KEGG   ORTHOLOGY: K03087Help
Entry
K03087                      KO                                     

Name
SIG2, rpoS
Definition
RNA polymerase nonessential primary-like sigma factor
Pathway
Vibrio cholerae pathogenic cycle
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Human Diseases
  Infectious diseases
   05111 Vibrio cholerae pathogenic cycle
    K03087  SIG2, rpoS; RNA polymerase nonessential primary-like sigma factor
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Sigma factors
     K03087  SIG2, rpoS; RNA polymerase nonessential primary-like sigma factor
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
ECO: 
b2741(rpoS)
ECJ: 
Y75_p2679(rpoS)
ECD: 
EBW: 
BWG_2477(rpoS)
ECOK: 
ECE: 
Z4049(rpoS)
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ECSP_3689(rpoS)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_3166(rpoS)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_02591(rpoS)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m2947(rpoS)
ELL: 
WFL_14390(rpoS)
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
ECD_02591(rpoS)
EBE: 
B21_02556(rpoS)
ELF: 
LF82_1965(rpoS)
ECOA: 
EFE: 
EFER_0328(rpoS)
EBT: 
STY: 
STY3049(rpoS)
STT: 
t2825(rpoS)
SEX: 
STM: 
STM2924(rpoS)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SPT: 
SPA2780(rpoS)
SEK: 
SEI: 
SPC_2966(rpoS)
SEC: 
SC2856(rpoS)
SEH: 
SEE: 
SEW: 
SEA: 
SED: 
SeD_A3233(rpoS)
SEG: 
SG2827(rpoS)
SEL: 
SPUL_2922(rpoS)
SET: 
SEN2763(rpoS)
SENJ: 
SES: 
SBG: 
SBG_2538(rpoS)
YPE: 
YPO3355(rpoS)
YPK: 
y0834(rpoS)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_0332(rpoS)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPZ3_2954(rpoS)
YPT: 
YPD: 
YPD4_2940(rpoS)
YPX: 
YPD8_2938(rpoS)
YPH: 
YPC_3674(rpoS)
YPS: 
YPTB0776(rpoS)
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YEN: 
YE0775(appR)
YEP: 
YEY: 
SFL: 
SFV: 
SFV_2757(rpoS)
SFE: 
SFxv_3031(rpoS)
SSN: 
SSON_2889(rpoS)
SSJ: 
SBO: 
SBO_2779(rpoS)
SDY: 
SDY_2940(rpoS)
ECA: 
ECA3530(rpoS)
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
ETA_26950(rpoS)
EPY: 
EpC_28160(rpoS)
EAM: 
EAMY_0765(rpoS)
EAY: 
EAM_2679(rpoS)
EBI: 
EbC_35220(rpoS)
ERJ: 
PLU: 
plu0719(rpoS)
PAY: 
PAU_00692(rpoS)
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
ESC: 
EEC: 
ENL: 
EAE: 
EAR: 
CSK: 
ES15_0809(rpoS)
CSZ: 
CTU: 
CTU_33130(rpoS)
KPN: 
KPN_03103(rpoS)
KPU: 
KP1_4373(rpoS)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_1020(rpoS)
KPO: 
KVA: 
KOX: 
CKO: 
CRO: 
ROD_30681(rpoS)
SPE: 
SRR: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
PMR: 
PMI2236(rpoS)
EIC: 
ETR: 
ETAE_2873(rpoS)
ETD: 
ETAF_2609(rpoS)
ETC: 
HDE: 
HDEF_1712(rpoS)
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XBJ1_3581(rpoS)
XNE: 
XNC1_3846(rpoS)
PAM: 
PANA_3042(rpoS)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_2317(rpoS)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_2436(rpoS)
PAO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
MMK: 
ROR: 
EBF: 
VCH: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VVU: 
VV1_1588(rpoS)
VVY: 
VVM: 
VPA: 
VPB: 
VHA: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VFI: 
VF_2067(rpoS) VF_A1015(rpoQ)
VFM: 
VSA: 
PPR: 
VAN: 
PAE: 
PA3622(rpoS)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PPU: 
PP_1623(rpoS)
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_4974(rpoS)
PPUH: 
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSP: 
PFL: 
PFL_1207(rpoS)
PFO: 
PFS: 
PFLU1302(rpoS)
PFE: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN4189(rpoS)
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PST_1572(rpoS)
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PBA: 
PFV: 
PDR: 
CJA: 
CJA_2218(rpoS)
AVN: 
AVL: 
AVD: 
SON: 
SO_3432(rpoS)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
SVI_3167(rpoS)
ILO: 
IL0745(rpoS)
CPS: 
CPS_1079(rpoS)
PHA: 
PSHAa0691(rpoS)
PAT: 
PSM: 
PSM_A2370(rpoS)
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMK: 
AMAA: 
ALT: 
GAG: 
GNI: 
GNIT_2922(rpoS)
GPS: 
PIN: 
Ping_0677(rpoS)
PSY: 
TTU: 
FBL: 
CBU: 
CBU_1669(rpoS)
CBS: 
CBD: 
CBUD_0331(rpoS)
CBG: 
CbuG_0351(rpoS)
CBC: 
CbuK_0341(rpoS.1)
LPN: 
lpg1284(rpoS)
LPU: 
LPF: 
lpl1247(rpoS)
LPP: 
lpp1247(rpoS)
LPC: 
LPC_0709(rpoS)
LPA: 
lpa_01916(rpoS)
LPE: 
LLO: 
LLO_1151(rpoS)
MMT: 
MAH: 
CYQ: 
Q91_1041(rpoS)
NOC: 
NHL: 
NWA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
AEH: 
HHA: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_2954(rpoS_[H])
HNA: 
HCH: 
HCH_01877(rpoS)
CSA: 
HEL: 
HELO_3610(rpoS)
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
AHA: 
AHA_0830(rpoS)
ASA: 
ASA_3466(rpoS)
AVR: 
TAU: 
OCE: 
AFE: 
AFR: 
ACU: 
AFI: 
SAGA: 
GPB: 
CVI: 
CV_3682(rpoS)
LHK: 
LHK_00353(rpoS)
PSE: 
NH8B_0664(rpoS)
RSO: 
RSc1207(rpoS)
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RPI: 
RPF: 
REU: 
REH: 
H16_A2373(rpoS)
RME: 
Rmet_2115(rpoS)
CTI: 
CNC: 
BMA: 
BMA1354(rpoS)
BMV: 
BML: 
BMN: 
BPS: 
BPSL1505(rpoS)
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPZ: 
BPQ: 
BTE: 
BVI: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCAL1892(rpoS)
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BCT: 
BXE: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BRH: 
BGD: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
RFR: 
VAP: 
VPE: 
RTA: 
Rta_24400(rpoS)
MPT: 
HAR: 
HEAR1257(rpoS)
MMS: 
mma_2134(rpoS)
HSE: 
CFU: 
CFU_1909(rpoS)
TIN: 
THI: 
THI_0423(rpoS)
RGE: 
RGE_33330(rpoS)
NMU: 
EBA: 
ebA778(rpoS)
AZO: 
azo1090(rpoS)
AZA: 
AZKH_3526(rpoS)
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
TBD: 
APP: 
BSUB: 
CAC: 
CA_C1226(sigA)
CAE: 
SMB_G1247(sigB)
CAY: 
CEA_G1239(sigA)
EEL: 
ERT: 
MTU: 
Rv2710(sigB)
MTV: 
MTC: 
MT2783(sigB)
MRA: 
MRA_2738(sigB)
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTZ: 
MTI: 
MTE: 
MTL: 
MTO: 
MTD: 
UDA_2710(sigB)
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
MBO: 
Mb2729(sigB)
MBB: 
BCG_2723(sigB)
MBT: 
JTY_2717(sigB)
MBM: 
MBK: 
MAF: 
MAF_27140(sigB)
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MLE: 
MLB: 
MPA: 
MAP2826(sigB)
MAV: 
MIT: 
MIR: 
MIA: 
MID: 
MSM: 
MSG: 
MSA: 
MUL: 
MUL_3350(sigB)
MVA: 
MGI: 
MSP: 
MAB: 
MMV: 
MMC: 
MKM: 
MJL: 
MJD: 
MMI: 
MMAR_2003(sigB)
MRH: 
MMM: 
MCB: 
MLI: 
ASD: 
AS9A_1756(sigB)
CGL: 
NCgl1844(Cgl1919)
CGB: 
cg2102(sigB)
CGU: 
WA5_1844(SigB)
CGT: 
CEF: 
CE1811(sigB)
CDI: 
DIP1413(sigB)
CDP: 
CDH: 
CDT: 
CDE: 
CDR: 
CDA: 
CDZ: 
CDB: 
CDS: 
CDD: 
CDW: 
CDV: 
CJK: 
jk1094(sigB)
CUR: 
CUA: 
CAR: 
CKP: 
CPU: 
CPL: 
CPG: 
CPP: 
CPK: 
CPQ: 
CPX: 
CPZ: 
COR: 
COP: 
Cp31_1226(sigB)
COD: 
COS: 
COI: 
COE: 
COU: 
CRD: 
CRES_1185(sigB)
CUL: 
CUC: 
CUE: 
CVA: 
CVAR_1587(sigB)
CHN: 
CCN: 
NFA: 
nfa37750(sigB)
NCY: 
NBR: 
RHA: 
RER: 
RER_28040(sigB)
ROP: 
ROP_67980(sigB)
REQ: 
REQ_20170(sigB)
GBR: 
GPO: 
GOR: 
TPR: 
SRT: 
SCO: 
SCO0895(hrdC)
PFR: 
NML: 
GOB: 
BSD: 
MMAR: 
SEN: 
SACE_1786(sigB)
SVI: 
AMD: 
AMED_2568(rpoS)
AMN: 
AMM: 
AMES_2540(rpoS)
PDX: 
AMI: 
SESP: 
BN6_17770(sigB)
SAQ: 
MAU: 
MIL: 
ASE: 
ACPL_7139(sigB)
BBU: 
BB_0771(rpoS)
BBZ: 
BBN: 
BBJ: 
BGA: 
BG0794(rpoS)
BGB: 
KK9_0806(rpoS)
BGN: 
BAF: 
BAFZ: 
BAFH: 
BBS: 
BTU: 
BHR: 
BDU: 
BDU_775(rpoS)
BRE: 
BRE_778(rpoS)
BCW: 
TPA: 
TPP: 
TPU: 
TPH: 
TPO: 
TPC: 
TPG: 
TPM: 
TPL: 
TPCCA_1012(rpoD2)
SYN: 
sll0184(rpoD) sll0306(rpoD) sll1689(rpoD) sll2012(rpoD)
SYZ: 
MYO_111450(rpoD) MYO_120770(rpoD) MYO_124810(rpoD)
SYY: 
SYT: 
SYS: 
SYQ: 
SYW: 
SYC: 
syc0857_c(rpoD3) syc2245_c(rpoD5) syc2345_d(rpoD2)
SYF: 
SYD: 
SYE: 
SYG: 
SYR: 
SYX: 
SYP: 
CYA: 
CYB: 
SYNE: 
SYNP: 
TEL: 
tll0831(sigB) tlr0264(sigD) tlr0499(sigC)
MAR: 
CYT: 
cce_0644(sigB) cce_1873(sigC) cce_3594(sigD)
CYP: 
CYC: 
CYN: 
CYH: 
CYJ: 
AMR: 
AM1_1305(rpoD) AM1_2109(rpoD) AM1_2340(rpoD) AM1_3234(rpoD) AM1_3925(rpoD) AM1_4586(rpoD) AM1_B0294 AM1_D0201(rpoD)
CGC: 
CAN: 
CSN: 
DSL: 
HAO: 
GLP: 
CMP: 
CYU: 
GVI: 
ANA: 
all1692(sigC) all7179 all7608 all7615(sigB) alr3800(sigE) alr3810(sigD) alr4249(sigF)
NPU: 
NOS: 
NOP: 
AVA: 
ANB: 
ANA_C12371(sigC) ANA_C12545(sigD) ANA_C20343(sigB)
ACY: 
NAZ: 
CSG: 
CALO: 
CALT: 
RIV: 
PMA: 
Pro1791(rpoD)
PMM: 
PMT: 
PMN: 
PMI: 
PMB: 
PMC: 
PMF: 
PMG: 
PMH: 
PMJ: 
PME: 
TER: 
LEP: 
GEI: 
OAC: 
ONI: 
PSEU: 
CEP: 
MIC: 
ARP: 
CTHE: 
PLP: 
SCS: 
NDE: 
NIDE1246(rpoS)
DAP: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:11208809 (Synechocystis)
  Authors
Muro-Pastor AM, Herrero A, Flores E
  Title
Nitrogen-regulated group 2 sigma factor from Synechocystis sp. strain PCC 6803 involved in survival under nitrogen stress.
  Journal
J Bacteriol 183:1090-5 (2001)
Reference
  Authors
Potvin E, Sanschagrin F, Levesque RC
  Title
Sigma factors in Pseudomonas aeruginosa.
  Journal
FEMS Microbiol Rev 32:38-55 (2008)

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