KEGG   ORTHOLOGY: K12623Help
Entry
K12623                      KO                                     

Name
LSM4
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12623  LSM4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12623  LSM4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12623  LSM4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12623  LSM4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12623  LSM4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12623  LSM4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
25804(LSM4)
PPS: 
100977348(LSM4)
GGO: 
101127128(LSM4)
PON: 
100439809(LSM4)
MCC: 
720192(LSM4)
MCF: 
102115467(LSM4)
MMU: 
50783(Lsm4)
RNO: 
290647(Lsm4)
CGE: 
100769464(Lsm4)
HGL: 
CFA: 
609922(LSM4)
AML: 
FCA: 
101086377(LSM4)
PTG: 
102969185(LSM4)
BTA: 
613634(LSM4)
BOM: 
102273335(LSM4)
PHD: 
CFR: 
102510075(LSM4)
BACU: 
103008422(LSM4)
LVE: 
103086002(LSM4)
ECB: 
100070928(LSM4)
MYB: 
MYD: 
102751594(LSM4)
PALE: 
102880629(LSM4)
MDO: 
SHR: 
100928431(LSM4)
OAA: 
100091872(LSM4)
GGA: 
420128(LSM4)
MGP: 
TGU: 
100190604(LSM4)
FAB: 
101808950(LSM4)
PHI: 
102104124(LSM4)
FPG: 
101915599(LSM4)
FCH: 
102057255(LSM4)
CLV: 
102097285(LSM4)
ASN: 
102387363(LSM4)
AMJ: 
102558189(LSM4)
PSS: 
102464015(LSM4)
CMY: 
102934077(LSM4)
PBI: 
XLA: 
495318(lsm4)
XTR: 
395002(lsm4)
DRE: 
393669(lsm4)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102357508(LSM4)
CMK: 
103182042(lsm4)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
552529(GB12398)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
CEL: 
CBR: 
CBG13115(Cbr-lsm-4)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT5G27720(emb1644)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0002s20720g(POPTRDRAFT_552428) POPTR_0014s12520g(POPTRDRAFT_664457)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0256900-01(Os01g0256900)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_03g009890(SORBIDRAFT_03g009890)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00045p00214370(AMTR_s00045p00214370)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YER112W(LSM4)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A14510(NCAS0A14510)
NDI: 
NDAI_0A01520(NDAI0A01520)
TPF: 
TPHA_0K00740(TPHA0K00740)
TBL: 
TBLA_0I00350(TBLA0I00350)
TDL: 
TDEL_0C02700(TDEL0C02700)
KAF: 
KAFR_0K01940(KAFR0K01940)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
TTT: 
MTM: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
CMT: 
ELA: 
SSL: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_820014(AO090026000445)
ANG: 
ANI_1_2458024(An02g04080)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CPW: 
PBL: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
PPL: 
CCI: 
SCM: 
UMA: 
MGL: 
PGR: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_02782(lsm4)
EHI: 
EHI_049370(21.t00001)
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFH: 
PYO: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_I004760(19.m02880)
BEQ: 
TGO: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
  Sequence
[sce:YER112W]

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