KEGG   ORTHOLOGY: K12589Help
Entry
K12589                      KO                                     

Name
RRP42, EXOSC7
Definition
exosome complex component RRP42
Pathway
RNA degradation
Module
M00390  
Exosome, archaea
M00391  
Exosome, eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12589  RRP42, EXOSC7; exosome complex component RRP42
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00390  Exosome, archaea
     K12589  RRP42, EXOSC7; exosome complex component RRP42
    M00391  Exosome, eukaryotes
     K12589  RRP42, EXOSC7; exosome complex component RRP42
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
23016(EXOSC7)
PTR: 
460313(EXOSC7)
PPS: 
GGO: 
101137532(EXOSC7)
PON: 
100458989(EXOSC7)
MCC: 
714624(EXOSC7)
MCF: 
102127831(EXOSC7)
MMU: 
66446(Exosc7)
RNO: 
316098(Exosc7)
CGE: 
100763217(Exosc7)
HGL: 
101703631(Exosc7)
TUP: 
CFA: 
476654(EXOSC7)
AML: 
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101081873(EXOSC7)
PTG: 
102951879(EXOSC7)
BTA: 
100847343(EXOSC7)
BOM: 
102270956(EXOSC7)
PHD: 
102316489(EXOSC7)
CHX: 
102182644(EXOSC7)
SSC: 
100511347(EXOSC7)
CFR: 
102512715(EXOSC7)
BACU: 
103009363(EXOSC7)
LVE: 
103073704(EXOSC7)
ECB: 
100065722(EXOSC7)
MYB: 
102249499(EXOSC7)
MYD: 
102763509(EXOSC7)
PALE: 
102888505(EXOSC7)
MDO: 
100618055(EXOSC7)
SHR: 
100933501(EXOSC7)
OAA: 
100681439(EXOSC7)
GGA: 
420704(EXOSC7)
MGP: 
TGU: 
100221537(EXOSC7)
FAB: 
101810463(EXOSC7)
PHI: 
102107881(EXOSC7)
APLA: 
101791648(EXOSC7)
FPG: 
101921241(EXOSC7)
FCH: 
102054407(EXOSC7)
CLV: 
102088153(EXOSC7)
ASN: 
102368349(EXOSC7)
AMJ: 
PSS: 
102449425(EXOSC7)
CMY: 
102944846(EXOSC7)
ACS: 
PBI: 
103048836(EXOSC7)
XLA: 
446601(exosc7)
XTR: 
DRE: 
550247(exosc7)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102351241(EXOSC7)
CMK: 
103183923(exosc7)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
AME: 
411836(GB10475)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CELE_F31D4.1(exos-7)
CBR: 
CBG05573(Cbr-exos-7)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0014s16420g(POPTRDRAFT_834971)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os12t0403800-01(Os12g0403800)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_08g006250(SORBIDRAFT_08g006250) SORBI_10g031070(SORBIDRAFT_10g031070)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00028p00065140(AMTR_s00028p00065140)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YDL111C(RRP42)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0D00800(NCAS0D00800)
NDI: 
NDAI_0H03350(NDAI0H03350)
TPF: 
TPHA_0G00970(TPHA0G00970)
TBL: 
TBLA_0B09550(TBLA0B09550)
TDL: 
TDEL_0G02560(TDEL0G02560)
KAF: 
KAFR_0B04720(KAFR0B04720)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
LEL: 
SPAA: 
CAL: 
CaO19.12506(RRP42) CaO19.5039(RRP42)
CTP: 
CDU: 
COT: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_510014(AO090026000270)
ANG: 
ANI_1_264024(An02g01970)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
TML: 
SPO: 
LBC: 
SCM: 
MGL: 
PGR: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
EHI: 
EHI_188080(75.t00036)
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
BBO: 
BBOV_IV008760(23.m05910)
BEQ: 
CPV: 
TGO: 
PTI: 
TPS: 
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EHX: 
GTT: 
NGR: 
MAC: 
MA1776(rrp42)
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MMA: 
MMAZ: 
MBU: 
MMH: 
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MPY: 
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RCIX2125(rrp42p)
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MTH: 
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mru_1352(rrp42)
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Abm4_0918(rrp42)
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MEW: 
METH: 
MFV: 
MKA: 
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APO: 
AVE: 
AST: 
FPL: 
TAC: 
TVO: 
PTO: 
FAC: 
TAR: 
PHO: 
PAB: 
PFU: 
PFI: 
PYN: 
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TKO: 
TON: 
TGA: 
TGAM_2035(rrp42p)
TSI: 
TBA: 
THE: 
THA: 
THM: 
TLT: 
THS: 
TNU: 
ABI: 
ACF: 
APE: 
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SMR: 
SHC: 
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DKA: 
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SOL: 
STO: 
SAI: 
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SACS: 
SIS: 
SIA: 
SIM: 
SID: 
SIY: 
SIN: 
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TUZ: 
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TPE: 
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NMR: 
NIR: 
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NGA: 
CSU: 
NEQ: 
KCR: 
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Wang HW, Wang J, Ding F, Callahan K, Bratkowski MA, Butler JS, Nogales E, Ke A
  Title
Architecture of the yeast Rrp44 exosome complex suggests routes of RNA recruitment for 3' end processing.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 104:16844-9 (2007)
Reference
PMID:9390555
  Authors
Mitchell P, Petfalski E, Shevchenko A, Mann M, Tollervey D
  Title
The exosome: a conserved eukaryotic RNA processing complex containing multiple 3'- 5' exoribonucleases.
  Journal
Cell 91:457-66 (1997)

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