KEGG   Clostridioides difficile 630Derm: CD630DERM_19620
Entry
CD630DERM_19620   CDS       T03785                                 
Name
(GenBank) ABC-type transport system, permease
  KO
K02004  putative ABC transport system permease protein
Organism
pdf  Clostridioides difficile 630Derm
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pdf00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pdf02000]
    CD630DERM_19620
Transporters [BR:pdf02000]
 ABC transporters, prokaryotic type
  ABC-2 type and other transporters
   Putative ABC transporter
    CD630DERM_19620
SSDB
Motif
Pfam: FtsX
Other DBs
NCBI-ProteinID: CEJ98536
Position
1:2221135..2223552
AA seq 805 aa
MFRNNNRTFIRKIALNDLKINKLKTYLSGIIIMISTCLLLTVTLVSYNASVDLVNASPYH
AIYKSVDEKAKNILYKDKNFSGVGTYKLIGSNKKTDCIMSIVYADDTAIKLMNFQPLKGK
LPTNKNEIAISEKYLQEFGLDKDIGDSIKLNYYDDITNKEVQCDFIIVGFLENYYQDNAK
QYYTVVSNDYFKNIASTPLQNKSNTFDESRPDTVDVLVKLSEENTEKDSASIKTQLKKIG
LSLGIKKYNIYLNDNYIESNLIDGEQIITVLVVGIVVLFSSVFVIYSIFYISVVNSVQMY
AKLKSLGMTSFQLKKIISLQGNILSIIFIPLGVIASCIIAYIIQPLAWQMIADLFIILIL
SLVMFLTVRISLFKPARIISKISAIEAMQYTETKFRKKVKNFSYINIKNLALKNIESNRK
KNLIALISLSISGVLFISIANLANSIDFKKQLSQQFVYNEDYIISIKSDNLYEHITEIQQ
NNPLTDSLKNEIKSIHGVKKLIESKAIKSNIIEPYIKDRDEKQFITLIKGITPELSKSLE
EYIVSGKIDYTHLDSDSLIINKYRTKYYGLNLKVGDTVTFNIFSGNDIIKKKMKIIGIID
NSNTGGMFFASDKTLESLTPYNTNLDFSILIDKKHSKEVEEKLLSIIQKNSNLMLYSYED
DYRMITRAFQYIIIASYIFVGLISCFGILNMTNTLVNSVLIRKKEFALLQAVGMTRKQLR
NMLYREGLNISIKAICTSSILGYFGSNLLCTFIKDVIRLDFINFKFSIFTILIFSFVLIG
IQVLVTELLVRNIEKKSLTERLRSQ
NT seq 2418 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttagaaataataatcgcacatttataagaaaaatagctttaaatgatttaaaaatt
aataaacttaaaacatatctttcaggtatcattataatgatttctacatgtttattatta
acagtgaccttagtttcatataatgcctctgtagatttagttaatgcatctccatatcat
gctatatataaatctgtagatgaaaaagcaaaaaatatactatataaagataaaaacttt
agtggcgtaggaacttacaaattaattggaagtaataaaaagacagattgtattatgtcg
attgtttatgcagatgatacagcaattaaacttatgaattttcaaccattgaaaggcaaa
ctacctacaaataaaaatgaaattgctatttcagaaaaatatttacaggaatttggttta
gataaagatattggagatagcattaaattaaattattatgatgatattacgaataaagaa
gttcaatgtgattttattattgttggatttctagaaaattattatcaagataatgccaag
caatactatacagtcgtttcaaatgattattttaagaatatagcttctacacctttacaa
aataaaagtaatacttttgacgagtcaagacctgatactgtagatgtattagttaaacta
tcagaagaaaatacagagaaagattcagcttcaattaagacacagttaaagaaaattggt
ttatctttaggtattaagaaatataatatatacttaaatgataactatattgaatcaaat
ttaattgatggtgagcagattattacagttttagtagttggaatagttgttcttttttct
agcgtttttgttatatatagtattttttatatttcagttgttaattcagttcagatgtat
gctaagttgaaatcgttaggtatgacttcttttcagttaaaaaagattatttctctacaa
ggaaatattttgtcaattatttttattccattaggggttatagcttcttgtataattgct
tacataattcaaccattagcatggcaaatgatagctgatttatttataattttaatttta
tcactggtaatgtttttaactgttagaatttctttatttaaaccagctagaattatttct
aaaatatctgctattgaagccatgcaatatacagaaactaaatttagaaaaaaagtaaaa
aattttagttatataaatataaaaaatctagcattaaagaatatcgagtcaaatagaaaa
aaaaatttgattgcattaatatcgctaagcattagtggagttttatttatttcaatcgct
aatcttgctaattcaatagatttcaaaaaacaactatctcaacaatttgtctataacgaa
gattatataattagcattaagagtgataacttgtatgagcatattacagaaatccaacaa
aataatccactaacagattctcttaagaatgaaattaaatctattcatggagtaaaaaaa
ttaattgaatccaaagcaattaaaagtaatattatagaaccttacatcaaagatagagac
gaaaaacaatttattactctaattaaaggtattacgcctgaactttcaaaatcacttgaa
gaatatattgtcagtggaaaaatagactatacacatttagattcagatagtttaattata
aataaatatagaacaaaatattatggattaaatttaaaagttggagatacagttacattt
aatatctttagtggaaatgatattattaaaaagaaaatgaaaattataggaatcattgac
aattccaatacaggaggtatgttttttgcttcagacaaaactttagaatctctaacacca
tataatacaaatttagatttttctattttaatagataaaaagcattctaaagaagttgaa
gaaaagttgttaagtataattcagaaaaattcaaatttaatgctttattcatatgaagat
gattatagaatgattactagagcatttcaatatataattatagcttcatacatttttgtt
ggtttaatttcttgctttggtatactaaatatgaccaataccctagtaaacagcgtttta
attagaaaaaaagagtttgccttacttcaagccgttggaatgacaagaaagcaactgcga
aatatgctttatagagaaggtctaaacataagtatcaaagctatatgtacttcaagtata
ctaggttattttggttcaaatctactttgcacttttataaaagatgtaattagattagac
tttattaattttaaattttctatatttactattttaattttttcattcgtattaattggt
atacaagttttagtgactgaattacttgtaagaaatatagaaaaaaaatcacttacagaa
cgcttacgttctcagtaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (7)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system