MTE: 
MTUR: 
MTL: 
MTO: 
MTD: 
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
MTUC: 
MTUE: 
MTX: 
MTUH: 
MTUL: 
MTUT: 
MTUU: 
MTQ: 
MBO: 
MBB: 
MBT: 
MBM: 
MBK: 
MBZ: 
MAF: 
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MPA: 
MAO: 
MAV: 
MAV_0360(ligC) MAV_0362(ligD) MAV_1056 MAV_3148(ligD) MAV_3937(ligB)
MAVR: 
MAVD: 
MIT: 
MIR: 
MIA: 
MIE: 
MID: 
MYO: 
MSM: 
MSG: 
MSB: 
MSA: 
MSN: 
MSH: 
MUL: 
MVA: 
MGI: 
MSP: 
MAB: 
MABB: 
MMV: 
MAK: 
MAY: 
MAZ: 
MMC: 
MKM: 
MJL: 
MJD: 
MMI: 
MRH: 
MMM: 
MCB: 
MLI: 
MKN: 
MNE: 
ASD: 
CVA: 
CVAR_1338(ligD)
CGY: 
CUV: 
NFA: 
NCY: 
NBR: 
NNO: 
RHA: 
RER: 
REY: 
ROP: 
ROA: 
REQ: 
RPY: 
GBR: 
GPO: 
GOR: 
TPR: 
SRT: 
SCO: 
SCO1202(ligB) SCO5308(SC6G9.25) SCO6498(SC1E6.07) SCO6707(ligC) SCO6709(SC4C6.19) SCO6907(SC1B2.13) SCO7345(SC4G10.24c) SCO7355(SC9H11.09c)
SMA: 
SGR: 
SCB: 
SSX: 
SVL: 
SCT: 
SCY: 
SFA: 
SBH: 
SHY: 
SHO: 
SVE: 
SDV: 
SALB: 
STRP: 
SFI: 
SCI: 
SRC: 
SALU: 
SLV: 
SGU: 
KSK: 
LXY: 
CMI: 
CMC: 
CMN_02036(ligD)
MTS: 
ART: 
AAU: 
ACH: 
APN: 
ARR: 
BCV: 
BFA: 
KSE: 
DNI: 
XCE: 
IVA: 
SKE: 
CFL: 
CFI: 
CGA: 
ICA: 
PBO: 
MPH: 
NCA: 
KFL: 
NDA: 
NAL: 
B005_3125(ligD)
TCU: 
SRO: 
FRE: 
FRI: 
FAL: 
ACE: 
NML: 
GOB: 
BSD: 
MMAR: 
KRA: 
SEN: 
SVI: 
TBI: 
AMD: 
AMN: 
AMM: 
AMZ: 
AOI: 
AJA: 
AMQ: 
PDX: 
AMI: 
SESP: 
KAL: 
STP: 
SAQ: 
MAU: 
MIL: 
VMA: 
AMS: 
ASE: 
ACTN: 
AFS: 
CAI: 
SNA: 
CWO: 
AYM: 
ELE: 
EYY: 
PCU: 
PUV: 
SNG: 
OTE: 
MIN: 
Minf_2347(cdc9)
LIL: 
LA_0984(cdc9)
LIE: 
LIF_A0796(cdc9)
LIC: 
ABA: 
ACA: 
ACM: 
GMA: 
TSA: 
TRS: 
SUS: 
GAU: 
GBA: 
RBA: 
RB1571(dnlI)
PLM: 
PBS: 
IPA: 
SACI: 
PHM: 
SYW: 
SYD: 
SYE: 
SYG: 
SYR: 
SYX: 
SYNK: 
SYNR: 
SYND: 
CGC: 
PMM: 
PMI: 
PMB: 
PMC: 
PMG: 
PMH: 
PRC: 
BXY: 
CPI: 
NKO: 
PHE: 
PSN: 
SHG: 
SHT: 
SCN: 
CMR: 
BBD: 
CHU: 
DFE: 
MTT: 
GFO: 
FJO: 
RBI: 
ZPR: 
CAT: 
CAO: 
KDI: 
DOK: 
LAN: 
ZGA: 
ASL: 
PTQ: 
NDO: 
POM: 
FBA: 
OHO: 
DET: 
DEH: 
DEB: 
DEV: 
DEG: 
DMC: 
DMD: 
DMG: 
DLY: 
RRS: 
RCA: 
STI: 
OPR: 
HYA: 
HHO: 
HYS: 
MPG: 
FGI: 
CEX: 
FSI: 
TYE: 
TID: 
TOP: 
MOX: 
MAC: 
MBA: 
MMA: 
MMH: 
MEV: 
MZH: 
MCJ: 
MHI: 
MEM: 
MBG: 
MPI: 
MBN: 
MFO: 
MPD: 
MEZ: 
RCI: 
MEL: 
MEW: 
METH: 
MFC: 
BRM9_1588(ligD)
AFU: 
AFG: 
APO: 
AVE: 
AST: 
THB: 
CSU: 
KCR: 
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Reference
  Authors
Weller GR, Kysela B, Roy R, Tonkin LM, Scanlan E, Della M, Devine SK, Day JP, Wilkinson A, d'Adda di Fagagna F, Devine KM, Bowater RP, Jeggo PA, Jackson SP, Doherty AJ.
  Title
Identification of a DNA nonhomologous end-joining complex in bacteria.
  Journal
Science 297:1686-9 (2002)
  Sequence
[bsu:BSU13400]
Reference
  Authors
Wang ST, Setlow B, Conlon EM, Lyon JL, Imamura D, Sato T, Setlow P, Losick R, Eichenberger P
  Title
The forespore line of gene expression in Bacillus subtilis.
  Journal
J Mol Biol 358:16-37 (2006)
  Sequence
[bsu:BSU13400]
Reference
  Authors
Moeller R, Stackebrandt E, Reitz G, Berger T, Rettberg P, Doherty AJ, Horneck G, Nicholson WL
  Title
Role of DNA repair by nonhomologous-end joining in Bacillus subtilis spore resistance to extreme dryness, mono- and polychromatic UV, and ionizing radiation.
  Journal
J Bacteriol 189:3306-11 (2007)
  Sequence
[bsu:BSU13400]

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