KEGG   ORTHOLOGY: K12621Help
Entry
K12621                      KO                                     

Name
LSM2
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
 Complex C
  U2 snRNP components
   LSm proteins
    K12621  LSM2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
HSA: 
57819(LSM2)
PTR: 
462569(LSM2)
PPS: 
100993919(LSM2)
GGO: 
101145429(LSM2)
PON: 
100459387(LSM2)
NLE: 
100594047(LSM2)
MCC: 
715592(LSM2)
MCF: 
102144654(LSM2)
CJC: 
100407527(LSM2)
MMU: 
27756(Lsm2)
RNO: 
684148(Lsm2)
CGE: 
100769701(Lsm2)
NGI: 
103724427(Lsm2)
HGL: 
101700991(Lsm2)
OCU: 
100353275(LSM2)
TUP: 
102476768(LSM2)
CFA: 
474849(LSM2)
AML: 
UMR: 
103682337(LSM2)
FCA: 
101101054(LSM2)
PTG: 
102962338(LSM2)
BTA: 
538662(LSM2)
BOM: 
102264980(LSM2)
PHD: 
102341862(LSM2)
CHX: 
100861322(LSM2)
OAS: 
101117372(LSM2)
SSC: 
100144534(LSM2)
CFR: 
102517181(LSM2)
BACU: 
103020764(LSM2)
LVE: 
103074338(LSM2)
ECB: 
100058963(LSM2)
MYB: 
MYD: 
102772715(LSM2)
PALE: 
102880899(LSM2)
MDO: 
100025239(LSM2)
SHR: 
100929839(LSM2)
OAA: 
100091911(LSM2)
PHI: 
102109389(LSM2)
FPG: 
FCH: 
CLV: 
ASN: 
102373949(LSM2)
AMJ: 
PSS: 
102451592(LSM2)
CMY: 
ACS: 
100566131(lsm2)
PBI: 
103061523(LSM2)
XLA: 
100134834(lsm2)
XTR: 
549156(lsm2)
DRE: 
57924(smx5)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102352591(LSM2)
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
AME: 
725142(GB13993)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
ISC: 
CEL: 
BMY: 
LOA: 
HRO: 
LGI: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
POP: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os08t0154700-01(Os08g0154700)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_07g003620(SORBIDRAFT_07g003620)
ZMA: 
100276999(pco086335a) 100286339
SITA: 
PDA: 
ATR: 
s00025p00112530(AMTR_s00025p00112530)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
OLU: 
BPG: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YBL026W(LSM2)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B04420(NCAS0B04420)
NDI: 
NDAI_0A03760(NDAI0A03760)
TPF: 
TPHA_0C02850(TPHA0C02850)
TBL: 
TBLA_0B08120(TBLA0B08120)
TDL: 
TDEL_0B04360(TDEL0B04360)
KAF: 
KAFR_0C02750(KAFR0C02750)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CaO19.514(LSM2) CaO19.8145(LSM2)
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
NCR: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
TRE: 
MAJ: 
CMT: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
AFM: 
AOR: 
ANG: 
ANI_1_414084(An09g03480)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
NPA: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
DSQ: 
SHS: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT36837(AGABI1DRAFT_36837)
ABV: 
AGABI2DRAFT68745(AGABI2DRAFT_68745)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_04344(lsm2)
EHI: 
EHI_068580(61.t00040)
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
BBO: 
BBOV_II002620(18.m06211) BBOV_II002860(18.m06235) BBOV_II002900(18.m06239)
BEQ: 
CPV: 
TGO: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
  Sequence
[sce:YBL026W]

DBGET integrated database retrieval system