KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0352
Entry
MSC_0352          CDS       T00161                                 
Symbol
nusA
Name
(GenBank) transcriptional terminator
  KO
K02600  transcription termination/antitermination protein NusA
Organism
mmy  Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmy00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mmy03021]
    MSC_0352 (nusA)
   03009 Ribosome biogenesis [BR:mmy03009]
    MSC_0352 (nusA)
Transcription machinery [BR:mmy03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   Other transcription-related factors
    RNA polymerase-associated proteins
     MSC_0352 (nusA)
Ribosome biogenesis [BR:mmy03009]
 Prokaryotic type
  rRNA transcription factors
   MSC_0352 (nusA)
SSDB
Motif
Pfam: NusA_N KH_5 KH_1 S1
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAE76989
UniProt: Q6MTP7
Position
complement(399813..401567)
AA seq 584 aa
MLNGTELLESIKLIEKEKGISKESIINGLKEGLQKAYERFYDTDAIIKIDINENTGLITM
HQELKVVDDEQLDDDWLEITLSKAKLKNPDIQIDDTIYKPIEFSEEFSRMVVNQVRQIFQ
QKIREAERARIYEQFVSLEGEVVQAKIVGMNRENNYVLDINGTTAYLWKSKTINNEIFQI
NEIIDVYIEVVEKESKLSQISISRTAPNFLTKLIEREVPEVRMGIVEIKAVSREPGKRSK
VAVITHNNNVEPIGAIIGVGGNRINRISDILKGEKIDIIRWDEDQITYLINAMTPVKVIS
INKIGDEYDIVVPDTQLSLAIGKQGVAAKLIASLLKTKINIFSYSTALKENMDILWNGDT
TKQEVETNTYIPKTKTTKKEEKPVITTIKKPVKQTIKKEENQIDVDALIAFQAEVEHEQE
LKDQEELLKQEYIYKEYENNFNDFENEKEIVLAEKQLESQNQIIKEPVVEVQEVEIEKQS
KTEDQIIENKQPETRTEVETKPNTVEQVNKLNTNKPNNKFEQNRFSYKKQKQKEEELELD
FDIKNEPDIDEIDANLKAFNDAILKQEDDEDLDIDLDDYDKYYD
NT seq 1755 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaacggaacagaattattagaatcaattaaattaatagaaaaagaaaaaggaatt
agcaaagaaagtattataaatggtcttaaagaaggtttacaaaaagcttatgaaagattt
tatgatactgatgcaattattaaaattgatattaatgaaaatacaggattaattactatg
catcaagaattaaaagtggttgatgatgaacaacttgatgacgattgattagagattaca
ctatcaaaagcaaaattaaaaaatcctgatattcaaattgatgatactatttataaacca
attgaatttagtgaagaattttcaagaatggtagttaaccaagtaagacaaatttttcaa
caaaagatcagagaggctgaaagagcaagaatttatgaacaatttgttagtttagaaggt
gaagttgttcaagctaaaatagttggaatgaatagagaaaataattatgttttagatata
aatggtacaactgcttatttatgaaaatcaaaaactattaataatgaaatttttcaaatt
aatgaaattattgatgtttatattgaagttgttgaaaaagaaagcaaattatctcaaatc
tcaatttcaagaactgcccctaattttttaactaaattaattgaaagagaagttccagaa
gtaagaatgggaattgttgaaatcaaagctgttagtcgtgaacctggaaaacgttcaaaa
gttgctgtaattactcataataataatgttgaaccaattggagctattattggagttggt
ggtaatagaattaatagaattagtgatattttaaaaggtgaaaaaatcgatattattaga
tgggatgaagatcaaatcacttatttaattaatgcaatgacaccagtgaaagtaatttct
attaataaaattggtgatgaatatgatatagttgttccagatactcaattatcattagca
attggaaaacaaggagttgcagctaagctaattgctagtttattaaaaactaagattaat
attttttcatattcaactgctttaaaagaaaatatggacattttatgaaatggtgataca
actaaacaagaagttgaaactaatacatacattccaaaaactaaaacaactaaaaaagaa
gaaaaaccagtaataacaactattaaaaaacctgtaaaacaaacaattaaaaaagaagaa
aatcaaattgatgttgatgctttaattgcttttcaagctgaagttgaacatgaacaagaa
ttaaaagatcaagaagagttattaaaacaagaatatatatataaagaatatgaaaataac
tttaatgattttgaaaatgaaaaagaaattgttttagctgaaaaacaattagaatctcaa
aatcaaataataaaagaaccagttgttgaagttcaagaagttgaaattgaaaaacaatca
aaaactgaagatcaaataattgaaaataaacaaccagaaactagaactgaggttgaaact
aaacctaatacagttgaacaagttaataaattaaatactaataagccaaataataaattt
gaacaaaatagatttagttataaaaaacaaaaacaaaaagaagaagaactagagcttgat
tttgatattaaaaacgaaccagatattgatgaaattgatgcaaacttaaaagcatttaat
gatgcaattttaaaacaagaagatgatgaagatcttgatatagatttagatgattatgac
aaatattatgattaa

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (4)   
   Pfam (4)   
All databases (12)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system