KEGG   ORTHOLOGY: K03681Help
Entry
K03681                      KO                                     

Name
RRP40, EXOSC3
Definition
exosome complex component RRP40
Pathway
RNA degradation
Module
M00391  
Exosome, eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K03681  RRP40, EXOSC3; exosome complex component RRP40
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00391  Exosome, eukaryotes
     K03681  RRP40, EXOSC3; exosome complex component RRP40
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
51010(EXOSC3)
PTR: 
465105(EXOSC3)
PPS: 
100983326(EXOSC3)
GGO: 
101134852(EXOSC3)
PON: 
100453226(EXOSC3)
MCC: 
716347(EXOSC3)
MCF: 
102139045(EXOSC3)
MMU: 
66362(Exosc3)
RNO: 
313243(Exosc3)
CGE: 
100753640(Exosc3)
HGL: 
101707251(Exosc3)
TUP: 
102473629(EXOSC3)
CFA: 
481616(EXOSC3)
AML: 
FCA: 
101081087(EXOSC3)
PTG: 
102957996(EXOSC3)
BTA: 
533245(EXOSC3)
BOM: 
102285568(EXOSC3)
PHD: 
102331806(EXOSC3)
CHX: 
102189674(EXOSC3)
OAS: 
101106397(EXOSC3)
SSC: 
100152421(EXOSC3)
CFR: 
102523942(EXOSC3)
BACU: 
103014266(EXOSC3)
LVE: 
103073587(EXOSC3)
ECB: 
100055153(EXOSC3)
MYB: 
102254667(EXOSC3)
MYD: 
102767746(EXOSC3)
PALE: 
102886649(EXOSC3)
MDO: 
100018999(EXOSC3)
SHR: 
100929981(EXOSC3)
OAA: 
100080422(EXOSC3)
GGA: 
423626(EXOSC3)
MGP: 
FAB: 
PHI: 
APLA: 
FPG: 
FCH: 
CLV: 
ASN: 
AMJ: 
PSS: 
CMY: 
ACS: 
100562168(exosc3)
PBI: 
XLA: 
734370(exosc3)
XTR: 
DRE: 
565000(exosc3)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102352091(EXOSC3)
CMK: 
103177664(exosc3)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
413313(Rrp40)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
100301502(Rrp40)
API: 
100575257(ACYPI56194)
PHU: 
CEL: 
CELE_F59C6.4(exos-3)
CBR: 
CBG02224(Cbr-exos-3)
BMY: 
LOA: 
NVE: 
HMG: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0012s08180g(POPTRDRAFT_728586) POPTR_0015s08670g(POPTRDRAFT_575149)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0661400-01(Os01g0661400) Os01t0891400-01(Os01g0891400)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_03g030230(SORBIDRAFT_03g030230)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00009p00262150(AMTR_s00009p00262150)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
BPG: 
MIS: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YOL142W(RRP40)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0C04310(NCAS0C04310)
NDI: 
NDAI_0G03750(NDAI0G03750)
TPF: 
TPHA_0P01550(TPHA0P01550)
TBL: 
TBLA_0H00160(TBLA0H00160)
TDL: 
TDEL_0A00320(TDEL0A00320)
KAF: 
KAFR_0I02920(KAFR0I02920)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CaO19.10814(RRP40) CaO19.3304(RRP40)
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_876054(AO090011000514)
ANG: 
ANI_1_1924064(An07g06510)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
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ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
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NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
DSQ: 
SHS: 
PCO: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT74231(AGABI1DRAFT_74231)
ABV: 
AGABI2DRAFT207051(AGABI2DRAFT_207051)
CPUT: 
SLA: 
PFP: 
MGL: 
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DDI: 
DPP: 
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EHI: 
EHI_004770(203.t00019)
EDI: 
ACAN: 
PFD: 
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BBOV_III004170(17.m07379)
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TCR: 
LMA: 
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LMI: 
LBZ: 
NGR: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Wang HW, Wang J, Ding F, Callahan K, Bratkowski MA, Butler JS, Nogales E, Ke A
  Title
Architecture of the yeast Rrp44 exosome complex suggests routes of RNA recruitment for 3' end processing.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 104:16844-9 (2007)
  Sequence
[sce:YOL142W]
Reference
  Authors
Mukherjee D, Gao M, O'Connor JP, Raijmakers R, Pruijn G, Lutz CS, Wilusz J
  Title
The mammalian exosome mediates the efficient degradation of mRNAs that contain AU-rich elements.
  Journal
EMBO J 21:165-74 (2002)
  Sequence
[hsa:51010]

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