KEGG   ORTHOLOGY: K12620Help
Entry
K12620                      KO                                     

Name
LSM1
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1
Pathway
RNA degradation
Module
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12620  LSM1; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12620  LSM1; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12620  LSM1; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12620  LSM1; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
HSA: 
27257(LSM1)
PTR: 
746776(LSM1)
PPS: 
100993216(LSM1)
GGO: 
101149641(LSM1)
PON: 
100456491(LSM1)
NLE: 
100599147(LSM1)
MCC: 
699754(LSM1)
MCF: 
CJC: 
100388253(LSM1)
MMU: 
67207(Lsm1)
RNO: 
364624(Lsm1)
CGE: 
100771944(Lsm1)
NGI: 
103745764(Lsm1)
HGL: 
101708340(Lsm1)
OCU: 
100353471(LSM1)
TUP: 
102494257(LSM1)
CFA: 
475587(LSM1)
AML: 
UMR: 
103659125(LSM1)
FCA: 
101088074(LSM1)
PTG: 
102950256(LSM1)
BTA: 
535447(LSM1)
BOM: 
102277632(LSM1)
PHD: 
102343129(LSM1)
CHX: 
102187561(LSM1)
OAS: 
101111937(LSM1)
SSC: 
CFR: 
102517039(LSM1)
BACU: 
103015301(LSM1)
LVE: 
103075602(LSM1)
ECB: 
100057784(LSM1)
MYB: 
102250462(LSM1)
MYD: 
102762740(LSM1)
PALE: 
102880866(LSM1)
MDO: 
100029797(LSM1)
SHR: 
100913641(LSM1)
OAA: 
103170245(LSM1)
GGA: 
426775(LSM1)
MGP: 
100550668(LSM1)
APLA: 
101797025(LSM1)
TGU: 
PHI: 
102105089(LSM1)
CCW: 
104694902(LSM1)
FPG: 
101919646(LSM1)
FCH: 
102046823(LSM1)
CLV: 
102084488(LSM1)
ASN: 
102374395(LSM1)
AMJ: 
102573407(LSM1)
PSS: 
102461981(LSM1)
CMY: 
102948096(LSM1)
ACS: 
100551826(lsm1)
PBI: 
103064943(LSM1)
XLA: 
XTR: 
496613(lsm1)
DRE: 
445157(lsm1)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102358881(LSM1)
CMK: 
103186540(lsm1)
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
552260(GB17800)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
100302489(Lsm1)
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG02963(Cbr-lsm-1)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
EGR: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
BVG: 
OSA: 
DOSA: 
Os04t0445800-01(Os04g0445800)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_06g017930(SORBIDRAFT_06g017930)
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
MUS: 
ATR: 
s00131p00107350(AMTR_s00131p00107350)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YJL124C(LSM1)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B07980(NCAS0B07980)
NDI: 
NDAI_0B05340(NDAI0B05340)
TPF: 
TPHA_0B01170(TPHA0B01170)
TBL: 
TBLA_0D05620(TBLA0D05620)
TDL: 
TDEL_0H01120(TDEL0H01120)
KAF: 
KAFR_0G01760(KAFR0G01760)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
NTE: 
NEUTE1DRAFT45645(NEUTE1DRAFT_45645)
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
FPU: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
VDA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
ANG: 
ANI_1_528024(An02g03850)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
DSQ: 
PCO: 
SHS: 
HIR: 
ADL: 
GTR: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
WIC: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
ERO: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_10628(lsm1)
EHI: 
EHI_007960(55.t00006)
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TGO: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
PSOJ: 
EHX: 
GTT: 
NGR: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Mullen TE, Marzluff WF
  Title
Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'.
  Journal
Genes Dev 22:50-65 (2008)
  Sequence
[hsa:27257]

DBGET integrated database retrieval system