KEGG M.pulmonis: MYPU

Mycoplasma pulmonis: MYPU_5450

Entry

MYPU_5450 CDS M.pulmonis

Gene name rpoC

Definition DNA-directed RNA polymerase subunit beta' (EC:2.7.7.6)

Orthology K03046 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]

Pathway mpu00230 Purine metabolism
mpu00240 Pyrimidine metabolism
mpu01100 Metabolic pathways
mpu03020 RNA polymerase

Class Metabolism; Nucleotide Metabolism; Purine metabolism [PATH:mpu00230]
Metabolism; Nucleotide Metabolism; Pyrimidine metabolism
[PATH:mpu00240]
Genetic Information Processing; Transcription; RNA polymerase
[PATH:mpu03020]
Genetic Information Processing; Replication and Repair; DNA repair
and recombination proteins

SSDB

Motif Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4 Apocytochr_F_C Mod_r

Other DBs NCBI-GI: 15829016
NCBI-GeneID: 911208
MypuList: MYPU_5450
UniProt: Q98Q24

Position complement(669816..674096)

AA seq 1426 aa
MPKTRKYSTVDEEKILKVSLSLATKEDVLEWSHGEVTKPETINYKSYKPERHGLFDELIF
GPATDYKCPICGKKYKKSNEGLTCNNTPQCEIEKPEILPKISRRSRMGHIALQTPVVHFW
FFKIDNSIISKLLVLRVGESNEYVSKNDLENIIYYKSHIVLDNGGLKSLPKNKIININNA
AQIYKDALIELRELNLNDADALEIIDGTINHLNDIVGSKVGNDYGVDFYELNEVIEEYSS
AKIQTGSKAIEFLLENIDLEEEQRKIKSKIKEINNLEKTSSSRKQDLSKLYKRLQVVESF
INSGQKPTSMLIYNLPVIPAELRPLVQLDGGRHSTSDINELYRRIIIRNNRLRKWIELNA
PTLITQNELRMIQEAVDALIDNSKKKPKPVTSKDNRNLKSISDALTGKKGRFRQNLLGKR
VDYSGRSVIVVGPELKMNQVGIPREMAAKLFEPWIIKELIDQEITLSVKSARKLIDNLNP
IIWPHVAKVIQGRPVLLNRAPTLHRLSIQAFEPVLIRGKAIKLHPLVTTAFNADFDGDQM
AVHVPISDEAVREAKELLFANRNILGPKDGEPIINPSQDMILGIYYLTIEIAGAKGEAKV
FQDVNSMLRAYEEGSVSLHARVAIPFKKLQKTFNLKGDKGYIFSTVGKFIFNQAFPENFP
FIFDSSVSSISDAQEYTKKYYIPYGLNIKETIQNTPINDALSKKDLSKIIRTIFDKYVPV
LTKEDVASVINDVNHTNYKDTSTKFANLVTTNKTALEYIHAESLSKFTTKHFVDVNKKLS
LKTPGNPNQPIWEVDQYVELLENVWFDYVNIVASVLDEIKDLGFKFSTKSGTSISIHDIE
VSDNKKERIKEGDDYTSELKSMYREGLLTDDERYSLTINKWSEVKDNIQNDLKKIVKNNP
LNPIFIMMNSGARSNMANYVQLAGIRGLMTNNTKILKSDAENERVVRSTVEIPVKSSFLD
GLTAYEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRLVDVAQGIVVTEKDCATQNGFVVKDI
VDNKTKTVIVPIRERIEGRFTIEDVKDKDGNVIVEKDTLIDAKMAEEIVEVHDVKEVNIR
SILGCEAKNGVCQKCFGKDLATSRIVSIGEAVGITASQSIGEPGTQLTMRTFHSGGVAGV
EDITGGFGRLTELIDAYRSPWGRPAIISKVDGIITEIKTPKDKNTNLVYITYLDQDDASQ
TEVVSVPKNRTLRVKVGDKIVKGQKIIDGPIILEELLEYGGPRKVQSYLLKEIQKIYRMQ
GIAINDKYIEIIISQMLSKIEISEPGDSDFIIGSLVNNLDFYNTNNELLEKGLEPAKGKV
VIHGAKRIPLLSNSFLAAASYQESAKILVNSSISSQQDFLVGVKENIILGKKIPAGTNSQ
YESKSKFDIRDPKEYFKDKSPQRHYKIEMDNEVSDMFNEFRISQNK

NT seq 4281 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgccaaaaactagaaaatattcaacagttgatgaagaaaagattttaaaagttagctta
tctcttgcaactaaagaagatgttttagagtgatctcatggtgaagttaccaagccagag
acaattaactataaatcttataaaccagaaagacatgggcttttcgatgagttaattttt
ggtcctgcaactgactataaatgtcctatttgtggtaaaaaatacaaaaaaagcaatgaa
ggtctaacatgtaataacactcctcaatgtgaaattgaaaaacctgaaatattgccaaaa
atttcaagaagaagtagaatgggtcatattgctttacaaactcctgttgttcacttttga
tttttcaaaattgacaattcaattatttcgaaattattagtactaagagttggagagagc
aatgaatatgtttctaaaaatgacttagaaaacattatttactacaaaagccacattgtt
ttagataatggtggcctaaaaagcttaccaaaaaacaaaattatcaatattaataatgca
gctcaaatttataaagatgctcttattgaactaagagagctaaatttaaatgacgctgat
gctcttgaaattattgatggaaccattaatcaccttaatgatattgttggatcaaaagtt
ggaaatgactatggagttgatttttacgagctaaatgaagttattgaagagtactcaagt
gcaaaaattcaaactggatcaaaagccatagaatttttactagaaaatattgaccttgaa
gaagagcaaagaaaaattaaatctaaaattaaagaaattaataacttagaaaaaacttct
tcttcaagaaagcaagatctttccaaactttacaaaagattgcaagtagttgagtctttt
attaactctggacaaaaaccaactagcatgttaatttataacttgccggttattccagct
gagcttagacctttagttcaacttgatggaggaagacactcaacaagtgacattaatgag
ctatatagaagaattattattagaaataatcgtctaagaaaatgaattgaattaaatgct
cctactttgattactcaaaatgagcttagaatgattcaagaagcagttgatgctctaata
gataattctaagaaaaaacctaaacctgtaacttctaaagataatagaaatctaaagtct
atttcagatgctctaactggtaaaaaaggtcgttttagacaaaatctacttggaaaaagg
gttgactattcaggaagaagtgttattgttgttggtcctgaattaaaaatgaaccaagtt
ggtattccaagggaaatggctgctaaattatttgagccatgaattattaaagaattaata
gatcaagaaattaccttaagtgttaaaagtgctcgtaaattaattgataatttaaatcca
attatttgacctcatgttgcaaaagttatccaaggaagacctgttcttttaaaccgtgct
cctacattgcatcgtctttcaattcaagcttttgagccagttttaattagaggtaaggct
attaaacttcatccacttgtaactacagcttttaacgctgactttgatggtgatcaaatg
gcggttcatgttcctattagtgatgaagctgttagagaagctaaagaattgctttttgct
aatagaaatattttagggccaaaagatggtgagccaattattaacccttcacaggatatg
attttaggtatttattatctaactattgaaatagcaggggccaaaggagaggcaaaagtc
ttccaagatgtcaattcaatgctaagagcttatgaagaaggaagtgtttctcttcatgct
agagttgcaattccatttaaaaagttacaaaaaacctttaatttaaaaggtgataaaggt
tatattttctcaacagttggtaaattcatttttaaccaagcttttcctgaaaacttccca
tttatctttgactcatcagtttcatctataagtgatgctcaagaatatactaaaaaatat
tatattccttatggtttaaacataaaagagacaattcaaaacactcctattaatgatgct
ctttctaaaaaagatctttcaaaaattattagaaccatttttgacaaatatgttcctgtt
ttaacaaaagaagatgtagctagtgttattaatgatgtaaatcacacaaactataaagac
acttctacaaaatttgctaatttagttacaacaaacaaaacagctcttgaatacattcat
gcagaatcactttcaaaatttacaacaaaacactttgttgatgtaaataaaaaactttct
ctaaaaactccaggaaatccaaatcaaccaatttgagaagttgatcaatatgttgagctt
cttgaaaatgtttgatttgactatgtcaatattgtagcttctgtgcttgatgaaattaaa
gacttaggatttaaattctcaactaaatcaggaacatcaatttcaattcatgacattgaa
gtaagtgataacaaaaaagaaagaattaaagaaggtgatgattacaccagtgaacttaaa
tctatgtatcgtgaaggtcttttaaccgacgatgaaagatattctctaacaattaacaaa
tgatctgaagttaaagataacattcaaaatgaccttaagaaaattgttaaaaataatcca
ttaaatccaatttttattatgatgaattcaggggctcgttctaatatggccaactatgtt
caattagctggaattaggggactaatgactaacaatactaaaatccttaaatccgatgct
gaaaacgaaagggttgttcgttcaactgttgaaattccggttaaatcttcttttcttgat
ggactaactgcctatgagttttattcttcaacccacggagctcgtaaaggactaaccgat
actgctcttaacacagctaagtcaggatatttaactagaaggctagttgatgtggctcaa
ggaattgttgtaactgaaaaagattgtgctacacaaaatggatttgttgttaaagacatt
gttgacaataaaactaaaacagttattgttccaattagagaaagaattgaaggaagattt
acaattgaagatgtcaaagacaaagatggaaatgtcattgtagaaaaagatactttaatt
gatgcaaaaatggcagaagaaattgtcgaagttcatgatgttaaagaagtaaacattaga
tcaattttaggttgtgaggctaaaaacggagtttgtcaaaaatgttttggtaaagatctt
gcaacttcaagaattgtttcaattggtgaggcagttggtattacagctagccagtcaatt
ggtgagcctggaactcagctaaccatgcgtactttccactctggaggggtagctggtgta
gaggatattactggtggttttggacgtttaactgagcttattgatgcttatcgttctcct
tgaggaagaccagctattatttcaaaagttgatgggataataactgagattaaaactcca
aaagacaaaaatactaacttagtttatataacttatttagaccaagatgatgcaagtcaa
acagaagtagtttcagttcctaaaaatagaacacttcgtgttaaagttggtgacaaaatc
gttaaaggtcaaaaaattattgatggacctattattttagaagagcttctagaatatggt
ggacctagaaaagttcaaagttatctacttaaagaaattcaaaaaatttatagaatgcaa
ggtattgcaattaatgacaaatacattgaaattatcattagccaaatgctttcaaaaatt
gaaatttctgaaccaggagatagtgactttattattggttcacttgtaaataaccttgat
ttttacaacacaaataacgagcttttagaaaaaggacttgaacctgccaaaggtaaagtg
gtaattcatggagctaaaagaatcccacttctttcaaattcattccttgcagcggcaagt
tatcaagaatcggctaaaattttagttaattcatcaatttcatctcaacaagacttttta
gttggggttaaagaaaacattattctaggtaagaaaattccagctggaacaaactctcaa
tatgaaagtaaatctaaatttgacattagagatccaaaagaatacttcaaagataaatct
cctcaaagacactacaaaattgaaatggacaatgaagtctcagacatgttcaatgaattt
agaatttctcaaaataaataa

All links

Pathway (4)   
   KEGG PATHWAY (4)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (5)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (2)   
   MYPULIST (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (2)   
   GenBank (1)   
   EMBL (1)   
Protein domain (7)   
   Pfam (7)   
All databases (22)

DBGET integrated database retrieval system