KEGG   ORTHOLOGY: K12606Help
Entry
K12606                      KO                                     

Name
RCD1, CNOT9, CAF40
Definition
CCR4-NOT transcription complex subunit 9
Pathway
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12606  RCD1, CNOT9, CAF40; CCR4-NOT transcription complex subunit 9
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
9125(RQCD1)
PTR: 
741696(RQCD1)
PPS: 
100986562(RQCD1)
GGO: 
101126950(RQCD1)
PON: 
100173439(RQCD1)
MCC: 
MCF: 
101866077(RQCD1)
MMU: 
58184(Rqcd1)
RNO: 
301513(Rqcd1)
CGE: 
100772865(Rqcd1)
HGL: 
101704652(Rqcd1)
TUP: 
102477039(RQCD1)
CFA: 
610449(RQCD1)
AML: 
FCA: 
PTG: 
102955249(RQCD1)
BTA: 
536537(RQCD1)
BOM: 
102273204(RQCD1)
PHD: 
102328006(RQCD1)
CHX: 
102176836(RQCD1)
SSC: 
100153939(RQCD1)
CFR: 
102515273(RQCD1)
BACU: 
103018885(RQCD1)
LVE: 
103083621(RQCD1)
ECB: 
100058624(RQCD1)
MYB: 
102252176(RQCD1)
MYD: 
102757518(RQCD1)
PALE: 
102885147(RQCD1)
MDO: 
100011219(RQCD1)
SHR: 
100919854(RQCD1)
GGA: 
424215(RQCD1)
MGP: 
TGU: 
100230308(RQCD1)
FAB: 
101814806(RQCD1)
PHI: 
102099933(RQCD1)
APLA: 
101804561(RQCD1)
FPG: 
101911685(RQCD1)
FCH: 
102046097(RQCD1)
CLV: 
102085009(RQCD1)
AMJ: 
PSS: 
102458243(RQCD1)
CMY: 
102929421(RQCD1)
ACS: 
PBI: 
103051119(RQCD1)
XLA: 
432229(rqcd1)
XTR: 
394620(rqcd1)
DRE: 
406632(rqcd1)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
100049470(rqcd1)
XMA: 
LCM: 
102354672(RQCD1)
CMK: 
103189803(rqcd1)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
412388(GB10035)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
100384888(rcd1)
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
BMY: 
TSP: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0001s37000g(POPTRDRAFT_829875) POPTR_0011s08710g POPTR_0011s08720g(POPTRDRAFT_805875) POPTR_0014s15360g(POPTRDRAFT_897561)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os02t0296400-00(Os02g0296400) Os02t0301700-00(Os02g0301700) Os03t0784800-01(Os03g0784800) Os04t0613400-00(Os04g0613400)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g006090(SORBIDRAFT_01g006090) SORBI_02g002910(SORBIDRAFT_02g002910) SORBI_06g028320(SORBIDRAFT_06g028320)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00017p00162080(AMTR_s00017p00162080) s00053p00168120(AMTR_s00053p00168120)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
BPG: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YNL288W(CAF40)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A09850(NCAS0A09850)
NDI: 
NDAI_0A06040(NDAI0A06040)
TPF: 
TPHA_0P01190(TPHA0P01190)
TBL: 
TBLA_0A07900(TBLA0A07900)
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TDEL_0E00810(TDEL0E00810)
KAF: 
KAFR_0A08270(KAFR0A08270)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
LEL: 
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CAL: 
CaO19.7198(CAF40) CaO19_7198(CaJ7_0439)
CTP: 
CDU: 
COT: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
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MGR: 
TMN: 
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TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
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ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_736184(AO090009000447)
ANG: 
ANI_1_1044014(An01g07810)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
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PNO: 
PTE: 
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TML: 
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SCM: 
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MGL: 
PGR: 
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DDI: 
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EHI_093570(78.t00002)
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BBOV_III004860(17.m07435)
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LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Garapaty S, Mahajan MA, Samuels HH
  Title
Components of the CCR4-NOT complex function as nuclear hormone receptor coactivators via association with the NRC-interacting Factor NIF-1.
  Journal
J Biol Chem 283:6806-16 (2008)
Reference
  Authors
Schilders G, van Dijk E, Raijmakers R, Pruijn GJ
  Title
Cell and molecular biology of the exosome: how to make or break an RNA.
  Journal
Int Rev Cytol 251:159-208 (2006)

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