KEGG   ORTHOLOGY: K12621
Entry
K12621                      KO                                     
Symbol
LSM2
Name
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
Pathway
map03018  RNA degradation
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
   03041 Spliceosome
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
 Complex C
  U2 snRNP components
   LSm proteins
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
Other DBs
COG: COG1958
Genes
HSA: 57819(LSM2)
PTR: 462569(LSM2)
PPS: 100993919(LSM2) 112439825
GGO: 101145429(LSM2)
PON: 100459387(LSM2)
NLE: 100594047(LSM2)
HMH: 116460284(LSM2) 116470956
MCC: 715592(LSM2)
MCF: 102144654(LSM2) 123574106
MTHB: 126953356 126955626 126957012
MNI: 105497612(LSM2)
CSAB: 103221748(LSM2)
CATY: 105573432(LSM2)
PANU: 116275018
TGE: 112617522(LSM2)
MLEU: 105554188(LSM2)
RRO: 104678133(LSM2)
RBB: 108520229(LSM2)
TFN: 117064845 117086965(LSM2)
PTEH: 111523911(LSM2)
CANG: 105502831 105513757(LSM2)
CJC: 100407527(LSM2)
SBQ: 101050747(LSM2)
CSYR: 103258635(LSM2)
MMUR: 105858171(LSM2)
LCAT: 123631750(LSM2)
PCOQ: 105817880(LSM2)
OGA: 100945771(LSM2)
MMU: 27756(Lsm2)
MCAL: 110312699(Lsm2)
MPAH: 110335649(Lsm2)
RNO: 684148(Lsm2)
MCOC: 116074791(Lsm2)
ANU: 117724503(Lsm2)
MUN: 110560100(Lsm2)
CGE: 100769701(Lsm2)
MAUA: 101828344(Lsm2)
PROB: 127224325(Lsm2)
PLEU: 114705891(Lsm2)
MORG: 121435333(Lsm2)
MFOT: 126494893
AAMP: 119822521(Lsm2)
NGI: 103724427(Lsm2)
HGL: 101700991(Lsm2)
CPOC: 100717756(Lsm2)
CCAN: 109689587(Lsm2)
DORD: 105999843(Lsm2)
DSP: 122111289(Lsm2)
PLOP: 125345769 125352826(Lsm2)
NCAR: 124988635
MMMA: 107143588(Lsm2) 125615824
OCU: 100353275
OPI: 101516553(LSM2)
TUP: 102476768(LSM2)
GVR: 103592386(LSM2)
CFA: 102154474 474849(LSM2)
CLUD: 112676538
VLG: 121475298
NPO: 129507806 129512478(LSM2)
AML: 100483807(LSM2)
UMR: 103682337(LSM2)
UAH: 113243761(LSM2)
UAR: 123790990(LSM2)
ELK: 111152283
LLV: 125102935
MPUF: 101671247(LSM2)
MNP: 132017811(LSM2)
MLK: 131834345(LSM2)
NVS: 122911530(LSM2)
ORO: 101375825(LSM2)
EJU: 114222180(LSM2)
MLX: 118027324(LSM2)
NSU: 110586723(LSM2)
LWW: 102734792(LSM2)
FCA: 101101054(LSM2)
PCOO: 112853624(LSM2)
PBG: 122478302(LSM2)
PVIV: 125166674(LSM2)
LRUF: 124528874
PTG: 102962338(LSM2)
PPAD: 109260496(LSM2)
PUC: 125938193
AJU: 106983974
HHV: 120221889(LSM2)
BTA: 538662(LSM2)
BOM: 102264980(LSM2)
BBIS: 104983796(LSM2)
CHX: 100861322(LSM2)
OAS: 101117372(LSM2)
BTAX: 128056313(LSM2)
ODA: 120870565(LSM2)
CCAD: 122430142(LSM2)
SSC: 100144534(LSM2)
CFR: 102517181(LSM2)
CBAI: 105074050(LSM2)
CDK: 105087448(LSM2)
VPC: 102525843(LSM2)
BACU: 103020764(LSM2)
BMUS: 118903331(LSM2)
LVE: 103074338(LSM2)
OOR: 101284570(LSM2)
DLE: 111170689(LSM2)
PCAD: 102995743(LSM2)
PSIU: 116762081(LSM2)
NASI: 112395448(LSM2)
ECB: 100058963(LSM2)
EPZ: 103562497(LSM2)
EAI: 106825058(LSM2)
MYB: 102255949(LSM2)
MYD: 102772715(LSM2)
MMYO: 118670078 118679636(LSM2)
MLF: 102426142(LSM2)
PKL: 118705340(LSM2)
EFUS: 103300529(LSM2) 114232907
MNA: 107538951(LSM2)
DRO: 112302185(LSM2)
SHON: 118987564(LSM2)
AJM: 119055438(LSM2)
PDIC: 114494560(LSM2)
PHAS: 123810411(LSM2)
PPAM: 129067323(LSM2)
HAI: 109373094(LSM2)
RFQ: 117015110(LSM2)
PALE: 102880899(LSM2)
PGIG: 120618913(LSM2)
PVP: 105305303(LSM2)
RAY: 107498478(LSM2)
MJV: 108397885(LSM2)
TOD: 119245894 119252221(LSM2)
SARA: 101549069(LSM2)
LAV: 100659774(LSM2)
TMU: 101358726
ETF: 101643219(LSM2)
DNM: 101419577(LSM2)
MDO: 100025239(LSM2)
GAS: 123244199(LSM2) 123245500
SHR: 100929839(LSM2)
AFZ: 127561075
PCW: 110199438(LSM2)
OAA: 100091911(LSM2)
PMOA: 120503971(LSM2)
PHI: 102109389(LSM2)
FPG: 101912439(LSM2)
FCH: 102048008(LSM2)
AGEN: 126035024
SHAB: 115618886(LSM2)
AAM: 106491403(LSM2)
ASN: 102373949(LSM2)
AMJ: 102567974(LSM2)
PSS: 102451592(LSM2)
CCAY: 125621335(LSM2)
DCC: 119843152(LSM2)
CABI: 116835975(LSM2)
MRV: 120392356(LSM2)
ACS: 100566131(lsm2)
PVT: 110091287(LSM2)
SUND: 121924239(LSM2)
PBI: 103061523(LSM2)
PMUR: 107296257(LSM2)
CTIG: 120314257(LSM2)
TSR: 106554150(LSM2)
PGUT: 117667939(LSM2)
APRI: 131192993(LSM2)
PTEX: 113449347(LSM2)
NSS: 113423872(LSM2)
VKO: 123017923(LSM2)
PMUA: 114592000(LSM2)
PRAF: 128409163(LSM2)
HCG: 128347131(LSM2)
GJA: 107108245(LSM2)
STOW: 125427645(LSM2) 125434556
EMC: 129328523(LSM2)
XLA: 100134834(lsm2.L) 108700236(lsm2.S)
XTR: 549156(lsm2)
NPR: 108790395(LSM2)
RTEM: 120913510(LSM2)
BBUF: 120977741(LSM2)
BGAR: 122919556(LSM2)
MUO: 115464956(LSM2)
GSH: 117346891(LSM2)
DRE: 57924(smx5)
PTET: 122346920(smx5)
LROH: 127166759(smx5)
OMC: 131542491(smx5)
PPRM: 120493068(smx5)
RKG: 130081308(smx5)
MAMB: 125273910(smx5)
CIDE: 127514001
TROS: 130556331(smx5)
TDW: 130424872(smx5)
MANU: 129450584(smx5)
IPU: 100528971(smx5)
IFU: 128614939(smx5)
PHYP: 113531446(lsm2)
SMEO: 124393040(smx5)
TFD: 113642726(smx5)
TVC: 132843932(smx5)
AMEX: 103032596(lsm2)
CMAO: 118807514(smx5)
EEE: 113575886(lsm2)
CHAR: 122130814(smx5)
TRU: 101079697(lsm2)
TFS: 130528756(smx5)
LCO: 104925825(lsm2)
TBEN: 117491056(smx5)
CGOB: 115006822(lsm2)
PGEO: 117445143(smx5)
GACU: 117559046(smx5)
EMAC: 134869544(smx5)
ELY: 117253605(smx5)
EFO: 125895311(smx5)
PLEP: 121941117(smx5)
SLUC: 116058973(smx5)
ECRA: 117949888(smx5)
ESP: 116695785(lsm2)
PFLV: 114561743(lsm2)
GAT: 120823554(smx5)
PPUG: 119216732(smx5)
AFB: 129094433(smx5)
CLUM: 117729262(smx5)
PSWI: 130193601(smx5)
MSAM: 119901161(smx5)
SCHU: 122877134(smx5)
CUD: 121512330(smx5)
ALAT: 119028777(smx5)
MZE: 101485074(lsm2)
ONL: 100694409(lsm2)
OAU: 116312980(smx5)
OLA: 101162034(lsm2)
OML: 112150114(smx5)
CSAI: 133457702(smx5)
XMA: 102237019(lsm2)
XCO: 114150892(lsm2)
XHE: 116725720(lsm2)
PRET: 103463940(lsm2)
PFOR: 103151356(lsm2)
PLAI: 106949593(lsm2)
PMEI: 106908433(lsm2)
GAF: 122838281(smx5)
PPRL: 129371089(smx5)
CVG: 107088664(lsm2)
CTUL: 119795887(smx5)
GMU: 124873384(smx5)
NFU: 107387411(lsm2)
KMR: 108240166(smx5)
ALIM: 106527461(lsm2)
NWH: 119408162(smx5)
AOCE: 111567140(lsm2)
MCEP: 125008970(smx5)
CSEM: 103399951(lsm2)
POV: 109625496(lsm2)
SSEN: 122780444(smx5)
HHIP: 117760299(smx5)
HSP: 118120910(smx5)
SMAU: 118317904(smx5)
LCF: 108878872(smx5)
SDU: 111232003(lsm2)
SLAL: 111669585(lsm2)
XGL: 120790881(smx5)
HCQ: 109532361(lsm2)
SSCV: 125970877
SBIA: 133503325(smx5)
PEE: 133406373(smx5)
PTAO: 133481167(smx5)
BPEC: 110154831(lsm2)
MALB: 109965740(lsm2)
BSPL: 114854697(smx5)
SJO: 128361676(smx5)
SASA: 100286658(lsm2)
STRU: 115151451(lsm2)
OTW: 112251280(smx5)
OMY: 110532077(smx5)
OGO: 123991047(smx5)
ONE: 115119146(lsm2)
OKI: 109881932(lsm2)
OKE: 118375341(smx5)
SALP: 112071376(lsm2)
SNH: 120053589(smx5)
CCLU: 121537630(smx5)
ELS: 105029546(lsm2)
SFM: 108937357(lsm2)
PKI: 111836543(lsm2)
AANG: 118224586(smx5)
LOC: 102697834(lsm2)
PSEX: 120539644(smx5)
LCM: 102352591(LSM2)
RTP: 109914619(smx5)
CPLA: 122541508(smx5)
HOC: 132832506(smx5)
LERI: 129693605(smx5)
PMRN: 116955365(LSM2)
BFO: 118421550
BBEL: 109482336
LPIC: 129278331
APLC: 110978370
SKO: 100371976
DME: Dmel_CG10418(CG10418)
DER: 6545028
DSI: Dsimw501_GD14374(Dsim_GD14374)
DSR: 110176215
DPO: 4813061
DPE: 6596152
DMN: 108165502
DWI: 6645199
DGR: 6557390
DAZ: 108614586
DNV: 108652527
DHE: 111598748
CCAT: 101454738
BOD: 106615487
BDR: 105223926
RZE: 108370993
AOQ: 129241584
SCAC: 106094469
LCQ: 111677336
LSQ: 119607992
GFS: 119632241
ECOE: 129946945
CLON: 129609152
HIS: 119648830
AGA: 1274814
ACOZ: 120948461
AARA: 120894210
ASTE: 118511528
AFUN: 125768955
AMOU: 128303699
AALI: 118466253
AAG: 5570353
CPII: 120417451
CNS: 116339267
BCOO: 119080869
AME: 725142
ACER: 107992425
ALAB: 122712063
ADR: 102678675
AFLR: 100863915
BIM: 100746929
BBIF: 117205299
BVK: 117230370
BVAN: 117165064
BTER: 100644066
BAFF: 126913946
BPYO: 122571528
BPAS: 132909147
FVI: 122529860
CCAL: 108622391
OBB: 114874665
OLG: 117608720
MGEN: 117229034
NMEA: 116424067
CGIG: 122403754
SOC: 105207949
MPHA: 105834150
AEC: 105150974
ACEP: 105619859
PBAR: 105424035
VEM: 105570262
HST: 105186588
DQU: 106748458
CFO: 105250551
FEX: 115233987
LHU: 105676625
PGC: 109853441
OBO: 105284662
PCF: 106788978
PFUC: 122521987
VPS: 122637489
VCRB: 124428080
VVE: 124946600
NVI: 100121484
CSOL: 105367514
TPRE: 106654834
LHT: 122503971
LBD: 127290198
CGLO: 123274209
FAS: 105268660
DAM: 107036089
AGIF: 122854367
CINS: 118067994
VCAN: 122409830
CCIN: 107263458
DSM: 124405528
NPT: 124212917
NFB: 124176423
NLO: 107216465
NVG: 124298707
AROA: 105693601
TCA: 655665
SOY: 115889691
AGRG: 126737227
ATD: 109605166
CSET: 123309172
AGB: 108909844
LDC: 111509383
NVL: 108559948
APLN: 108744295
PPYR: 116180928
OTU: 111429487
BMOR: 101741431
BMAN: 114249790
MSEX: 115456196
BANY: 112042830
MJU: 123871053
NIQ: 126778944
VCD: 124541948
MCIX: 123668182
PMAC: 106708320
PRAP: 111000712
PBX: 123717247
PNAP: 125055173
ZCE: 119838122
CCRC: 123704380
LSIN: 126974754
HAW: 110381120
HZE: 124643722
TNL: 113502616
SLIU: 111354820
OFU: 114356857
PXY: 105382334
PGW: 126379289
CFEL: 113373136
API: 100158887
DNX: 107164353
ACOO: 126835984
DVT: 126903525
BTAB: 109029953
DCI: 103514923
CLEC: 106668220
HHAL: 106686681
NLU: 111059339
FOC: 113202914
TPAL: 117640126
ZNE: 110840462
CSEC: 111862036
SGRE: 126365819
BROR: 134527082
IEL: 124174098
FCD: 110846034
DMK: 116933050
DPZ: 124350180
PVM: 113819369
PJA: 122252638
PCHN: 125033426
PMOO: 119577720
HAME: 121860299
PCLA: 123775339
CQD: 128691123
PTRU: 123506124
ESN: 127008849
HAZT: 108670146
EAF: 111713025
TCF: 131877439
ISC: 8040318
DSV: 119465890
RMP: 119163394
DPTE: 113799539
DFR: 124496075
CSCU: 111631350
PTEP: 107456014
ABRU: 129981588
UDV: 129222402
SDM: 118198537
PMEO: 129583660
CEL: CELE_T10G3.6(gut-2)
PCAN: 112575875
BGT: 106063727
GAE: 121383167
HRF: 124142483
HRJ: 124280810
CRG: 105330850
CANU: 128155792
OED: 125681693
MYI: 110449084
PMAX: 117320916
MCAF: 127730087
MMER: 123557706
RPHI: 132748249
OBI: 106882765
OSN: 115225873
EGL: EGR_01836
NVE: 5506012
EPA: 110250267
ATEN: 116289196
ADF: 107332975
AMIL: 114961174
PDAM: 113676996
SPIS: 111339453
DGT: 114518871
XEN: 124438030
AQU: 100636659
ATH: AT1G03330(LSM2)
ALY: 9325518
CRB: 17897116
THJ: 104801217
CPAP: 110814989
CIT: 102628439
TCC: 108663471
EGR: 104426693
VRA: 106757334
VAR: 108329067
VUM: 124827114
CCAJ: 109798163
APRC: 113860930
PSAT: 127126181
VVO: 131610179
LJA: Lj0g3v0304109.1(Lj0g3v0304109.1)
ADU: 107492836
AIP: 107645359
LANG: 109336281
FVE: 101310298
RCN: 112202049
PPER: 18779649
PMUM: 103325844
PAVI: 110771417
PDUL: 117626636
ZJU: 107423367
MNT: 21394599
CSAV: 115708245
CSV: 101205556
BHJ: 120087205
RCU: 107261696
JCU: 105650034
CAVE: 132171215
QSU: 112008381
QLO: 115971977
VRI: 117918468
CANN: 107863914
INI: 109182823
ITR: 116024909
EGT: 105953532
SSPL: 121755081
APAN: 127242896
ECAD: 122580999
LSV: 111892187
DCR: 108221002
RVL: 131308005
BVG: 104904851
SOE: 110776932
MOF: 131156335
MING: 122090684
OSA: 4344686
DOSA: Os08t0154700-01(Os08g0154700)
OBR: 102714310
OGL: 127783332
BDI: 100843890
ATS: 109762555
TUA: 125523278
LPER: 127314832
LRD: 124682912
SITA: 101772598
SVS: 117859918
PHAI: 112897349
DCT: 110107052
PEQ: 110024589
AOF: 109848735
NCOL: 116264130
ATR: 18440605
PPP: 112278281
MNG: MNEG_9262
APRO: F751_0881
MPP: MICPUCDRAFT_13695(JGI:MicpuC2_13695)
SCE: YBL026W(LSM2)
SEUB: DI49_0155
ERC: Ecym_6224
KMX: KLMA_20293(LSM2)
NCS: NCAS_0B04420(NCAS0B04420)
NDI: NDAI_0A03760(NDAI0A03760)
TPF: TPHA_0C02850(TPHA0C02850)
TBL: TBLA_0B08120(TBLA0B08120)
TDL: TDEL_0B04360(TDEL0B04360)
KAF: KAFR_0C02750(KAFR0C02750)
KNG: KNAG_0D02020(KNAG0D02020)
PIC: PICST_50259(LSM2)
LEL: PVL30_002834(LSM2)
CAL: CAALFM_CR04260WA(SNP3)
NCR: NCU07382
NTE: NEUTE1DRAFT118711(NEUTE1DRAFT_118711)
PBEL: QC761_117870(LSM2)
PPSD: QC762_117870(LSM2)
PPSP: QC763_117870(LSM2)
PPSA: QC764_117870(LSM2)
MGR: MGG_00355
PGRI: PgNI_08988
SSCK: SPSK_00917
FPOA: FPOAC1_000378(LSM2)
FMU: J7337_001179(LSM2)
MAJ: MAA_04337
CMT: CCM_02227
PTKZ: JDV02_001246(LSM2)
BFU: BCIN_02g03420(Bclsm2)
MBE: MBM_02326
ALUC: AKAW2_40394S(LSM2)
ACHE: ACHE_31374S(LSM2)
APUU: APUU_80359A(LSM2)
PTE: PTT_11246
SPO: SPCC1620.01c(lsm2)
SOM: SOMG_04865(lsm2)
CNE: CNC01770
CNB: CNBC5480
CDEU: CNBG_3780
CCAC: CcaHIS019_0306480(LSM2)
ABP: AGABI1DRAFT36837(AGABI1DRAFT_36837)
ABV: AGABI2DRAFT68745(AGABI2DRAFT_68745)
MORE: E1B28_000615(LSM2)
SCM: SCHCO_02635036(SCHCODRAFT_02635036)
MGL: MGL_3694
MRT: MRET_1657
DDI: DDB_G0281779(lsm2)
DFA: DFA_04344(lsm2)
EHI: EHI_068580(61.t00040)
PMAL: PMUG01_10024300(LSM2)
PREL: PRELSG_1011500(LSM2)
TAN: TA07745
TPV: TP04_0304
CPV: cgd7_1070
SMIN: v1.2.041208.t1(symbB.v1.2.041208.t1)
SPAR: SPRG_02015
 » show all
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.21.9646-9657.2004
  Sequence
[sce:YBL026W]

DBGET integrated database retrieval system