KEGG   ORTHOLOGY: K12626Help
Entry
K12626                      KO                                     

Name
LSM7
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
Pathway
ko03018  RNA degradation
ko03040  Spliceosome
Module
M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  Lsm 2-8 complex
M00397  Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG1958
Genes
HSA: 51690(LSM7)
PTR: 455572(LSM7)
PPS: 100981435(LSM7)
GGO: 101138820(LSM7)
PON: 100451306(LSM7)
NLE: 100580561(LSM7)
MCC: 721486(LSM7)
MCF: 102145754(LSM7)
CSAB: 103233635(LSM7)
RRO: 104671387(LSM7)
RBB: 108531448(LSM7)
CJC: 100408990(LSM7)
SBQ: 101029572(LSM7)
MMU: 66094(Lsm7)
RNO: 362829(Lsm7)
CGE: 100772252(Lsm7)
NGI: 103737293(Lsm7)
HGL: 101709127(Lsm7)
CCAN: 109687799(Lsm7)
TUP: 102497862(LSM7)
CFA: 612170(LSM7)
AML: 100465685(LSM7)
UMR: 103681650(LSM7)
ORO: 101365368(LSM7)
FCA: 101087712(LSM7)
PTG: 102965644(LSM7)
AJU: 106983736(LSM7)
BTA: 509920(LSM7)
BOM: 102279607(LSM7)
BIU: 109561793(LSM7)
PHD: 102320834(LSM7)
CHX: 102178998(LSM7)
OAS: 101121092(LSM7)
SSC: 100515470(LSM7)
CFR: 102517216(LSM7)
CDK: 105103614(LSM7)
BACU: 103012489(LSM7)
LVE: 103083602(LSM7)
OOR: 101284643(LSM7)
ECB: 100060584(LSM7)
EPZ: 103542758(LSM7)
EAI: 106834211(LSM7)
MYB: 102250366(LSM7) 102254425
MYD: 102753627(LSM7)
HAI: 109390601(LSM7)
RSS: 109453896(LSM7)
PALE: 102884702(LSM7)
LAV: 100658536(LSM7)
TMU: 101361098
MDO: 100019863(LSM7)
SHR: 100923315(LSM7)
OAA: 100075247(LSM7)
GGA: 420055(LSM7)
MGP: 100550366(LSM7)
CJO: 107325375(LSM7)
APLA: 101791716(LSM7)
ACYG: 106045632(LSM7)
TGU: 100226245(LSM7)
GFR: 102034693(LSM7)
FAB: 101820250(LSM7)
PHI: 102114693(LSM7)
PMAJ: 107215533(LSM7)
CCW: 104696970(LSM7)
FPG: 101910749(LSM7)
FCH: 102047548(LSM7)
CLV: 102086558(LSM7)
EGZ: 104126332(LSM7)
AAM: 106497708(LSM7)
ASN: 102375094(LSM7)
AMJ: 102576963(LSM7)
PSS: 102448011(LSM7)
CMY: 102941560(LSM7)
CPIC: 101947072(LSM7)
PVT: 110079261(LSM7)
PBI: 103055404(LSM7)
GJA: 107118491(LSM7)
XLA: 108706793 444555(lsm7.L)
XTR: 100127774(lsm7)
NPR: 108792263(LSM7)
DRE: 573047(lsm7)
SRX: 107756021(lsm7)
IPU: 100528551(lsm7)
AMEX: 103032086(lsm7)
TRU: 101074881(lsm7)
NCC: 104959695(lsm7)
MZE: 101472407(lsm7)
OLA: 101175386(lsm7)
XMA: 102236907(lsm7)
PRET: 103464113(lsm7)
NFU: 107392648(lsm7)
CSEM: 103393874(lsm7)
LCF: 108881162(lsm7)
HCQ: 109522061(lsm7)
BPEC: 110160204(lsm7)
SASA: 100195694(lsm7) 106569602(lsm7)
ELS: 105022661(lsm7)
SFM: 108919845(lsm7)
LCM: 102362026(LSM7)
CMK: 103172330(lsm7)
CIN: 100180305
SPU: 594039
APLC: 110984200
SKO: 100374873
DME: Dmel_CG13277(LSm7)
DSI: Dsimw501_GD21898(Dsim_GD21898)
MDE: 101897725
AAG: 5577183
AME: 725352(Lsm7)
BIM: 100748043
BTER: 100651413
SOC: 105201188
AEC: 105146311
ACEP: 105620755
PBAR: 105422368
HST: 105190209
CFO: 105252994
LHU: 105671212
PGC: 109855759
NVI: 100114792(LSM7)
TCA: 658224
DPA: 109544522
NVL: 108558114
BMOR: 692825
PMAC: 106721060
PRAP: 110999191
PXY: 105380053
API: 100167222
DNX: 107168756
ZNE: 110834883
CEL: CELE_ZK593.7(lsm-7)
CBR: CBG05961(Cbr-lsm-7)
BMY: Bm1_31505
MYI: 110445404
OBI: 106881825
EPA: 110237851
ADF: 107347234
AQU: 100634218
ATH: AT2G03870(EMB2816)
THJ: 104809874
CPAP: 110824008
CIT: 102624901
TCC: 18614648
GRA: 105790282
EGR: 104425185
VRA: 106755385
VAR: 108339764
CCAJ: 109810696
CAM: 101491551
ADU: 107482324
AIP: 107631976
LJA: Lj3g3v0478010.1(Lj3g3v0478010.1) Lj4g3v2573940.1(Lj4g3v2573940.1)
FVE: 101292154
PPER: 18785097
PMUM: 103330497
PAVI: 110764218
ZJU: 107423563
CSV: 101206321
MCHA: 111020268
RCU: 8260774
JCU: 105628682
VVI: 100855332
SLY: 101258986
SPEN: 107029358
SOT: 102580345
CANN: 107843221
NTA: 107765381
NSY: 104224160
HAN: 110916744
OSA: 4344803
DOSA: Os08t0177700-01(Os08g0177700)
OBR: 102706674
ATS: 109734399(LOC109734399) 109736943 109748116(LOC109748116) 109763635
SBI: 8077679
SITA: 101776421
MUS: 103999873
DCT: 110109630
ATR: 18439928
CRE: CHLREDRAFT_55095(LSM7)
MNG: MNEG_8955
APRO: F751_6659
SCE: YNL147W(LSM7)
ERC: Ecym_6383
KMX: KLMA_10734(LSM7)
NCS: NCAS_0B07110(NCAS0B07110)
NDI: NDAI_0B04440(NDAI0B04440)
TPF: TPHA_0I01310(TPHA0I01310)
TBL: TBLA_0B01090(TBLA0B01090)
TDL: TDEL_0B04830(TDEL0B04830)
KAF: KAFR_0F00610(KAFR0F00610)
CAUR: QG37_00044
NCR: NCU01930
NTE: NEUTE1DRAFT53111(NEUTE1DRAFT_53111)
MGR: MGG_02938
MAW: MAC_07950
MAJ: MAA_09305
MBE: MBM_07225
ANI: AN0767.2
ANG: ANI_1_1664014(An01g12330)
ABE: ARB_01809(lsm7)
TVE: TRV_06436
PTE: PTT_08326
SPO: SPCC285.12(lsm7)
CNE: CNL03890
CNB: CNBI2880
ABP: AGABI1DRAFT131111(AGABI1DRAFT_131111)
ABV: AGABI2DRAFT121482(AGABI2DRAFT_121482)
MGL: MGL_1018
DDI: DDB_G0289499(lsm7)
DFA: DFA_08733(lsm7)
EHI: EHI_025840(392.t00003)
PFA: PFL0460w
PYO: PY17X_0610100(PY03614)
TAN: TA17980
TPV: TP03_0732
BBO: BBOV_III001070(17.m07121)
CPV: cgd7_3520
SMIN: v1.2.003168.t1(symbB.v1.2.003168.t1)
NGD: NGA_0181000(LSM7)
SPAR: SPRG_15839
TBR: Tb927.5.4030(Tb05.45E22.290)
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.21.9646-9657.2004
  Sequence
[sce:YNL147W]

DBGET integrated database retrieval system