KEGG   Mycoplasma fermentans M64: MfeM64YM_1066Help
Entry
MfeM64YM_1066     CDS       T01402                                 

Gene name
recD
Definition
exodeoxyribonuclease v, alpha subunit
Orthology
K03581  
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
mfm  Mycoplasma fermentans M64
Pathway
Homologous recombination
Class
Genetic Information Processing; Replication and repair; Homologous recombination [PATH:mfm03440]
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
UniProt: 
Position
complement(1116173..1118413)
Genome map
AA seq 746 aa AA seqDB search
MQAKTTIKVKGTIKKIRKGLAQKWILFEFKSQENQLFVVYARISSDDFLQVGYLYEMELS
GPNKYNNYILEGYNMIEATKEDLKVMLKNHIRGFKEEDHNILKENLGENYLDVIKDTPKE
ERKIFYEFIKPPLLKKIEAFIEEVLNMGKDERFFITNNIYNFYIKLKQKLPLADGESYLD
FFDKNKENHEDPYLILYIELGLSFDSVDNFASLIGYSKDCETRYYAIVYKSIYDFGIQVN
DTYYNLSDLHKNWLEFTNELILNNKLSISKLAIDNIFINSINKLIEMQKLYYAEKEVPTI
ALSFIKEQEDFIFEKLITIKNKINKTIPQIEDDTLTAKQLDALNIALNEPISIISGFPGT
GKTYLISNIYESLIAQKVYKKGEIEILTPTGRAAINIKNKSNNLPAKTIHNYLKIDKEDE
DVVYNNDCDKTKVVIIDEFSMVNLKIFYQLLSHLSKLEKLIIVGDKDQLPCIGPGNLMHD
LCNWDFIPKTLLIENQRAESDEICEHFLSIIDSKVKEVEIGSTNTIQMKEINSVALLNEL
SYLYQTYNPEYNSEKMVTLIPLHDGQVGAKTVNKWLQKEKLNNYTYKLPKFKQSKDNYIQ
SWEGTKFYLFDNVIQLINDYEKNVFNGEIGIIKEIIDDKIVSVEYPQGGNKFKTVNYVKS
EIAINLSLAYALTVHKFQGSEAPHVVIPVFKDYSRMLNKKLLYTAVSRAKEKLFILGDLA
LYAKKTKTEDYSKIKTYLFDLIKEQN
NT seq 2241 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaagcaaaaacaacaataaaagtaaaaggaacaataaaaaaaataagaaaaggattg
gctcaaaagtgaattctttttgaatttaaatctcaagaaaaccaattatttgttgtctat
gctcgaattagttccgatgactttttacaagttggttatttatatgaaatggaattaagt
gggcctaataaatataataattacatacttgaaggctacaatatgattgaagcaacaaaa
gaagatttaaaagttatgttgaagaatcatattagaggttttaaagaagaagatcataat
attttaaaagaaaatttaggtgaaaattatttagatgttattaaagatacacctaaagaa
gaaagaaaaatattttacgaatttattaaaccccctttgcttaaaaaaatagaagctttt
attgaagaagttctaaacatgggtaaagatgaaagattttttataaccaataatatttac
aatttttatattaaattgaagcaaaaattacctcttgcagatggcgaatcatatttagat
ttttttgataaaaacaaagaaaatcatgaagatccttatcttattttgtatattgaatta
ggattaagctttgactcagtagacaattttgcaagcttaataggatattcaaaagattgc
gaaactagatattatgcaatagtttataaatctatttatgattttggaattcaagttaat
gatacatattacaatttgtctgatttacataaaaattgacttgaatttacaaatgagtta
atactaaataataagttatcaatttcaaagcttgctattgataatatatttattaattct
ataaacaaactaattgaaatgcaaaaattatattatgcagaaaaagaagttccaactata
gcacttagttttattaaagaacaagaagactttatttttgaaaaattaataactataaaa
aataagataaataaaactattccgcaaatagaagatgatacattaactgctaaacaactt
gatgctttaaacattgcactaaatgaaccgataagcataatttcaggattccctggcact
ggcaaaacatatttaattagtaatatttatgagtcattaattgcccaaaaagtctataaa
aaaggtgaaatagaaattttgacccccactggtagagctgcaattaatattaaaaataag
agtaataatttgcctgcaaaaacgattcacaactatttaaaaattgataaagaagatgaa
gacgttgtttataacaatgattgtgacaaaacgaaagttgtaattattgacgagttttca
atggttaatttaaagattttttatcaacttttaagtcatttatccaagcttgaaaagctc
attattgttggagataaagatcagcttccatgtattggacctggcaatttaatgcacgac
ttatgtaattgagattttattcctaaaactcttttaattgaaaatcaaagagctgaaagt
gatgaaatttgcgaacactttttaagtattattgattcaaaagttaaagaagttgaaata
ggaagtacaaacacaattcaaatgaaagaaataaactcagttgcattattaaacgaatta
tcatacttatatcaaacttataatccagaatacaattctgaaaaaatggtaaccttgatt
ccacttcatgatggtcaagttggagccaaaacagttaataaatgattgcaaaaagaaaaa
ctaaataattacacatataagttgcctaaatttaaacaaagtaaagacaactatatccaa
tcttgagaaggtacaaaattctatttatttgacaatgttatccaattaataaatgattat
gaaaaaaatgtttttaatggtgagatcggaataataaaagaaataatagatgacaaaatt
gttagtgttgaatatccacaaggtggaaataaatttaaaacagttaattatgtaaaatca
gaaatagcaattaatttatctttagcatatgctttaactgttcataaatttcaaggttca
gaagcgccacatgttgtaattccggtttttaaagattattcaagaatgcttaataaaaaa
cttttatatacagcagtttcaagagctaaagaaaaattatttattttaggcgacttagct
ttatacgctaaaaaaacaaaaactgaagattatagtaaaataaaaacatatttatttgat
ttaattaaggaacaaaattaa

DBGET integrated database retrieval system