KEGG   ORTHOLOGY: K03017Help
Entry
K03017                      KO                                     

Name
RPB9, POLR2I
Definition
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
Pathway
Purine metabolism
Pyrimidine metabolism
RNA polymerase
Huntington's disease
Epstein-Barr virus infection
Module
M00180  
RNA polymerase II, eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Metabolism
  Nucleotide metabolism
   00230 Purine metabolism
    K03017  RPB9, POLR2I; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
   00240 Pyrimidine metabolism
    K03017  RPB9, POLR2I; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03017  RPB9, POLR2I; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
 Human Diseases
  Neurodegenerative diseases
   05016 Huntington's disease
    K03017  RPB9, POLR2I; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
  Infectious diseases
   05169 Epstein-Barr virus infection
    K03017  RPB9, POLR2I; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA polymerase
    M00180  RNA polymerase II, eukaryotes
     K03017  RPB9, POLR2I; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol II specific subunits
     K03017  RPB9, POLR2I; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic Type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase II complex
      K03017  RPB9, POLR2I; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
BRITE hierarchy
Other DBs
Genes
HSA: 
5438(POLR2I)
PTR: 
746261(POLR2I)
PPS: 
100995061(POLR2I)
GGO: 
101130252(POLR2I)
PON: 
100447409(POLR2I)
NLE: 
100587588(POLR2I)
MCC: 
712412(POLR2I)
MCF: 
102130057(POLR2I)
RRO: 
104666680(POLR2I)
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100411511(POLR2I)
MMU: 
69920(Polr2i)
RNO: 
NGI: 
103729955(Polr2i)
HGL: 
101713641(Polr2i)
OCU: 
100349199(POLR2I)
TUP: 
102501716(POLR2I)
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476476(POLR2I)
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100476564(POLR2I)
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103682534(POLR2I)
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101082198(POLR2I)
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102969140(POLR2I)
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614472(POLR2I)
BOM: 
102281490(POLR2I)
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102318949(POLR2I)
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102510617(POLR2I)
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102892810(POLR2I)
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100014201(POLR2I)
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100543044(POLR2I)
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FAB: 
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102089470(POLR2I)
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100101756(polr2i)
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101158787(polr2i)
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102226006(polr2i)
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102361828(POLR2I)
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CIN: 
SPU: 
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DME: 
Dmel_CG3284(RpII15)
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DAN: 
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DPE: 
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DWI: 
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Dyak_GE24228(dyak_GLEANR_7943)
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
AAG: 
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AME: 
412547(RpII15)
SOC: 
AEC: 
HST: 
CFO: 
NVI: 
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PXY: 
API: 
PHU: 
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CEL: 
CBR: 
CBG11394(Cbr-rpb-9)
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TSP: 
HRO: 
LGI: 
CRG: 
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SMM: 
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AT3G16980(NRPB9A) AT4G16265(NRPB9B)
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CRB: 
EUS: 
BRP: 
BNA: 
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MTR: 
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PPER: 
PMUM: 
MDM: 
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CSV: 
CMO: 
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POP: 
POPTR_0008s10640g(POPTRDRAFT_820572) POPTR_0010s15240g(POPTRDRAFT_805257)
VVI: 
SLY: 
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SOT: 
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NNU: 
OSA: 
DOSA: 
Os03t0102200-01(Os03g0102200) Os07t0615800-00(Os07g0615800) Os11t0676650-00(Os11g0676650) Os12t0560400-01(Os12g0560400)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_02g039195(SORBIDRAFT_02g039195) SORBI_05g026420(SORBIDRAFT_05g026420) SORBI_06g001670(SORBIDRAFT_06g001670) SORBI_08g018130(SORBIDRAFT_08g018130) SORBI_09g022760(SORBIDRAFT_09g022760)
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100194206 100282092(GRMZM2G023028) 100284267(umc1300) 100285329(GRMZM5G898768) 103646824
SITA: 
PDA: 
EGU: 
MUS: 
ATR: 
SMO: 
PPP: 
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MPP: 
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SCE: 
YGL070C(RPB9)
AGO: 
ERC: 
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LTH: 
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TPHA_0E02850(TPHA0E02850)
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KAFR_0C02270(KAFR0C02270)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
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COT: 
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NEUTE1DRAFT110529(NEUTE1DRAFT_110529)
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AOR_1_1432054(AO090011000849)
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AGABI2DRAFT194810(AGABI2DRAFT_194810)
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DFA_03549(rpb9)
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BBOV_II007540(18.m06627)
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VG: 
15766087(PGCG_00198) 20041519(JO84_gp177) 26049133(ceV_266)
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TaxonomyVtaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:9852112
  Authors
Kershnar E, Wu SY, Chiang CM
  Title
Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.
  Journal
J Biol Chem 273:34444-53 (1998)
  Sequence
[hsa:5438]
Reference
  Authors
Li S, Smerdon MJ
  Title
Rpb4 and Rpb9 mediate subpathways of transcription-coupled DNA repair in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
EMBO J 21:5921-9 (2002)
  Sequence
[sce:YGL070C]

DBGET integrated database retrieval system