KEGG   ORTHOLOGY: K12625Help
Entry
K12625                      KO                                     

Name
LSM6
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
11157(LSM6)
PTR: 
100613876(LSM6)
PPS: 
100994728(LSM6)
GGO: 
101130229(LSM6)
PON: 
100436232(LSM6)
MCC: 
703226(LSM6)
MCF: 
102141461(LSM6)
MMU: 
78651(Lsm6)
RNO: 
CGE: 
100769852(Lsm6)
HGL: 
101699334(Lsm6)
TUP: 
CFA: 
612329(LSM6)
AML: 
FCA: 
101084955(LSM6)
PTG: 
102954115(LSM6)
BTA: 
615916(LSM6)
BOM: 
PHD: 
CHX: 
102175883(LSM6)
SSC: 
100522884(LSM6)
CFR: 
102515274(LSM6)
BACU: 
103005214(LSM6)
LVE: 
103091276(LSM6)
ECB: 
100629585(LSM6)
MYB: 
MYD: 
PALE: 
102878461(LSM6)
MDO: 
100026239(LSM6)
SHR: 
100918491(LSM6)
OAA: 
100080021(LSM6)
GGA: 
422466(LSM6)
MGP: 
TGU: 
FAB: 
101821394(LSM6)
PHI: 
102113193(LSM6)
APLA: 
FPG: 
101918885(LSM6)
FCH: 
102058902(LSM6)
CLV: 
102097075(LSM6)
ASN: 
102371039(LSM6)
AMJ: 
102563750(LSM6)
PSS: 
102455265(LSM6)
CMY: 
102934382(LSM6)
ACS: 
PBI: 
103060231(LSM6)
XLA: 
447141(lsm6)
XTR: 
779701(lsm6)
DRE: 
415167(lsm6)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102367496(LSM6)
CMK: 
103182239(lsm6)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
CQU: 
AME: 
725947(GB12358)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG22150(Cbr-lsm-6)
BMY: 
LOA: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0008s07780g(POPTRDRAFT_832613) POPTR_0010s18590g(POPTRDRAFT_1091637)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os02t0510100-01(Os02g0510100) Os04t0388900-01(Os04g0388900)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_06g013920(SORBIDRAFT_06g013920)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00156p00050710(AMTR_s00156p00050710)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
MIS: 
MPP: 
BPG: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YDR378C(LSM6)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A11810(NCAS0A11810)
NDI: 
NDAI_0A04480(NDAI0A04480)
TPF: 
TPHA_0E01630(TPHA0E01630)
TBL: 
TBLA_0A06450(TBLA0A06450)
TDL: 
TDEL_0D02490(TDEL0D02490)
KAF: 
KAFR_0E03760(KAFR0E03760)
DHA: 
LEL: 
SPAA: 
CTP: 
CDU: 
COT: 
CTEN: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
AFM: 
AOR: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
ZTR: 
PFJ: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
PPL: 
LBC: 
CCI: 
SCM: 
UMA: 
MGL: 
PGR: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_07891(lsm6)
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_IV008050(23.m06295)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Wahl MC, Will CL, Luhrmann R
  Title
The spliceosome: design principles of a dynamic RNP machine.
  Journal
Cell 136:701-18 (2009)
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)

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