KEGG   ORTHOLOGY: K12619Help
Entry
K12619                      KO                                     

Name
XRN2, RAT1
Definition
5'-3' exoribonuclease 2 [EC:3.1.13.-]
Pathway
Ribosome biogenesis in eukaryotes
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.-  
     K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Other transcription-related factors
    Transcription termination factor
     K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic Type
  Pre-60S particles
   RNases
    K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic Type
  tRNA degradation factors
   Rapid tRNA decay (RTD) pathway factors
    K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
22803(XRN2)
PTR: 
458131(XRN2)
PPS: 
100981151(XRN2)
GGO: 
101139932(XRN2)
PON: 
100173960(XRN2)
MCC: 
700934(XRN2)
MCF: 
102134671(XRN2)
MMU: 
24128(Xrn2)
RNO: 
362229(Xrn2)
CGE: 
100770311(Xrn2)
HGL: 
101697198(Xrn2)
TUP: 
102490729(XRN2)
CFA: 
477133(XRN2)
AML: 
100468930(XRN2)
FCA: 
101084699(XRN2)
PTG: 
102950740(XRN2)
BTA: 
517417(XRN2)
BOM: 
102273486(XRN2)
PHD: 
102331271(XRN2)
CHX: 
102171526(XRN2)
OAS: 
101102410(XRN2)
SSC: 
100517201(XRN2)
CFR: 
102504615(XRN2)
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103000607(XRN2)
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103072390(XRN2)
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102759792(XRN2)
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102893608(XRN2)
MDO: 
100031372(XRN2)
SHR: 
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101919651(XRN2)
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102093706(XRN2)
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102374361(XRN2)
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102558593(XRN2)
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102452295(XRN2)
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102941188(XRN2)
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100562943(xrn2)
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103063230(XRN2)
XLA: 
100049102(xrn2)
XTR: 
733834(xrn2)
DRE: 
321940(xrn2)
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103181691(xrn2)
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DME: 
DPO: 
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DWI: 
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DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
408840(GB17901)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG20900(Cbr-xrn-2)
BMY: 
LOA: 
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SMM: 
HMG: 
AQU: 
ATH: 
AT1G54490(XRN4) AT1G75660(XRN3) AT5G42540(XRN2)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
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MTR: 
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MDM: 
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POP: 
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SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0872700-01(Os01g0872700) Os02t0481900-01(Os02g0481900) Os03t0794800-01(Os03g0794800)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g005340(SORBIDRAFT_01g005340) SORBI_03g010040(SORBIDRAFT_03g010040) SORBI_05g001880(SORBIDRAFT_05g001880) SORBI_05g003580(SORBIDRAFT_05g003580) SORBI_05g003583(SORBIDRAFT_05g003583) SORBI_07g005160(SORBIDRAFT_07g005160)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00004p00046450(AMTR_s00004p00046450) s00025p00023010(AMTR_s00025p00023010) s00025p00024460(AMTR_s00025p00024460) s00204p00040220(AMTR_s00204p00040220) s00423p00011960(AMTR_s00423p00011960) s00491p00000370(AMTR_s00491p00000370) s03991p00001150(AMTR_s03991p00001150)
SMO: 
PPP: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YOR048C(RAT1)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
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TPHA_0J01240(TPHA0J01240)
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TDEL_0B02780(TDEL0B02780)
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PPA: 
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CAL: 
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AOR_1_874194(AO090012000503)
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ANI_1_968074(An08g06790)
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AGABI2DRAFT191725(AGABI2DRAFT_191725)
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BBOV_II002230(18.m06180)
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TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Fang F, Phillips S, Butler JS
  Title
Rat1p and Rai1p function with the nuclear exosome in the processing and degradation of rRNA precursors.
  Journal
RNA 11:1571-8 (2005)
  Sequence
[sce:YOR048C]
Reference
  Authors
Kim M, Krogan NJ, Vasiljeva L, Rando OJ, Nedea E, Greenblatt JF, Buratowski S
  Title
The yeast Rat1 exonuclease promotes transcription termination by RNA polymerase II.
  Journal
Nature 432:517-22 (2004)
  Sequence
[sce:YOR048C]

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