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Database: Pfam
Entry: Terminase_3
LinkDB: Terminase_3
Original site: Terminase_3 
#=GF ID   Terminase_3
#=GF AC   PF04466.11
#=GF DE   Phage terminase large subunit
#=GF PI   G2P; 
#=GF AU   Waterfield DI, Finn RD
#=GF SE   COG1783
#=GF GA   22.40 22.40;
#=GF TC   22.60 22.40;
#=GF NC   22.20 22.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10930407
#=GF RT   Functional analysis of the terminase large subunit, G2P, of
#=GF RT   Bacillus subtilis bacteriophage SPP1. 
#=GF RA   Gual A, Camacho AG, Alonso JC; 
#=GF RL   J Biol Chem 2000;275:35311-35319.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   1548711
#=GF RT   Molecular analysis of the Bacillus subtilis bacteriophage SPP1
#=GF RT   region encompassing genes 1 to 6. The products of gene 1 and
#=GF RT   gene 2 are required for pac cleavage. 
#=GF RA   Chai S, Bravo A, Luder G, Nedlin A, Trautner TA, Alonso JC; 
#=GF RL   J Mol Biol 1992;224:87-102.
#=GF DR   INTERPRO; IPR006437;
#=GF CC   Initiation of packaging of double-stranded viral DNA involves
#=GF CC   the specific interaction of the prohead with viral DNA in a
#=GF CC   process mediated by a phage-encoded terminase protein. The
#=GF CC   terminase enzymes are usually hetero-oligomers composed of a
#=GF CC   small and a large subunit.  This region is found on the large
#=GF CC   subunit and possess an endonuclease and ATPase activity that
#=GF CC   require Mg2+ and a neutral or slightly basic reaction.  This
#=GF CC   region is also found in bacterial sequences [1,2].
#=GF SQ   317
#=GS A4CPV0_ROBBH/67-461       AC A4CPV0.1
#=GS Q2FX51_STAA8/27-402       AC Q2FX51.1
#=GS J6J3X2_9RHOB/9-245        AC J6J3X2.1
#=GS R6I0M1_9FIRM/24-402       AC R6I0M1.1
#=GS F3ZZG0_MAHA5/95-347       AC F3ZZG0.1
#=GS I6H803_SHIFL/1-198        AC I6H803.1
#=GS A0A0M3BFU4_9RHIZ/1-409    AC A0A0M3BFU4.1
#=GS C8WLW0_EGGLE/152-542      AC C8WLW0.1
#=GS S5R5K1_9STRE/21-424       AC S5R5K1.1
#=GS A0A0G0R6R7_9BACT/17-369   AC A0A0G0R6R7.1
#=GS A1B8H8_PARDP/18-233       AC A1B8H8.1
#=GS A0A0D1YF11_ANEMI/24-418   AC A0A0D1YF11.1
#=GS A6LAD3_PARD8/16-403       AC A6LAD3.1
#=GS R6HF73_9CLOT/1-211        AC R6HF73.1
#=GS D1PQ39_9FIRM/26-407       AC D1PQ39.1
#=GS C3WEU3_FUSMR/29-428       AC C3WEU3.1
#=GS Q9A0P4_STRP1/67-396       AC Q9A0P4.1
#=GS S1NK09_9ENTE/23-268       AC S1NK09.1
#=GS A0A0L0CI80_LUCCU/111-477  AC A0A0L0CI80.1
#=GS F9ULP9_LACPL/22-400       AC F9ULP9.1
#=GS A0A0F5F0F4_AVIPA/15-437   AC A0A0F5F0F4.1
#=GS D1AH92_SEBTE/20-400       AC D1AH92.1
#=GS O50744_BORBU/18-394       AC O50744.1
#=GS R5ILS3_9CLOT/92-409       AC R5ILS3.1
#=GS A0A097R3I3_HAFAL/14-433   AC A0A097R3I3.1
#=GS V2VT71_9GAMM/18-400       AC V2VT71.1
#=GS K2E107_9BACT/21-418       AC K2E107.1
#=GS K1LCW1_9LACT/24-397       AC K1LCW1.1
#=GS R5BEP0_9FIRM/29-410       AC R5BEP0.1
#=GS B0PAN9_9FIRM/23-402       AC B0PAN9.1
#=GS A0A095ZE72_9BACT/16-403   AC A0A095ZE72.1
#=GS R6MWJ3_9FIRM/1-259        AC R6MWJ3.1
#=GS F9VIT3_ARTSS/21-405       AC F9VIT3.1
#=GS R5AA08_9FIRM/25-404       AC R5AA08.1
#=GS F8X4S7_9PORP/18-371       AC F8X4S7.1
#=GS E5BHZ2_9FUSO/24-406       AC E5BHZ2.1
#=GS R6RP56_9CLOT/26-408       AC R6RP56.1
#=GS C4Z827_AGARV/80-419       AC C4Z827.1
#=GS F9VE44_LACGL/122-391      AC F9VE44.1
#=GS F3YBH2_MELPT/3-135        AC F3YBH2.1
#=GS F4QVW8_BREDI/20-216       AC F4QVW8.1
#=GS R7JCJ6_9FUSO/21-422       AC R7JCJ6.1
#=GS N0APP4_9BACI/20-422       AC N0APP4.1
#=GS I7LDX7_9LACO/21-425       AC I7LDX7.1
#=GS A0Q0V0_CLONN/28-410       AC A0Q0V0.1
#=GS G9ZM87_9LACO/26-123       AC G9ZM87.1
#=GS F4LSC8_TEPAE/24-406       AC F4LSC8.1
#=GS H0A2U0_9PROT/16-216       AC H0A2U0.1
#=GS J0L7I2_9LACO/23-405       AC J0L7I2.1
#=GS A0A0M9GC33_9PSED/18-448   AC A0A0M9GC33.1
#=GS R6MFX7_9FIRM/19-149       AC R6MFX7.1
#=GS Q65GH8_BACLD/18-410       AC Q65GH8.1
#=GS Q3ABI4_CARHZ/25-404       AC Q3ABI4.1
#=GS N2C0F4_9ACTN/153-551      AC N2C0F4.1
#=GS A7GSS0_BACCN/31-416       AC A7GSS0.1
#=GS G4HNU3_9BACL/22-405       AC G4HNU3.1
#=GS R6QFA3_9FIRM/27-406       AC R6QFA3.1
#=GS G5KEP9_9STRE/21-423       AC G5KEP9.1
#=GS I3DMM3_HAEPH/17-411       AC I3DMM3.1
#=GS A0A0A8K745_9RHIZ/1-349    AC A0A0A8K745.1
#=GS G9ZM88_9LACO/1-327        AC G9ZM88.1
#=GS A0A060R8V4_9BACT/69-253   AC A0A060R8V4.1
#=GS U2SJV9_9FIRM/35-257       AC U2SJV9.1
#=GS R6ENJ8_9FIRM/23-427       AC R6ENJ8.1
#=GS A0A068R1W5_9ENTR/20-395   AC A0A068R1W5.1
#=GS A0A0A0X340_9SPIO/24-427   AC A0A0A0X340.1
#=GS V9W734_9BACL/18-373       AC V9W734.1
#=GS A9C0G4_DELAS/19-401       AC A9C0G4.1
#=GS D1AHQ4_SEBTE/39-420       AC D1AHQ4.1
#=GS B2TNX5_CLOBB/19-411       AC B2TNX5.1
#=GS I4YP49_9RHIZ/17-396       AC I4YP49.1
#=GS Q5NQK1_ZYMMO/21-287       AC Q5NQK1.1
#=GS K9QV84_NOSS7/81-402       AC K9QV84.1
#=GS R5TJR5_9FIRM/18-413       AC R5TJR5.1
#=GS A0A0D1XVP2_ANEMI/23-391   AC A0A0D1XVP2.1
#=GS B1M1Q8_METRJ/15-259       AC B1M1Q8.1
#=GS C0DAJ3_9FIRM/1-308        AC C0DAJ3.1
#=GS J9QTH9_RIEAN/1-360        AC J9QTH9.1
#=GS R5BT21_9FIRM/18-412       AC R5BT21.1
#=GS B2KD07_ELUMP/22-383       AC B2KD07.1
#=GS E3HBR6_ILYPC/23-405       AC E3HBR6.1
#=GS E5BFF5_9FUSO/24-404       AC E5BFF5.1
#=GS A0A0A8JKM6_BACSX/24-407   AC A0A0A8JKM6.1
#=GS A0A0N0K0A0_9SPHN/24-401   AC A0A0N0K0A0.1
#=GS C0QVC9_BRAHW/18-393       AC C0QVC9.1
#=GS Q5WE37_BACSK/27-411       AC Q5WE37.1
#=GS R6YLA5_9BACE/16-404       AC R6YLA5.1
#=GS R6MJA7_9FIRM/23-399       AC R6MJA7.1
#=GS Q9A018_STRP1/26-409       AC Q9A018.1
#=GS G5H916_9BACT/23-460       AC G5H916.1
#=GS L0DHW5_SINAD/25-419       AC L0DHW5.1
#=GS D4XAS7_9BURK/34-450       AC D4XAS7.1
#=GS H8GX87_DEIGI/5-413        AC H8GX87.1
#=GS R6EF77_9BACT/23-392       AC R6EF77.1
#=GS C5RA73_WEIPA/23-405       AC C5RA73.1
#=GS M1NZZ6_BARAA/25-376       AC M1NZZ6.1
#=GS B6GAM2_9ACTN/156-546      AC B6GAM2.1
#=GS Q5F7S2_NEIG1/21-264       AC Q5F7S2.1
#=GS A0A0F0CE32_9CLOT/160-539  AC A0A0F0CE32.1
#=GS J0KWS0_9LACO/22-433       AC J0KWS0.1
#=GS R7FKJ2_9CLOT/8-278        AC R7FKJ2.1
#=GS R5YUG9_9CLOT/19-291       AC R5YUG9.1
#=GS D4YZA0_SPHJU/6-205        AC D4YZA0.1
#=GS R7FA01_9CLOT/8-278        AC R7FA01.1
#=GS R6AGQ8_9FIRM/2-71         AC R6AGQ8.1
#=GS W8F094_9BACT/32-264       AC W8F094.1
#=GS K4M4B9_9CAUD/30-421       AC K4M4B9.1
#=GS A0A0F5EQP0_AVIPA/15-199   AC A0A0F5EQP0.1
#=GS R5AG08_9FIRM/24-404       AC R5AG08.1
#=GS K0PZY1_9RHIZ/19-287       AC K0PZY1.1
#=GS A0A0D6E025_9LACT/26-410   AC A0A0D6E025.1
#=GS G4Q9A6_ACIIR/1-352        AC G4Q9A6.1
#=GS A0A0F3GLZ1_9BACT/54-417   AC A0A0F3GLZ1.1
#=GS B9CMH9_9ACTN/51-206       AC B9CMH9.1
#=GS R6L362_9FIRM/107-450      AC R6L362.1
#=GS G9RTS3_9FIRM/25-403       AC G9RTS3.1
#=GS F5IT16_9PORP/17-371       AC F5IT16.1
#=GS A0A0A2TVS2_9BACL/91-407   AC A0A0A2TVS2.1
#=GS A0A0A0X546_9SPIO/24-427   AC A0A0A0X546.1
#=GS I0KCT8_9BACT/264-471      AC I0KCT8.1
#=GS D0GNY2_9FUSO/19-424       AC D0GNY2.1
#=GS R5R3C8_9FIRM/36-427       AC R5R3C8.1
#=GS Q2NRY0_SODGM/14-433       AC Q2NRY0.1
#=GS E1SKA4_PANVC/1-266        AC E1SKA4.1
#=GS U6Q048_HAECO/207-305      AC U6Q048.1
#=GS R6E534_9FIRM/114-441      AC R6E534.1
#=GS E5BEP4_9FUSO/1-233        AC E5BEP4.1
#=GS U2S8R8_9FIRM/26-412       AC U2S8R8.1
#=GS A8FGQ9_BACP2/21-413       AC A8FGQ9.1
#=GS F0FX00_9BURK/19-384       AC F0FX00.1
#=GS F0H2C8_9FIRM/109-431      AC F0H2C8.1
#=GS A0A0D6DZH6_9LACT/22-408   AC A0A0D6DZH6.1
#=GS I0K6V5_9BACT/26-239       AC I0K6V5.1
#=GS A0A0G0Q035_9BACT/18-376   AC A0A0G0Q035.1
#=GS G4Q8N3_ACIIR/24-402       AC G4Q8N3.1
#=GS D5QIL5_KOMHA/18-385       AC D5QIL5.1
#=GS A0A060R8H9_9BACT/69-251   AC A0A060R8H9.1
#=GS E5WCN0_9BACI/23-424       AC E5WCN0.1
#=GS M9X2C0_MANHA/18-393       AC M9X2C0.1
#=GS R6FN33_9CLOT/18-410       AC R6FN33.1
#=GS R4K123_CLOPA/26-402       AC R4K123.1
#=GS R6ZIM5_9FIRM/22-249       AC R6ZIM5.1
#=GS A6LTY0_CLOB8/81-454       AC A6LTY0.1
#=GS A0Q3S2_CLONN/26-426       AC A0Q3S2.1
#=GS A0A0H4PD30_9BACI/4-53     AC A0A0H4PD30.1
#=GS H0TXW8_9BRAD/39-305       AC H0TXW8.1
#=GS A6L468_BACV8/24-296       AC A6L468.1
#=GS R6PLJ3_9CLOT/18-373       AC R6PLJ3.1
#=GS R6H5U4_9CLOT/36-173       AC R6H5U4.1
#=GS F3YBH3_MELPT/6-96         AC F3YBH3.1
#=GS F4BWS1_METCG/19-419       AC F4BWS1.1
#=GS S0K4N9_9ENTE/28-432       AC S0K4N9.1
#=GS R6YMJ3_9CLOT/8-278        AC R6YMJ3.1
#=GS R6QSC6_9CLOT/19-432       AC R6QSC6.1
#=GS J1JWY4_9RHIZ/47-190       AC J1JWY4.1
#=GS X2H188_9GAMM/7-99         AC X2H188.1
#=GS A6Q270_NITSB/19-382       AC A6Q270.1
#=GS R6F235_9BACE/16-397       AC R6F235.1
#=GS L0EU85_LIBCB/26-233       AC L0EU85.1
#=GS Q32IE7_SHIDS/31-272       AC Q32IE7.1
#=GS E0NNB4_9FIRM/2-379        AC E0NNB4.1
#=GS A1URF7_BARBK/11-327       AC A1URF7.1
#=GS C0DA45_9FIRM/299-679      AC C0DA45.1
#=GS L0A0Y8_DEIPD/24-402       AC L0A0Y8.1
#=GS R7MGB4_9CLOT/21-421       AC R7MGB4.1
#=GS B8QU22_BPPPB/15-448       AC B8QU22.1
#=GS C7MM68_CRYCD/25-420       AC C7MM68.1
#=GS Q8Y4X9_LISMO/32-434       AC Q8Y4X9.1
#=GS R7GX05_9FIRM/20-399       AC R7GX05.1
#=GS TERL_BPSPP/25-411         AC P54308.1
#=GS TERL_BPSPP/25-411         DR PDB; 2WBN A; 237-411;
#=GS TERL_BPSPP/25-411         DR PDB; 2WC9 A; 237-411;
#=GS R5GX83_9FIRM/30-408       AC R5GX83.1
#=GS L0EUV6_LIBCB/19-119       AC L0EUV6.1
#=GS R5SSX0_9FIRM/24-405       AC R5SSX0.1
#=GS R2S1K3_9ENTE/28-254       AC R2S1K3.1
#=GS D1PRG9_9FIRM/32-410       AC D1PRG9.1
#=GS R5RMV9_9FIRM/15-405       AC R5RMV9.1
#=GS E8SDW7_STAPH/22-404       AC E8SDW7.1
#=GS F7V7P3_CLOSS/126-498      AC F7V7P3.1
#=GS C4K6U5_HAMD5/4-450        AC C4K6U5.1
#=GS D4BUK1_PRORE/14-451       AC D4BUK1.1
#=GS Q7N1R3_PHOLL/21-392       AC Q7N1R3.1
#=GS K4ZFL7_PAEAL/24-403       AC K4ZFL7.1
#=GS A0A0M1V0L9_CLOSO/102-433  AC A0A0M1V0L9.1
#=GS R5ST10_9GAMM/22-426       AC R5ST10.1
#=GS D4CPK5_9FIRM/20-398       AC D4CPK5.1
#=GS A0A059NXR7_9BACI/21-402   AC A0A059NXR7.1
#=GS Y1410_HAEIN/1-384         AC P44184.1
#=GS R6QB80_9FIRM/23-404       AC R6QB80.1
#=GS R6P8C3_9CLOT/27-405       AC R6P8C3.1
#=GS S0S8H6_ENTAV/38-423       AC S0S8H6.1
#=GS R7N5K9_9FIRM/95-291       AC R7N5K9.1
#=GS G4HEI4_9BACL/25-404       AC G4HEI4.1
#=GS Q2NT61_SODGM/14-262       AC Q2NT61.1
#=GS XTMB_BACSU/18-410         AC P39786.2
#=GS R6ADD5_9FIRM/1-131        AC R6ADD5.1
#=GS H1Y7Q3_9SPHI/27-269       AC H1Y7Q3.1
#=GS F2JK49_CELLD/118-416      AC F2JK49.1
#=GS A0A037UUB2_SPIME/1-384    AC A0A037UUB2.1
#=GS Q2Y905_NITMU/18-397       AC Q2Y905.1
#=GS V9VR13_9RHOB/23-461       AC V9VR13.1
#=GS A0A0M2PKJ6_9BACI/1-57     AC A0A0M2PKJ6.1
#=GS F9VIP9_ARTSS/19-403       AC F9VIP9.1
#=GS F9UQW2_LACPL/26-214       AC F9UQW2.1
#=GS R6I7Z5_9ACTN/26-423       AC R6I7Z5.1
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#=GS K4ZCA7_PAEAL/18-410       AC K4ZCA7.1
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