KEGG   ORTHOLOGY: K12625Help
Entry
K12625                      KO                                     

Name
LSM6
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
HSA: 
11157(LSM6)
PTR: 
100613876(LSM6)
PPS: 
100994728(LSM6)
GGO: 
101130229(LSM6)
PON: 
100436232(LSM6)
NLE: 
100580341(LSM6)
MCC: 
703226(LSM6)
MCF: 
102141461(LSM6)
CJC: 
100401332(LSM6)
MMU: 
78651(Lsm6)
RNO: 
CGE: 
100769852(Lsm6)
NGI: 
103729401(Lsm6)
HGL: 
101699334(Lsm6)
OCU: 
100340511(LSM6)
TUP: 
CFA: 
612329(LSM6)
AML: 
100477883(LSM6)
UMR: 
103657996(LSM6)
FCA: 
101084955(LSM6)
PTG: 
102954115(LSM6)
BTA: 
615916(LSM6)
BOM: 
PHD: 
CHX: 
102175883(LSM6)
OAS: 
101109392(LSM6)
SSC: 
100522884(LSM6)
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102515274(LSM6)
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103005214(LSM6)
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103091276(LSM6)
ECB: 
100629585(LSM6)
MYB: 
MYD: 
PALE: 
102878461(LSM6)
MDO: 
100026239(LSM6)
SHR: 
100918491(LSM6)
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100080021(LSM6)
GGA: 
422466(LSM6)
MGP: 
100544905(LSM6)
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TGU: 
GFR: 
102039342(LSM6)
FAB: 
101821394(LSM6)
PHI: 
102113193(LSM6)
CCW: 
104697237(LSM6)
FPG: 
101918885(LSM6)
FCH: 
102058902(LSM6)
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102097075(LSM6)
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102371039(LSM6)
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102563750(LSM6)
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102455265(LSM6)
CMY: 
102934382(LSM6)
ACS: 
100559863(lsm6)
PBI: 
103060231(LSM6)
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447141(lsm6)
XTR: 
779701(lsm6)
DRE: 
415167(lsm6)
TRU: 
101068714(lsm6)
MZE: 
OLA: 
101156227(lsm6)
XMA: 
LCM: 
102367496(LSM6)
CMK: 
103182239(lsm6)
BFO: 
CIN: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
Dyak_GE12153(Dyak_CG9344)
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
CQU: 
AME: 
725947(GB12358)
SOC: 
AEC: 
HST: 
CFO: 
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
PXY: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG22150(Cbr-lsm-6)
BMY: 
LOA: 
HRO: 
LGI: 
CRG: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
EGR: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
JCU: 
POP: 
POPTR_0008s07780g(POPTRDRAFT_832613) POPTR_0010s18590g(POPTRDRAFT_1091637)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
BVG: 
OSA: 
DOSA: 
Os02t0510100-01(Os02g0510100) Os04t0388900-01(Os04g0388900)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_06g013920(SORBIDRAFT_06g013920)
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
EGU: 
MUS: 
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YDR378C(LSM6)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A11810(NCAS0A11810)
NDI: 
NDAI_0A04480(NDAI0A04480)
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TPHA_0E01630(TPHA0E01630)
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TBLA_0A06450(TBLA0A06450)
TDL: 
TDEL_0D02490(TDEL0D02490)
KAF: 
KAFR_0E03760(KAFR0E03760)
PPA: 
DHA: 
SPAA: 
LEL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
NCR: 
NTE: 
NEUTE1DRAFT96889(NEUTE1DRAFT_96889)
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
MGR: 
TMN: 
FPU: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VDA: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
AFM: 
AOR: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
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CPW: 
PBL: 
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URE: 
ABE: 
TVE: 
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PNO: 
PTE: 
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SPO: 
CNE: 
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TMS: 
PPL: 
DSQ: 
PCO: 
SHS: 
HIR: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT61513(AGABI1DRAFT_61513)
ABV: 
AGABI2DRAFT212748(AGABI2DRAFT_212748)
CPUT: 
SLA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
ERO: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_07891(lsm6)
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
TOT: 
BBO: 
BBOV_IV008050(23.m06295)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
PSOJ: 
EHX: 
GTT: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
CSU: 
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
  Sequence
[sce:YDR378C]

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