KEGG   ORTHOLOGY: K03514Help
Entry
K03514                      KO                                     

Name
PAPD5_7, TRF4
Definition
non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7 [EC:2.7.7.19]
Pathway
RNA degradation
Module
M00393  
TRAMP complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00393  TRAMP complex
     K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.19  polynucleotide adenylyltransferase
     K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic Type
  tRNA degradation factors
   TRAMP complex
    K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
BRITE hierarchy
Other DBs
GO: 
Genes
HSA: 
11044(PAPD7) 64282(PAPD5)
PTR: 
461712(PAPD7) 465160(PAPD5)
PPS: 
100977699(PAPD5) 100977847(PAPD7)
GGO: 
PON: 
100438688(PAPD5) 100444704(PAPD7)
MCC: 
694589(PAPD5) 713853(PAPD7)
MCF: 
102127649(PAPD7) 102143902(PAPD5)
MMU: 
210106(Papd7) 214627(Papd5)
RNO: 
306672(Papd7) 307745(Papd5)
CGE: 
100759123(Papd5) 100760867(Papd7)
HGL: 
101713227(Papd5) 101716019(Papd7)
TUP: 
102488557(PAPD5) 102494700(PAPD7)
CFA: 
478131(PAPD5) 488057(PAPD7)
AML: 
FCA: 
101094571(PAPD7) 101096123(PAPD5)
PTG: 
102952497(PAPD7) 102955869(PAPD5)
BTA: 
523016(PAPD7) 789894(PAPD5)
BOM: 
102267140(PAPD7) 102267247(PAPD5)
PHD: 
102326406(PAPD5) 102328616(PAPD7)
CHX: 
102172200(PAPD7) 102177827(PAPD5)
SSC: 
100517864(PAPD7) 100625961(PAPD5)
CFR: 
102510602(PAPD7) 102524345(PAPD5)
BACU: 
102997174(PAPD7) 102998922(PAPD5)
LVE: 
103069908(PAPD7) 103078951(PAPD5)
ECB: 
100058454(PAPD5) 100071429(PAPD7)
MYB: 
102242396(PAPD7) 102247320(PAPD5)
MYD: 
102760124(PAPD5) 102773524(PAPD7)
PALE: 
102881109(PAPD5) 102888755(PAPD7)
MDO: 
100018235(PAPD7) 100617010(PAPD5)
SHR: 
100921222(PAPD7) 100929023(PAPD5)
OAA: 
100076181(PAPD5) 100089694(PAPD7)
GGA: 
415733(PAPD5) 770425(PAPD7)
MGP: 
TGU: 
100220882(PAPD7) 100231411(PAPD5)
FAB: 
101808596(PAPD7) 101816203(PAPD5)
PHI: 
102109362(PAPD5) 102110112(PAPD7)
APLA: 
101790626(PAPD7) 101794381(PAPD5)
FPG: 
101910477(PAPD7) 101912209(PAPD5)
FCH: 
102047156(PAPD7) 102057536(PAPD5)
CLV: 
102085887(PAPD7) 102090287(PAPD5)
ASN: 
102379771(PAPD7) 102387872(PAPD5)
AMJ: 
102563533(PAPD5) 102564760(PAPD7)
PSS: 
102449378(PAPD7) 102449438(PAPD5)
CMY: 
102941127(PAPD7) 102946010(PAPD5)
ACS: 
PBI: 
103065100(PAPD7) 103066949(PAPD5)
XTR: 
100491336(papd5)
DRE: 
557829(papd7) 568678
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102351320(PAPD5)
CMK: 
103176080(papd5) 103183193(papd7)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
Dmel_CG11265(Trf4-1) Dmel_CG17462(Trf4-2)
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
NVI: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
BMY: 
LOA: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
CAM: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os06t0669275-00(Os06g0669275)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_03g030810(SORBIDRAFT_03g030810)
SITA: 
ATR: 
s00058p00123890(AMTR_s00058p00123890)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
BPG: 
CSL: 
CVR: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YOL115W(PAP2)
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0C04670(NCAS0C04670)
NDI: 
NDAI_0G04030(NDAI0G04030)
TPF: 
TPHA_0P01280(TPHA0P01280)
TBL: 
TBLA_0B08530(TBLA0B08530)
TDL: 
TDEL_0E00670(TDEL0E00670)
KAF: 
KAFR_0C01610(KAFR0C01610)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
LEL: 
SPAA: 
CAL: 
CaO19.429(TRF4) CaO19.8059(TRF4)
CTP: 
CDU: 
COT: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_182174(AO090005000098)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
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PPL: 
LBC: 
MPR: 
CCI: 
SCM: 
UMA: 
MGL: 
PGR: 
ECU: 
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EHE: 
DPP: 
DFA: 
EHI: 
EHI_003910(370.t00004) EHI_073170(436.t00002) EHI_087330(406.t00005)
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ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_III006620(17.m07586)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
TPS: 
PIF: 
NGD: 
EHX: 
GTT: 
TCR: 
NGR: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Rammelt C, Bilen B, Zavolan M, Keller W
  Title
PAPD5, a noncanonical poly(A) polymerase with an unusual RNA-binding motif.
  Journal
RNA 17:1737-46 (2011)
Reference
  Authors
Ogami K, Cho R, Hoshino S
  Title
Molecular cloning and characterization of a novel isoform of the non-canonical poly(A) polymerase PAPD7.
  Journal
Biochem Biophys Res Commun 432:135-40 (2013)

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