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Database: Pfam
Entry: Terminase_3
LinkDB: Terminase_3
Original site: Terminase_3 
#=GF ID   Terminase_3
#=GF AC   PF04466.10
#=GF DE   Phage terminase large subunit
#=GF PI   G2P; 
#=GF AU   Waterfield DI, Finn RD
#=GF SE   COG1783
#=GF GA   22.40 22.40;
#=GF TC   22.80 22.40;
#=GF NC   22.20 22.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10930407
#=GF RT   Functional analysis of the terminase large subunit, G2P, of
#=GF RT   Bacillus subtilis bacteriophage SPP1. 
#=GF RA   Gual A, Camacho AG, Alonso JC; 
#=GF RL   J Biol Chem 2000;275:35311-35319.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   1548711
#=GF RT   Molecular analysis of the Bacillus subtilis bacteriophage SPP1
#=GF RT   region encompassing genes 1 to 6. The products of gene 1 and
#=GF RT   gene 2 are required for pac cleavage. 
#=GF RA   Chai S, Bravo A, Luder G, Nedlin A, Trautner TA, Alonso JC; 
#=GF RL   J Mol Biol 1992;224:87-102.
#=GF DR   INTERPRO; IPR006437;
#=GF CC   Initiation of packaging of double-stranded viral DNA involves
#=GF CC   the specific interaction of the prohead with viral DNA in a
#=GF CC   process mediated by a phage-encoded terminase protein. The
#=GF CC   terminase enzymes are usually hetero-oligomers composed of a
#=GF CC   small and a large subunit.  This region is found on the large
#=GF CC   subunit and possess an endonuclease and ATPase activity that
#=GF CC   require Mg2+ and a neutral or slightly basic reaction.  This
#=GF CC   region is also found in bacterial sequences [1,2].
#=GF SQ   228
#=GS A4CPV0_ROBBH/67-461      AC A4CPV0.1
#=GS Q2FX51_STAA8/27-402      AC Q2FX51.1
#=GS R6I0M1_9FIRM/24-402      AC R6I0M1.1
#=GS F3ZZG0_MAHA5/95-347      AC F3ZZG0.1
#=GS C8WLW0_EGGLE/152-542     AC C8WLW0.1
#=GS S5R5K1_9STRE/21-424      AC S5R5K1.1
#=GS A1B8H8_PARDP/18-233      AC A1B8H8.1
#=GS A0A0D1YF11_ANEMI/24-418  AC A0A0D1YF11.1
#=GS A6LAD3_PARD8/16-403      AC A6LAD3.1
#=GS R6HF73_9CLOT/1-211       AC R6HF73.1
#=GS Q9A0P4_STRP1/67-396      AC Q9A0P4.1
#=GS B1HPY7_LYSSC/1-39        AC B1HPY7.1
#=GS S1NK09_9ENTE/23-268      AC S1NK09.1
#=GS F9ULP9_LACPL/22-400      AC F9ULP9.1
#=GS D1AH92_SEBTE/20-400      AC D1AH92.1
#=GS O50744_BORBU/18-394      AC O50744.1
#=GS R5ILS3_9CLOT/92-409      AC R5ILS3.1
#=GS A0A097R3I3_HAFAL/14-433  AC A0A097R3I3.1
#=GS V2VT71_9GAMM/18-400      AC V2VT71.1
#=GS K1LCW1_9LACT/24-397      AC K1LCW1.1
#=GS R5BEP0_9FIRM/29-410      AC R5BEP0.1
#=GS A0A095ZE72_9BACT/16-403  AC A0A095ZE72.1
#=GS R6MWJ3_9FIRM/1-259       AC R6MWJ3.1
#=GS F9VIT3_ARTSS/21-405      AC F9VIT3.1
#=GS R5AA08_9FIRM/25-404      AC R5AA08.1
#=GS E5BHZ2_9FUSO/24-406      AC E5BHZ2.1
#=GS R6RP56_9CLOT/26-408      AC R6RP56.1
#=GS C4Z827_EUBR3/80-419      AC C4Z827.1
#=GS F9VE44_LACGL/122-391     AC F9VE44.1
#=GS F3YBH2_MELPT/3-135       AC F3YBH2.1
#=GS R7JCJ6_9FUSO/21-422      AC R7JCJ6.1
#=GS N0APP4_9BACI/20-422      AC N0APP4.1
#=GS A0Q0V0_CLONN/28-410      AC A0Q0V0.1
#=GS F4LSC8_TEPAE/24-406      AC F4LSC8.1
#=GS R6MFX7_9FIRM/19-149      AC R6MFX7.1
#=GS Q65GH8_BACLD/18-410      AC Q65GH8.1
#=GS Q3ABI4_CARHZ/25-404      AC Q3ABI4.1
#=GS N2C0F4_9ACTN/153-551     AC N2C0F4.1
#=GS A7GSS0_BACCN/31-416      AC A7GSS0.1
#=GS R6QFA3_9FIRM/27-406      AC R6QFA3.1
#=GS G5KEP9_9STRE/21-423      AC G5KEP9.1
#=GS A0A0A8K745_9RHIZ/1-349   AC A0A0A8K745.1
#=GS A0A060R8V4_9BACT/69-253  AC A0A060R8V4.1
#=GS R6ENJ8_9FIRM/23-427      AC R6ENJ8.1
#=GS U2SJV9_9FIRM/35-257      AC U2SJV9.1
#=GS A0A068R1W5_9ENTR/20-395  AC A0A068R1W5.1
#=GS A0A0A0X340_9SPIO/24-427  AC A0A0A0X340.1
#=GS V9W734_9BACL/18-373      AC V9W734.1
#=GS A9C0G4_DELAS/19-401      AC A9C0G4.1
#=GS D1AHQ4_SEBTE/39-420      AC D1AHQ4.1
#=GS B2TNX5_CLOBB/19-411      AC B2TNX5.1
#=GS K9QV84_NOSS7/81-402      AC K9QV84.1
#=GS Q5NQK1_ZYMMO/21-287      AC Q5NQK1.1
#=GS R5TJR5_9FIRM/18-413      AC R5TJR5.1
#=GS A0A0D1XVP2_ANEMI/23-391  AC A0A0D1XVP2.1
#=GS B1M1Q8_METRJ/15-259      AC B1M1Q8.1
#=GS J9QTH9_RIEAN/1-360       AC J9QTH9.1
#=GS R5BT21_9FIRM/18-412      AC R5BT21.1
#=GS B2KD07_ELUMP/22-383      AC B2KD07.1
#=GS E3HBR6_ILYPC/23-405      AC E3HBR6.1
#=GS E5BFF5_9FUSO/24-404      AC E5BFF5.1
#=GS A0A0A8JKM6_BACSX/24-407  AC A0A0A8JKM6.1
#=GS C0QVC9_BRAHW/18-393      AC C0QVC9.1
#=GS Q5WE37_BACSK/27-411      AC Q5WE37.1
#=GS R6YLA5_9BACE/16-404      AC R6YLA5.1
#=GS R6MJA7_9FIRM/23-399      AC R6MJA7.1
#=GS Q9A018_STRP1/26-409      AC Q9A018.1
#=GS L0DHW5_SINAD/25-419      AC L0DHW5.1
#=GS H8GX87_DEIGI/5-413       AC H8GX87.1
#=GS R6EF77_9BACT/23-392      AC R6EF77.1
#=GS M1NZZ6_BARAA/25-376      AC M1NZZ6.1
#=GS Q5F7S2_NEIG1/21-264      AC Q5F7S2.1
#=GS R7FKJ2_9CLOT/8-278       AC R7FKJ2.1
#=GS R5YUG9_9CLOT/19-291      AC R5YUG9.1
#=GS D4YZA0_SPHJU/6-205       AC D4YZA0.1
#=GS R7FA01_9CLOT/8-278       AC R7FA01.1
#=GS R6AGQ8_9FIRM/2-71        AC R6AGQ8.1
#=GS W8F094_9BACT/32-264      AC W8F094.1
#=GS R5AG08_9FIRM/24-404      AC R5AG08.1
#=GS G4Q9A6_ACIIR/1-352       AC G4Q9A6.1
#=GS R6L362_9FIRM/107-450     AC R6L362.1
#=GS A0A0A2TVS2_9BACL/91-407  AC A0A0A2TVS2.1
#=GS A0A0A0X546_9SPIO/24-427  AC A0A0A0X546.1
#=GS I0KCT8_9BACT/264-471     AC I0KCT8.1
#=GS R5R3C8_9FIRM/36-427      AC R5R3C8.1
#=GS Q2NRY0_SODGM/14-433      AC Q2NRY0.1
#=GS E1SKA4_PANVC/1-266       AC E1SKA4.1
#=GS R6E534_9FIRM/114-441     AC R6E534.1
#=GS E5BEP4_9FUSO/1-233       AC E5BEP4.1
#=GS A8FGQ9_BACP2/21-413      AC A8FGQ9.1
#=GS U2S8R8_9FIRM/26-412      AC U2S8R8.1
#=GS I0K6V5_9BACT/26-239      AC I0K6V5.1
#=GS G4Q8N3_ACIIR/24-402      AC G4Q8N3.1
#=GS D5QIL5_KOMHA/18-385      AC D5QIL5.1
#=GS A0A060R8H9_9BACT/69-251  AC A0A060R8H9.1
#=GS M9X2C0_MANHA/18-393      AC M9X2C0.1
#=GS R6FN33_9CLOT/18-410      AC R6FN33.1
#=GS R4K123_CLOPA/26-402      AC R4K123.1
#=GS R6ZIM5_9FIRM/22-249      AC R6ZIM5.1
#=GS A6LTY0_CLOB8/81-454      AC A6LTY0.1
#=GS A0Q3S2_CLONN/26-426      AC A0Q3S2.1
#=GS A6L468_BACV8/24-296      AC A6L468.1
#=GS R6PLJ3_9CLOT/18-373      AC R6PLJ3.1
#=GS R6H5U4_9CLOT/36-173      AC R6H5U4.1
#=GS F3YBH3_MELPT/6-96        AC F3YBH3.1
#=GS F4BWS1_METCG/19-419      AC F4BWS1.1
#=GS S0K4N9_9ENTE/28-432      AC S0K4N9.1
#=GS R6YMJ3_9CLOT/8-278       AC R6YMJ3.1
#=GS R6QSC6_9CLOT/19-432      AC R6QSC6.1
#=GS J1JWY4_9RHIZ/47-190      AC J1JWY4.1
#=GS X2H188_9GAMM/7-99        AC X2H188.1
#=GS A6Q270_NITSB/19-382      AC A6Q270.1
#=GS R6F235_9BACE/16-397      AC R6F235.1
#=GS L0EU85_LIBCB/26-233      AC L0EU85.1
#=GS Q32IE7_SHIDS/31-272      AC Q32IE7.1
#=GS A1URF7_BARBK/11-327      AC A1URF7.1
#=GS L0A0Y8_DEIPD/24-402      AC L0A0Y8.1
#=GS R7MGB4_9CLOT/21-421      AC R7MGB4.1
#=GS B8QU22_BPPPB/15-448      AC B8QU22.1
#=GS C7MM68_CRYCD/25-420      AC C7MM68.1
#=GS Q8Y4X9_LISMO/32-434      AC Q8Y4X9.1
#=GS R7GX05_9FIRM/20-399      AC R7GX05.1
#=GS R5GX83_9FIRM/30-408      AC R5GX83.1
#=GS L0EUV6_LIBCB/19-119      AC L0EUV6.1
#=GS R5SSX0_9FIRM/24-405      AC R5SSX0.1
#=GS R2S1K3_9ENTE/28-254      AC R2S1K3.1
#=GS F7V7P3_CLOSS/126-498     AC F7V7P3.1
#=GS E8SDW7_STAPH/22-404      AC E8SDW7.1
#=GS R5RMV9_9FIRM/15-405      AC R5RMV9.1
#=GS C4K6U5_HAMD5/4-450       AC C4K6U5.1
#=GS Q7N1R3_PHOLL/21-392      AC Q7N1R3.1
#=GS R5ST10_9GAMM/22-426      AC R5ST10.1
#=GS A0A059NXR7_9BACI/21-402  AC A0A059NXR7.1
#=GS Y1410_HAEIN/1-384        AC P44184.1
#=GS R6QB80_9FIRM/23-404      AC R6QB80.1
#=GS R6P8C3_9CLOT/27-405      AC R6P8C3.1
#=GS S0S8H6_ENTAV/38-423      AC S0S8H6.1
#=GS R7N5K9_9FIRM/95-291      AC R7N5K9.1
#=GS Q2NT61_SODGM/14-262      AC Q2NT61.1
#=GS XTMB_BACSU/18-410        AC P39786.2
#=GS R6ADD5_9FIRM/1-131       AC R6ADD5.1
#=GS H1Y7Q3_9SPHI/27-269      AC H1Y7Q3.1
#=GS F2JK49_CELLD/118-416     AC F2JK49.1
#=GS A0A037UUB2_SPIME/1-384   AC A0A037UUB2.1
#=GS Q2Y905_NITMU/18-397      AC Q2Y905.1
#=GS V9VR13_9RHOB/23-461      AC V9VR13.1
#=GS F9VIP9_ARTSS/19-403      AC F9VIP9.1
#=GS F9UQW2_LACPL/26-214      AC F9UQW2.1
#=GS R6I7Z5_9ACTN/26-423      AC R6I7Z5.1
#=GS A5N2D7_CLOK5/19-411      AC A5N2D7.1
#=GS A0A0A6ZP62_SHIDY/31-221  AC A0A0A6ZP62.1
#=GS A0A099WNL3_9LIST/22-405  AC A0A099WNL3.1
#=GS F0NXR9_WEEVC/21-305      AC F0NXR9.1
#=GS R2SHR9_9ENTE/34-413      AC R2SHR9.1
#=GS I0XRH8_9LEPT/45-431      AC I0XRH8.1
#=GS R5CTQ8_9BACT/17-407      AC R5CTQ8.1
#=GS F9UQW1_LACPL/7-205       AC F9UQW1.1
#=GS A6TRB3_ALKMQ/81-453      AC A6TRB3.1
#=GS A0A077KDG1_9FLAO/15-402  AC A0A077KDG1.1
#=GS R5AA21_9CLOT/1-85        AC R5AA21.1
#=GS A9BYN9_DELAS/19-370      AC A9BYN9.1
#=GS R5Z584_9FIRM/18-401      AC R5Z584.1
#=GS A0A090HXA1_9FIRM/23-405  AC A0A090HXA1.1
#=GS V5XSK7_ENTMU/22-429      AC V5XSK7.1
#=GS A5EV01_DICNV/20-401      AC A5EV01.1
#=GS R6UVI8_9FIRM/21-413      AC R6UVI8.1
#=GS R6ZNT6_9CLOT/28-441      AC R6ZNT6.1
#=GS D9R916_CLOSW/23-413      AC D9R916.1
#=GS F2JQV4_CELLD/22-396      AC F2JQV4.1
#=GS D4M102_9FIRM/51-435      AC D4M102.1
#=GS Q2NSD3_SODGM/20-396      AC Q2NSD3.1
#=GS R5R0P6_9FIRM/68-405      AC R5R0P6.1
#=GS A0A0C2YDG7_BACBA/22-414  AC A0A0C2YDG7.1
#=GS R6PDP8_9FIRM/23-400      AC R6PDP8.1
#=GS R5NQ09_9PORP/115-372     AC R5NQ09.1
#=GS F3YBH1_MELPT/4-148       AC F3YBH1.1
#=GS R6T861_9FIRM/3-132       AC R6T861.1
#=GS A0A088GHC8_9LACT/26-405  AC A0A088GHC8.1
#=GS R5HL80_9SPIR/21-422      AC R5HL80.1
#=GS S0K156_9ENTE/17-160      AC S0K156.1
#=GS B8I130_CLOCE/130-437     AC B8I130.1
#=GS A0A0D1XSF6_ANEMI/85-282  AC A0A0D1XSF6.1
#=GS A0A099WMP8_9LIST/1-390   AC A0A099WMP8.1
#=GS R6QF24_9FIRM/109-411     AC R6QF24.1
#=GS X4ZFB7_9BACL/30-409      AC X4ZFB7.1
#=GS J9Z9U1_LEPFM/24-400      AC J9Z9U1.1
#=GS D4W1Y5_9FIRM/24-401      AC D4W1Y5.1
#=GS W0EDP9_9FIRM/25-280      AC W0EDP9.1
#=GS A7MK06_CROS8/22-139      AC A7MK06.1
#=GS R7EDM5_9BACE/5-329       AC R7EDM5.1
#=GS H2J4B5_MARPK/24-401      AC H2J4B5.1
#=GS R6AUD0_9FIRM/25-404      AC R6AUD0.1
#=GS E6WS64_PSEUU/19-299      AC E6WS64.1
#=GS Q62W49_BACLD/17-407      AC Q62W49.1
#=GS R5H4Y4_9FIRM/26-405      AC R5H4Y4.1
#=GS B8I910_CLOCE/130-437     AC B8I910.1
#=GS F6DM21_DESRL/22-417      AC F6DM21.1
#=GS Q4FT04_PSYA2/26-400      AC Q4FT04.1
#=GS A5VJS2_LACRD/22-404      AC A5VJS2.1
#=GS R5XRQ9_9PROT/16-280      AC R5XRQ9.1
#=GS Q2NSP4_SODGM/13-237      AC Q2NSP4.1
#=GS R6XV26_9CLOT/154-537     AC R6XV26.1
#=GS B9EBQ6_MACCJ/23-413      AC B9EBQ6.1
#=GS YQAT_BACSU/17-409        AC P45916.1
#=GS Q184A6_PEPD6/18-402      AC Q184A6.2
#=GS K4LGT5_9FIRM/27-457      AC K4LGT5.1
#=GS A0A085BWF7_9RHOB/19-293  AC A0A085BWF7.1
#=GS A5I4C6_CLOBH/25-409      AC A5I4C6.1
#=GS Q7N322_PHOLL/21-397      AC Q7N322.1
#=GS R7GTI0_9FIRM/23-397      AC R7GTI0.1
#=GS G8NRE6_GRAMM/29-342      AC G8NRE6.1
#=GS I0DXX8_PROSM/21-396      AC I0DXX8.1
#=GS R6FNF2_9BACE/54-366      AC R6FNF2.1
#=GS U1FC56_TRESO/25-425      AC U1FC56.1
#=GS G8AHJ0_AZOBR/19-290      AC G8AHJ0.1
#=GS C5A7W5_BURGB/68-467      AC C5A7W5.1
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