KEGG   ORTHOLOGY: K12624Help
Entry
K12624                      KO                                     

Name
LSM5
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12624  LSM5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12624  LSM5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12624  LSM5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12624  LSM5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12624  LSM5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12624  LSM5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
23658(LSM5)
PTR: 
463335(LSM5)
PPS: 
GGO: 
PON: 
100173625(LSM5)
MCC: 
693550(LSM5) 702299(LSM5)
MCF: 
MMU: 
66373(Lsm5)
RNO: 
306222(Lsm5)
CGE: 
100764270(Lsm5)
HGL: 
TUP: 
CFA: 
611686(LSM5)
AML: 
FCA: 
101090251(LSM5)
PTG: 
102968107(LSM5)
BTA: 
615136(LSM5)
BOM: 
102264920(LSM5)
PHD: 
102325785(LSM5)
CHX: 
SSC: 
CFR: 
102522321(LSM5)
BACU: 
103015098(LSM5)
LVE: 
103088504(LSM5)
ECB: 
100055259(LSM5)
MYB: 
102258795(LSM5)
MYD: 
102767260(LSM5)
PALE: 
102890317(LSM5)
MDO: 
100018797(LSM5)
SHR: 
GGA: 
420751(LSM5)
MGP: 
TGU: 
FAB: 
PHI: 
APLA: 
101801966(LSM5)
FPG: 
FCH: 
CLV: 
ASN: 
102376189(LSM5)
AMJ: 
102565642(LSM5)
PSS: 
102448007(LSM5)
ACS: 
PBI: 
103067697(LSM5)
XLA: 
447076(lsm5)
XTR: 
100216118(lsm5)
DRE: 
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102347003(LSM5)
CMK: 
103183400(lsm5)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
725641(GB18491)
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
CEL: 
CBR: 
CBG18602(Cbr-lsm-5)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT5G48870(SAD1)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os05t0389300-01(Os05g0389300)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_09g019200(SORBIDRAFT_09g019200)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00019p00197070(AMTR_s00019p00197070)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
SCE: 
YER146W(LSM5)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A03890(NCAS0A03890)
NDI: 
NDAI_0E03360(NDAI0E03360)
TPF: 
TPHA_0D04330(TPHA0D04330)
TBL: 
TBLA_0A08590(TBLA0A08590)
TDL: 
TDEL_0B04180(TDEL0B04180)
KAF: 
KAFR_0B02310(KAFR0B02310)
DHA: 
PIC: 
SPAA: 
CAL: 
COT: 
CTEN: 
YLI: 
NCR: 
MTM: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
ANG: 
ANI_1_116114(An13g00820)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
PBL: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
LBC: 
CCI: 
SCM: 
UMA: 
MGL: 
PGR: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_11296(lsm5)
EHI: 
PFA: 
PFH: 
PCB: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_IV009630(23.m05873)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
TGO: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
NGR: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
  Sequence
[sce:YER146W]

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