KEGG   Mycoplasma synoviae: MS53_0617Help
Entry
MS53_0617         CDS       T00261                                 

Gene name
recD
Definition
exodeoxyribonuclease V subunit alpha (EC:3.1.11.5)
Orthology
K03581  
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
msy  Mycoplasma synoviae
Pathway
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:msy00001]
 Genetic Information Processing
  Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    MS53_0617 (recD)
Enzymes [BR:msy01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     MS53_0617 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
LNCC_Brazil: 
UniProt: 
Position
complement(731363..733585)
Genome map
AA seq 740 aa AA seqDB search
MKDITQLVGKFTKIKAGGPEVGWGLYIFQSTDSLLRNCMVYITKKSVGSMPTLFRNYKID
LVNNSNPNYKNSSKTLVAFTEFYEDQLTQEEKNKLLETILLKVKNLGKVKIERIIKNFGF
DIFKHHSDIDALKEQTKDILTNLQIESLYEYFQNHLDLIKSSFLNSKEISNFDIFIEQNK
LSELKEFLVKKHPSNFDFLKHYKVSDPYVWYNRNEFDNFALLDYFALKLNWGMSCDERIN
ALTKFCFLELITNNSTTVELRLLNSKIKEFIHEENSYWNGYPEDKNELEKTFKVVREIDG
KIYVALSIIYDKEKKIASFLKMLNSLNPIVLDSLPDSETKTLSEGQKSAYESFLKNNITI
ISGAPGTGKSHIIKHIHNTLKQNKYKNQKEYAILAPTGKASLSVSEKINAKVSTIHSFLQ
IEPSSEHTIKVKQINTEVKFLIIDEFSMVNTYIFNLLIRACPNLIKLVLVGDVDQLPAIG
PGNLLSDIVESKLFNVFYLDKYFRSDSIEIFNHFNSIKTNSPPNFKDGIINYIKYLDSKY
LSSVVDLFCEIAKESGLDNLMLLSPMKVGDKGLDAINKKIQDLINPDSELVYSTKFGNKF
KINDRVIQQENRLDDDVYNGDIGFIRKKIGTKTQDIKILVEFKNNKLIKYPLNEFLSQIK
LAYGITVHKFQGSEIDNVIFAFADTHKRMLYKKLIYTGLSRAKKQIWIVTNNKIDYPNLI
KEIQNETPIYTNLKYILKGK
NT seq 2223 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagatataacccagcttgttggaaaatttacaaagattaaagccggtggcccagaa
gtcggatgagggctatatattttccaatcaactgattcgctattgcgtaactgcatggtt
tatataaccaaaaaaagtgttggttcaatgccaacattatttagaaactacaaaattgat
ttagtaaataattcaaatccaaattacaaaaattcttcaaaaacattagtagcatttaca
gaattctacgaagatcaattaactcaagaagaaaaaaacaaacttcttgaaactattttg
cttaaagttaaaaatttaggtaaagtaaaaatcgaaagaattattaaaaattttggtttt
gatatttttaagcatcatagtgacatagatgctttaaaagaacaaaccaaagatattctt
acaaatctgcaaattgaaagcctttatgagtattttcaaaatcatttagatttaattaaa
agttcatttttaaacagcaaagaaattagtaactttgatatttttatcgaacaaaataaa
ttaagtgaacttaaagaatttttagttaaaaaacacccttctaattttgattttttaaag
cattataaagttagcgatccttatgtttgatacaacagaaatgaatttgataactttgcg
cttcttgattattttgctcttaaattaaattgaggaatgtcttgcgatgaaagaattaat
gcgctaactaaattttgttttttagaactaattactaacaattcaaccacggttgaattg
cgtttattaaattctaaaatcaaagaatttattcacgaagaaaattcttattgaaatggt
tatccagaagacaaaaatgaactagaaaaaacctttaaagttgttagagaaattgatggc
aaaatttatgttgctttaagcattatttatgacaaagaaaaaaagattgccagcttttta
aaaatgcttaattcactaaatcctattgttttagattcacttcctgatagtgaaactaag
actttgtctgagggacaaaaaagtgcatatgaaagctttcttaaaaacaatataaccatt
atttcaggagcacctggaaccggtaaaagtcacatcattaaacatattcacaacacctta
aaacaaaacaaatataaaaaccaaaaagaatatgcaattttagctcctactggaaaagct
agcctttcagtttctgaaaaaataaacgccaaagtttcaactattcattcgtttctgcaa
atcgaaccaagtagcgaacacactattaaagtaaaacaaattaacactgaagttaagttt
ttaatcattgacgaattttcaatggttaatacttatatttttaatttattaattagagct
tgtcctaatttaataaaactagttttagtaggtgatgttgatcagcttcctgcaatagga
cctggtaatttactttcagatattgttgaaagtaaattatttaatgtgttttatttagat
aaatattttagaagtgattcaattgaaatttttaatcactttaattcaattaaaactaat
tcgccgcctaattttaaagacggaataattaattacattaaatatttagattcaaaatat
ttatcaagtgtagttgatttattttgtgaaatagctaaagaatcaggccttgataattta
atgctactatctccaatgaaggttggcgataaaggtcttgatgcaattaataaaaaaatt
caagatttaattaatcctgattctgaattagtttatagcactaagtttggaaataaattt
aaaatcaacgatagagttattcaacaagaaaatagactcgatgatgacgtatataatgga
gatattggttttattagaaaaaaaatcggaaccaaaactcaagatattaaaatattagta
gaatttaaaaacaataaattaattaaatatccattaaatgaatttctatctcagataaag
ttggcttatggaattactgttcataaatttcaaggttctgaaattgataacgtaattttt
gcatttgcagatactcacaaaagaatgctttataaaaagttaatttatacagggctttcc
agagctaaaaaacaaatttgaatagttactaataataaaatcgattatccaaatttaata
aaagaaattcaaaatgaaactccaatttatactaatttaaaatacattctaaaaggaaaa
taa

DBGET integrated database retrieval system