KEGG   ORTHOLOGY: K13171Help
Entry
K13171                      KO                                     

Name
SRRM1, SRM160
Definition
serine/arginine repetitive matrix protein 1
Pathway
RNA transport
mRNA surveillance pathway
Module
M00430  
Exon junction complex (EJC)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03013 RNA transport
    K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
   03015 mRNA surveillance pathway
    K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00430  Exon junction complex (EJC)
     K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   SR-related proteins
    K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
10250(SRRM1)
PTR: 
456632(SRRM1)
PPS: 
100993769(SRRM1)
PON: 
100173713(SRRM1)
MCC: 
MCF: 
102142011(SRRM1)
MMU: 
51796(Srrm1)
RNO: 
313620(Srrm1)
CGE: 
100757992(Srrm1)
HGL: 
101724550(Srrm1)
TUP: 
CFA: 
478185(SRRM1)
FCA: 
101098241(SRRM1)
PTG: 
BTA: 
784123(SRRM1)
BOM: 
PHD: 
102339442(SRRM1)
CHX: 
SSC: 
100521629(SRRM1)
CFR: 
102509535(SRRM1)
BACU: 
LVE: 
ECB: 
100071467(SRRM1)
MYB: 
MYD: 
102765371(SRRM1)
PALE: 
MDO: 
100010857(SRRM1)
SHR: 
OAA: 
100078424(SRRM1)
GGA: 
428216(SRRM1)
MGP: 
FAB: 
101817622(SRRM1)
PHI: 
APLA: 
101795236(SRRM1)
FPG: 
101923218(SRRM1)
FCH: 
CLV: 
ASN: 
AMJ: 
CMY: 
ACS: 
100567164(srrm1)
PBI: 
XLA: 
445881(srrm1) 494754
XTR: 
448115(srrm1)
DRE: 
406751(srrm1)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102346247(SRRM1)
CMK: 
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
Dmel_CG11274(SRm160)
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
CQU: 
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
100160294(Srrm1)
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG07956(Cbr-rsr-1)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0001s25140g(POPTRDRAFT_172546) POPTR_0009s04160g(POPTRDRAFT_879725)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os03t0270200-01(Os03g0270200)
OBR: 
BDI: 
SITA: 
ATR: 
s00012p00256890(AMTR_s00012p00256890)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
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MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
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PGU: 
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NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
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CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_2546174(AO090005001466)
ANG: 
ANI_1_3074024(An02g11630)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
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PBL: 
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PNO: 
PTE: 
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PFJ: 
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PPL: 
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SHS: 
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ADL: 
FME: 
GTR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT116472(AGABI1DRAFT_116472)
ABV: 
AGABI2DRAFT194307(AGABI2DRAFT_194307)
CPUT: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
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WSE: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_04067(srrm1)
EHI: 
EHI_013250(14.t00046)
EDI: 
ACAN: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TGO: 
TET: 
TPS: 
PIF: 
NGD: 
EHX: 
GTT: 
NGR: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Caceres JF, Blencowe BJ
  Title
An evolutionarily conserved role for SRm160 in 3'-end processing that functions independently of exon junction complex formation.
  Journal
J Biol Chem 278:44153-60 (2003)
  Sequence
[hsa:10250]

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