KEGG   Mycoplasma leachii PG50: MSB_A0353
Entry
MSB_A0353         CDS       T01367                                 
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III, alpha subunit, Gram-positive type
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mlc  Mycoplasma leachii PG50
Pathway
mlc03030  DNA replication
mlc03430  Mismatch repair
mlc03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mlc00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MSB_A0353 (polC)
   03430 Mismatch repair
    MSB_A0353 (polC)
   03440 Homologous recombination
    MSB_A0353 (polC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mlc03032]
    MSB_A0353 (polC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mlc03400]
    MSB_A0353 (polC)
Enzymes [BR:mlc01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MSB_A0353 (polC)
DNA replication proteins [BR:mlc03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MSB_A0353 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mlc03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MSB_A0353 (polC)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP DNA_pol3_a_NII HHH_6 DNA_pol3_a_NI tRNA_anti-codon RNase_H_2 tRNA_anti_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADR23905
UniProt: E4PTX2
Position
complement(409939..414381)
AA seq 1480 aa
MQTKILNIFKKLDIELSETDYIYFKDAILVETPRISKIKNKGYLHIQIKDFLPIEVLKQI
NNKLKNNKYFNFKLILNVENQDINKQLIIQYLEFIKMYKSLFNNRVSWKLLDIYNFDLIN
NQLIFTVSSQTTKNDISQELDYCLAKLNQFGFKNLSYLINVKEISLDALDQQEQKYSTNI
EQQIVIKQVEKKPSLPTNSYKNKRTNLDKPSYQSLLDVEDDAQNIVIQGVVINKEFKLSK
TGRKIFYIDITDYQSSIRCMYFAKSDALCEFDDLTDEQLNSKNVEEIKESKIKINDWISV
KGKTSLSLYDQEQIFYIDDFKKINKQIISRTDDAKTKRVELHAHTKMSVMDGVSDPIDYL
ELISNWNHKAIAFTDHTNVQAFPDIYKALNSVNKKRDDQNKIKAIYGLEINMLNNDLWYV
KNPKNQNLKDAKMVFFDLETTGLSPELDEIIEFGAIEYNFKTGERKKIDILIKPKAKLKD
FTKKLTNINEEMLENKPGIEVAFKQINQIIKDAILVAHNANFDYTFLSHWSQKLGYGKLE
NTIIDTLTISRIIYPELKSHRLGSLAKRVNISYDPSVAHRGDYDADILADIYERMLDETR
KKTKITIDSDWDKINPLNNIDNLNYHKNKGFHTNILVKNQAGLKELYKLVTKSHTTNFYS
SPKIFKSDLIEVKKNNNLLFGSSCVNSEIFELARTSTLENLKQAISFYDYIEIQPISVYK
NLLQNDSLDLDQLKQVITNIINIAKQENKLIIASSDCHYTNPELKQIREVYINAKGLGGI
RHPLFDFNNKVKDYPDQYLRTTNEMLEEFSWLEDENLIYEIVVINSNKINEMIDINVIPI
KDGLFTPKIANVNEKLKDKCYQTAKQMYGENLPDIVEKRLEKELGSITKHGFAIVYWISH
LLVKQSYDDGYLVGSRGSVGSSFVATMAQITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFDTDPTYKCGY
DLPTKNCPNCNQKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQNQAHNFTKKMFGEN
NVFRAGTISTVAEKTAFGYVKTYFEETKKDTNLPRKTEINRLAKLAQGVKRTTGQHPGGI
IILPNEYEIEDFTPVNYPADDLSSTWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHDDPTALRMLRDL
TNIDPITIPTDDKNVYSLFSSLQALNLTSDKINDEITGAIGIPEFGTGFVRNMLRETKPK
TFADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKDNKANISTVIGCRDDIMVYLINIGLESSLAFMI
MESVRKGKGLKKEWIDIMKKHNIPDWYIDSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIAWYKIYY
PTEYYATYLSTKADVFDLKTALGGYESVLLKLKSQQQKVKNGEKLSKKEEDLEVVYEVLL
EMFARNIKFSNIDFEKSEATKFKVDVLNDNTKIIIPPFNVIDSLGEAVALSIINARNTKP
ITSVNDLKNRTQTTQTQIKIFEEFNILDSLSVDEQLTFDF
NT seq 4443 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaaacaaaaatactaaatatctttaaaaaattagatattgaattaagtgaaactgat
tatatttattttaaagatgctattttagtagaaactcctagaatttctaaaattaaaaac
aaaggttatttgcatattcaaattaaagactttttaccaatagaagttttaaaacaaatt
aataataagttaaaaaataataagtattttaattttaaattaatacttaatgtagaaaat
caagatattaataagcaactaattattcaatatttagaatttattaaaatgtataaatct
ttatttaataatcgagtttcttgaaaattattagatatttataattttgacttaataaat
aatcaattaatttttacagtaagtagtcaaacaactaaaaatgatattagtcaagaatta
gattattgtttagctaaattaaaccaatttgggtttaaaaatcttagctatttaataaat
gttaaagaaattagtttagatgctttagatcagcaagaacaaaaatatagtacaaatatt
gaacaacaaatagtaattaaacaagttgaaaaaaaaccaagtttacctactaatagttat
aaaaataaaagaactaatttagataaacctagttatcagtcattactagatgttgaagat
gatgcacaaaacattgtaattcaaggtgttgtgattaataaagagtttaaattatcaaaa
acaggtagaaagattttttatatagatataactgactatcaatcatcaattagatgtatg
tattttgcaaaaagtgatgcattatgtgagtttgatgatttaactgatgaacaattaaat
tctaaaaatgttgaagaaattaaagaaagtaaaataaaaataaatgattgaattagtgtt
aaaggaaaaactagtttatctttatatgatcaagaacaaattttttatattgatgatttt
aaaaaaattaataaacaaattataagtagaactgatgatgctaaaactaaacgtgttgaa
ctgcatgctcatactaaaatgagtgtaatggatggagttagtgatccaattgattattta
gaactaattagtaattgaaatcacaaagcaattgcttttacagatcatactaacgtacaa
gcttttccagatatttataaagctttaaattcagttaataaaaagcgtgatgatcagaat
aaaattaaagctatttatggtttagaaatcaatatgctaaataatgatttatggtatgtt
aaaaatcctaaaaaccaaaatttaaaagatgctaaaatggtcttttttgacttagaaact
actggactaagtcctgaattagatgaaattattgaatttggagctattgaatataacttt
aaaactggtgaaagaaaaaaaatagatattttaattaaaccaaaagcaaaattaaaagac
tttactaaaaaactaactaatataaatgaagaaatgttagaaaataaaccgggaattgaa
gttgcttttaaacaaattaatcaaataataaaagatgctattttagttgctcataatgcc
aattttgactatacttttttatcacattgatctcaaaaattaggttatggaaaattagaa
aacactattattgatactttaacaatctcaagaattatttatcctgaattaaagtcacat
agattaggttcactagcaaaaagagtaaatatttcatatgatccaagtgttgctcaccgt
ggagattatgatgctgatatattagctgatatttatgaaagaatgctagatgaaactaga
aaaaaaactaaaatcacaatcgatagtgattgagataaaataaatcctttaaataatatc
gataatctaaattatcacaaaaataaaggttttcatacaaacattttagttaaaaaccaa
gcaggattaaaagagttatataaattagtaacaaaatcacatactactaatttttattca
tctccaaaaatttttaaaagtgatttaattgaagttaaaaaaaataataatttattattt
ggttcaagttgtgttaatagtgaaatttttgaactagctagaactagtacacttgaaaat
ttaaaacaagcaattagtttttatgattatattgaaattcaaccaattagtgtttataaa
aatttattacaaaatgattcattagatttagatcaattaaaacaagtaattacaaatatt
attaatatagcaaaacaagaaaataaactaattatagcaagcagtgattgtcattataca
aatcctgaactaaaacaaattagagaagtttatattaatgctaaaggacttggtggaatt
agacatccattatttgattttaataacaaagttaaagattatcctgatcaatatttaaga
acaactaatgaaatgttagaagaatttagttgattagaagatgaaaacttaatttatgaa
atagttgttattaactctaataaaattaatgaaatgattgacattaatgtcattcctatt
aaagatggattatttactccaaaaattgctaatgttaatgaaaaattaaaagataaatgt
tatcaaacagcaaaacaaatgtatggagaaaatttaccagatattgttgaaaaaagatta
gaaaaagaattaggttcaattacaaaacatggatttgctattgtttattgaatttctcat
ttattagttaaacaatcatatgatgatggatatttagtaggatcacgtggttcagttggt
tcatcatttgtagcaactatggctcaaattacagaagttaatcctttaaaagctcattat
agatgtttaaattgcaaatattcagattttgatactgatccaacttataaatgtggatat
gatttacctacaaaaaattgtcctaattgtaatcaaaaactaattggggatggtcatgat
attccatttgaaacttttttaggttttgatggtgataaagttccagatattgatttaaat
ttttctggagaatatcaaaaccaagctcataatttcactaaaaaaatgtttggtgaaaat
aatgtttttagagcaggaacaatttcaacagttgctgaaaaaacagcttttggttatgta
aaaacttattttgaagaaactaaaaaagatacaaatttaccaagaaaaaccgaaattaat
agattagcaaaactagctcaaggagtaaaaaggacaactggtcaacatccaggtggaatt
attattctaccaaatgagtatgaaattgaagattttactccagttaattatccagctgat
gatttaagttcaacttgaaaaacaactcattttgattttcattcaattcatgataattta
ttaaaaatggatattctaggtcatgatgatccaactgctttaagaatgctaagagatttg
acaaatattgatccaattactattccaacagatgataaaaatgtttattcattattttca
tctttacaggctttaaatttaacttcagataaaattaatgatgaaatcactggagctatt
ggaatacctgaatttgggactggttttgttagaaatatgttaagagaaacaaaaccaaaa
acttttgcagatctagtacaaatctctggtctttcacatggtactgatgtttggttaggt
aatgctagagatttaattaaagataataaagctaatatttctacagttattggatgtaga
gatgatattatggtttatttaataaacataggattagaaagttccttggcttttatgatt
atggaatcagttagaaaaggtaaaggattaaaaaaagaatgaattgatattatgaaaaaa
cataatattcctgactgatatattgattcttgtttaaaaattaaatatatgtttccaaaa
gcacatgctactgcttatgtattaatggcttatagaattgcttgatataaaatttattat
ccaactgaatattatgcaacttatttatctacaaaagctgatgtttttgatttaaaaaca
gctcttggtggctatgaatcagtcttattaaaactaaaatctcaacagcaaaaagtaaaa
aatggagaaaagctttctaaaaaagaagaagatttagaagttgtgtatgaagttttatta
gaaatgtttgctagaaatattaaatttagtaatattgattttgaaaaatctgaagctact
aaatttaaagtagatgttttaaatgataatactaaaattattattccaccatttaatgtg
attgattcactaggagaagcagtggcactttctataattaatgctagaaatacaaaacca
atcacttcagttaatgatttaaaaaacagaacacaaactacacaaactcaaattaaaatt
tttgaagaatttaatattttagactcattatcagttgatgaacaattaacttttgatttc
taa

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (4)   
Pathway (3)   
   KEGG PATHWAY (3)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (10)   
   Pfam (10)   
All databases (23)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system