KEGG   ORTHOLOGY: K10802Help
Entry
K10802                      KO                                     

Name
HMGB1
Definition
high mobility group protein B1
Pathway
Base excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Replication and repair
   03410 Base excision repair
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
Chromosome [BR:ko03036]
 Eukaryotic Type
  Nucleosome assembly factors
   HMG (high mobility group) proteins
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic Type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    Other BER factors
     K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
   MMR (mismatch exicision repair)
    Other MMR factors
     K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of colorectal cancer cells
   K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
3146(HMGB1)
PTR: 
452518(HMGB1) 736904(HMGB1P1) 749521 749557
PPS: 
GGO: 
PON: 
MCC: 
MCF: 
MMU: 
100862258(Gm21596) 15289(Hmgb1) 385454(Gm5396) 619937(Gm6115)
RNO: 
100365478 25459(Hmgb1) 497907(RGD1563668) 679571(Hmg1l1) 685520 690521
CGE: 
HGL: 
TUP: 
CFA: 
403170(HMGB1) 609805
AML: 
FCA: 
PTG: 
BTA: 
282691(HMGB1)
BOM: 
102267614(HMGB1)
PHD: 
CHX: 
OAS: 
SSC: 
445521(HMGB1)
CFR: 
BACU: 
103011749(HMGB1)
LVE: 
103077348(HMGB1)
ECB: 
MYB: 
MYD: 
PALE: 
102882684(HMGB1)
MDO: 
100020248(HMGB1)
SHR: 
100932515(HMGB1)
OAA: 
100078150(HMGB1)
GGA: 
395724(HMGB1)
MGP: 
APLA: 
101797353(HMGB1)
TGU: 
100230146(HMGB1)
FAB: 
101821040(HMGB1)
PHI: 
102109700(HMGB1)
FPG: 
101917614(HMGB1)
FCH: 
102059204(HMGB1)
CLV: 
102092823(HMGB1)
ASN: 
AMJ: 
PSS: 
102454149(HMGB1)
CMY: 
102935166(HMGB1)
PBI: 
103050122(HMGB1)
XLA: 
380530(hmgb1) 398054(hmg-1)
XTR: 
394834(hmgb1)
DRE: 
321622(hmgb1a) 795095(hmgb1b)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102366474(HMGB1)
CMK: 
103180230(hmgb2) 103183237(hmgb1)
BFO: 
CIN: 
778643(hmg1/2)
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
725551(Dsp1)
NVI: 
100122354(Dsp1)
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CBR: 
CBG17468(Cbr-hmg-1.2)
BMY: 
LOA: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
AQU: 
ATH: 
AT3G51880(HMGB1)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0008s06730g(POPTRDRAFT_656232) POPTR_0010s19720g(POPTRDRAFT_822396)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os06t0728000-01(Os06g0728000)
OBR: 
BDI: 
ZMA: 
100381276(HMG13)
SITA: 
ATR: 
s00029p00240750(AMTR_s00029p00240750) s00044p00160130(AMTR_s00044p00160130)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
AGO: 
DFA: 
DFA_02761(nhp6)
ACAN: 
GTT: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:9184213
  Authors
van Gent DC, Hiom K, Paull TT, Gellert M
  Title
Stimulation of V(D)J cleavage by high mobility group proteins.
  Journal
EMBO J 16:2665-70 (1997)
  Sequence

DBGET integrated database retrieval system