KEGG T01241: NAEGRDRAFT

Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_59636

Entry

NAEGRDRAFT_59636 CDS T01241

Definition

hypothetical protein

Orthology

K11541

carbamoyl-phosphate synthase / aspartate carbamoyltransferase [EC:6.3.5.5 2.1.3.2]

Organism

ngr Naegleria gruberi

Pathway

ngr00240	Pyrimidine metabolism
ngr00250	Alanine, aspartate and glutamate metabolism
ngr01100	Metabolic pathways

Class

Metabolism; Nucleotide metabolism; Pyrimidine metabolism [PATH:ngr00240]
Metabolism; Amino acid metabolism; Alanine, aspartate and glutamate metabolism [PATH:ngr00250]

SSDB

Motif

Pfam:

CPSase_L_D2 GATase CPSase_sm_chain CPSase_L_chain CPSase_L_D3 ATP-grasp_4 Dala_Dala_lig_C Peptidase_C26

Other DBs

NCBI-GI:

NCBI-GeneID:

JGI:

UniProt:

AA seq 1818 aa
MYSPSPSNKSYMVYANNKANTTTNPSSNSTTTTGGAAVTGHSASTTNNPLNSLLSAASLL
LSDDSNSNSLNQTTSPTVSESSSNSTLVTATNTTTTTTTIPNPNNNNNNGKMMNNNQPSP
SDMFDGYLELQDGTRYYGKLFGANKCLIENDSNWNSPFSVSGECVFTTAMVGYPESLTDP
SYHGQILVLTFPLVGNYGAPNFKTTVSNNGNKNLDEFGLLPKLESDKIHIRGLIVQDYSH
NYSHYEAICSLHRWLQEYNIPALYHIDTRAITKKLRDEKSMLARIVTNINYEHELSIKGL
APLQWYDPGQDVEIIKKVTCKDVTIYGKGNKFKVIAIDCGMKYNIIRELVKRDVELKVVP
YNYNWLELDVNNSNNNNTNNDNNTNNNNTNNTNNTNIDGIFISNGPGNPNNFHETISILS
EYISLVQQQQQVPIIPIFGICLGNQLVGKAIGASVYKLPFGNRGHNQPVIDQLTRKCFIT
SQNHGYAIDNQTLPSNFKPYFINANDQSNEGVYCLNLPIFTAQFHPEAKGGPSDTFFLFD
QFIDLIKLKISNKLHRVKNFESKYSKVFIKHHKNMKTKFNQLLKSVEDTSDISTPILKQQ
ESLMKKSIFNQSIIQEEKKLSTLDEKKKVLPKKVIILGSGGLQIGQAGEFDYSGSQAIKA
LKEEGIYTILVNPNIATVQTCKELADRVYFGAVTPDFVEKVIKKENADGLLLSFGGQTAL
NCGVQLHKSGVLEELNCRVLGTPVQSIIDTEDRDIFNQKMREISQPIADSKACDNVEEAI
LAASHIGYPVIIRAAFALGGLGSGFANDERELRELATQALSSSPQILVEKSVKGWKEVEY
EVVRDCNDNCITVCNMENFDPVGIHTGESIVVAPSQTLNNDEYHMLRTAAIKVIRHLGIV
GECNIQYALNPYSKEYVIIEVNARLSRSSALASKATGYPLAFVAAKLSLGMELIDIKNSV
TKETIACFEPALDYCVVKMPRWDLKKFTRVSTVIGSAMKSVGEVMAIGRNFEEAIQKAIR
MVDTSYRGFDSANSSFDLEKLMKQYSSSSNTAANTNTTTASSNHHQHHHQQYQYHHHSGS
SHNSVGSANTNYGSFGSGSTHFGSFGQTHYGSFGSSSHSHLFNSSVTNPFALQPQVSPKE
DIKQKIIRELTHPTDQRIFAISLAMEHFEMTVDQIHQFTQIDRWFLYKLQNIIQTKKALV
GIGKLLNSLPELPYPLLLLSKQQGFSDLQIASSLPSLLYHEFLQAILKNQVQFPYQLSCF
NNNTNTNNNSNNTTTDNTNNTTNNNTNNTQPQYKDTYKNPPKLSKIDKELMVRFIRKYQY
KIEPIVKQIDTLAAEYPAQTNYLYTTYNAGINSIGKEGGEMIYPDHCYHHDVSFNDEGII
VLGSGVYRIGSSVEFDYCGVMSVRELKRLNYKTIMINYNPETVSTDYDEPDRLYFEELSL
ERVLDIYELEHSQGVIVSVGGQQPNNIVLPLDKQCHVKILGTSSDSIDKCEDRSKFSQLL
DSLVNEKTGDKLVYQPEWANLITIEDALIFANKVQYPVLIRPSYVLSGAAMNVAYSDSEL
LQQLYMAADVSKEHPVVISKFYENAKEIEIDGVAMNGEIIIDAISEHVERAGTHSGDATL
ICPPYSLSFDIQDLIREKASMIVKSLSISGPFNMQFLFDNECIHDDDQEEEEEHGQQQGM
TQSFSTNSLDGYDDSFESESLYLKLSKRLRVIECNLRASRSFPFISKTLDLDFIALATRI
FTHHFNLPSSSSSLASSLVNSNTITSLPGSNVPTRNYYQQMNLLEQITMKREQVESITHS
NTSSLQNNSNGKTDDNDR

NT seq 5457 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgtactctccatcaccttctaacaaatcctacatggtttatgccaataataaggctaat
accaccaccaatccatcatccaattctacaaccaccacaggaggagcagcagtaacaggt
cattctgcttcaaccaccaataatccattgaatagtttattgagtgctgcttctttatta
ttgtccgatgattcaaattccaactctctgaatcaaacaacctcaccaacagtatctgaa
tcatcatccaattctacacttgttacagctacaaatactactacaaccactactaccatt
cctaatcctaataataataataataatggtaaaatgatgaataataatcaaccatcacca
tctgatatgtttgatggttatttagaattacaagatggtacaagatattatggtaaatta
tttggagctaataagtgtttaattgaaaatgattccaattggaattcaccattttctgtg
agtggtgaatgtgtttttacaactgcaatggttggttatcctgaatcattgactgatcct
tcttatcatggtcaaattttagttttaacttttccacttgttggtaattatggtgcacca
aatttcaaaacaacagtttctaataatggtaataagaatttagatgaatttggattgctt
ccaaaattagaaagtgataagattcatattagaggtttaatagttcaagattattcacat
aattattcacattatgaagcaatttgttcacttcatcgttggttacaagaatataatatt
ccagctctatatcacattgatacgagagcaattacaaagaaattgagagatgaaaaatca
atgttagcaagaattgttacaaatattaattatgaacatgaactttctattaaaggtctt
gctcctttacaatggtatgatccaggtcaagatgttgaaattattaagaaagtaacttgt
aaagatgttactatttatggtaaaggtaataagtttaaagttattgctattgattgtggt
atgaaatataatattattcgtgaacttgttaaaagagatgttgaattgaaagttgttcca
tataattataattggttagaattagatgttaataattcaaacaataataataccaacaat
gataataatactaataataataatactaataatactaataatactaatattgatggtatt
tttattagtaatggacctggtaatccaaataatttccatgaaactatttcaattttatct
gaatatatttcattagttcaacaacaacaacaagttccaattattcctatttttggtatt
tgtttaggtaatcaattggttggtaaagctattggtgcaagtgtttataaattaccattt
ggtaatagaggtcataatcaacctgttattgatcaattaacacgtaaatgttttatcact
tcacaaaatcatggttatgctattgataatcaaactttaccttcaaatttcaaaccatat
ttcattaatgccaatgatcaatctaatgaaggtgtttattgtttgaatttaccaattttt
acagctcaatttcatccagaagctaaaggtggaccaagtgatactttctttttatttgat
caatttattgatttgatcaaattaaagatttcaaacaagttacatcgtgttaaaaatttt
gaatctaaatatagcaaagtatttatcaaacatcataagaatatgaaaactaaattcaat
caattattgaaatctgttgaagatacttcagatatttcaactccaattttaaaacaacaa
gaatctttaatgaagaagagtatttttaatcaatcaattattcaagaagaaaagaaactc
tcaactcttgatgaaaagaagaaggtattaccaaagaaggttattattttaggttcaggt
ggtttacaaattggtcaagcaggtgaatttgattattcaggatcacaagctattaaagca
cttaaagaagaaggaatttatacaattttagttaatccaaatattgctacagttcaaaca
tgtaaagaattggctgatagagtttatttcggggcagttacacctgattttgttgaaaaa
gtcattaagaaggagaatgcagatggtttacttttatcatttggtggtcaaactgcatta
aattgtggtgttcaattacacaaatcaggagttttagaagaattgaattgtagagtatta
ggtacacctgttcaatcaattattgatactgaagatcgtgatattttcaatcaaaagatg
cgtgaaatttcacaaccaattgctgattcaaaggcatgtgataatgttgaagaggcaatt
ttagcagcctctcacattggttatccagtaattattagagcagcatttgcattgggtgga
ttaggaagtggatttgccaatgatgaacgtgaattgagagaattggcaactcaagcactt
tcaagttcacctcaaattcttgttgaaaaatcagttaagggatggaaagaagttgaatat
gaagttgttcgtgattgtaatgataattgtattacagtttgtaatatggaaaactttgat
ccagttggtattcatacaggtgaatcaattgttgttgcaccatcacaaacattaaataat
gatgaatatcacatgttgagaactgctgctattaaggttattagacatttgggtattgtt
ggtgaatgtaatattcaatatgcattgaatccatacagtaaggaatatgttatcattgaa
gttaatgctcgtttatcaagaagttcagctttggcttcaaaagcaactggttatccactt
gcatttgttgctgctaaactttcattgggaatggaattgattgatattaagaattctgtt
actaaggaaactattgcttgttttgaacctgcattagattattgtgttgttaaaatgcca
cgttgggatttgaagaaattcactcgtgtttcaactgtcattggatcagcaatgaaaagt
gttggtgaagtgatggccattggtagaaattttgaagaagcaattcaaaaagctattaga
atggttgatacttcatatagaggatttgattctgccaattcttcatttgatttggaaaag
ttgatgaaacaatattcttcttcttctaatactgctgctaatactaatactactactgct
tcttcaaatcatcaccaacatcaccatcaacagtatcaatatcaccatcactctggttca
tctcataatagtgttggttctgctaatactaattatggtagttttggatctggttctact
cattttggaagctttggtcaaactcattatggtagttttggatctagttctcattctcac
ttatttaatagtagtgtcactaatccatttgctttacaaccacaagtttcaccaaaagaa
gatatcaaacaaaagattattagagaattaactcatccaactgatcaacgtatctttgct
atttcacttgctatggaacattttgaaatgacagttgaccaaattcatcaatttactcaa
attgatcgttggttcttgtacaaattacaaaatattattcaaactaagaaggcattggtt
ggaattggtaaattattgaattcattacctgaacttccatatccattacttttactttcc
aaacaacaaggtttctctgatttacaaattgcttcaagtttaccttcattgttatatcat
gaatttttacaagcaattttaaagaatcaagttcaattcccatatcaattatcatgtttc
aataataatactaatactaataataatagtaataatactactactgataatactaataat
actactaataataatactaataatactcaaccacaatataaagatacctataaaaatcca
cctaaattaagtaagattgataaagaattaatggttagatttattagaaagtatcaatat
aagattgaaccaattgttaaacaaattgatacattagcagcagaatatccagcacaaaca
aattatctctatacaacctataatgcaggtattaatagtattggaaaggaaggaggtgaa
atgatttatccagatcattgttatcatcatgatgtttcatttaatgatgaaggtataatt
gtattaggaagtggtgtttatagaattggtagtagtgttgaatttgattattgtggtgtg
atgagtgttagagaattgaagagattaaattacaagactataatgattaattataatcct
gaaactgtttcaactgattatgatgaacctgatcgtttatattttgaagaattaagttta
gaaagagttttagatatttatgaattggaacattcacaaggtgttattgttagtgttggt
ggtcaacaacctaataatattgttttacctttggataaacaatgtcatgttaaaatttta
ggaactagttcagattcaattgataaatgtgaagatcgttctaaattttcacaactctta
gattcacttgttaatgaaaagacaggtgacaaattggtttatcaacctgaatgggctaat
ttaattactattgaagatgctttaatttttgctaataaggttcaatatcctgttttaatt
agaccttcatatgttttatcaggtgctgcaatgaatgttgcttattcagattctgaatta
ttacaacaattatatatggctgctgacgtttctaaagaacatccagttgtcatttctaaa
ttttatgaaaatgctaaagaaattgaaattgatggtgttgcaatgaatggtgaaattatt
attgatgcaattagtgaacatgttgaaagagcaggtactcactctggtgatgctactcta
atttgtccaccttattcattgagttttgatattcaagatttaattagagaaaaggcatca
atgattgttaaatctttatcaattagtggtccatttaatatgcaattcttatttgataat
gaatgtattcatgatgatgatcaagaagaagaagaagaacatggacaacaacaaggaatg
actcaatcattctcaacaaattcactagatggatatgatgatagttttgaatctgaatct
ttatatttgaaattatcaaagagattacgtgttattgaatgtaatttgagagcaagtaga
tcattcccattcattagtaagactttagatttggattttattgcattggctactagaatc
tttactcatcatttcaatttaccatcttcttcttcatcattagcatcatcattggtcaat
tcaaataccatcacaagcttaccaggtagtaatgttccaactagaaattattatcaacaa
atgaatttacttgaacaaattacaatgaaacgtgaacaagttgaatccattacacattct
aatacatcatcattacaaaataatagtaatggtaaaactgatgataatgatagatag

All links

Pathway (3)   
   KEGG PATHWAY (3)   
Chemical substance (10)   
   KEGG COMPOUND (10)   
Chemical reaction (4)   
   KEGG ENZYME (2)   
   KEGG REACTION (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (5)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (1)   
   JGI-NGR (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (8)   
   Pfam (8)   
All databases (34)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system