KEGG   Mycoplasmopsis bovis CQ-W70: K668_03270
Entry
K668_03270        CDS       T03268                                 
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
mbq  Mycoplasmopsis bovis CQ-W70
Pathway
mbq03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mbq00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K668_03270
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mbq03021]
    K668_03270
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mbq03400]
    K668_03270
Enzymes [BR:mbq01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K668_03270
Transcription machinery [BR:mbq03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K668_03270
DNA repair and recombination proteins [BR:mbq03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      K668_03270
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIA34224
UniProt: A0A059Y010
Position
complement(783053..787489)
AA seq 1478 aa
MNSFNKKIAKEIKKIKISLAAQDDVKNWSCGEVTKPETINYKSYKPERDGLFDELIFGPT
TDFKCPICGTKYKKSDENTICEKTPMCQKYQPVILPKMVRRSRMGHIHLENPVVHFWFFK
IDHSIISKLLGLRIANSNKTVSKGDLEKLIYYKSHIVLEDGGLKKLQKNAIIDISDAAII
YADALEELKERFEKDTEEYEIISEALAELESYAVSQTGQDYGIDFYEYNEIIHEFSKAKI
STGSKAIEYLLENIDLKAEAEFIESEIEKINQHFDSNPTASIKAQERSKLYKRLAVVNAF
IHSGQDPKSMLIYDLPVIPADLRPLVQLDGGRHSTSDVNELYRRIIIRNNRLKKWEETDA
PMLIKQNEFRMIQEAVDALIDNSRKKPAPVTSKDNRPLKSISDTLTGKKGRFRQNLLGKR
VDYSGRSVIVVGPELKMHQVGVPREMAAKLFEPWIIKELINGDSHINSIKAGKKAIENLD
PIIWPYVEKAIEGKVVLLNRAPTLHRLSIQAYEPVLIRGKAIKLHPLSCTPFNADFDGDQ
MAIHVPISDEAVREARELMLASKNILGPKDGEPIINPAQDIILGLYYLTMEKSVAIDGDK
VVGEGKFFSTYDEMLLAYENKLVSLHARVALPINEINKKRLNYSPENKYIISTVGKFIFN
RAFPESFEFVFGKHVEYVNKTDANGEVKLSEKEVVYTSNNKNQLEQFLLPYGQNFAEVIA
KMPLNLPLSKKDVAKIVRRVYDKYVAIVTKSDVASVINQINANDISQIFDLCAELKDFNG
KQIDVNHVEILEKIIVEEYKIISQEIILRERTEEPIWTVNDYTKLLEIVWFKYTNVVANV
LDNIKELGYKFSTISGTTISISDVITHQDTKSRIAEGDKYIELLKDYFDQGLMTDDERYN
ATIAKWAAIKDDIEKDLKKLTKLYPDNSLFMMFNSGARGNSSNFVQLAGMRGLMNNNTKV
LKADAENERVVRSTVEIPVKSSFLNGLTAYEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRL
VDVAQGITVREEDCGTDYGFQVKDILDTKTNTVIEGLYDRIEGRFTNKAIYGKDGQLIVD
AGVLITPEIATEIIENEIKKVEIRSVLSCYTPNGVCKKCYGKDLALNRVVNIGEAVGVIA
AQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFGRLIELIDAYDSPWGRPAVISNYYGRITD
IKRIKEGSESVEYDVITQEYKTRDGKVNSVEYKTRAGRKVRVKVNDKVRPGQKIVEGPIV
LNNLLRVGDTRLVQNYILKEVQKLYRLQGITISDKYIEIIIRQMLSKILITDSGDSEFFN
GSLVDIHVYQKESARLISEGKKPPFGEVKIKGAKQIPLLSDSFLAAASYQETPKILVNAS
IKAQVDRLKGLKENIILGHKIPAGTNSNFEENGKYDLRNPKSYFADKYDPDIKTVKFVAD
ENEILSMENRVEIQHIFDEFQSEAFASNMIEFTDESDN
NT seq 4437 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatagttttaataagaaaatagcaaaagaaattaaaaaaataaaaatatcattagcg
gctcaagacgatgttaaaaattgatcatgtggtgaagtaacaaaacctgaaacaattaac
tataagagctataaaccagagcgtgatggtttatttgatgaacttatttttggtcctaca
actgactttaaatgtcctatttgcggcactaagtataagaaaagtgatgaaaacacaatt
tgtgaaaagacaccaatgtgtcaaaaatatcaacctgttattttacctaaaatggttaga
agaagcagaatgggtcacattcatttagaaaaccctgttgtgcacttttgattttttaag
atcgaccactcaattatttctaagttattaggtttaagaatagcaaattcaaataagact
gtttcaaagggtgatttggaaaaattaatttactataagagtcacattgttttagaagat
gggggtcttaagaaacttcaaaagaatgctattattgatatttcagatgctgctattatc
tatgcagacgctttagaagaacttaaagaaagattcgaaaaagatactgaagagtatgaa
ataattagcgaagcattagctgaattagaatcatatgcagtttcacaaactggtcaagat
tatggtattgacttctatgaatacaatgaaattattcatgaattttctaaggctaaaatt
tcaactggttctaaggctattgaatacttattagaaaatatagatctaaaagctgaggct
gaatttattgaaagtgaaattgaaaaaatcaatcaacactttgacagcaatcctactgca
tcaataaaagcacaagaaagatctaaactatacaaacgtttagccgtagttaacgctttt
attcactcagggcaagatcctaaatcaatgcttatttatgatcttccagtaattcctgct
gatttgcgtccattagtacaattagatggcggtcgtcattcaactagtgatgtcaacgaa
ctttatcgtcgtattattattagaaataatcgtttgaaaaaatgggaagaaactgatgct
cctatgcttattaagcaaaatgaatttagaatgattcaagaagctgttgatgctttaatt
gataattctagaaagaaacctgcaccagttacttcaaaagataatcgcccacttaagtca
attagtgacacactaactggtaaaaaaggtagatttagacaaaaccttctaggtaagcgt
gttgattattctggtcgttcagttattgttgttggacctgaattaaaaatgcatcaagtt
ggtgtgccacgtgaaatggccgctaaattgtttgaaccttgaattattaaagaattaatt
aatggtgatagccacataaattcaattaaagctggtaaaaaagcaattgaaaacttagac
ccaattatctgaccttatgttgaaaaagctattgaaggtaaggttgtgcttttaaaccgt
gcccctacactccaccgtttatctattcaagcatatgaacctgtgcttatccgtggtaaa
gcaattaaacttcacccactttcatgtaccccatttaatgctgacttcgatggtgaccaa
atggctatccacgtgcctattagcgatgaagctgtgcgtgaagcaagagagctaatgtta
gcttcaaaaaacattttagggcctaaagatggtgaacctattattaaccctgcacaagat
attatccttggtctttactacctaacaatggaaaaatctgtcgctattgatggtgacaaa
gttgttggtgaaggtaagttcttctctacatatgatgaaatgttattagcatatgaaaac
aaattagtttcacttcatgctcgtgtggcattgccaattaatgaaattaacaagaaaagg
cttaattattcacctgaaaataaatacataatttcaactgtgggtaagtttatttttaat
agagcctttcctgaaagttttgaatttgtttttggtaaacatgtcgaatatgtcaataaa
acagatgcaaacggcgaagttaagttaagtgaaaaagaagtagtttacacttcaaacaat
aagaatcagctagagcagttcctacttccttatggccaaaatttcgctgaagttattgca
aaaatgccacttaatttaccattaagtaaaaaggacgtggctaaaattgtacgtagagtt
tatgacaaatatgttgctatagtaacaaagagcgatgttgcaagcgttataaaccaaatc
aacgcaaatgatataagtcaaatttttgatttatgtgctgaattaaaggactttaacggc
aagcaaattgacgttaaccatgttgaaatattagaaaaaattattgttgaagaatataag
attatctctcaagaaataatactaagagaaagaactgaagaacctatttgaacagttaat
gattacacaaaattgttagaaattgtttgatttaaatatactaacgttgttgctaatgtt
ttggataacattaaagaattaggttacaaattctcaacaatttcaggaactacaatttca
attagtgacgttattactcaccaagatactaagagcagaattgctgaaggcgataaatac
atcgagctattaaaagattattttgatcaaggtttaatgactgatgacgaaagatataat
gcaacaattgctaagtgagctgctattaaggatgatattgaaaaagaccttaagaaacta
actaagctttatcctgataactcattatttatgatgtttaactctggagctcgtggtaac
tcaagtaacttcgtgcaattagctggtatgcgtggacttatgaacaacaacacaaaggtg
ttaaaagccgatgctgaaaacgaacgtgttgttcgttcaactgttgaaattccagttaag
tcatctttcctaaatggtcttactgcttatgaattctattcatcaactcacggtgctcgt
aaaggtttaactgatacagcgcttaacacagctaaatctggttatttaactagaagatta
gttgacgttgctcaaggaattacagtaagagaagaagactgtggaactgactatggcttc
caagttaaagacattttagacactaaaaccaatactgttattgaaggtttatatgacaga
attgaaggaagatttactaataaagcaatttatggtaaagacggacaattaatagttgac
gctggcgtgctaattactcctgaaattgcaactgaaattattgaaaacgaaattaagaaa
gttgaaatccgttcagttctttcatgttatacacctaatggtgtatgtaagaagtgctat
ggtaaggacttagcgcttaaccgtgtagttaacatcggtgaagcagttggtgttattgcg
gctcaatcaataggtgaaccaggtacacaactaactatgcgtacattccatactggtggg
gttgctggtgttgaagatatcactggcggttttggtagattaattgaattaattgatgcc
tatgattcaccatgaggccgtccagctgttatttctaattattatggtcgcataactgat
attaaacgtattaaagaaggctctgaatcggttgaatatgatgttattactcaagagtat
aaaactcgtgatggcaaagtaaattcagttgagtataaaactagagctggcagaaaagta
agagtaaaagttaatgataaagttagaccagggcaaaagatcgttgaaggtccaattgtg
cttaacaatttattaagagttggtgatacacgtttggtgcaaaattacattcttaaagaa
gtgcaaaaactataccgtttacaaggtattaccattagtgacaaatatattgaaataatt
attcgtcaaatgctttctaagattttaattactgactcaggtgattcagaattctttaat
ggttcattagtagatatccatgtttatcaaaaggaaagtgctcgtttaatttcagaaggt
aaaaagccaccttttggtgaagtaaaaattaaaggagctaaacaaattccattattatct
gattcattcttggctgctgcttcatatcaagaaactccaaagattttagttaatgcatct
attaaggcacaagttgacagacttaaagggctaaaggaaaacattatcctaggtcataaa
atacctgctggaactaactctaactttgaagaaaacggaaaatatgacttacgtaaccca
aaatcatattttgcagataaatatgatccggatattaaaactgttaagttcgtggctgat
gaaaatgaaatattaagcatggaaaacagagttgaaattcaacacatttttgatgaattt
cagtctgaagcatttgcttcaaatatgattgaatttacagacgaatctgataattaa

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (4)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (16)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system