KEGG   ORTHOLOGY: K14548Help
Entry
K14548                      KO                                     

Name
UTP4, CIRH1A
Definition
U3 small nucleolar RNA-associated protein 4
Pathway
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Disease
H00624  Familial cholestasis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K14548  UTP4, CIRH1A; U3 small nucleolar RNA-associated protein 4
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic Type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    K14548  UTP4, CIRH1A; U3 small nucleolar RNA-associated protein 4
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG2319
Genes
HSA: 84916(UTP4)
PTR: 454197(UTP4)
PPS: 100977899(UTP4)
GGO: 101150202(UTP4)
PON: 100172915(UTP4)
NLE: 100597751(UTP4)
MCC: 705036(UTP4)
MCF: 102145277(UTP4)
CSAB: 103233224(UTP4)
RRO: 104655686(UTP4) 104661630
RBB: 108514510(UTP4)
CJC: 100401215(UTP4)
SBQ: 101040952(CIRH1A)
MMU: 21771(Utp4)
RNO: 291987(Utp4)
CGE: 100757324(Utp4)
NGI: 103734791(Utp4)
HGL: 101717614(Utp4)
CCAN: 109693774(Utp4)
OCU: 100355535(UTP4)
TUP: 102490380(UTP4)
CFA: 489738(UTP4)
AML: 100474816(UTP4)
UMR: 103673617(UTP4)
ORO: 101373198(CIRH1A)
FCA: 101096526(UTP4)
PTG: 102954480(UTP4)
AJU: 106972099(UTP4)
BTA: 510315(UTP4)
BOM: 102283019(UTP4)
BIU: 109572272(UTP4)
PHD: 102327921(UTP4)
CHX: 102171455(UTP4)
OAS: 101120686(UTP4)
SSC: 414432(UTP4)
CFR: 102517110(UTP4)
CDK: 105088405(UTP4)
BACU: 103001007(UTP4)
LVE: 103072183(UTP4)
OOR: 101280149(CIRH1A)
ECB: 100066965(UTP4)
EPZ: 103566425(UTP4)
EAI: 106822466(UTP4)
MYB: 102242030(UTP4) 106728140
MYD: 102768135(UTP4)
HAI: 109389328(UTP4)
RSS: 109460936(UTP4)
PALE: 102887664(UTP4)
LAV: 100660800(UTP4)
TMU: 101348659
MDO: 100020058(UTP4)
SHR: 100915731(UTP4)
OAA: 100079357(UTP4)
GGA: 769632(UTP4)
MGP: 100547335(UTP4)
CJO: 107319478(UTP4)
APLA: 101794714(UTP4)
TGU: 100229140(UTP4)
GFR: 102040621(UTP4)
FAB: 101815221(UTP4)
PHI: 102112511(UTP4)
PMAJ: 107210033(UTP4)
FPG: 101920706(UTP4)
CLV: 102086781(UTP4)
EGZ: 104129688(CIRH1A)
AAM: 106487434(UTP4)
ASN: 102379693(UTP4)
AMJ: 102559182(UTP4)
PSS: 102456872(UTP4)
CMY: 102935386(UTP4)
CPIC: 101951037(UTP4)
ACS: 100557850(utp4)
PVT: 110076335(UTP4)
PBI: 103053342(UTP4)
GJA: 107106549(UTP4)
XLA: 108715429(utp4.S) 379136(utp4.L)
XTR: 733991(utp4)
NPR: 108787712(UTP4)
DRE: 406571(utp4)
IPU: 108264269(utp4)
AMEX: 103033628(utp4)
TRU: 101068325(utp4)
LCO: 104930144(utp4) 109138040
MZE: 101487953(utp4)
OLA: 101165728(utp4)
XMA: 102230175(utp4)
PRET: 103466740(utp4)
NFU: 107389164(utp4)
CSEM: 103379755(utp4)
LCF: 108902275(utp4)
HCQ: 109520767(utp4)
BPEC: 110169572(utp4)
SASA: 106560879(utp4) 106573694
ELS: 105018591(utp4)
SFM: 108926535(utp4)
LCM: 102353156(UTP4)
CMK: 103188092(utp4)
CIN: 100180054
APLC: 110982164
SKO: 100378061
DME: Dmel_CG5018(l(3)72Dn)
DSI: Dsimw501_GD12505(Dsim_GD12505)
MDE: 101887615
AAG: 5568119
AME: 724542
BIM: 100749678
BTER: 100645054
SOC: 105197147
AEC: 105154205
ACEP: 105619243
PBAR: 105433917
HST: 105191321
CFO: 105255732
LHU: 105674702
PGC: 109856011
NVI: 100119913
TCA: 663378
DPA: 109546562
NVL: 108565106
BMOR: 101742367
PMAC: 106719119
PRAP: 110992171
API: 100168462
DNX: 107171165
ZNE: 110829122
FCD: 110854425
TUT: 107362493
CRG: 105342118
OBI: 106877551
SHX: MS3_10098
ADF: 107339745
HMG: 100206371
ATH: AT1G27470 AT4G07410(PCN)
CPAP: 110808440
CIT: 102629361
TCC: 18601299
EGR: 104449250
VRA: 106765128
VAR: 108338395
ADU: 107495772
AIP: 107605591
LJA: Lj1g3v1733530.1(Lj1g3v1733530.1)
FVE: 101291781
PPER: 18793991
PMUM: 103320479
PAVI: 110772473
CSV: 101222880
CMO: 103493610
MCHA: 111007425
RCU: 8283219
HBR: 110671356
VVI: 100243694
INI: 109170567
SIND: 105159093
BVG: 104901882
SOE: 110790790
NNU: 104609684
OSA: 4334021
DOSA: Os03t0735100-01(Os03g0735100)
OBR: 102707944
BDI: 100837329
ATS: 109750427(LOC109750427) 109776662(LOC109776662)
SBI: 8059937
SITA: 101770131
EGU: 105054900
MUS: 103972978
DCT: 110114352
ATR: 18446959
MNG: MNEG_7651
APRO: F751_2416
SCE: YDR324C(UTP4)
KMX: KLMA_50356(UTP4)
NCS: NCAS_0F02940(NCAS0F02940)
NDI: NDAI_0C04390(NDAI0C04390)
TPF: TPHA_0D02150(TPHA0D02150)
TBL: TBLA_0A03210(TBLA0A03210)
TDL: TDEL_0E02620(TDEL0E02620)
KAF: KAFR_0D04430(KAFR0D04430)
CAL: CAALFM_C302130WA(UTP4)
CAUR: QG37_03586
SLB: AWJ20_2662(UTP4)
NCR: NCU00650
NTE: NEUTE1DRAFT150889(NEUTE1DRAFT_150889)
MGR: MGG_03597
MAW: MAC_05544
MAJ: MAA_05165
CMT: CCM_07623
BFU: BCIN_01g01040(Bcutp4)
MBE: MBM_00911
ANI: AN3794.2
ANG: ANI_1_1060064(An07g08590)
ABE: ARB_06218
TVE: TRV_01688
PTE: PTT_14199
SPO: SPBC19F5.02c(utp4)
CNE: CNM00140
CNB: CNBM0150
MRR: Moror_194
ABP: AGABI1DRAFT116933(AGABI1DRAFT_116933)
ABV: AGABI2DRAFT198370(AGABI2DRAFT_198370)
MGL: MGL_2244
DDI: DDB_G0293462(cirh1a)
DFA: DFA_11991(cirh1a)
EHI: EHI_023870(484.t00001)
SMIN: v1.2.027441.t1(symbB.v1.2.027441.t1)
SPAR: SPRG_00194
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Freed EF, Baserga SJ
  Title
The C-terminus of Utp4, mutated in childhood cirrhosis, is essential for ribosome biogenesis.
  Journal
Nucleic Acids Res 38:4798-806 (2010)
DOI:10.1093/nar/gkq185
  Sequence
[sce:YDR324C]
Reference
  Authors
Yu B, Mitchell GA, Richter A
  Title
Cirhin up-regulates a canonical NF-kappaB element through strong interaction with Cirip/HIVEP1.
  Journal
Exp Cell Res 315:3086-98 (2009)
DOI:10.1016/j.yexcr.2009.08.017
  Sequence
[hsa:84916]

DBGET integrated database retrieval system