KEGG   ORTHOLOGY: K12627Help
Entry
K12627                      KO                                     

Name
LSM8
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
Pathway
ko03018  RNA degradation
ko03040  Spliceosome
Module
M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  Lsm 2-8 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12627  LSM8; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 51691(LSM8)
PTR: 736972(LSM8)
PPS: 100988740(LSM8)
GGO: 101133433(LSM8)
PON: 100172134(LSM8)
NLE: 100602163(LSM8)
MCC: 708569(LSM8)
MCF: 101865271(LSM8)
CSAB: 103226780(LSM8)
RRO: 104660775 104682623(LSM8)
RBB: 108526541(LSM8)
CJC: 100413456(LSM8)
SBQ: 104652219(LSM8)
MMU: 76522(Lsm8)
RNO: 296913(Lsm8)
CGE: 100756548(Lsm8)
NGI: 103737332(Lsm8)
HGL: 101708401(Lsm8) 106008778
CCAN: 109700506(Lsm8)
OCU: 100358159(LSM8)
TUP: 102469267(LSM8)
CFA: 100685900 475298(LSM8)
AML: 100479478(LSM8)
UMR: 103676593(LSM8)
ORO: 101363054(LSM8)
FCA: 101085872(LSM8)
PTG: 102957233(LSM8)
AJU: 106970663(LSM8)
BTA: 613630(LSM8)
BOM: 102265016(LSM8)
BIU: 109557928(LSM8)
PHD: 102327891(LSM8)
CHX: 102168690(LSM8)
OAS: 101102229(LSM8)
SSC: 100739296(LSM8)
CFR: 102505854(LSM8)
CDK: 105085327(LSM8)
BACU: 103005706(LSM8)
LVE: 103086028(LSM8)
OOR: 101277580(LSM8)
ECB: 100071271(LSM8)
EPZ: 103556613(LSM8)
EAI: 106829394(LSM8)
MYB: 102258246(LSM8)
MYD: 102771725(LSM8)
HAI: 109377627(LSM8)
PALE: 102884068(LSM8)
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TMU: 101343403
MDO: 100012204(LSM8)
SHR: 100917785(LSM8)
OAA: 100077583(LSM8)
GGA: 417765(LSM8)
MGP: 100543190(LSM8)
CJO: 107309059(LSM8)
APLA: 101801164(LSM8)
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TGU: 100229832(LSM8) 100230262
GFR: 102035967(LSM8)
FAB: 101821106(LSM8)
PHI: 102114166(LSM8)
PMAJ: 107204648(LSM8)
CCW: 104698287(LSM8)
FPG: 101922270(LSM8)
FCH: 102046665(LSM8)
CLV: 102089102(LSM8)
EGZ: 104133405(LSM8)
AAM: 106488899(LSM8)
ASN: 102368199(LSM8)
AMJ: 102569069(LSM8)
PSS: 102448812(LSM8)
CMY: 102932268(LSM8)
CPIC: 101933023(LSM8)
ACS: 100562026(lsm8)
PVT: 110077040(LSM8)
PBI: 103056850(LSM8)
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XLA: 108711139 414679(lsm8.S)
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SMIN: v1.2.002943.t1(symbB.v1.2.002943.t1)
SPAR: SPRG_11298
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.21.9646-9657.2004
  Sequence
[sce:YJR022W]

DBGET integrated database retrieval system