KEGG   ORTHOLOGY: K05592Help
Entry
K05592                      KO                                     

Name
deaD, cshA
Definition
ATP-dependent RNA helicase DeaD [EC:3.6.4.13]
Pathway
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K05592  deaD, cshA; ATP-dependent RNA helicase DeaD
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K05592  deaD, cshA; ATP-dependent RNA helicase DeaD
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic Type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Helicases
     K05592  deaD, cshA; ATP-dependent RNA helicase DeaD
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Prokaryotic Type
  rRNA helicases
   K05592  deaD, cshA; ATP-dependent RNA helicase DeaD
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
GO: 
Genes
ECO: 
b3162(deaD)
ECJ: 
Y75_p3084(deaD)
ECD: 
EBW: 
BWG_2866(deaD)
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Z4523(deaD)
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ECSP_4137(deaD)
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c3916(deaD)
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ECR: 
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CE10_3692(deaD)
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LF82_0457(dead)
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STM3280.S(deaD)
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bbp335(deaD)
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Sant_3447(deaD)
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EAR: 
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ES15_3508(deaD)
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CTU_04160(deaD)
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KPN_03570(deaD)
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KP1_4878(deaD)
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KPK: 
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KPR_4765(deaD)
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ROD_46701(deaD)
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SCc_049(deaD)
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PMI3424(deaD)
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Bfl109(deaD)
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PAJ_3611(deaD)
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MPC_147(deaD)
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DR96_732(deaD)
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CEN: 
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PSTS: 
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HI0231(deaD)
HIT: 
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HIL: 
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XFS: 
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XCC2642(deaD)
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XCA: 
XCP: 
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XCV2974(deaD)
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XAC2813(deaD)
XCI: 
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XACM_2757(deaD)
XAO: 
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XOO1550(deaD)
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XOR: 
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XALc_2052(deaD)
XFU: 
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Smlt1461(deaD)
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_1296(deaD)
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
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VCH: 
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VCR: 
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VCI: 
VCL: 
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VAN: 
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VF_A0384(deaD)
VFM: 
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PPR: 
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PNC: 
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PRP: 
PAEP: 
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PAEM: 
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PAES: 
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PPU: 
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PPT: 
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T1E_0505(deaD)
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PP4_39160(deaD)
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PPUU: 
PST: 
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PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_4251(deaD)
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PFLU1726(deaD)
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PSZ: 
PSR: 
PSC: 
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CJA_1979(deaD-1)
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SBB: 
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SPC: 
SHP: 
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SPL: 
SHE: 
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SWP: 
SVO: 
SVI_3730(deaD)
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IL1991(deaD)
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CPS_1726(deaD)
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PSHAa0990(deaD)
PAT: 
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PSM_A1057(deaD)
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MARHY0816(deaD)
MAD: 
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AMAL: 
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FTF1471c(deaD)
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TVNIR_3767(deaD_[H])
HNA: 
HCH: 
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ABO_1695(deaD)
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THI_2598(deaD)
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azo2122(deaD)
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jhp0232(deaD)
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HPS: 
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HPM: 
HPE: 
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HEQ: 
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KHP_0246(deaD)
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Hac_1370(deaD)
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SKU: 
SULR: 
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NIS_1709(deaD)
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Pcar_0328(dbpA)
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DVM: 
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S23_26940(csdA)
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MNO: 
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MSL: 
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JAN: 
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KVL: 
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BSX: 
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BSP: 
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BL02197(ydbR)
BLD: 
BLi00546(cshA)
BLH: 
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BAMF_0435(cshA)
BAY: 
BAQ: 
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BAMF: 
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BAI: 
BAX: 
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BCE: 
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BCB: 
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bwei_2552(deaD) bwei_5496(cshA)
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BPUM: 
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SUJ: 
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MS7_2097(cshA)
SUD: 
SUX: 
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SUG: 
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SAUU: 
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SAB: 
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SSP: 
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CBO2802(csdA)
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CLB: 
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CLT: 
AMT: 
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CCT: 
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EEL: 
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MCZ: 
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MAP2521c(deaD)
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MIT: 
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MSM: 
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MSP: 
MAB: 
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MMC: 
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MMAR_4189(deaD)
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MCB: 
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MKN: 
MNE: 
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AS9A_3314(deaD)
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NCgl1109(Cgl1156)
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DIP1018(deaD)
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jk1366(deaD)
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CPU: 
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PMN: 
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TME: 
TAF: 
FNO: 
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PMO: 
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FGI: 
DIN: 
DDF: 
CNI: 
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:10591847 (Synechocystis)
  Authors
Vinnemeier J, Hagemann M
  Title
Identification of salt-regulated genes in the genome of the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803 by subtractive RNA hybridization.
  Journal
Arch Microbiol 172:377-86 (1999)
Reference
  Authors
Prud'homme-Genereux A, Beran RK, Iost I, Ramey CS, Mackie GA, Simons RW
  Title
Physical and functional interactions among RNase E, polynucleotide phosphorylase and the cold-shock protein, CsdA: evidence for a 'cold shock degradosome'.
  Journal
Mol Microbiol 54:1409-21 (2004)
  Sequence
[ecj:Y75_p3084] [eco:b3162]

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