KEGG   ORTHOLOGY: K12618Help
Entry
K12618                      KO                                     

Name
XRN1, SEP1, KEM1
Definition
5'-3' exoribonuclease 1 [EC:3.1.13.-]
Pathway
Ribosome biogenesis in eukaryotes
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K12618  XRN1, SEP1, KEM1; 5'-3' exoribonuclease 1
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12618  XRN1, SEP1, KEM1; 5'-3' exoribonuclease 1
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.-  
     K12618  XRN1, SEP1, KEM1; 5'-3' exoribonuclease 1
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic Type
  Pre-60S particles
   RNases
    K12618  XRN1, SEP1, KEM1; 5'-3' exoribonuclease 1
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic Type
  tRNA degradation factors
   Rapid tRNA decay (RTD) pathway factors
    K12618  XRN1, SEP1, KEM1; 5'-3' exoribonuclease 1
Chromosome [BR:ko03036]
 Eukaryotic Type
  RNA silencing
   piRNA pathway
    K12618  XRN1, SEP1, KEM1; 5'-3' exoribonuclease 1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
54464(XRN1)
PTR: 
460744(XRN1)
PPS: 
100975490(XRN1)
GGO: 
PON: 
100449590(XRN1)
NLE: 
100597889(XRN1)
MCC: 
714497(XRN1)
MCF: 
CJC: 
100412678(XRN1)
MMU: 
24127(Xrn1)
RNO: 
300944(Xrn1)
CGE: 
100760243(Xrn1)
HGL: 
101701152(Xrn1)
TUP: 
102482614(XRN1)
CFA: 
477100(XRN1)
AML: 
UMR: 
103678392(XRN1)
FCA: 
101097088(XRN1)
PTG: 
102948561(XRN1)
BTA: 
540834(XRN1)
BOM: 
102268763(XRN1)
PHD: 
102327924(XRN1)
CHX: 
102178771(XRN1)
OAS: 
101106821(XRN1)
SSC: 
100515927(XRN1)
CFR: 
102511588(XRN1)
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103016273(XRN1)
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103082255(XRN1)
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100051335(XRN1)
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102249234(XRN1)
MYD: 
102768117(XRN1)
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102889090(XRN1)
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100013672(XRN1)
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424778(XRN1)
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101794979(XRN1)
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100232132(XRN1)
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101808622(XRN1)
PHI: 
102109729(XRN1)
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101913095(XRN1)
FCH: 
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102097760(XRN1)
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102380424(XRN1)
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102558616(XRN1)
PSS: 
102459789(XRN1)
CMY: 
102936409(XRN1)
ACS: 
100562142(xrn1)
PBI: 
103066866(XRN1)
XTR: 
733797(xrn1)
DRE: 
394008(xrn1)
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XMA: 
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102350811(XRN1)
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103178358(xrn1)
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
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DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
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AME: 
409993(XRN1)
NVI: 
TCA: 
663618(XRN1)
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG20837(Cbr-xrn-1)
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TSP: 
HRO: 
LGI: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
100201010(xrn1)
TAD: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YGL173C(XRN1)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0C04170(NCAS0C04170)
NDI: 
NDAI_0G03520(NDAI0G03520)
TPF: 
TPHA_0D00960(TPHA0D00960) TPHA_0H00510(TPHA0H00510)
TBL: 
TBLA_0G02750(TBLA0G02750)
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TDEL_0F01070(TDEL0F01070)
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KAFR_0C03080(KAFR0C03080)
PPA: 
PGU: 
SPAA: 
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CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
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CLU: 
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SMP: 
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AOR_1_838134(AO090102000515)
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ANI_1_654084(An09g05290)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
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PTE: 
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FME: 
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LBC: 
MPR: 
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AGABI1DRAFT114526(AGABI1DRAFT_114526)
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UMA: 
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BBOV_II007140(18.m06591)
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LMA: 
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LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Chernyakov I, Whipple JM, Kotelawala L, Grayhack EJ, Phizicky EM
  Title
Degradation of several hypomodified mature tRNA species in Saccharomyces cerevisiae is mediated by Met22 and the 5'-3' exonucleases Rat1 and Xrn1.
  Journal
Genes Dev 22:1369-80 (2008)
  Sequence
[sce:YGL173C]
Reference
  Authors
Mullen TE, Marzluff WF
  Title
Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'.
  Journal
Genes Dev 22:50-65 (2008)
  Sequence
[hsa:54464]

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