KEGG   ORTHOLOGY: K12608Help
Entry
K12608                      KO                                     

Name
CAF16
Definition
CCR4-NOT complex subunit CAF16
Pathway
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12608  CAF16; CCR4-NOT complex subunit CAF16
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0002s03760g(POPTRDRAFT_551020) POPTR_0003s15450g(POPTRDRAFT_800064) POPTR_0005s24830g(POPTRDRAFT_715207) POPTR_0006s08620g(POPTRDRAFT_762363)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os02t0810300-01(Os02g0810300) Os03t0316900-01(Os03g0316900)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g037080(SORBIDRAFT_01g037080) SORBI_04g036680(SORBIDRAFT_04g036680)
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
MUS: 
ATR: 
s00003p00210080(AMTR_s00003p00210080) s00067p00082350(AMTR_s00067p00082350)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
SCE: 
YFL028C(CAF16)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0C03820(NCAS0C03820)
NDI: 
NDAI_0G03160(NDAI0G03160)
TPF: 
TPHA_0D00450(TPHA0D00450)
TBL: 
TBLA_0D02530(TBLA0D02530)
TDL: 
TDEL_0C00680(TDEL0C00680)
KAF: 
KAFR_0C03470(KAFR0C03470)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CaO19.388(CAF16) CaO19.8018(CAF16)
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_54114(AO090701000030)
ANG: 
ANI_1_1090134(An15g00220)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
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BSC: 
BOR: 
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PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
PPL: 
DSQ: 
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SHS: 
PSQ: 
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FME: 
GTR: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT113502(AGABI1DRAFT_113502)
ABV: 
AGABI2DRAFT191849(AGABI2DRAFT_191849)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
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WSE: 
PFA: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TGO: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
Tb927.6.2810(Tb06.5F5.330)
TCR: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Liu HY, Chiang YC, Pan J, Chen J, Salvadore C, Audino DC, Badarinarayana V, Palaniswamy V, Anderson B, Denis CL
  Title
Characterization of CAF4 and CAF16 reveals a functional connection between the CCR4-NOT complex and a subset of SRB proteins of the RNA polymerase II holoenzyme.
  Journal
J Biol Chem 276:7541-8 (2001)
  Sequence
[sce:YFL028C]

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