KEGG   ORTHOLOGY: K02342Help
Entry
K02342                      KO                                     

Name
dnaQ
Definition
DNA polymerase III subunit epsilon [EC:2.7.7.7]
Pathway
ko00230  Purine metabolism
ko00240  Pyrimidine metabolism
ko01100  Metabolic pathways
ko03030  DNA replication
ko03430  Mismatch repair
ko03440  Homologous recombination
Module
M00260  DNA polymerase III complex, bacteria
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Metabolism
  Nucleotide metabolism
   00230 Purine metabolism
    K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
   00240 Pyrimidine metabolism
    K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
 Genetic Information Processing
  Replication and repair
   03030 DNA replication
    K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
   03430 Mismatch repair
    K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
   03440 Homologous recombination
    K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   DNA polymerase
    M00260  DNA polymerase III complex, bacteria
     K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Prokaryotic Type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic Type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch exicision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     K02342  dnaQ; DNA polymerase III subunit epsilon
BRITE hierarchy
Other DBs
RN: R00375 R00376 R00377 R00378
COG: COG0847
GO: 0003887
Genes
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PAE: PA1816(dnaQ) PA3232
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PPU: PP_0353 PP_4141(dnaQ) PP_4768
PEN: PSEEN3558(dnaQ) PSEEN5130
PSA: PST_2251(dnaQ) PST_3900
PKC: PKB_2002(dnaQ) PKB_4111
PAR: Psyc_0391(dnaQ)
PALI: A3K91_0498
PSYC: DABAL43B_0505(dnaQ1) DABAL43B_0655(polC)
PSYA: AOT82_1301
ABAZ: P795_18045
SON: SO_2245 SO_2559(dnaQ) SO_2855
SVO: SVI_1694 SVI_1942(dnaQ-1) SVI_2384(dnaQ-2)
ILO: IL1176 IL1420 IL1693(dnaQ)
PTN: PTRA_a0671(dnaQ) PTRA_a1806(dnaQ) PTRA_a2388(dnaQ) PTRA_a2433(dnaQ)
PEA: PESP_a1363(dnaQ) PESP_a1412(dnaQ) PESP_a1850(dnaQ) PESP_a3135(dnaQ)
PSPO: PSPO_a1196(dnaQ) PSPO_a2534(dnaQ) PSPO_b0039(dnaQ)
PART: PARC_a1288(dnaQ) PARC_a2123(dnaQ) PARC_a2597(dnaQ) PARC_a3189(dnaQ)
PTU: PTUN_a0875(dnaQ) PTUN_a2786(dnaQ)
PNG: PNIG_a0710(dnaQ) PNIG_a1904(dnaQ) PNIG_a2619(dnaQ) PNIG_a2652(dnaQ)
PTD: PTET_a1240(dnaQ) PTET_a1717(dnaQ) PTET_a2339(dnaQ) PTET_a2814(dnaQ)
MBS: MRBBS_0204(polC) MRBBS_1412(polC) MRBBS_2104(dnaQ) MRBBS_3291(cho)
CJA: CJA_2048(dnaQ)
MICC: AUP74_02270(dnaQ)
CBU: CBU_0317(dnaQ)
CBS: COXBURSA331_A0426(dnaQ)
CBD: CBUD_1761(dnaQ)
CBG: CbuG_1687(dnaQ)
CBC: CbuK_0515(dnaQ)
CEY: CleRT_12870(dnaQ)
LPN: lpg1384(dnaQ)
LPH: LPV_1500(dnaQ)
LPO: LPO_1374(dnaQ)
LPM: LP6_1365(dnaQ)
LPF: lpl1335(dnaQ)
LPP: lpp1339(dnaQ)
LPC: LPC_0800(dnaQ)
LPA: lpa_02036
LPE: lp12_1322
LOK: Loa_01115
TMC: LMI_1743(dnaQ)
MCA: MCA0720(dnaQ)
MAH: MEALZ_3032(dnaQ)
FTU: FTT_0548(dnaQ)
FTQ: RO31_0624(dnaQ)
FTF: FTF0548(dnaQ)
FTW: FTW_0993(dnaQ)
FTT: FTV_0511(dnaQ)
FTY: CH70_1036(dnaQ) CH70_981(dnaQ)
FTG: FTU_0595(dnaQ)
FTL: FTL_1003
FTH: FTH_0980(dnaQ)
FTA: FTA_1057(dnaQ)
FTS: F92_05545
FTI: FTS_0981(dnaQ)
FTC: DA46_1799(dnaQ)
FTV: CH67_1344(dnaQ)
FTZ: CH68_1076(dnaQ)
FTM: FTM_1137(dnaQ)
FTN: FTN_0968(dnaQ)
FTX: AW25_1044(dnaQ)
FTD: AS84_1561(dnaQ)
FPH: Fphi_1632
FPT: BZ13_358(dnaQ)
FPI: BF30_1907(dnaQ)
FPM: LA56_533(dnaQ)
FPX: KU46_1668(dnaQ)
FPZ: LA55_1154(dnaQ)
FPJ: LA02_1328(dnaQ)
FNA: OOM_1030
CYQ: Q91_0956
CZA: CYCME_1651(dnaQ)
NHL: Nhal_3456
NWA: Nwat_0274
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TaxonomyVtaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Cisneros GA, Perera L, Schaaper RM, Pedersen LC, London RE, Pedersen LG, Darden TA
  Title
Reaction mechanism of the epsilon subunit of E. coli DNA polymerase III: insights into active site metal coordination and catalytically significant residues.
  Journal
J Am Chem Soc 131:1550-6 (2009)
DOI:10.1021/ja8082818
  Sequence
[eco:b0215]

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