KEGG   ORTHOLOGY: K03514Help
Entry
K03514                      KO                                     

Name
PAPD5_7, TRF4
Definition
non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7 [EC:2.7.7.19]
Pathway
ko03018  RNA degradation
Module
M00393  TRAMP complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00393  TRAMP complex
     K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.19  polynucleotide adenylyltransferase
     K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    TRAMP complex
     K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic Type
  tRNA degradation factors
   TRAMP complex
    K03514  PAPD5_7, TRF4; non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5/7
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG5260
GO: 0004652
Genes
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PTR: 461712(PAPD7) 465160(PAPD5)
PPS: 100977699(PAPD5) 100977847(PAPD7)
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MCC: 694589(PAPD5) 713853(PAPD7)
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Rammelt C, Bilen B, Zavolan M, Keller W
  Title
PAPD5, a noncanonical poly(A) polymerase with an unusual RNA-binding motif.
  Journal
RNA 17:1737-46 (2011)
DOI:10.1261/rna.2787011
  Sequence
[hsa:64282]
Reference
  Authors
Ogami K, Cho R, Hoshino S
  Title
Molecular cloning and characterization of a novel isoform of the non-canonical poly(A) polymerase PAPD7.
  Journal
Biochem Biophys Res Commun 432:135-40 (2013)
DOI:10.1016/j.bbrc.2013.01.072
  Sequence
[hsa:11044]

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