GenomeNet

Database: Pfam
Entry: AMA-1
LinkDB: AMA-1
Original site: AMA-1 
#=GF ID   AMA-1
#=GF AC   PF02430.14
#=GF DE   Apical membrane antigen 1
#=GF AU   Mian N, Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_2016 (release 5.4)
#=GF GA   21.00 21.00;
#=GF TC   21.10 21.50;
#=GF NC   20.90 20.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Apical_membrane_antigen_1
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8757869
#=GF RT   Protective immune responses to apical membrane antigen 1 of
#=GF RT   Plasmodium chabaudi involve recognition of strain-specific
#=GF RT   epitopes. 
#=GF RA   Crewther PE, Matthew ML, Flegg RH, Anders RF; 
#=GF RL   Infect Immun 1996;64:3310-3317.
#=GF DR   INTERPRO; IPR003298;
#=GF DR   SCOP; 1hn6; fa;
#=GF CC   Apical membrane antigen 1 (AMA-1) is a Plasmodium asexual
#=GF CC   blood-stage antigen. It has been suggested that positive
#=GF CC   selection operates on the AMA-1 gene in regions coding for
#=GF CC   antigenic sites [1].
#=GF SQ   96
#=GS Q4YZP5_PLABA/17-476       AC Q4YZP5.1
#=GS K6UDK2_9APIC/801-980      AC K6UDK2.1
#=GS A0A074STG0_HAMHA/57-424   AC A0A074STG0.1
#=GS U6GC05_EIMAC/79-192       AC U6GC05.1
#=GS Q7RC08_PLAYO/208-387      AC Q7RC08.1
#=GS A0A0L7M7W4_PLAF4/110-481  AC A0A0L7M7W4.1
#=GS U6L1T3_EIMTE/235-382      AC U6L1T3.1
#=GS W7JAQ3_PLAFA/110-580      AC W7JAQ3.1
#=GS A0A0L0CYH0_PLAFA/10-158   AC A0A0L0CYH0.1
#=GS A5K5D2_PLAVS/217-393      AC A5K5D2.1
#=GS W7JVX5_PLAFA/775-954      AC W7JVX5.1
#=GS U6H4I0_9EIME/249-380      AC U6H4I0.1
#=GS W7AML2_PLAVN/788-953      AC W7AML2.1
#=GS A7ASF6_BABBO/97-567       AC A7ASF6.1
#=GS U6GS04_9EIME/3328-3693    AC U6GS04.1
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       AC B6K9M7.2
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLD A; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE B; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE E; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE K; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE F; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE A; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE D; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE G; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE J; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE H; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE C; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE I; 106-388;
#=GS AMA1L_TOXGV/106-445       DR PDB; 3ZLE L; 106-388;
#=GS H2D7F7_BABBI/88-550       AC H2D7F7.1
#=GS A0A0L7M6F0_PLAF4/210-392  AC A0A0L7M6F0.1
#=GS U6KTA0_EIMTE/332-411      AC U6KTA0.1
#=GS Q7RP78_PLAYO/55-515       AC Q7RP78.1
#=GS U6M3K3_EIMMA/1-38         AC U6M3K3.1
#=GS A0A0D9QET0_PLAFR/219-398  AC A0A0D9QET0.1
#=GS V4Z337_TOXGV/57-424       AC V4Z337.1
#=GS L1LDY1_THEEQ/46-437       AC L1LDY1.1
#=GS K6UK89_9APIC/26-491       AC K6UK89.1
#=GS U6KTA0_EIMTE/68-334       AC U6KTA0.1
#=GS W4IUI7_PLAFP/110-580      AC W4IUI7.1
#=GS Q4N820_THEPA/250-745      AC Q4N820.1
#=GS F0VH85_NEOCL/77-347       AC F0VH85.1
#=GS B3L5E1_PLAKH/55-520       AC B3L5E1.1
#=GS B3L5E1_PLAKH/55-520       DR PDB; 4UV6 B; 55-387;
#=GS B3L5E1_PLAKH/55-520       DR PDB; 4UAO A; 55-386;
#=GS B3L5E1_PLAKH/55-520       DR PDB; 4UV6 A; 55-387;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         AC B6KAM0.1
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2Y8R D; 78-420;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2Y8R E; 78-420;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2X2Z A; 78-421;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2X2Z E; 78-419;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2X2Z B; 78-419;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2Y8R A; 78-421;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2X2Z D; 80-420;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2Y8T A; 78-421;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2Y8S D; 78-421;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2Y8R B; 78-421;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2Y8T D; 78-421;
#=GS AMA1_TOXGV/78-422         DR PDB; 2Y8S A; 78-421;
#=GS A5K4Z2_PLAVS/55-520       AC A5K4Z2.1
#=GS A0A074T241_HAMHA/106-444  AC A0A074T241.1
#=GS F0VQN6_NEOCL/55-495       AC F0VQN6.1
#=GS A0A0L7M840_PLAF4/1-36     AC A0A0L7M840.1
#=GS U6GC05_EIMAC/250-318      AC U6GC05.1
#=GS A0A0D9QTE6_PLAFR/55-520   AC A0A0D9QTE6.1
#=GS W4IY05_PLAFP/775-954      AC W4IY05.1
#=GS Q7RC08_PLAYO/794-968      AC Q7RC08.1
#=GS U6K5E0_9EIME/265-422      AC U6K5E0.1
#=GS A0A074SKW9_HAMHA/78-425   AC A0A074SKW9.1
#=GS U6LXP7_9EIME/36-201       AC U6LXP7.1
#=GS Q4YFU7_PLABA/3-155        AC Q4YFU7.1
#=GS B3L5S9_PLAKH/218-382      AC B3L5S9.1
#=GS U6LXM1_EIMMA/265-419      AC U6LXM1.1
#=GS U6LIV4_9EIME/265-448      AC U6LIV4.1
#=GS Q4UHH9_THEAN/247-742      AC Q4UHH9.1
#=GS A5K5D2_PLAVS/801-982      AC A5K5D2.1
#=GS A0A125YRE7_TOXGV/305-455  AC A0A125YRE7.1
#=GS U6MYE8_9EIME/45-493       AC U6MYE8.1
#=GS W7JSP8_PLAFO/110-580      AC W7JSP8.1
#=GS F0VNX2_NEOCL/250-348      AC F0VNX2.1
#=GS A0A024WNN5_PLAFA/110-580  AC A0A024WNN5.1
#=GS W7K4H6_PLAFO/302-485      AC W7K4H6.1
#=GS U6M7P6_EIMMA/68-411       AC U6M7P6.1
#=GS A0A024WKJ3_PLAFA/775-974  AC A0A024WKJ3.1
#=GS Q4XID8_PLACH/1-150        AC Q4XID8.1
#=GS A0A024VLA5_PLAFA/110-580  AC A0A024VLA5.1
#=GS A0A024W433_PLAFA/775-955  AC A0A024W433.1
#=GS U6KGB8_EIMTE/45-498       AC U6KGB8.1
#=GS W7A6A4_9APIC/207-374      AC W7A6A4.1
#=GS A0A024W6S3_PLAFA/110-580  AC A0A024W6S3.1
#=GS A0A024VPT1_PLAFA/208-396  AC A0A024VPT1.1
#=GS W7K4H6_PLAFO/867-1047     AC W7K4H6.1
#=GS J4C7J2_THEOR/242-723      AC J4C7J2.1
#=GS Q8IHP3_PLAF7/208-397      AC Q8IHP3.1
#=GS U6MK42_9EIME/235-382      AC U6MK42.1
#=GS Q8IHP3_PLAF7/776-954      AC Q8IHP3.1
#=GS Q4XPF4_PLACH/199-366      AC Q4XPF4.1
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      AC Q7KQK5.1
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 3SRJ A; 110-442;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 2Z8V A; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 2Z8W B; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 1Z40 A; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 2Q8B A; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 2Z8V B; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 4R19 B; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 3SRJ B; 110-442;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 2Z8W A; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 4R1C A; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 1Z40 E; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 3ZWZ A; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 4R1C B; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 4R1B A; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 4R19 A; 110-438;
#=GS Q7KQK5_PLAF7/110-580      DR PDB; 2Q8A A; 110-438;
#=GS A0A024VPT1_PLAFA/775-954  AC A0A024VPT1.1
#=GS U6GGA9_EIMAC/43-408       AC U6GGA9.1
#=GS F0V7F4_NEOCL/247-455      AC F0V7F4.1
#=GS Q4XT25_PLACH/206-395      AC Q4XT25.1
#=GS Q4YV31_PLABA/795-954      AC Q4YV31.1
#=GS U6LBB9_9EIME/83-489       AC U6LBB9.1
#=GS U6MD88_EIMMA/42-424       AC U6MD88.1
#=GS W7JVX5_PLAFA/211-394      AC W7JVX5.1
#=GS B3L5S9_PLAKH/803-976      AC B3L5S9.1
#=GS W7A5X1_9APIC/55-520       AC W7A5X1.1
#=GS W7B4V6_PLAVN/55-516       AC W7B4V6.1
#=GS U6GI61_EIMAC/3-140        AC U6GI61.1
#=GS W7A6A4_9APIC/798-975      AC W7A6A4.1
#=GS Q4YV31_PLABA/202-387      AC Q4YV31.1
#=GS U6LXP7_9EIME/200-299      AC U6LXP7.1
#=GS A0A0L1ID51_PLAFA/110-580  AC A0A0L1ID51.1
#=GS A0A074TKS5_HAMHA/305-454  AC A0A074TKS5.1
#=GS F0VNX2_NEOCL/18-228       AC F0VNX2.1
#=GS A0A024W433_PLAFA/208-396  AC A0A024W433.1
#=GS A0A024WKJ3_PLAFA/209-401  AC A0A024WKJ3.1
#=GS A0A0D9QET0_PLAFR/798-974  AC A0A0D9QET0.1
#=GS W4IY05_PLAFP/208-398      AC W4IY05.1
#=GS U6L0U6_EIMTE/116-379      AC U6L0U6.1
#=GS A0A0L7M6F0_PLAF4/775-955  AC A0A0L7M6F0.1
#=GS K6UDK2_9APIC/216-396      AC K6UDK2.1
#=GS W7AML2_PLAVN/211-399      AC W7AML2.1
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A0A074STG0_HAMHA/57-424              .............................................................WADILERYNVPLVHG.....SGVYVDLGNTKTLSNKKYREPGGKCPNYGKYIQTyqptT....N...P...D.....Iw....pnD.......FLR..PVpyanTPQ....D..TKPL..G....GGFAMPM-...................-.KQISPVSLKELKEqveslkagngvsS...YAVE...........HA..........KKIR....DDL....GHCIFWA..RM.TsahdassS...A...T...N..S.......K...E...DYY.R.Y.AFAWDPKNEMCHIMYLNMQEMTGAgTHCKR.GdSGPN..LSWYCFQPQKS.IE.-.K.NLVWGSAYAR....PD....HA...SACP.EHGLVNVHWGQ..WNG..RTCQK.M.AV....R...K...R...I...SV.G.SATECALELF..K..N..S..PSD.NPTQYVGD---E---GRGW-DKILDDVVGV.LIPAGSTKKDQPH.TRGVGINWANF....YRK...SsgSY....CEMYDGVPNCLTSAPDQYAFVSLGDPNPDNA.QLpP.CSSTT-................................-------------------------..----.-....-------------------------.-------------------------------....-------------------------------.......------..-----egivi..........................................................................................
U6GC05_EIMAC/79-192                  ...........................................................la--DFMSRFDIPKNHG.....SGIYVDLGSEKEVDGQMYREPSGRCPVFGKNIQL....HqppnN...Ph.yK.....N.......D.......FLV..DI....PSK....A..ESDA..-....AGNPLPGGfnns..........fklpdK.TPYSPMTAAKLNS............F...SQSN...........KA..........----....---....-------..--.-.......-...-...-...-..-.......-...-...---.-.-.------------------------.-----.-.----..-----------.--.-.-.----------....--....--...----.-----------..---..-----.-.--....-...-...-...-...--.-.----------..-..-..-..---.------------------------------.-------------.-----------....---...-..--....-------------------------------.--.-.------................................-------------------------..----.-....-------------------------.-------------------------------....-------------------------------.......------..-----va.............................................................................................
Q7RC08_PLAYO/208-387                 .......................................teyplhiynpienyrtqkmryp---------------.....----------------------------------....-....-...-...-.....-.......-.......---..--....---....-..----..-....--------...................-.-------------............-...----...........--..........-KLV....ETL....EDCSIYS..HC.I.......G...P...C...F..D.......RdfdN...KCF.RdL.PVAFNHKTKECIII--GTHEEKKT.TNCNS.D.NSR-..NNGRCFSSIKK.EK.G.K.DWTYASSFLR....PD....YE...TKCPpRYPLNNSEFGY..FNYntGNCES.P.TK....L...Y...D...N...SV.I.SFNECIEKLF..N..F..N..YANeDPEEK-------------------------.-------------.-----------....---...-..--....-------------------------------.--.-.------................................-------------------------..----.-....-------------------------.-------------------------------....-------------------------------.......------..-----rnnylwgv.......................................................................................
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