KEGG   ORTHOLOGY: K12604Help
Entry
K12604                      KO                                     

Name
CNOT1, NOT1
Definition
CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Pathway
ko03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12604  CNOT1, NOT1; CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12604  CNOT1, NOT1; CCR4-NOT transcription complex subunit 1
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     K12604  CNOT1, NOT1; CCR4-NOT transcription complex subunit 1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 23019(CNOT1)
PTR: 454137(CNOT1)
PPS: 100993745(CNOT1)
GGO: 101149250(CNOT1)
PON: 100444542(CNOT1)
NLE: 100589604(CNOT1)
MCC: 712880(CNOT1)
MCF: 102120215(CNOT1)
CSAB: 103233090(CNOT1)
RRO: 104673990(CNOT1)
RBB: 108533906(CNOT1)
CJC: 100389255(CNOT1)
SBQ: 101048733(CNOT1)
MMU: 234594(Cnot1)
RNO: 291841(Cnot1)
CGE: 100761778(Cnot1)
NGI: 103735116(Cnot1)
HGL: 101713904(Cnot1)
CCAN: 109692232(Cnot1)
OCU: 100348223(CNOT1)
TUP: 102477543(CNOT1)
CFA: 608777(CNOT1)
AML: 100474169(CNOT1)
UMR: 103673747(CNOT1)
ORO: 101386052(CNOT1)
FCA: 101089665(CNOT1)
PTG: 102971815(CNOT1)
AJU: 106977052(CNOT1)
BTA: 533968(CNOT1)
BOM: 102267797(CNOT1)
BIU: 109572255(CNOT1)
PHD: 102329250(CNOT1)
CHX: 102176722(CNOT1)
OAS: 101105519(CNOT1)
SSC: 100511993(CNOT1)
CFR: 102522615(CNOT1)
CDK: 105093834(CNOT1)
BACU: 103011827(CNOT1)
LVE: 103078807(CNOT1)
OOR: 101276315(CNOT1)
ECB: 100052554(CNOT1)
EPZ: 103564568(CNOT1)
EAI: 106822201(CNOT1)
MYB: 102260427(CNOT1)
MYD: 102753712(CNOT1)
HAI: 109394419(CNOT1)
RSS: 109440087 109459974(CNOT1)
PALE: 102887066(CNOT1)
LAV: 100656328(CNOT1)
TMU: 101346885
MDO: 100011840(CNOT1)
SHR: 100935273(CNOT1)
OAA: 100074556(CNOT1)
GGA: 100858397(CNOT1)
MGP: 100546363(CNOT1)
CJO: 107319059(CNOT1)
APLA: 101803516(CNOT1)
ACYG: 106033175(CNOT1)
TGU: 100224758(CNOT1)
GFR: 102043407(CNOT1)
FAB: 101816260(CNOT1)
PHI: 102112073(CNOT1)
PMAJ: 107209824(CNOT1)
CCW: 104687526(CNOT1)
FPG: 101921087(CNOT1)
FCH: 102055608(CNOT1)
CLV: 102093442(CNOT1)
EGZ: 104130244(CNOT1)
AAM: 106489393(CNOT1)
ASN: 102380319(CNOT1)
AMJ: 102566632(CNOT1)
PSS: 102449063(CNOT1)
CMY: 102943148(CNOT1)
CPIC: 101933472 101948832(CNOT1)
ACS: 100561603(cnot1)
PVT: 110081297(CNOT1)
PBI: 103048047 103061248 103067420
GJA: 107118551 107125682
XLA: 108714156(cnot1.L) 108715464(cnot1.S)
XTR: 100036630(cnot1)
NPR: 108803458(CNOT1)
DRE: 448949(cnot1)
SRX: 107707469 107732782
SANH: 107665696 107679599
SGH: 107572701 107575087
CCAR: 109050653 109050662 109059791
IPU: 108268989(cnot1)
AMEX: 103032033(cnot1)
TRU: 101063095(cnot1) 101076457
TNG: GSTEN00034624G001
LCO: 104936050(cnot1)
NCC: 104955432 104955433(cnot1) 104955434
MZE: 101486947(cnot1)
OLA: 101156649(cnot1)
XMA: 102228947(cnot1)
PRET: 103466729(cnot1)
NFU: 107389139(cnot1)
CSEM: 103379646(cnot1) 103399714
LCF: 108901868(cnot1)
HCQ: 109531112(cnot1)
BPEC: 110169601(cnot1)
SASA: 106561350 106573200
ELS: 105018219(cnot1)
SFM: 108926306
LCM: 102345241(CNOT1)
CMK: 103171676 103189438 103191460
BFO: BRAFLDRAFT_118779 BRAFLDRAFT_68441
CIN: 100182575
SPU: 591524
APLC: 110981309
SKO: 100370697
DME: Dmel_CG34407(Not1)
DPO: Dpse_GA30445
DAN: Dana_GF12498
DER: Dere_GG25279
DPE: Dper_GL17311 Dper_GL17312
DSE: Dsec_GM20597
DSI: Dsimw501_GD10070(Dsim_GD10070)
DWI: Dwil_GK21492
DYA: Dyak_GE22247
DGR: Dgri_GH21959
DMO: Dmoj_GI19666
DVI: Dvir_GJ15030
MDE: 101900513
AGA: AgaP_AGAP009057
AAG: 5569047
CQU: CpipJ_CPIJ007821
AME: 412371(CNOT1)
BIM: 100745008
BTER: 100642693
SOC: 105201852
AEC: 105152061
ACEP: 105617639
PBAR: 105430155
HST: 105188642
CFO: 105251911
LHU: 105667492
PGC: 109857696
NVI: 100114396(CNOT1)
TCA: 663739(CNOT1)
DPA: 109534470
NVL: 108563358
BMOR: 101739199
DPL: KGM_208376
PMAC: 106715928 106716278
PRAP: 110996562 110999335
PXY: 105392705
API: 100159030 100169254
DNX: 107162215 107170247
PHU: Phum_PHUM564470 Phum_PHUM624580
ZNE: 110830680
FCD: 110851858
DPX: DAPPUDRAFT_117361 DAPPUDRAFT_324499
ISC: IscW_ISCW022114
TUT: 107363469
CEL: CELE_F57B9.2(let-711)
CBR: CBG16483(Cbr-let-711)
NAI: NECAME_15083 NECAME_15085
BMY: Bm1_41195
LOA: LOAG_17788
TSP: Tsp_05273
HRO: HELRODRAFT_157038
LGI: LOTGIDRAFT_239532
CRG: 105324909 105333827
MYI: 110450788
OBI: 106872123
LAK: 106179078
SMM: Smp_133320
SHX: MS3_05181 MS3_07197
NVE: NEMVE_v1g90783
EPA: 110233439
ADF: 107348165
HMG: 100201810(cnot1)
TAD: TRIADDRAFT_23606
AQU: 100636010
ATH: AT1G02080
ALY: ARALYDRAFT_887229
CRB: 17897544
CSAT: 104754361 104758274 104759049 104773522
EUS: EUTSA_v10006521mg
BRP: 103836952 103843826 103850259 103865412
BNA: 106370831 106399970 106401509 106426027 106427619 106431742 106434149 106434158 106450106 106452420 111203605 111207780 111208209 111211238
BOE: 106299982 106309435 106340306
THJ: 104801485 104814077
CPAP: 110815350 110819903
CIT: 102630812
CIC: CICLE_v10018430mg
TCC: 18605343 18614385
GRA: 105763730 105802567
GHI: 107891569 107911607 107911887 107924016 107945544
DZI: 111285688 111287055 111313761
EGR: 104444451
GMX: 100783935 100803794 100818196
PVU: PHAVU_010G056800g
VRA: 106774010
VAR: 108347373
CCAJ: 109812609 109812748
MTR: MTR_8g005820
CAM: 101499438
ADU: 107473165
AIP: 107624816
LJA: Lj3g3v0439760.1(Lj3g3v0439760.1) Lj3g3v0439760.2(Lj3g3v0439760.2) Lj3g3v0439760.3(Lj3g3v0439760.3) Lj3g3v3225370.1(Lj3g3v3225370.1)
LANG: 109335620 109335628 109337834 109340616 109341709 109362321
FVE: 101308317
PPER: 18787307
PMUM: 103331693
PAVI: 110751076
MDM: 103420630 103439027 103450084
PXB: 103928608 103940468
ZJU: 107424219
CSV: 101222446
CMO: 103483121
MCHA: 111015708
CMAX: 111472871 111472902 111479079
CMOS: 111432166 111449221
CPEP: 111786720 111790227 111799741
RCU: 8265839
JCU: 105643175
HBR: 110663040 110666945
JRE: 108979027 108990535 109015989
VVI: 100256945 100261590 100853179
SLY: 101267935(CNOT1)
SPEN: 107002569
SOT: 102583960 102589155 102593292
CANN: 107845472
NTA: 107802598 107804987
NSY: 104226614
NTO: 104120949
INI: 109157649 109183311
SIND: 105170897
OEU: 111387193 111409878
HAN: 110864689 110919828 110937806
LSV: 111896007 111904112
DCR: 108195949 108218356
BVG: 104905333
SOE: 110788994
NNU: 104598503
OSA: 4331296 9272729
DOSA: Os03t0102333-00(Os03g0102333) Os03t0102366-00(Os03g0102366) Os10t0556600-00(Os10g0556600)
OBR: 102707524
BDI: 100840701 100843991
ATS: 109737062(LOC109737062) 109749698(LOC109749698) 109755226(LOC109755226)
SBI: 8058085 8081555
ZMA: 100273922 100502409 103650181 103653357
SITA: 101754582 101780813
PDA: 103711640 103716554
EGU: 105043649 105053997
MUS: 103970388
DCT: 110113164
AOF: 109848315
ATR: 18428828
SMO: SELMODRAFT_440060 SELMODRAFT_444949
CRE: CHLREDRAFT_60751(NOT1)
VCN: VOLCADRAFT_108387
MNG: MNEG_11468 MNEG_5135
OLU: OSTLU_32751
OTA: OT_ostta07g03420
BPG: Bathy04g04130
MIS: MICPUN_98844
MPP: MICPUCDRAFT_47070
CSL: COCSUDRAFT_47765
CVR: CHLNCDRAFT_135829
APRO: F751_5980
CME: CYME_CMF162C
GSL: Gasu_10450
CCP: CHC_T00004465001
SCE: YCR093W(CDC39)
AGO: AGOS_ABR112C
ERC: Ecym_6036
KLA: KLLA0C18612g
KMX: KLMA_40022(CDC39)
LTH: KLTH0A07502g
VPO: Kpol_458p1
ZRO: ZYRO0D17512g
CGR: CAGL0E00451g
NCS: NCAS_0D04690(NCAS0D04690)
NDI: NDAI_0I00270(NDAI0I00270)
TPF: TPHA_0H02420(TPHA0H02420) TPHA_0M02090(TPHA0M02090)
TBL: TBLA_0F00220(TBLA0F00220)
TDL: TDEL_0A07880(TDEL0A07880)
KAF: KAFR_0J02600(KAFR0J02600)
PPA: PAS_chr4_0431
DHA: DEHA2E01573g
PIC: PICST_65421
PGU: PGUG_04019
SPAA: SPAPADRAFT_143625
LEL: LELG_04966
CAL: CAALFM_C604270WA(CDC39)
CTP: CTRG_02760
COT: CORT_0H02450
CDU: CD36_64860
CTEN: CANTEDRAFT_117969
YLI: YALI0F23045g
CLU: CLUG_05207 CLUG_05208
CLUS: A9F13_03g00275
CAUR: QG37_05137
SLB: AWJ20_3429(CDC39)
NCR: NCU04766
NTE: NEUTE1DRAFT87125(NEUTE1DRAFT_87125)
SMP: SMAC_03402
PAN: PODANSg3020
TTT: THITE_2110243
MTM: MYCTH_2306855
CTHR: CTHT_0042750
MGR: MGG_02476
FGR: FGSG_08474
FPU: FPSE_04649
FVR: FVEG_02144
FOX: FOXG_03272
NHE: NECHADRAFT_58915
TRE: TRIREDRAFT_70218
MAW: MAC_03438
MAJ: MAA_02269
CMT: CCM_04489
PLJ: VFPFJ_02676
VAL: VDBG_09319
VDA: VDAG_07472
CFJ: CFIO01_03456
ELA: UCREL1_4109
PFY: PFICI_10356
SSL: SS1G_06643
BFU: BC1G_03405
MBE: MBM_09663
PSCO: LY89DRAFT_444918
GLZ: GLAREA_00109
ANI: AN4965.2
AFM: AFUA_3G10240
AOR: AO090003000559
ANG: ANI_1_578144(An16g04100)
AFV: AFLA_032610
ACT: ACLA_038100
NFI: NFIA_067040
PCS: Pc13g10490
PDP: PDIP_28860
CIM: CIMG_03576
CPW: CPC735_006860
PBL: PAAG_01892
PBN: PADG_00568
URE: UREG_07356
ABE: ARB_05467
TVE: TRV_02382
AJE: HCAG_00094
PNO: SNOG_08035
PTE: PTT_06506
BZE: COCCADRAFT_5655
BSC: COCSADRAFT_163454
BOR: COCMIDRAFT_85171
AALT: CC77DRAFT_971554
ZTR: MYCGRDRAFT_90353
PFJ: MYCFIDRAFT_46219
BCOM: BAUCODRAFT_159617
NPA: UCRNP2_4596
TML: GSTUM_00002521001
SPO: SPAC20G8.06(not1)
CNE: CNC05460
CNB: CNBC1720
CGI: CGB_C8030C
TMS: TREMEDRAFT_72862
TVS: TRAVEDRAFT_45904
DSQ: DICSQDRAFT_146168
PCO: PHACADRAFT_144527
SHS: STEHIDRAFT_154920 STEHIDRAFT_161064
HIR: HETIRDRAFT_154447
PSQ: PUNSTDRAFT_144231
ADL: AURDEDRAFT_157903 AURDEDRAFT_54059
FME: FOMMEDRAFT_87350
GTR: GLOTRDRAFT_73035
LBC: LACBIDRAFT_141130
MPR: MPER_11064
MRR: Moror_6631
CCI: CC1G_05143
SCM: SCHCODRAFT_81262
ABP: AGABI1DRAFT97790(AGABI1DRAFT_97790)
ABV: AGABI2DRAFT115297(AGABI2DRAFT_115297)
CPUT: CONPUDRAFT_79965
SLA: SERLADRAFT_362944
WSE: WALSEDRAFT_32400
WIC: J056_000565
UMA: UMAG_05540
PFP: PFL1_05117
MGL: MGL_1912
PGR: PGTG_06508
MLR: MELLADRAFT_117315
ECU: ECU11_1370
EIN: Eint_111260
EHE: EHEL_111260
ERO: EROM_111260
NCE: NCER_100883
MBR: MONBRDRAFT_33815
SRE: PTSG_09777
DDI: DDB_G0276029(DG1040)
DPP: DICPUDRAFT_153294
DFA: DFA_06236
EHI: EHI_184570(391.t00002)
EDI: EDI_022960
EIV: EIN_250300 EIN_371320
ACAN: ACA1_189590
PFA: PF11_0049
PFD: PFDG_02374
PFH: PFHG_01740
PYO: PY17X_0945600(PY01940)
PCB: PCHAS_090120(PC103976.00.0)
PBE: PBANKA_094310
PKN: PKH_090100
PVX: PVX_090875
PCY: PCYB_091090
TAN: TA17090
TPV: TP01_1063
TOT: TOT_010001007 TOT_010001008
BEQ: BEWA_044040
BBO: BBOV_IV003100(21.m02838)
CPV: cgd6_2060
CHO: Chro.60241
TGO: TGME49_291140
TET: TTHERM_00095500
PTM: GSPATT00003071001 GSPATT00004757001
SMIN: v1.2.007588.t1(symbB.v1.2.007588.t1)
PTI: PHATR_10354 PHATR_18735
FCY: FRACYDRAFT_139032 FRACYDRAFT_277084
TPS: THAPSDRAFT_37472
AAF: AURANDRAFT_52580
PIF: PITG_18474
PSOJ: PHYSODRAFT_467355
SPAR: SPRG_06770
EHX: EMIHUDRAFT_423675 EMIHUDRAFT_470734
GTT: GUITHDRAFT_165547
TBR: Tb10.70.6450
TCR: 509247.30
LMA: LMJF_21_0800
LIF: LINJ_21_0880
LDO: LDBPK_210880
LMI: LMXM_21_0800
LBZ: LBRM_21_0890
NGR: NAEGRDRAFT_78352
TVA: TVAG_109990
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT
  Title
Isolation and characterization of human orthologs of yeast CCR4-NOT complex subunits.
  Journal
Nucleic Acids Res 28:809-17 (2000)
DOI:10.1093/nar/28.3.809
  Sequence
[hsa:23019]

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (2)   
   KEGG PATHWAY (2)   
Gene (9932)   
   KEGG GENES (546)   
   KEGG MGENES (1454)   
   RefGene (7669)   
   EGENES (251)   
   OC (12)   
Protein sequence (291)   
   UniProt (285)   
   SWISS-PROT (6)   
Literature (1)   
   PubMed (1)   
All databases (10229)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system