KEGG   Mycoplasma fermentans M64: MfeM64YM_1066Help
Entry
MfeM64YM_1066     CDS       T01402                                 

Gene name
recD
Definition
exodeoxyribonuclease v, alpha subunit
Orthology
K03581  
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
mfm  Mycoplasma fermentans M64
Pathway
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mfm00001]
 Genetic Information Processing
  Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    MfeM64YM_1066 (recD)
Enzymes [BR:mfm01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     MfeM64YM_1066 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
UniProt: 
Position
complement(1116173..1118413)
Genome map
AA seq 746 aa AA seqDB search
MQAKTTIKVKGTIKKIRKGLAQKWILFEFKSQENQLFVVYARISSDDFLQVGYLYEMELS
GPNKYNNYILEGYNMIEATKEDLKVMLKNHIRGFKEEDHNILKENLGENYLDVIKDTPKE
ERKIFYEFIKPPLLKKIEAFIEEVLNMGKDERFFITNNIYNFYIKLKQKLPLADGESYLD
FFDKNKENHEDPYLILYIELGLSFDSVDNFASLIGYSKDCETRYYAIVYKSIYDFGIQVN
DTYYNLSDLHKNWLEFTNELILNNKLSISKLAIDNIFINSINKLIEMQKLYYAEKEVPTI
ALSFIKEQEDFIFEKLITIKNKINKTIPQIEDDTLTAKQLDALNIALNEPISIISGFPGT
GKTYLISNIYESLIAQKVYKKGEIEILTPTGRAAINIKNKSNNLPAKTIHNYLKIDKEDE
DVVYNNDCDKTKVVIIDEFSMVNLKIFYQLLSHLSKLEKLIIVGDKDQLPCIGPGNLMHD
LCNWDFIPKTLLIENQRAESDEICEHFLSIIDSKVKEVEIGSTNTIQMKEINSVALLNEL
SYLYQTYNPEYNSEKMVTLIPLHDGQVGAKTVNKWLQKEKLNNYTYKLPKFKQSKDNYIQ
SWEGTKFYLFDNVIQLINDYEKNVFNGEIGIIKEIIDDKIVSVEYPQGGNKFKTVNYVKS
EIAINLSLAYALTVHKFQGSEAPHVVIPVFKDYSRMLNKKLLYTAVSRAKEKLFILGDLA
LYAKKTKTEDYSKIKTYLFDLIKEQN
NT seq 2241 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaagcaaaaacaacaataaaagtaaaaggaacaataaaaaaaataagaaaaggattg
gctcaaaagtgaattctttttgaatttaaatctcaagaaaaccaattatttgttgtctat
gctcgaattagttccgatgactttttacaagttggttatttatatgaaatggaattaagt
gggcctaataaatataataattacatacttgaaggctacaatatgattgaagcaacaaaa
gaagatttaaaagttatgttgaagaatcatattagaggttttaaagaagaagatcataat
attttaaaagaaaatttaggtgaaaattatttagatgttattaaagatacacctaaagaa
gaaagaaaaatattttacgaatttattaaaccccctttgcttaaaaaaatagaagctttt
attgaagaagttctaaacatgggtaaagatgaaagattttttataaccaataatatttac
aatttttatattaaattgaagcaaaaattacctcttgcagatggcgaatcatatttagat
ttttttgataaaaacaaagaaaatcatgaagatccttatcttattttgtatattgaatta
ggattaagctttgactcagtagacaattttgcaagcttaataggatattcaaaagattgc
gaaactagatattatgcaatagtttataaatctatttatgattttggaattcaagttaat
gatacatattacaatttgtctgatttacataaaaattgacttgaatttacaaatgagtta
atactaaataataagttatcaatttcaaagcttgctattgataatatatttattaattct
ataaacaaactaattgaaatgcaaaaattatattatgcagaaaaagaagttccaactata
gcacttagttttattaaagaacaagaagactttatttttgaaaaattaataactataaaa
aataagataaataaaactattccgcaaatagaagatgatacattaactgctaaacaactt
gatgctttaaacattgcactaaatgaaccgataagcataatttcaggattccctggcact
ggcaaaacatatttaattagtaatatttatgagtcattaattgcccaaaaagtctataaa
aaaggtgaaatagaaattttgacccccactggtagagctgcaattaatattaaaaataag
agtaataatttgcctgcaaaaacgattcacaactatttaaaaattgataaagaagatgaa
gacgttgtttataacaatgattgtgacaaaacgaaagttgtaattattgacgagttttca
atggttaatttaaagattttttatcaacttttaagtcatttatccaagcttgaaaagctc
attattgttggagataaagatcagcttccatgtattggacctggcaatttaatgcacgac
ttatgtaattgagattttattcctaaaactcttttaattgaaaatcaaagagctgaaagt
gatgaaatttgcgaacactttttaagtattattgattcaaaagttaaagaagttgaaata
ggaagtacaaacacaattcaaatgaaagaaataaactcagttgcattattaaacgaatta
tcatacttatatcaaacttataatccagaatacaattctgaaaaaatggtaaccttgatt
ccacttcatgatggtcaagttggagccaaaacagttaataaatgattgcaaaaagaaaaa
ctaaataattacacatataagttgcctaaatttaaacaaagtaaagacaactatatccaa
tcttgagaaggtacaaaattctatttatttgacaatgttatccaattaataaatgattat
gaaaaaaatgtttttaatggtgagatcggaataataaaagaaataatagatgacaaaatt
gttagtgttgaatatccacaaggtggaaataaatttaaaacagttaattatgtaaaatca
gaaatagcaattaatttatctttagcatatgctttaactgttcataaatttcaaggttca
gaagcgccacatgttgtaattccggtttttaaagattattcaagaatgcttaataaaaaa
cttttatatacagcagtttcaagagctaaagaaaaattatttattttaggcgacttagct
ttatacgctaaaaaaacaaaaactgaagattatagtaaaataaaaacatatttatttgat
ttaattaaggaacaaaattaa

DBGET integrated database retrieval system