KEGG   ORTHOLOGY: K12626Help
Entry
K12626                      KO                                     

Name
LSM7
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
51690(LSM7)
PTR: 
455572(LSM7)
PPS: 
100981435(LSM7)
GGO: 
101138820(LSM7)
PON: 
NLE: 
100580561(LSM7)
MCC: 
MCF: 
102145754(LSM7)
CJC: 
100408990(LSM7)
MMU: 
66094(Lsm7)
RNO: 
362829(Lsm7)
CGE: 
HGL: 
101709127(Lsm7)
TUP: 
102497862(LSM7)
CFA: 
612170(LSM7)
AML: 
UMR: 
103681650(LSM7)
FCA: 
101087712(LSM7)
PTG: 
102965644(LSM7)
BTA: 
509920(LSM7)
BOM: 
102279607(LSM7)
PHD: 
102320834(LSM7)
CHX: 
OAS: 
101121092(LSM7)
SSC: 
100515470(LSM7)
CFR: 
102517216(LSM7)
BACU: 
103012489(LSM7)
LVE: 
103083602(LSM7)
ECB: 
MYB: 
MYD: 
102753627(LSM7)
PALE: 
102884702(LSM7)
MDO: 
100019863(LSM7)
SHR: 
100923315(LSM7)
OAA: 
100075247(LSM7)
GGA: 
420055(LSM7)
MGP: 
APLA: 
101791716(LSM7)
TGU: 
100226245(LSM7)
FAB: 
101820250(LSM7)
PHI: 
102114693(LSM7)
FPG: 
101910749(LSM7)
FCH: 
102047548(LSM7)
CLV: 
102086558(LSM7)
ASN: 
102375094(LSM7)
AMJ: 
PSS: 
102448011(LSM7)
CMY: 
102941560(LSM7)
PBI: 
103055404(LSM7)
XLA: 
444555(lsm7)
XTR: 
100127774(lsm7)
DRE: 
573047(lsm7)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102362026(LSM7)
CMK: 
103172330(lsm7)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
725352(Lsm7)
NVI: 
100114792(LSM7)
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG05961(Cbr-lsm-7)
BMY: 
LOA: 
HRO: 
LGI: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os08t0177700-01(Os08g0177700)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_06g029950(SORBIDRAFT_06g029950)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00022p00235920(AMTR_s00022p00235920)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YNL147W(LSM7)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B07110(NCAS0B07110)
NDI: 
NDAI_0B04440(NDAI0B04440)
TPF: 
TPHA_0I01310(TPHA0I01310)
TBL: 
TBLA_0B01090(TBLA0B01090)
TDL: 
TDEL_0B04830(TDEL0B04830)
KAF: 
KAFR_0F00610(KAFR0F00610)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
SPAA: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
NCR: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
ANG: 
ANI_1_1664014(An01g12330)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
ARB_01809(lsm7)
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
DSQ: 
SHS: 
PCO: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT131111(AGABI1DRAFT_131111)
ABV: 
AGABI2DRAFT121482(AGABI2DRAFT_121482)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
EIN: 
EHE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_08733(lsm7)
EHI: 
EHI_025840(392.t00003)
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_III001070(17.m07121)
BEQ: 
CPV: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
NGD: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
Tb927.5.4030(Tb05.45E22.290)
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
  Sequence
[sce:YNL147W]

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