KEGG   ORTHOLOGY: K03006Help
Entry
K03006                      KO                                     

Name
RPB1, POLR2A
Definition
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 [EC:2.7.7.6]
Pathway
Purine metabolism
Pyrimidine metabolism
RNA polymerase
Huntington's disease
Herpes simplex infection
Epstein-Barr virus infection
Module
M00180  
RNA polymerase II, eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Metabolism
  Nucleotide metabolism
   00230 Purine metabolism
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
   00240 Pyrimidine metabolism
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
 Human Diseases
  Neurodegenerative diseases
   05016 Huntington's disease
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
  Infectious diseases
   05168 Herpes simplex infection
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
   05169 Epstein-Barr virus infection
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA polymerase
    M00180  RNA polymerase II, eukaryotes
     K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Core subunits
     K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic Type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase II complex
      K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
BRITE hierarchy
Other DBs
Genes
HSA: 
5430(POLR2A)
PTR: 
454463(POLR2A)
PPS: 
100978542(POLR2A)
GGO: 
101125439(POLR2A)
PON: 
100432084(POLR2A)
NLE: 
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721865(POLR2A)
MCF: 
CSAB: 
RRO: 
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SBQ: 
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20020(Polr2a)
RNO: 
363633(Polr2a)
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103752129(Polr2a)
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101725588(Polr2a)
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100466109(POLR2A)
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103660476(POLR2A)
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101098500(POLR2A)
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102963688(POLR2A)
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102267367(POLR2A)
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102187892(POLR2A)
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103085062(POLR2A)
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100662030(POLR2A)
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101067103(polr2a)
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Dere_GG18851(Dere_RpII215)
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DSE: 
DSI: 
Dsimw501_GD15986(Dsim_GD15986)
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Dyak_GE17292(Dyak_RpII215)
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DMO: 
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550829(Polii)
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CBG05355(Cbr-rpb-1)
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AT4G35800(NRPB1)
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Lj2g3v1648020.1(Lj2g3v1648020.1) Lj2g3v1648040.1(Lj2g3v1648040.1) Lj2g3v1659630.1(Lj2g3v1659630.1)
FVE: 
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PXB: 
CSV: 
CMO: 
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VVI: 
SLY: 
778257(RPB1)
SPEN: 
SOT: 
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BVG: 
NNU: 
OSA: 
4337831 9267835(OJ1177_E11.16)
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Os05t0151000-00(Os05g0151000)
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103634299(GRMZM2G434353) 541967(GRMZM2G044306)
SITA: 
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MUS: 
ATR: 
18424189(RPB1)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
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YDL140C(RPO21)
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CaO19.7655(RPO21)
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DFA_09469(rpb1)
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v1.2.018632.t1(symbB.v1.2.018632.t1) v1.2.036200.t1(symbB.v1.2.036200.t1)
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Tb927.4.5020(Tb04.3M17.400) Tb927.8.7400(Tb08.10K10.170)
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10399602(LAU_0014) 10963889(WIV_gp167) 11257036(mg373) 12977914(11R) 14445391(H012_gp622) 1494811(AMV221) 15613246(CHBEV_256) 15613547(CHREV_222) 15613866(MYSEV_244) 15614128(AHEV_199) 15766152(PGCG_00263) 16414381(042R) 16512858(pd_418) 16605586(ps_447) 1733004(IIV6gp172) 1733090(IIV6gp339) 18263659(BA82_gp230) 18266178(pv_150) 18266394(pv_366-368) 18501236(041R) 18501416(044R) 18501593(043R) 18938278(DH26_gp117) 19738704(120R) 19738736(152R) 20041646(JO84_gp233) 20041750(JO84_gp155) 21012068(MEL_047) 22220328(NP1450L) 23463173(TW95_gp1522) 23463174(TW95_gp1523) 23463175(TW95_gp1524) 25479125(AMQ81_gp076) 25812737(ml_310) 26049265(ceV_398) 26281639(ATL82_gp007) 26683634(AV955_gp089) 2700224(CNPV182) 27111943(A3303_gp030) 27924823(A9K97_gp028) 27924825(A9K97_gp026) 28218350(ORF105) 28619867(BGV90_gp007) 2943447(LDVICp190) 2947780(FV3gorf8R) 3197022(ORF104L) 3654696(EhV064) 3678174(ATVp06) 4156234(MIV090L) 4306175(ORF008) 5076030(HVAV3e_gp011) 5141657(TNAV2c_gp042) 8746289(MAR_ORF052) 932487(SPV068) 935304(Isaknvgp028) 9887771(crov368) 9925132(R501)
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TaxonomyVtaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:9852112
  Authors
Kershnar E, Wu SY, Chiang CM
  Title
Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.
  Journal
J Biol Chem 273:34444-53 (1998)
  Sequence
[hsa:5430]

DBGET integrated database retrieval system