KEGG   Lactobacillus gasseri: LGAS_1186Help
Entry
LGAS_1186         CDS       T00410                                 

Definition
exonuclease V subunit alpha
Orthology
K03581  
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
lga  Lactobacillus gasseri
Pathway
Homologous recombination
Class
Genetic Information Processing; Replication and repair; Homologous recombination [PATH:lga03440]
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
JGI: 
UniProt: 
Position
complement(1187063..1189441)
Genome map
AA seq 792 aa AA seqDB search
MAETSFTGRINGIVFENNQDLFKIIDVDLISKLADYDRDNIRVTGNFGDIQIGSTYKFVG
QVVVHEKFGKQFRVSSYEPVLPHEEGSLAKYLSSDKFPGIGKKAAEKIIASLGTNALDLI
KSNPTEIENLDLTPKQKNSLLSGINQMDSFSEIVIKLAKYGINKKTAGNIYKAYHGDSLK
KLEEDPYQAVGEIRGFGFRTADNIGQALGIELNDPKRVRGAILSILQSALSTLGDTYVAL
DDLLTQAYDLVQASSYDDLANSVNELQRQGKVVVSGDKAALQGIFQTELDISNELKRLVK
NRVEKEKFSDEKIEHAINHAEEELEIKYDETQKKAIKNALNNPISILTGGPGTGKTTIIN
GILMCLKELAEIPSGALYSEDPPFLLAAPTGRAAKRMSEITDISAKTIHRLLGLGIGEND
ATDVNELNGEILIIDEMSMVDMFLFKQLLSGINSTKRIVFVGDQDQLPSVGAGNIFSDLI
KSEAFPTTRLQVIHRQGEDSSIIKLAHAINEEDAEQIIFNKTKNYSFIPCQPRLVGDAID
QIVNLAIKRGFEKDDVQVLGAMYNGQGGITHLNDILQDVMNPMSSKTKVIEAHNESFRIG
DRILQLQNNPEKDIYNGQIGKIIGLNPDDKAKILIADFDGREIEFSVKDLNDITRAYAIT
IHKSQGSEFPLVILNLTMQNYMMLRRNLLYTAITRAEKNLVMVGEKKAYLMALRTPGNDR
KTDLASKIRHELGLKEVVEHDSNENIKQEQAQTEVKEEVTEPKDYILTPDLIYSGKINPM
IGMEKIELKARD
NT seq 2379 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atggcagaaactagttttactggacgaattaacggaattgtttttgaaaataatcaagat
cttttcaaaattattgatgtagacttgattagtaaattagcagattatgatcgtgacaat
atccgagtaactggtaattttggtgatattcagattggctcgacttacaagtttgttggt
caagttgttgtacatgaaaagtttggtaaacaatttcgcgttagttcatatgaaccagtt
ttaccacatgaagagggaagtttagcgaaatatctaagttctgataaattccccggtatt
ggtaaaaaagccgctgagaagattattgctagtttaggtactaatgccttggatctgatt
aagtccaacccaactgaaattgaaaaccttgatttaacgccaaagcaaaagaatagttta
ctatctgggattaatcaaatggactctttctcagaaattgttattaagctagctaaatac
ggaattaataaaaaaactgctggaaatatttataaagcctatcatggagattctctaaaa
aaacttgaagaggatccttatcaagcagttggtgaaattagaggcttcggctttaggaca
gcagataatattggtcaagcacttggaattgaattaaatgatccaaaaagagttagaggt
gcaattttaagtattttgcagagtgctctaagtacgctgggagacacttatgtggcacta
gatgatttactaactcaggcatatgatttggttcaagctagttcttatgacgacttggca
aatagtgtgaatgagcttcagcgtcaaggtaaggtggttgtgtcaggcgacaaagcagct
ttacagggaatttttcaaactgaacttgatatttcaaatgagttaaagcgtttagtcaaa
aatcgggtagaaaaagaaaaattcagtgatgaaaaaattgagcatgcaattaatcatgct
gaagaagaacttgaaattaagtatgacgaaacgcaaaaaaaagctattaaaaatgcttta
aataatccaatttccattcttactggtggaccaggtactggtaagacaacaattattaat
ggaattttgatgtgtttaaaggaacttgcagagattccaagtggagccttgtatagtgaa
gatccgccatttttgttagctgctccaacaggacgggctgctaagagaatgagcgagatt
accgatatttctgctaaaactattcaccgtttgttggggctaggtattggcgaaaatgat
gctaccgatgttaatgaattaaatggtgaaattttaattattgatgaaatgtcgatggtt
gatatgtttctgttcaagcagttgttatcggggattaattcgacaaaaagaattgtattt
gttggtgaccaagaccagctaccttcggttggagcgggaaatatttttagtgatctaatt
aagtcagaagcgtttccaacaactagacttcaggtaattcatcgacaaggggaagattca
tcaattatcaagctagctcatgcaattaatgaagaagatgctgaacaaataatttttaat
aaaactaagaactattcctttattccgtgtcagccaaggttagttggagacgcaattgat
caaattgttaatttagctattaagcgtggttttgaaaaggatgacgttcaggtccttgga
gctatgtataatggtcagggcgggattacccacttgaatgacatcttgcaagatgtgatg
aatccaatgtcttctaaaaccaaggtaattgaagcacataatgaaagttttagaatcggt
gatcggattttacaattgcaaaataatcctgaaaaggatatttataatggtcaaattggc
aaaattattggcctcaatcctgatgataaggctaaaatattaattgctgattttgatggc
cgagaaatagagtttagcgttaaagatttaaatgatattactcgtgcttatgcaattacg
attcataaatcacagggatcagaatttccgttagttattttgaatcttactatgcaaaat
tatatgatgttgagacgtaatttgctctatacagcaattactcgagctgagaagaatctc
gttatggtaggagaaaaaaaggcctatcttatggctttacgtacacccggaaatgatcgg
aaaacggatttagcttctaagatcagacatgaattgggtctaaaagaagtagttgagcat
gattctaacgaaaatattaaacaagaacaggctcaaactgaagttaaagaagaggtaact
gaacctaaagattatatcttaactcctgatttaatttactctggtaaaatcaacccaatg
attgggatggaaaagatagaattaaaagcaagagattag

DBGET integrated database retrieval system