KEGG   ORTHOLOGY: K12619Help
Entry
K12619                      KO                                     

Name
XRN2, RAT1
Definition
5'-3' exoribonuclease 2 [EC:3.1.13.-]
Pathway
Ribosome biogenesis in eukaryotes
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.-  
     K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Other transcription-related factors
    Transcription termination factor
     K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic Type
  Pre-60S particles
   RNases
    K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic Type
  tRNA degradation factors
   Rapid tRNA decay (RTD) pathway factors
    K12619  XRN2, RAT1; 5'-3' exoribonuclease 2
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
22803(XRN2)
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458131(XRN2)
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100981151(XRN2)
GGO: 
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PON: 
100173960(XRN2)
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700934(XRN2)
MCF: 
102134671(XRN2)
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24128(Xrn2)
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362229(Xrn2)
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101697198(Xrn2)
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102490729(XRN2)
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477133(XRN2)
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100468930(XRN2)
FCA: 
101084699(XRN2)
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517417(XRN2)
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PHD: 
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102171526(XRN2)
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100517201(XRN2)
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102504615(XRN2)
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100050094(XRN2)
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102263305(XRN2)
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100031372(XRN2)
SHR: 
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100074900(XRN2)
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XLA: 
100049102(xrn2)
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TRU: 
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LCM: 
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CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
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CQU: 
AME: 
408840(GB17901)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG20900(Cbr-xrn-2)
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TSP: 
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AQU: 
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CRB: 
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CIT: 
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Os01t0872700-01(Os01g0872700) Os03t0794800-01(Os03g0794800)
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g005340(SORBIDRAFT_01g005340) SORBI_03g010040(SORBIDRAFT_03g010040) SORBI_05g001880(SORBIDRAFT_05g001880) SORBI_05g003580(SORBIDRAFT_05g003580) SORBI_05g003583(SORBIDRAFT_05g003583) SORBI_07g005160(SORBIDRAFT_07g005160)
ZMA: 
SITA: 
SMO: 
PPP: 
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SCE: 
YOR048C(RAT1)
AGO: 
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LTH: 
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NCS: 
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KAFR_0C06110(KAFR0C06110)
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CAL: 
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AOR_1_874194(AO090012000503)
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LMI: 
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NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Houseley J, Tollervey D
  Title
The many pathways of RNA degradation.
  Journal
Cell 136:763-76 (2009)
Reference
  Authors
Fang F, Phillips S, Butler JS
  Title
Rat1p and Rai1p function with the nuclear exosome in the processing and degradation of rRNA precursors.
  Journal
RNA 11:1571-8 (2005)
Reference
  Authors
Chernyakov I, Whipple JM, Kotelawala L, Grayhack EJ, Phizicky EM
  Title
Degradation of several hypomodified mature tRNA species in Saccharomyces cerevisiae is mediated by Met22 and the 5'-3' exonucleases Rat1 and Xrn1.
  Journal
Genes Dev 22:1369-80 (2008)
Reference
  Authors
Kim M, Krogan NJ, Vasiljeva L, Rando OJ, Nedea E, Greenblatt JF, Buratowski S
  Title
The yeast Rat1 exonuclease promotes transcription termination by RNA polymerase II.
  Journal
Nature 432:517-22 (2004)

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