KEGG   ORTHOLOGY: K12604Help
Entry
K12604                      KO                                     

Name
CNOT1, NOT1
Definition
CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Pathway
ko03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12604  CNOT1, NOT1; CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12604  CNOT1, NOT1; CCR4-NOT transcription complex subunit 1
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     K12604  CNOT1, NOT1; CCR4-NOT transcription complex subunit 1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 23019(CNOT1)
PTR: 454137(CNOT1)
PPS: 100993745(CNOT1)
GGO: 101149250(CNOT1)
PON: 100444542(CNOT1)
NLE: 100589604(CNOT1)
MCC: 712880(CNOT1)
MCF: 102120215(CNOT1)
CSAB: 103233090(CNOT1)
RRO: 104673990(CNOT1)
RBB: 108533906(CNOT1)
CJC: 100389255(CNOT1)
SBQ: 101048733(CNOT1)
MMU: 234594(Cnot1)
RNO: 291841(Cnot1)
CGE: 100761778(Cnot1)
NGI: 103735116(Cnot1)
HGL: 101713904(Cnot1)
CCAN: 109692232(Cnot1)
OCU: 100348223(CNOT1)
TUP: 102477543(CNOT1)
CFA: 608777(CNOT1)
AML: 100474169(CNOT1)
UMR: 103673747(CNOT1)
ORO: 101386052(CNOT1)
FCA: 101089665(CNOT1)
PTG: 102971815(CNOT1)
AJU: 106977052(CNOT1)
BTA: 533968(CNOT1)
BOM: 102267797(CNOT1)
BIU: 109572255(CNOT1)
PHD: 102329250(CNOT1)
CHX: 102176722(CNOT1)
OAS: 101105519(CNOT1)
SSC: 100511993(CNOT1)
CFR: 102522615(CNOT1)
CDK: 105093834(CNOT1)
BACU: 103011827(CNOT1)
LVE: 103078807(CNOT1)
OOR: 101276315(CNOT1)
ECB: 100052554(CNOT1)
EPZ: 103564568(CNOT1)
EAI: 106822201(CNOT1)
MYB: 102260427(CNOT1)
MYD: 102753712(CNOT1)
HAI: 109394419(CNOT1)
RSS: 109440087 109459974(CNOT1)
PALE: 102887066(CNOT1)
LAV: 100656328(CNOT1)
TMU: 101346885
MDO: 100011840(CNOT1)
SHR: 100935273(CNOT1)
OAA: 100074556(CNOT1)
GGA: 100858397(CNOT1)
MGP: 100546363(CNOT1)
CJO: 107319059(CNOT1)
APLA: 101803516(CNOT1)
ACYG: 106033175(CNOT1)
TGU: 100224758(CNOT1)
GFR: 102043407(CNOT1)
FAB: 101816260(CNOT1)
PHI: 102112073(CNOT1)
PMAJ: 107209824(CNOT1)
CCW: 104687526(CNOT1)
FPG: 101921087(CNOT1)
FCH: 102055608(CNOT1)
CLV: 102093442(CNOT1)
EGZ: 104130244(CNOT1)
AAM: 106489393(CNOT1)
ASN: 102380319(CNOT1)
AMJ: 102566632(CNOT1)
PSS: 102449063(CNOT1)
CMY: 102943148(CNOT1)
CPIC: 101933472 101948832(CNOT1)
ACS: 100561603(cnot1)
PVT: 110081297(CNOT1)
XLA: 108714156(cnot1.L) 108715464(cnot1.S)
XTR: 100036630(cnot1)
NPR: 108803458(CNOT1)
DRE: 448949(cnot1)
IPU: 108268989(cnot1)
AMEX: 103032033(cnot1)
TRU: 101063095(cnot1) 101076457
LCO: 104936050(cnot1)
MZE: 101486947(cnot1)
OLA: 101156649(cnot1)
XMA: 102228947(cnot1)
PRET: 103466729(cnot1)
NFU: 107389139(cnot1)
CSEM: 103379646(cnot1) 103399714
LCF: 108901868(cnot1)
HCQ: 109531112(cnot1)
BPEC: 110169601(cnot1)
ELS: 105018219(cnot1)
SFM: 108926306
LCM: 102345241(CNOT1)
CIN: 100182575
SPU: 591524
APLC: 110981309
SKO: 100370697
DME: Dmel_CG34407(Not1)
DSI: Dsimw501_GD10070(Dsim_GD10070)
MDE: 101900513
AAG: 5569047
AME: 412371(CNOT1)
BIM: 100745008
BTER: 100642693
SOC: 105201852
AEC: 105152061
ACEP: 105617639
PBAR: 105430155
HST: 105188642
CFO: 105251911
LHU: 105667492
PGC: 109857696
NVI: 100114396(CNOT1)
TCA: 663739(CNOT1)
DPA: 109534470
NVL: 108563358
BMOR: 101739199
PXY: 105392705
ZNE: 110830680
FCD: 110851858
TUT: 107363469
CEL: CELE_F57B9.2(let-711)
CBR: CBG16483(Cbr-let-711)
BMY: Bm1_41195
TSP: Tsp_05273
MYI: 110450788
OBI: 106872123
LAK: 106179078
EPA: 110233439
ADF: 107348165
HMG: 100201810(cnot1)
AQU: 100636010
ATH: AT1G02080
CRB: 17897544
CIT: 102630812
EGR: 104444451
VRA: 106774010
VAR: 108347373
CAM: 101499438
ADU: 107473165
AIP: 107624816
LJA: Lj3g3v0439760.1(Lj3g3v0439760.1) Lj3g3v0439760.2(Lj3g3v0439760.2) Lj3g3v0439760.3(Lj3g3v0439760.3) Lj3g3v3225370.1(Lj3g3v3225370.1)
FVE: 101308317
PPER: 18787307
PMUM: 103331693
PAVI: 110751076
ZJU: 107424219
CSV: 101222446
CMO: 103483121
MCHA: 111015708
RCU: 8265839
JCU: 105643175
SLY: 101267935(CNOT1)
SPEN: 107002569
CANN: 107845472
NSY: 104226614
NTO: 104120949
SIND: 105170897
BVG: 104905333
SOE: 110788994
NNU: 104598503
DOSA: Os03t0102333-00(Os03g0102333) Os03t0102366-00(Os03g0102366) Os10t0556600-00(Os10g0556600)
OBR: 102707524
ATS: 109737062(LOC109737062) 109749698(LOC109749698) 109755226(LOC109755226)
MUS: 103970388
DCT: 110113164
AOF: 109848315
ATR: 18428828
CRE: CHLREDRAFT_60751(NOT1)
APRO: F751_5980
SCE: YCR093W(CDC39)
ERC: Ecym_6036
KMX: KLMA_40022(CDC39)
NCS: NCAS_0D04690(NCAS0D04690)
NDI: NDAI_0I00270(NDAI0I00270)
TPF: TPHA_0H02420(TPHA0H02420) TPHA_0M02090(TPHA0M02090)
TBL: TBLA_0F00220(TBLA0F00220)
TDL: TDEL_0A07880(TDEL0A07880)
KAF: KAFR_0J02600(KAFR0J02600)
CAL: CAALFM_C604270WA(CDC39)
CAUR: QG37_05137
SLB: AWJ20_3429(CDC39)
NCR: NCU04766
NTE: NEUTE1DRAFT87125(NEUTE1DRAFT_87125)
MGR: MGG_02476
MAW: MAC_03438
MAJ: MAA_02269
CMT: CCM_04489
MBE: MBM_09663
ANI: AN4965.2
ANG: ANI_1_578144(An16g04100)
ABE: ARB_05467
TVE: TRV_02382
PTE: PTT_06506
SPO: SPAC20G8.06(not1)
CNE: CNC05460
CNB: CNBC1720
ABP: AGABI1DRAFT97790(AGABI1DRAFT_97790)
ABV: AGABI2DRAFT115297(AGABI2DRAFT_115297)
MGL: MGL_1912
DDI: DDB_G0276029(DG1040)
DFA: DFA_06236
EHI: EHI_184570(391.t00002)
PFA: PF11_0049
PYO: PY17X_0945600(PY01940)
PCB: PCHAS_090120(PC103976.00.0)
TAN: TA17090
TPV: TP01_1063
BBO: BBOV_IV003100(21.m02838)
CPV: cgd6_2060
SMIN: v1.2.007588.t1(symbB.v1.2.007588.t1)
SPAR: SPRG_06770
TCR: 509247.30
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT
  Title
Isolation and characterization of human orthologs of yeast CCR4-NOT complex subunits.
  Journal
Nucleic Acids Res 28:809-17 (2000)
DOI:10.1093/nar/28.3.809
  Sequence
[hsa:23019]

DBGET integrated database retrieval system