KEGG   ORTHOLOGY: K12586Help
Entry
K12586                      KO                                     

Name
RRP43, EXOSC8, OIP2
Definition
exosome complex component RRP43
Pathway
RNA degradation
Module
M00391  
Exosome, eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12586  RRP43, EXOSC8, OIP2; exosome complex component RRP43
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00391  Exosome, eukaryotes
     K12586  RRP43, EXOSC8, OIP2; exosome complex component RRP43
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
HSA: 
11340(EXOSC8)
PTR: 
467263(EXOSC8)
PPS: 
100987406(EXOSC8)
GGO: 
101141467(EXOSC8)
PON: 
100447360(EXOSC8)
NLE: 
100585514(EXOSC8)
MCC: 
695071(EXOSC8)
MCF: 
102136151(EXOSC8)
CJC: 
100407072(EXOSC8)
MMU: 
69639(Exosc8)
RNO: 
295050(Exosc8)
CGE: 
100769802(Exosc8)
NGI: 
103745211(Exosc8)
HGL: 
101714894(Exosc8)
OCU: 
100341983(EXOSC8)
TUP: 
102494650(EXOSC8)
CFA: 
477300(EXOSC8)
AML: 
UMR: 
103664379(EXOSC8)
FCA: 
101088543(EXOSC8)
PTG: 
102949384(EXOSC8)
BTA: 
532080(EXOSC8)
BOM: 
102278839(EXOSC8)
PHD: 
102337563(EXOSC8)
CHX: 
102174040(EXOSC8)
OAS: 
101104834(EXOSC8)
SSC: 
100157236(EXOSC8)
CFR: 
102515521(EXOSC8)
BACU: 
103016311(EXOSC8)
LVE: 
103068827(EXOSC8)
ECB: 
100062567(EXOSC8)
MYB: 
MYD: 
102774067(EXOSC8)
PALE: 
102887265(EXOSC8)
MDO: 
100021240(EXOSC8)
SHR: 
100921939(EXOSC8)
OAA: 
100080908(EXOSC8)
GGA: 
100858560(EXOSC8)
MGP: 
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101799603(EXOSC8)
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100226285(EXOSC8)
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101813590(EXOSC8)
PHI: 
102113719(EXOSC8)
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101911348(EXOSC8)
FCH: 
102054250(EXOSC8)
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102088762(EXOSC8)
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102367882(EXOSC8)
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102570790(EXOSC8)
PSS: 
102448561(EXOSC8)
CMY: 
102944416(EXOSC8)
ACS: 
100565161(exosc8)
PBI: 
103052220(EXOSC8)
XLA: 
379078(exosc8) 496046
XTR: 
493300(exosc8)
DRE: 
323016(exosc8)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102366724(EXOSC8)
CMK: 
103177187(exosc8)
CIN: 
SPU: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
551606(GB19173)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0006s04970g(POPTRDRAFT_560507) POPTR_0016s05590g(POPTRDRAFT_576355)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os11t0311300-01(Os11g0311300)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_07g026060(SORBIDRAFT_07g026060)
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
MUS: 
ATR: 
s00025p00117140(AMTR_s00025p00117140)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YCR035C(RRP43)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B08510(NCAS0B08510)
NDI: 
NDAI_0A00720(NDAI0A00720)
TPF: 
TPHA_0A02560(TPHA0A02560) TPHA_0E03560(TPHA0E03560)
TBL: 
TBLA_0C06020(TBLA0C06020) TBLA_0J01240(TBLA0J01240)
TDL: 
TDEL_0C05620(TDEL0C05620)
KAF: 
KAFR_0G00230(KAFR0G00230)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CaO19.6259(RRP43)
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
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NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
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VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_170094(AO090120000101)
ANG: 
ANI_1_1044104(An12g08670)
ACT: 
NFI: 
PCS: 
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TML: 
SPO: 
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MPR: 
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AGABI2DRAFT195867(AGABI2DRAFT_195867)
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MBR: 
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TAN: 
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BBO: 
BBOV_III007030(17.m10569)
BEQ: 
TGO: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
NGR: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Wang HW, Wang J, Ding F, Callahan K, Bratkowski MA, Butler JS, Nogales E, Ke A
  Title
Architecture of the yeast Rrp44 exosome complex suggests routes of RNA recruitment for 3' end processing.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 104:16844-9 (2007)
  Sequence
[sce:YCR035C]
Reference
  Authors
Anderson JR, Mukherjee D, Muthukumaraswamy K, Moraes KC, Wilusz CJ, Wilusz J
  Title
Sequence-specific RNA binding mediated by the RNase PH domain of components of the exosome.
  Journal
RNA 12:1810-6 (2006)
  Sequence
[hsa:11340]

DBGET integrated database retrieval system