KEGG   ORTHOLOGY: K11600Help
Entry
K11600                      KO                                     

Name
RRP41, EXOSC4, SKI6
Definition
exosome complex component RRP41
Pathway
RNA degradation
Module
M00390  
Exosome, archaea
M00391  
Exosome, eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K11600  RRP41, EXOSC4, SKI6; exosome complex component RRP41
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00390  Exosome, archaea
     K11600  RRP41, EXOSC4, SKI6; exosome complex component RRP41
    M00391  Exosome, eukaryotes
     K11600  RRP41, EXOSC4, SKI6; exosome complex component RRP41
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
54512(EXOSC4)
PTR: 
740889(EXOSC4)
PPS: 
100967791(EXOSC4)
GGO: 
PON: 
100458925(EXOSC4)
MCC: 
700012(EXOSC4)
MCF: 
102144723(EXOSC4)
MMU: 
109075(Exosc4)
RNO: 
300045(Exosc4)
CGE: 
100766618(Exosc4)
HGL: 
101703302(Exosc4)
TUP: 
102470676(EXOSC4)
CFA: 
482086(EXOSC4)
AML: 
FCA: 
101100867(EXOSC4)
PTG: 
102954582(EXOSC4)
BTA: 
618292(EXOSC4)
BOM: 
102269917(EXOSC4)
PHD: 
102331167(EXOSC4)
CHX: 
102171352(EXOSC4)
OAS: 
101115548(EXOSC4)
SSC: 
100511875(EXOSC4)
CFR: 
102504123(EXOSC4)
BACU: 
103000766(EXOSC4)
LVE: 
103082704(EXOSC4)
ECB: 
100063419(EXOSC4)
MYD: 
102771688(EXOSC4)
PALE: 
102886998(EXOSC4)
MDO: 
100015142(EXOSC4)
SHR: 
100921225(EXOSC4)
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100093511(EXOSC4)
PHI: 
102103166(EXOSC4)
APLA: 
FPG: 
101916922(EXOSC4)
ASN: 
102375078(EXOSC4)
AMJ: 
102558508(EXOSC4)
PSS: 
CMY: 
ACS: 
XLA: 
495942(exosc4)
XTR: 
549190(exosc4)
DRE: 
393712(exosc4)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102355213(EXOSC4)
CMK: 
103179688(exosc4)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
412345(GB17566)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CBR: 
CBG01825(Cbr-exos-4.1)
BMY: 
LOA: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT3G61620(RRP41)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0014s09000g(POPTRDRAFT_834773)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os09t0252000-00(Os09g0252000)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_09g022550(SORBIDRAFT_09g022550) SORBI_09g028170(SORBIDRAFT_09g028170)
ZMA: 
100192964(rph1)
SITA: 
ATR: 
s00030p00070290(AMTR_s00030p00070290)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YGR195W(SKI6)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0D01780(NCAS0D01780)
NDI: 
NDAI_0C02930(NDAI0C02930)
TPF: 
TPHA_0J03200(TPHA0J03200)
TBL: 
TBLA_0H02430(TBLA0H02430)
TDL: 
TDEL_0E04840(TDEL0E04840)
KAF: 
KAFR_0E01920(KAFR0E01920)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_366094(AO090120000212)
ANG: 
ANI_1_1032064(An07g08320)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
DSQ: 
PCO: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT101423(AGABI1DRAFT_101423)
ABV: 
AGABI2DRAFT191204(AGABI2DRAFT_191204)
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
NCE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
EHI: 
EHI_040320(144.t00006)
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_IV005940(23.m05757)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
NGD: 
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GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
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NGR: 
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MMA: 
MMAZ: 
MBU: 
MMH: 
MEV: 
MZH: 
MPY: 
MHZ: 
MTP: 
MCJ: 
MHI: 
MPD: 
MEZ: 
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RCIX2124(rrp41p)
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MTH: 
MMG: 
MST: 
MSI: 
MRU: 
mru_1353(rrp41)
MEB: 
Abm4_0919(rrp41)
MEL: 
MEW: 
METH: 
MFV: 
MKA: 
MK0381(Rph)
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AF0493(rph)
APO: 
AVE: 
AST: 
FPL: 
TAC: 
TVO: 
PTO: 
FAC: 
TAR: 
PHO: 
PAB: 
PAB0420(rph)
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PFI: 
PYN: 
PYA: 
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TON: 
TGA: 
TGAM_2036(rrp41p)
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TBA: 
THE: 
THA: 
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TLT: 
THS: 
TNU: 
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ACF: 
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SMR: 
SHC: 
IHO: 
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PFM: 
SSO: 
SSO0735(rph)
SOL: 
STO: 
SAI: 
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SACS: 
SIS: 
SIA: 
SIM: 
SID: 
SIY: 
SIN: 
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SIR: 
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AHO: 
PAI: 
PIS: 
PCL: 
PAS: 
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POG: 
TNE: 
CMA: 
TUZ: 
TTN: 
VDI: 
VMO: 
TPE: 
THB: 
ASC: 
CLG: 
FFO: 
NMR: 
NIR: 
NKR: 
CSY: 
NGA: 
CSU: 
NEQ: 
KCR: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Wang HW, Wang J, Ding F, Callahan K, Bratkowski MA, Butler JS, Nogales E, Ke A
  Title
Architecture of the yeast Rrp44 exosome complex suggests routes of RNA recruitment for 3' end processing.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 104:16844-9 (2007)
  Sequence
[sce:YGR195W]
Reference
  Authors
Anderson JR, Mukherjee D, Muthukumaraswamy K, Moraes KC, Wilusz CJ, Wilusz J
  Title
Sequence-specific RNA binding mediated by the RNase PH domain of components of the exosome.
  Journal
RNA 12:1810-6 (2006)
  Sequence
[hsa:54512]

DBGET integrated database retrieval system