KEGG   ORTHOLOGY: K12622Help
Entry
K12622                      KO                                     

Name
LSM3
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
 Complex C
  U2 snRNP components
   LSm proteins
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
HSA: 
27258(LSM3)
PTR: 
742889(LSM3)
PPS: 
100993995(LSM3)
GGO: 
101148856(LSM3)
PON: 
100443823(LSM3)
NLE: 
MCC: 
701060(LSM3) 714046(LSM3)
MCF: 
CJC: 
100389959(LSM3)
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67678(Lsm3)
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297455(Lsm3)
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100765189(Lsm3)
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103751469(Lsm3)
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101708310(Lsm3)
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TUP: 
102473763(LSM3)
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607248(LSM3)
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103669509(LSM3)
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101101627(LSM3)
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102969019(LSM3)
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614759(LSM3)
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102276281(LSM3)
PHD: 
CHX: 
102190828(LSM3)
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103013829(LSM3)
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100629288(LSM3)
MYB: 
MYD: 
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416040(LSM3)
MGP: 
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101796253(LSM3)
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101807977(LSM3)
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102094969(LSM3)
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102386899(LSM3)
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102574303(LSM3)
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102938974(LSM3)
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100553365(lsm3)
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103056626(LSM3)
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103176687(lsm3)
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SPU: 
DME: 
DPO: 
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DSI: 
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AAG: 
CQU: 
AME: 
725401(GB16295)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG01776(Cbr-lsm-3)
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HRO: 
LGI: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
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CRB: 
EUS: 
BRP: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
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PPER: 
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MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
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POP: 
POPTR_0002s06940g(POPTRDRAFT_643482) POPTR_0005s21380g(POPTRDRAFT_831544)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
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Os01t0866700-01(Os01g0866700)
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SBI: 
SORBI_03g040930(SORBIDRAFT_03g040930)
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SITA: 
PDA: 
MUS: 
ATR: 
s00030p00090360(AMTR_s00030p00090360)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YLR438C-A(LSM3)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0J01950(NCAS0J01950)
NDI: 
NDAI_0J02710(NDAI0J02710)
TPF: 
TPHA_0B00530(TPHA0B00530)
TBL: 
TBLA_0E04630(TBLA0E04630)
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TDEL_0D00990(TDEL0D00990)
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KAFR_0E04140(KAFR0E04140)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
SPAA: 
LEL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
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SMP: 
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MTM: 
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ELA: 
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AOR: 
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ANI_1_908124(An14g06620)
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AGABI1DRAFT72874(AGABI1DRAFT_72874)
ABV: 
AGABI2DRAFT203319(AGABI2DRAFT_203319)
CPUT: 
SLA: 
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DPP: 
DFA: 
DFA_01036(lsm3)
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EHI_151310(2.t00032)
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BBOV_III010410(17.m07899)
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CPV: 
TGO: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
  Sequence
[sce:YLR438C-A]

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