KEGG   ORTHOLOGY: K12627Help
Entry
K12627                      KO                                     

Name
LSM8
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
Pathway
RNA degradation
Spliceosome
Module
M00354  
Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  
Lsm 2-8 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
51691(LSM8)
PTR: 
736972(LSM8)
PPS: 
100988740(LSM8)
GGO: 
101133433(NAA38)
PON: 
NLE: 
100602163(LSM8)
MCC: 
697125(NAA38) 708569(LSM8)
MCF: 
CJC: 
100413456(LSM8)
MMU: 
76522(Lsm8)
RNO: 
296913(Lsm8)
CGE: 
100756548(Lsm8)
NGI: 
103737332(Lsm8)
HGL: 
OCU: 
100358159(LSM8)
TUP: 
102469267(LSM8)
CFA: 
AML: 
100479478(LSM8)
UMR: 
103676593(LSM8)
FCA: 
101085872(LSM8)
PTG: 
102957233(LSM8)
BTA: 
613630(NAA38)
BOM: 
102265016(LSM8)
PHD: 
102327891(LSM8)
CHX: 
102168690(LSM8)
OAS: 
101102229(LSM8)
SSC: 
CFR: 
102505854(LSM8)
BACU: 
103005706(LSM8)
LVE: 
103086028(LSM8)
ECB: 
100071271(LSM8)
MYB: 
102258246(LSM8)
MYD: 
102771725(LSM8)
PALE: 
102884068(LSM8)
MDO: 
100012204(LSM8)
SHR: 
OAA: 
100077583(LSM8)
GGA: 
417765(LSM8)
MGP: 
100543190(LSM8)
APLA: 
TGU: 
FAB: 
101821106(LSM8)
PHI: 
102114166(LSM8)
FPG: 
101922270(LSM8)
FCH: 
102046665(LSM8)
CLV: 
102089102(LSM8)
ASN: 
102368199(LSM8)
AMJ: 
PSS: 
102448812(LSM8)
CMY: 
102932268(LSM8)
ACS: 
100562026(lsm8)
PBI: 
103056850(LSM8)
XLA: 
414679(naa38)
XTR: 
100486227(lsm8)
DRE: 
566017(lsm8)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102367425(LSM8)
CMK: 
103179364(lsm8)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
552155(GB14039)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG05470(Cbr-lsm-8)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
SMM: 
NVE: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0001s28460g(POPTRDRAFT_641478)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os05t0594900-01(Os05g0594900)
OBR: 
BDI: 
ZMA: 
100284021(AY110400)
SITA: 
PDA: 
MUS: 
ATR: 
s00002p00272060(AMTR_s00002p00272060)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
GSL: 
SCE: 
YJR022W(LSM8)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0D01690(NCAS0D01690)
NDI: 
NDAI_0C03080(NDAI0C03080)
TPF: 
TPHA_0A00160(TPHA0A00160)
TBL: 
TBLA_0H02350(TBLA0H02350)
TDL: 
TDEL_0E04990(TDEL0E04990)
KAF: 
KAFR_0E01990(KAFR0E01990)
DHA: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
NCR: 
NTE: 
NEUTE1DRAFT72679(NEUTE1DRAFT_72679)
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
FPU: 
TRE: 
CMT: 
VDA: 
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BFU: 
ANI: 
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AOR: 
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ANI_1_572074(An08g03940)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
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AJE: 
PTE: 
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SPO: 
CNE: 
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PPL: 
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MPR: 
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ABP: 
AGABI1DRAFT115264(AGABI1DRAFT_115264)
ABV: 
AGABI2DRAFT194226(AGABI2DRAFT_194226)
CPUT: 
SLA: 
PFP: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_11833(lsm8)
EHI: 
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFH: 
PCB: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
TOT: 
BBO: 
BBOV_IV002350(21.m02997)
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CPV: 
CHO: 
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TET: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
PSOJ: 
EHX: 
GTT: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
  Sequence
[sce:YJR022W]

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