KEGG ORTHOLOGY: K13167

ORTHOLOGY: K13167

Entry

K13167                      KO

Symbol

SCAF4, SFRS15

Name

SR-related and CTD-associated factor 4

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K13167  SCAF4, SFRS15; SR-related and CTD-associated factor 4
   03041 Spliceosome
    K13167  SCAF4, SFRS15; SR-related and CTD-associated factor 4
Transcription machinery [BR:ko03021]
Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Other transcription-related factors
    Transcription termination factor
     K13167  SCAF4, SFRS15; SR-related and CTD-associated factor 4
Spliceosome [BR:ko03041]
Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   SR proteins
    K13167  SCAF4, SFRS15; SR-related and CTD-associated factor 4

Genes

HSA:	57466(SCAF4)

PTR:	474092(SCAF4)

PPS:	100969954(SCAF4)

GGO:	101130776(SCAF4)

PON:	100432990(SCAF4)

NLE:	100605877(SCAF4)

HMH:	116482391(SCAF4)

MCC:	701931(SCAF4)

MCF:	102117327(SCAF4)

MTHB:

126951692

MNI:	105472733(SCAF4)

CSAB:

103217157(SCAF4)

CATY:

105575355(SCAF4)

PANU:

101008811(SCAF4)

TGE:	112621128(SCAF4)

MLEU:

105545974(SCAF4)

RRO:	104664626(SCAF4)

RBB:	108536839(SCAF4)

TFN:	117095686(SCAF4)

PTEH:

111525038(SCAF4)

CANG:

105520963(SCAF4)

CJC:	100392289(SCAF4)

SBQ:	101053841(SCAF4)

CIMI:

108295125(SCAF4)

CSYR:

103250292(SCAF4)

MMUR:

105880120(SCAF4)

LCAT:

123630680(SCAF4)

PCOQ:

105820832(SCAF4)

OGA:	100961769(SCAF4)

MMU:	224432(Scaf4)

MCAL:

110311956(Scaf4)

MPAH:

110329671(Scaf4)

RNO:	245924(Scaf4)

MCOC:

116086108(Scaf4)

ANU:	117718198(Scaf4)

MUN:	110563716(Scaf4)

CGE:	100765380(Scaf4)

MAUA:

101829976(Scaf4)

PROB:

127227506(Scaf4)

PLEU:

114698451(Scaf4)

MORG:

121465279(Scaf4)

MFOT:

126515284

AAMP:

119824514(Scaf4)

NGI:	103736470(Scaf4)

HGL:	101713662(Scaf4)

CPOC:

100719120(Scaf4)

CCAN:

109700072(Scaf4)

DORD:

105994098(Scaf4)

DSP:	122114222(Scaf4)

PLOP:

125351517(Scaf4)

NCAR:

124992481

MMMA:

107136432(Scaf4)

OCU:

100345182

OPI:	101525520(SCAF4)

TUP:	102477914(SCAF4)

GVR:	103585521(SCAF4)

CFA:	100687160(SCAF4)

CLUD:

112661654(SCAF4)

VVP:	112909261(SCAF4)

VLG:	121479537(SCAF4)

NPO:	129502029(SCAF4)

AML:	100477759(SCAF4)

UMR:	103673213(SCAF4)

UAH:	113266475(SCAF4)

UAR:	123784193(SCAF4)

ELK:

111155697

LLV:

125095110

MPUF:

101694127(SCAF4)

MNP:	132012343(SCAF4)

MLK:	131825302(SCAF4)

NVS:	122908343(SCAF4)

ORO:	101371214(SCAF4)

EJU:	114217139(SCAF4)

ZCA:	113917987(SCAF4)

MLX:	118018816(SCAF4)

NSU:	110570114(SCAF4)

LWW:	102750380(SCAF4)

FCA:	101094285(SCAF4)

PYU:	121036016(SCAF4)

PCOO:

112849765(SCAF4)

PBG:	122491245(SCAF4)

PVIV:

125174758(SCAF4)

LRUF:

124526013

PTG:	102956506(SCAF4)

PPAD:

109249687(SCAF4)

PUC:

125920775

AJU:

106966468

HHV:	120229685(SCAF4)

BTA:	541016(SCAF4)

BOM:	102279552(SCAF4)

BIU:	109556070(SCAF4)

BBUB:

102413766(SCAF4)

BBIS:

105004637(SCAF4)

CHX:	102169904(SCAF4)

OAS:	101114330(SCAF4)

BTAX:

128053873(SCAF4)

ODA:	120854168(SCAF4)

CCAD:

122428613(SCAF4)

MBEZ:

129552756(SCAF4)

SSC:	100627258(SCAF4)

CFR:	102505129(SCAF4)

CBAI:

105070248(SCAF4)

CDK:	105086834(SCAF4)

VPC:	102527270(SCAF4)

BACU:

103012237(SCAF4)

BMUS:

118894078(SCAF4)

LVE:	103076402(SCAF4)

OOR:	101277965(SCAF4)

DLE:	111172001(SCAF4)

PCAD:

102973869(SCAF4)

PSIU:

116753483(SCAF4)

NASI:

112408557(SCAF4)

ECB:	100052712(SCAF4)

EPZ:	103567258(SCAF4)

EAI:	106847106(SCAF4)

MYB:	102243327(SCAF4)

MYD:	102773667(SCAF4)

MMYO:

118674972(SCAF4)

MLF:	102425232(SCAF4)

PKL:	118714132(SCAF4)

EFUS:

103289939(SCAF4)

MNA:	107533507(SCAF4)

DRO:	112305492(SCAF4)

SHON:

118983243(SCAF4)

AJM:	119060960(SCAF4)

PDIC:

114490017(SCAF4)

PHAS:

123828074(SCAF4)

MMF:	118617093(SCAF4)

PPAM:

129074119(SCAF4)

HAI:	109393517(SCAF4)

RFQ:	117031757(SCAF4)

PALE:

102897911(SCAF4)

PGIG:

120598833(SCAF4)

PVP:	105301271(SCAF4)

RAY:	107519574(SCAF4)

MJV:	108398580(SCAF4)

TOD:	119257242(SCAF4)

SARA:

101539995(SCAF4)

LAV:	100670134(SCAF4)

TMU:

101353191

ETF:	101663232(SCAF4)

DNM:	101440496(SCAF4)

MDO:	100025053(SCAF4)

GAS:	123241640(SCAF4)

SHR:	100921849(SCAF4)

AFZ:

127553842

PCW:	110214885(SCAF4)

OAA:	100090979(SCAF4)

GGA:	418492(SCAF4)

PCOC:

116242077(SCAF4)

MGP:	100539853(SCAF4)

CJO:	107322789(SCAF4)

TPAI:

128076424(SCAF4)

LMUT:

125688280(SCAF4)

NMEL:

110402286(SCAF4)

APLA:

101801974(SCAF4)

ACYG:

106043440(SCAF4)

CATA:

118247647(SCAF4)

AFUL:

116496989(SCAF4)

TGU:	100230939(SCAF4)

LSR:	110481470(SCAF4)

SCAN:

103818446(SCAF4)

PMOA:

120496481(SCAF4)

OTC:	121344680(SCAF4)

PRUF:

121349724(SCAF4)

GFR:	102040173(SCAF4)

FAB:

101805635

OMA:	130253950(SCAF4)

PHI:	102110329(SCAF4)

PMAJ:

107214033(SCAF4)

CCAE:

111942391(SCAF4)

CCW:	104684203(SCAF4)

CBRC:

103625243(SCAF4)

ETL:	114070266(SCAF4)

ZAB:	102070964(SCAF4)

ACHL:

103797056(SCAF4)

SVG:	106860735(SCAF4)

MMEA:

130574760(SCAF4)

HRT:	120749086(SCAF4)

FPG:	101916315(SCAF4)

FCH:	102057941(SCAF4)

CLV:	102090071(SCAF4)

EGZ:	104128219(SCAF4)

NNI:	104020114(SCAF4)

PCRI:

104024417(SCAF4)

PLET:

104627757(SCAF4)

EHS:	104516312(SCAF4)

PCAO:

104048448(SCAF4)

ACUN:

113476408(SCAF4)

TALA:

104355489(SCAF4)

PADL:

103920309(SCAF4)

AFOR:

103902063(SCAF4)

ACHC:

115344168(SCAF4)

HALD:

104322022(SCAF4)

HLE:	104842741(SCAF4)

AGEN:

126053216

GCL:

127014958

CSTI:

104562156(SCAF4)

CMAC:

104481716

MUI:	104540006(SCAF4)

BREG:

104629110(SCAF4)

FGA:

104082796

GSTE:

104259104

LDI:	104344677(SCAF4)

MNB:	103777410(SCAF4)

OHA:	104328360(SCAF4)

NNT:	104399363(SCAF4)

SHAB:

115604376(SCAF4)

DPUB:

104306438(SCAF4)

PGUU:

104466776(SCAF4)

CPEA:

104392421(SCAF4)

AVIT:

104275012(SCAF4)

CVF:	104295181(SCAF4)

RTD:	128904150(SCAF4)

CUCA:

104064766(SCAF4)

TEO:	104369873(SCAF4)

BRHI:

104494307(SCAF4)

AAM:	106494943(SCAF4)

AROW:

112971886(SCAF4)

NPD:	112952142(SCAF4)

TGT:	104577166(SCAF4)

DNE:	112985155(SCAF4)

SCAM:

104139463(SCAF4)

ASN:	102388474(SCAF4)

AMJ:	102569238(SCAF4)

CPOO:

109305759(SCAF4)

GGN:	109302615(SCAF4)

PSS:	102446131(SCAF4)

CMY:	102938583(SCAF4)

DCC:	119850064(SCAF4)

CPIC:

101937510(SCAF4)

TST:	117889425(SCAF4)

CABI:

116835440(SCAF4)

MRV:	120398865(SCAF4)

ACS:	100551800(scaf4)

ASAO:

132771900(SCAF4)

PVT:	110080386(SCAF4)

SUND:

121924743(SCAF4)

PBI:	103061885(SCAF4)

PMUR:

107290532(SCAF4)

CTIG:

120319737

TSR:	106545349(SCAF4)

PGUT:

117674068(SCAF4)

APRI:

131199202(SCAF4)

PTEX:

113436284(SCAF4)

NSS:	113409867(SCAF4)

VKO:	123029501(SCAF4)

PMUA:

114596031(SCAF4)

PRAF:

128412963(SCAF4)

ZVI:	118084661(SCAF4)

HCG:	128348841(SCAF4)

GJA:	107114170(SCAF4)

STOW:

125431305(SCAF4)

EMC:	129326612(SCAF4)

XLA:	108707882(scaf4.L) 108709222(scaf4.S)

XTR:	595037(scaf4)

NPR:	108791093(SCAF4) 108791107

RTEM:

120927890(SCAF4)

BBUF:

120994538(SCAF4)

BGAR:

122930799(SCAF4)

MUO:	115469462(SCAF4)

GSH:	117362805(SCAF4)

DRE:	567501(scaf4a)

SRX:	107705626 107718735 107720638 107722265

SANH:

107669875 107670118 107693920 107701136

SGH:	107555128 107557222 107558831 107585791

CCAR:

109097903 109103309

CAUA:

113054301 113058691 113109850 113113267 113114734

CGIB:

127966411 127972948 128021186 128029035

PTET:

122353018(scaf4a) 122358810(scaf4b)

LROH:

127172315(scaf4a) 127177030(scaf4b)

OMC:	131520353(scaf4b) 131548407(scaf4a)

PPRM:

120476485(scaf4a)

RKG:	130073149 130082824(scaf4a)

MAMB:

125248576(scaf4b) 125258857(scaf4a)

CIDE:

127495902 127521564

MASI:

127422224 127429886 127432491 127433845

TROS:

130546361(scaf4a) 130564841(scaf4b)

TDW:	130411917(scaf4a) 130428823(scaf4b)

MANU:

129446950(scaf4a)

IPU:	108277104(scaf4a) 108278224

IFU:	128620014(scaf4a)

PHYP:

113543597(scaf4) 113544466

SMEO:

124393596(scaf4a)

TFD:	113659190(scaf4a)

TVC:	132863081(scaf4a)

AMEX:

103030891 103037277(scaf4)

CMAO:

118797944 118824482(scaf4a)

EEE:	113571776(scaf4) 113578716

CHAR:

122131697(scaf4a)

TRU:	101063067 101079009(scaf4)

TFS:	130535033 130537394(scaf4a)

TNG:	GSTEN00018897G001

LCO:	104923284 104923807(scaf4)

NCC:	104946281(scaf4)

TBEN:

117468904 117490324(scaf4a)

CGOB:

115017532 115019173(scaf4)

PGEO:

117457603 117458219(scaf4a)

GACU:

117536434(scaf4a) 117540433

EMAC:

134872513(scaf4a) 134880724

ELY:	117259548 117270210(scaf4a)

EFO:	125889212 125898997(scaf4a)

PLEP:

121942959 121952641

SLUC:

116036981(scaf4a) 116048369

ECRA:

117940274 117955565(scaf4a)

ESP:	116675716 116700475(scaf4)

PFLV:

114553102 114566382(scaf4)

GAT:	120817897 120822506(scaf4a)

PPUG:

119214856 119215599(scaf4a)

AFB:	129088876 129113681(scaf4a)

CLUM:

117741969 117742323(scaf4a)

PSWI:

130191955(scaf4a) 130210359

MSAM:

119882274 119884838 119895580(scaf4a)

SCHU:

122879401 122887809(scaf4a)

CUD:	121518703(scaf4a) 121526706

ALAT:

119031162(scaf4a) 119032656

MZE:	101477494 101483184(scaf4)

ONL:	100693803 100698488(scaf4)

OAU:	116310842 116331403(scaf4a)

OLA:	101172836(scaf4) 101174611

OML:	112142648(scaf4a) 112149200

CSAI:

133441929 133459395(scaf4a)

XMA:	102228016 102228422(scaf4)

XCO:	114153358(scaf4) 114161547

XHE:	116707886 116728326(scaf4)

PRET:

103474985 103475534(scaf4)

PFOR:

103140389(scaf4) 103140417 103149444

PLAI:

106934797 106937926 106950580

PMEI:

106904019 106906776 106914094

GAF:	122832527 122845018(scaf4a)

PPRL:

129356971 129358936

CVG:	107087928(scaf4) 107095573

CTUL:

119783468(scaf4a) 119789471

GMU:	124876582(scaf4a) 124883775

NFU:	107380222 107386953(scaf4)

KMR:	108236028 108237044(scaf4a)

ALIM:

106514131(scaf4) 106520556

NWH:	119410964 119420544(scaf4a)

AOCE:

111563697 111575872(scaf4)

MCEP:

125013168 125020859(scaf4a)

CSEM:

103378217 103395508(scaf4)

POV:	109630413 109635800(scaf4)

SSEN:

122759968 122779893(scaf4a)

HHIP:

117772422 117774485(scaf4a)

HSP:	118106112 118122097(scaf4a)

SMAU:

118294701 118300336(scaf4a)

LCF:	108876058 108893907(scaf4a)

SDU:	111217151(scaf4) 111224475

SLAL:

111652334(scaf4) 111657803

XGL:	120792300 120802721(scaf4a)

HCQ:	109509754 109530783

SSCV:

125972485 125982285

SBIA:

133492019(scaf4a) 133504770

PEE:	133405084(scaf4b) 133415601(scaf4a)

PTAO:

133466962(scaf4a) 133482259

BPEC:

110158428(scaf4) 110175097

MALB:

109959220(scaf4) 109967515

BSPL:

114867737 114869396(scaf4a)

SJO:	128360679 128371525(scaf4a)

SASA:

106563893 106581524 106613351(scaf4)

STRU:

115163809 115187970 115202670 115206870(scaf4)

OTW:	112231463(scaf4a) 112266208 112267333

OMY:	110503265 110508083 110509473(scaf4a)

OGO:	123992480 124004973 124006912

ONE:	115123066 115123489 115146963

OKI:	109880469 109885625 109904933

OKE:	118375164 118381391(scaf4a)

SALP:

111958074 112073235

SNH:	120018043 120021164 120028602

CCLU:

121542032(scaf4a) 121566852

ELS:	105012946 105026058(scaf4)

SFM:	108936262(scaf4)

PKI:	111840435(scaf4)

AANG:

118209835 118235972(scaf4a)

LOC:	102697019(scaf4)

PSPA:

121320413 121327804

ARUT:

117405866 117406457

PSEX:

120523539

LCM:	102354080(SCAF4)

CMK:	103185514(scaf4a)

CPLA:

122555063(scaf4a)

HOC:	132821027(scaf4a)

LERI:

129702645(scaf4a)

CSET:

APLN:

PPYR:

DCI:

DMK:

LSM:

PPOI:

PTEP:

CEL:	CELE_D1007.7(nrd-1)

CBR:	CBG_22270(Cbr-nrd-1)

NAI:	NECAME_02733

LOA:	LOAG_17472

BGT:

HRJ:

CRG:

CVN:

CANU:

OED:

NVE:

AMIL:

PDAM:

SPIS:

DGT:

HMG:

AQU:

ACAN:

Reference

PMID:18550522

Authors

Becker R, Loll B, Meinhart A

Title

Snapshots of the RNA processing factor SCAF8 bound to different phosphorylated forms of the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II.

Journal

J Biol Chem 283:22659-69 (2008)
DOI:10.1074/jbc.M803540200

Sequence

[hsa:57466]

All links

Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Gene (1969)   
   KEGG GENES (539)   
   KEGG MGENES (659)   
   RefGene (766)   
   OC (5)   
Literature (1)   
   PubMed (1)   
All databases (1973)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system