KEGG   ORTHOLOGY: K12626Help
Entry
K12626                      KO                                     

Name
LSM7
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
M00397  
Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12626  LSM7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.21.9646-9657.2004
  Sequence
[sce:YNL147W]

DBGET integrated database retrieval system