KEGG   Mycoplasma fermentans JER: MFE_08710Help
Entry
MFE_08710         CDS       T01325                                 

Gene name
recD
Definition
exodeoxyribonuclease V (EC:3.1.11.5)
Orthology
K03581  
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
mfr  Mycoplasma fermentans JER
Pathway
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mfr00001]
 Genetic Information Processing
  Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    MFE_08710 (recD)
Enzymes [BR:mfr01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     MFE_08710 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
UniProt: 
Position
complement(974756..976996)
Genome map
AA seq 746 aa AA seqDB search
MQAKTTIKVKGTIKKIRKGLAQKWILFEFKSQENQLFVVYARISSDDFLQVGYLYEMELS
GPNKYNNYILEGYNMIEATKEDLKVMLKNHIRGFKEEDHNILKENLGENYLDVIKDTPKE
ERKIFYEFIKPPLLKKIEAFIEEVLNMGKDERFFITNNIYNFYIKLKQKLPLADGESYLD
FFDKNKENHEDPYLILYIELGLSFDSVDNFASLIGYSKDCETRYYAIVYKSIYDFGIQVN
DTYYNLSDLHKNWLEFTNELILNNKLSISKLAIDNVFINSINKLIEMQKLYYAEKEVPTI
ALSFIKEQEDFIFEKLITIKNKINKTIPQIEDDTLTAKQLDALNIALNEPISIISGFPGT
GKTYLISNIYESLIAQKVYKKGEIEILTPTGRAAINIKNKSNNLPAKTIHNYLKIDKEDE
DVVYNNDCDKTKVVIIDEFSMVNLKIFYQLLSHLSKLEKLIIVGDKDQLPCIGPGNLMHD
LCNWDFIPKTLLIENQRAESDEICEHFLSIIDSKVKEVEIGSTNTIQMKEINSVALLNEL
SYLYQTYNPEYNSEKMVTLIPLHDGQVGAKTVNKWLQKEKLNNYTYKLPKFKQSKDNYIQ
SWEGTKFYLFDNVIQLINDYEKNVFNGEIGIIKEIIDDKIVSVEYPQGGNKFKTVNYVKS
EIAINLSLAYALTVHKFQGSEAPHVVIPVFKDYSRMLNKKLLYTAVSRAKEKLFILGDLA
LYAKKTKTEDYSKIKTYLFDLIKEQN
NT seq 2241 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaagcaaaaacaacaataaaagtaaaaggaacaataaaaaaaataagaaaaggattg
gctcaaaagtgaattctttttgaatttaaatctcaagaaaaccaattatttgttgtctat
gctcgaattagttccgatgactttttacaagttggttatttatatgaaatggaattaagt
gggcctaataaatataataattacatacttgaaggctacaatatgattgaagcaacaaaa
gaagatttaaaagttatgttgaagaatcatattagaggttttaaagaagaagatcataat
attttaaaagaaaatttaggtgaaaattatttagatgttattaaagatacacctaaagaa
gaaagaaaaatattttacgaatttattaaaccccctttgcttaaaaaaatagaagctttt
attgaagaagttctaaacatgggcaaagatgaaagattttttataaccaataatatttac
aatttttatattaaattgaagcaaaaattacctcttgcagatggcgaatcatatttagat
ttttttgacaaaaacaaagaaaatcatgaagatccttatctcattttgtatattgaatta
ggattaagttttgactcagtagacaattttgcaagcttaataggatattcaaaagattgc
gaaactagatattatgcaatagtttataaatctatttatgattttggaattcaagttaat
gatacatattacaatttgtctgatttacataaaaattgacttgaatttacaaatgagtta
atactaaataataagttatcaatttcaaagcttgctattgataatgtatttattaattcg
ataaacaaactaattgaaatgcaaaaattatattatgcagaaaaagaagttccaactata
gcacttagttttattaaagaacaagaagactttatttttgaaaaattaataactataaaa
aataagataaataaaactattccgcaaatagaagatgatacattaactgctaaacaactt
gatgctttaaacattgcactaaatgaaccgataagcataatttcaggattccctggcact
ggcaaaacatatttaattagtaatatttatgagtcattaattgcccaaaaagtctataaa
aaaggtgaaatagaaattttgacccccactggtagagctgcaattaatattaaaaataag
agtaataatttgcctgcaaaaacgattcacaactatttaaaaattgataaagaagatgaa
gacgttgtttataacaatgattgtgacaaaacgaaagttgtaattattgacgagttttca
atggttaatttaaagattttttatcaacttttaagtcatttatccaagcttgaaaagctc
attattgttggagataaagatcagcttccatgtattggacctggcaatttaatgcacgac
ttatgtaattgagattttattcctaaaactcttttaattgaaaatcaaagagctgaaagt
gatgaaatttgcgaacactttttaagtattattgattcaaaagttaaagaagttgaaata
ggaagtacaaacacaattcaaatgaaagaaataaactcagttgcattattaaacgaatta
tcatacttatatcaaacttataatccagaatacaattctgaaaaaatggtaaccttgatt
ccacttcatgatggtcaagttggagccaaaacagttaataaatgattgcaaaaagaaaaa
ctaaataattacacatataagttgcctaaatttaaacaaagtaaagacaactatatccaa
tcttgagaaggtacaaaattctatttatttgacaatgttatccaattaataaatgattat
gaaaaaaatgtttttaatggcgagatcggaataataaaagaaataatagatgacaaaatt
gttagtgttgaatatccacaaggtggaaataaatttaaaacagttaattatgtaaaatca
gaaatagcaattaatttatctttagcatatgctttaactgttcataaatttcaaggttca
gaagcgccacatgttgtaattccggtttttaaagattattcaagaatgcttaataaaaaa
cttttatatacagcagtttcaagagctaaagaaaaattatttattttaggcgacttagct
ttatacgctaaaaaaacaaaaactgaagattatagtaaaataaaaacatatttatttgat
ttaattaaggaacaaaattaa

DBGET integrated database retrieval system