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Database: Pfam
Entry: 7TM_GPCR_Srbc
LinkDB: 7TM_GPCR_Srbc
Original site: 7TM_GPCR_Srbc 
#=GF ID   7TM_GPCR_Srbc
#=GF AC   PF10316.4
#=GF DE   Serpentine type 7TM GPCR chemoreceptor Srbc 
#=GF PI   Srbc; 
#=GF AU   Thomas JH, Robertson H, Bateman A
#=GF SE   Thomas JH, Robertson H
#=GF GA   21.30 21.30;
#=GF TC   21.30 21.30;
#=GF NC   21.20 21.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   7585938
#=GF RT   Divergent seven transmembrane receptors are candidate
#=GF RT   chemosensory receptors in C. elegans. 
#=GF RA   Troemel ER, Chou JH, Dwyer ND, Colbert HA, Bargmann CI; 
#=GF RL   Cell 1995;83:207-218.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   18050473
#=GF RT   The putative chemoreceptor families of C. elegans. 
#=GF RA   Robertson HM, Thomas JH; 
#=GF RL   WormBook. 2006; [Epub ahead of print]
#=GF DR   INTERPRO; IPR019420;
#=GF CC   Chemoreception is mediated in Caenorhabditis elegans by members
#=GF CC   of the seven-transmembrane G-protein-coupled receptor class (7TM
#=GF CC   GPCRs) of proteins which are of the serpentine type [1]. Srbc is
#=GF CC   a solo family amongst the superfamilies of chemoreceptors.
#=GF CC   Chemoperception is one of the central senses of soil nematodes
#=GF CC   like C. elegans which are otherwise 'blind' and 'deaf' [2].
#=GF SQ   285
#=GS Q5FAM6_CAEEL/1-273      AC Q5FAM6.1
#=GS Q6BER8_CAEEL/1-272      AC Q6BER8.1
#=GS G0PLP2_CAEBE/1-177      AC G0PLP2.1
#=GS G0NES2_CAEBE/4-178      AC G0NES2.1
#=GS G0NBN5_CAEBE/4-271      AC G0NBN5.1
#=GS Q1XFZ2_CAEEL/1-115      AC Q1XFZ2.1
#=GS G0NEI8_CAEBE/1-276      AC G0NEI8.1
#=GS G0NEE3_CAEBE/154-188    AC G0NEE3.1
#=GS Q9XV28_CAEEL/7-277      AC Q9XV28.1
#=GS A8WQ26_CAEBR/407-547    AC A8WQ26.2
#=GS O17957_CAEEL/1-269      AC O17957.1
#=GS A8Y0U7_CAEBR/1-286      AC A8Y0U7.1
#=GS O44694_CAEEL/7-274      AC O44694.1
#=GS A8X718_CAEBR/5-186      AC A8X718.2
#=GS G5ECA4_CAEEL/2-273      AC G5ECA4.1
#=GS G0NEH7_CAEBE/1-223      AC G0NEH7.1
#=GS Q5F4U8_CAEEL/2-270      AC Q5F4U8.1
#=GS E3N7G0_CAERE/2-273      AC E3N7G0.1
#=GS G0PHT2_CAEBE/1-271      AC G0PHT2.1
#=GS Q5F4U4_CAEEL/1-269      AC Q5F4U4.1
#=GS A8WQ74_CAEBR/1-245      AC A8WQ74.2
#=GS O44692_CAEEL/1-270      AC O44692.3
#=GS E3NRJ7_CAERE/1-210      AC E3NRJ7.1
#=GS E3LHG7_CAERE/195-261    AC E3LHG7.1
#=GS H2WH24_CAEJA/1-272      AC H2WH24.1
#=GS G0NEF4_CAEBE/1-284      AC G0NEF4.1
#=GS O44636_CAEEL/1-271      AC O44636.2
#=GS O45565_CAEEL/1-272      AC O45565.1
#=GS Q19912_CAEEL/1-272      AC Q19912.1
#=GS A8Y0U7_CAEBR/419-482    AC A8Y0U7.1
#=GS H2WG61_CAEJA/5-264      AC H2WG61.1
#=GS H2VHP7_CAEJA/1-173      AC H2VHP7.1
#=GS A8X1Z4_CAEBR/1-273      AC A8X1Z4.1
#=GS E3LL22_CAERE/305-561    AC E3LL22.1
#=GS G0NEG5_CAEBE/1-273      AC G0NEG5.1
#=GS O62494_CAEEL/2-166      AC O62494.3
#=GS P91513_CAEEL/10-281     AC P91513.3
#=GS A8X2A9_CAEBR/1-181      AC A8X2A9.2
#=GS E3LL27_CAERE/1-212      AC E3LL27.1
#=GS E3M114_CAERE/11-288     AC E3M114.1
#=GS G0M931_CAEBE/1-106      AC G0M931.1
#=GS O61941_CAEEL/1-272      AC O61941.1
#=GS O45564_CAEEL/1-272      AC O45564.2
#=GS Q7YX63_CAEEL/4-155      AC Q7YX63.1
#=GS Q9GYT8_CAEEL/10-281     AC Q9GYT8.1
#=GS E3LL20_CAERE/563-834    AC E3LL20.1
#=GS G0NEF6_CAEBE/177-242    AC G0NEF6.1
#=GS A8X715_CAEBR/238-455    AC A8X715.1
#=GS H2VXF7_CAEJA/1-272      AC H2VXF7.1
#=GS A8Y0Z7_CAEBR/1-180      AC A8Y0Z7.2
#=GS E3LL19_CAERE/1-186      AC E3LL19.1
#=GS E3MWM2_CAERE/108-165    AC E3MWM2.1
#=GS E3MIZ7_CAERE/183-247    AC E3MIZ7.1
#=GS A8X2M5_CAEBR/85-273     AC A8X2M5.1
#=GS A8WQ24_CAEBR/1-274      AC A8WQ24.2
#=GS O17016_CAEEL/11-272     AC O17016.1
#=GS Q9XVF5_CAEEL/1-272      AC Q9XVF5.1
#=GS Q5FAM7_CAEEL/1-276      AC Q5FAM7.1
#=GS G0NEH5_CAEBE/1-271      AC G0NEH5.1
#=GS G0NEH6_CAEBE/133-198    AC G0NEH6.1
#=GS A8WQ22_CAEBR/270-540    AC A8WQ22.2
#=GS A8Y0Y0_CAEBR/11-281     AC A8Y0Y0.2
#=GS O16942_CAEEL/1-271      AC O16942.1
#=GS O44705_CAEEL/1-269      AC O44705.2
#=GS O44695_CAEEL/7-274      AC O44695.2
#=GS A8Y0U7_CAEBR/298-424    AC A8Y0U7.1
#=GS G0NHS0_CAEBE/1-99       AC G0NHS0.1
#=GS E3MWM7_CAERE/1-187      AC E3MWM7.1
#=GS H2W343_CAEJA/32-290     AC H2W343.1
#=GS G0NEE0_CAEBE/108-207    AC G0NEE0.1
#=GS G0NEG7_CAEBE/1-275      AC G0NEG7.1
#=GS A8WQ25_CAEBR/296-381    AC A8WQ25.1
#=GS G0NEG3_CAEBE/1-187      AC G0NEG3.1
#=GS Q9XXP2_CAEEL/1-272      AC Q9XXP2.1
#=GS O62362_CAEEL/1-271      AC O62362.1
#=GS G0M931_CAEBE/105-169    AC G0M931.1
#=GS A8Y0Y3_CAEBR/264-534    AC A8Y0Y3.1
#=GS G0MTW3_CAEBE/5-275      AC G0MTW3.1
#=GS H2WI16_CAEJA/24-301     AC H2WI16.1
#=GS H2W9D3_CAEJA/1-300      AC H2W9D3.1
#=GS E3MWU3_CAERE/1-214      AC E3MWU3.1
#=GS O44701_CAEEL/2-186      AC O44701.4
#=GS E3LNU1_CAERE/4-273      AC E3LNU1.1
#=GS E3LTE9_CAERE/18-275     AC E3LTE9.1
#=GS E3LIX8_CAERE/11-281     AC E3LIX8.1
#=GS Q9XVG1_CAEEL/1-285      AC Q9XVG1.3
#=GS A8WQ27_CAEBR/391-629    AC A8WQ27.1
#=GS A8X1Z3_CAEBR/1-274      AC A8X1Z3.1
#=GS G0NBN4_CAEBE/4-273      AC G0NBN4.1
#=GS A0A9S8_CAEEL/1-269      AC A0A9S8.2
#=GS H2WG61_CAEJA/265-536    AC H2WG61.1
#=GS G0NEG4_CAEBE/1-220      AC G0NEG4.1
#=GS Q9UAQ0_CAEEL/11-284     AC Q9UAQ0.2
#=GS G0NES1_CAEBE/4-179      AC G0NES1.1
#=GS Q5CZ32_CAEEL/54-195     AC Q5CZ32.1
#=GS H2VZ12_CAEJA/22-301     AC H2VZ12.1
#=GS G5EEB2_CAEEL/2-273      AC G5EEB2.1
#=GS H2WF61_CAEJA/1-277      AC H2WF61.1
#=GS E3LIX2_CAERE/12-257     AC E3LIX2.1
#=GS E3MWN0_CAERE/4-263      AC E3MWN0.1
#=GS O16943_CAEEL/1-271      AC O16943.2
#=GS E3NJM2_CAERE/1-214      AC E3NJM2.1
#=GS G0NEH3_CAEBE/177-240    AC G0NEH3.1
#=GS O76681_CAEEL/10-281     AC O76681.2
#=GS A8X2N5_CAEBR/1-271      AC A8X2N5.2
#=GS G0NEE3_CAEBE/7-131      AC G0NEE3.1
#=GS G0PKN5_CAEBE/125-221    AC G0PKN5.1
#=GS Q5DX38_CAEEL/1-272      AC Q5DX38.1
#=GS G0NU04_CAEBE/1-272      AC G0NU04.1
#=GS G0NEE4_CAEBE/16-285     AC G0NEE4.1
#=GS Q9XXK0_CAEEL/177-239    AC Q9XXK0.2
#=GS G0NBN3_CAEBE/4-273      AC G0NBN3.1
#=GS A8X202_CAEBR/97-156     AC A8X202.1
#=GS E3LHG6_CAERE/115-178    AC E3LHG6.1
#=GS E3LL08_CAERE/4-274      AC E3LL08.1
#=GS E3LL20_CAERE/1-272      AC E3LL20.1
#=GS H8WHC7_CAEBR/12-196     AC H8WHC7.1
#=GS Q23331_CAEEL/4-272      AC Q23331.2
#=GS A8WQ27_CAEBR/15-255     AC A8WQ27.1
#=GS G0NEH7_CAEBE/213-308    AC G0NEH7.1
#=GS A8WQ26_CAEBR/4-294      AC A8WQ26.2
#=GS E3NJM0_CAERE/1-273      AC E3NJM0.1
#=GS G0NEE6_CAEBE/11-281     AC G0NEE6.1
#=GS A8WQ22_CAEBR/1-237      AC A8WQ22.2
#=GS A8Y0Y3_CAEBR/1-235      AC A8Y0Y3.1
#=GS E3LNU3_CAERE/4-273      AC E3LNU3.1
#=GS O16411_CAEEL/10-282     AC O16411.2
#=GS Q9XTV7_CAEEL/1-267      AC Q9XTV7.1
#=GS G0NEG7_CAEBE/286-509    AC G0NEG7.1
#=GS O17958_CAEEL/1-272      AC O17958.1
#=GS E1G5L5_LOALO/2-159      AC E1G5L5.1
#=GS A8XZ25_CAEBR/1-268      AC A8XZ25.2
#=GS G0PLP1_CAEBE/4-271      AC G0PLP1.1
#=GS A8X200_CAEBR/1-269      AC A8X200.1
#=GS E3MWM4_CAERE/1-171      AC E3MWM4.1
#=GS E3LL24_CAERE/265-432    AC E3LL24.1
#=GS Q23340_CAEEL/5-275      AC Q23340.1
#=GS Q9UAQ1_CAEEL/15-284     AC Q9UAQ1.1
#=GS O45559_CAEEL/1-272      AC O45559.1
#=GS A8X715_CAEBR/4-245      AC A8X715.1
#=GS A8X2B0_CAEBR/1-236      AC A8X2B0.2
#=GS E3LL24_CAERE/1-274      AC E3LL24.1
#=GS G0NEF6_CAEBE/5-183      AC G0NEF6.1
#=GS G0NEI5_CAEBE/1-270      AC G0NEI5.1
#=GS H2WME0_CAEJA/4-227      AC H2WME0.1
#=GS E3LHG6_CAERE/1-119      AC E3LHG6.1
#=GS E3LNU2_CAERE/296-564    AC E3LNU2.1
#=GS H2WRA4_CAEJA/1-159      AC H2WRA4.1
#=GS A8XZ24_CAEBR/1-281      AC A8XZ24.2
#=GS E3LL19_CAERE/184-289    AC E3LL19.1
#=GS O76412_CAEEL/18-275     AC O76412.1
#=GS E3MWM9_CAERE/184-233    AC E3MWM9.1
#=GS A8Y0Y5_CAEBR/7-276      AC A8Y0Y5.2
#=GS Q9XV31_CAEEL/8-276      AC Q9XV31.2
#=GS Q5F4V7_CAEEL/3-115      AC Q5F4V7.2
#=GS Q5F4V5_CAEEL/1-276      AC Q5F4V5.1
#=GS A8WQ27_CAEBR/248-395    AC A8WQ27.1
#=GS G0NEG8_CAEBE/175-240    AC G0NEG8.1
#=GS P91075_CAEEL/10-274     AC P91075.3
#=GS A8Y0Y8_CAEBR/1-223      AC A8Y0Y8.1
#=GS O61944_CAEEL/1-272      AC O61944.1
#=GS Q5F4V0_CAEEL/1-276      AC Q5F4V0.1
#=GS A8Y0Y4_CAEBR/1-209      AC A8Y0Y4.2
#=GS E3LL09_CAERE/8-308      AC E3LL09.1
#=GS G0NAP4_CAEBE/3-282      AC G0NAP4.1
#=GS G5ECV4_CAEEL/2-273      AC G5ECV4.1
#=GS O45752_CAEEL/10-280     AC O45752.2
#=GS G0NES1_CAEBE/175-256    AC G0NES1.1
#=GS Q7YX63_CAEEL/147-249    AC Q7YX63.1
#=GS Q9U2X4_CAEEL/1-276      AC Q9U2X4.2
#=GS A8XTU3_CAEBR/1-213      AC A8XTU3.1
#=GS G2J6K1_CAEBR/1-276      AC G2J6K1.1
#=GS H3FW72_PRIPA/41-188     AC H3FW72.1
#=GS G0NEH4_CAEBE/1-209      AC G0NEH4.1
#=GS O16941_CAEEL/2-160      AC O16941.1
#=GS G0NHR8_CAEBE/587-805    AC G0NHR8.1
#=GS G0NHR7_CAEBE/1-255      AC G0NHR7.1
#=GS E3LL21_CAERE/193-257    AC E3LL21.1
#=GS P91077_CAEEL/14-286     AC P91077.2
#=GS Q9XXK0_CAEEL/1-180      AC Q9XXK0.2
#=GS E3MWM9_CAERE/4-183      AC E3MWM9.1
#=GS A8X202_CAEBR/149-199    AC A8X202.1
#=GS Q23339_CAEEL/5-274      AC Q23339.1
#=GS E3MIZ7_CAERE/1-187      AC E3MIZ7.1
#=GS E3LL21_CAERE/1-197      AC E3LL21.1
#=GS Q9N4Q8_CAEEL/7-275      AC Q9N4Q8.2
#=GS H3F872_PRIPA/4-263      AC H3F872.1
#=GS Q5F4V3_CAEEL/1-279      AC Q5F4V3.1
#=GS E3LL22_CAERE/1-273      AC E3LL22.1
#=GS G0NHR9_CAEBE/5-282      AC G0NHR9.1
#=GS G0NHR8_CAEBE/302-567    AC G0NHR8.1
#=GS G0NEG8_CAEBE/1-180      AC G0NEG8.1
#=GS A8WQ75_CAEBR/1-223      AC A8WQ75.2
#=GS E3LL10_CAERE/16-285     AC E3LL10.1
#=GS P91076_CAEEL/16-287     AC P91076.1
#=GS A8Y0Y8_CAEBR/205-423    AC A8Y0Y8.1
#=GS G0NEH8_CAEBE/277-497    AC G0NEH8.1
#=GS A8WKN2_CAEBR/1-211      AC A8WKN2.2
#=GS E3MWM2_CAERE/4-109      AC E3MWM2.1
#=GS E3LL43_CAERE/1-291      AC E3LL43.1
#=GS O44700_CAEEL/8-278      AC O44700.1
#=GS Q5CZ32_CAEEL/1-62       AC Q5CZ32.1
#=GS H2VJ09_CAEJA/1-277      AC H2VJ09.1
#=GS G0NES2_CAEBE/174-241    AC G0NES2.1
#=GS E3LHG7_CAERE/1-194      AC E3LHG7.1
#=GS Q564Y1_CAEEL/13-279     AC Q564Y1.1
#=GS Q5DX30_CAEEL/10-281     AC Q5DX30.1
#=GS E3MWR6_CAERE/11-235     AC E3MWR6.1
#=GS B6IGE5_CAEBR/1-107      AC B6IGE5.1
#=GS G0NEG9_CAEBE/2-125      AC G0NEG9.1
#=GS A8Y0Z7_CAEBR/174-239    AC A8Y0Z7.2
#=GS Q5F4U9_CAEEL/1-272      AC Q5F4U9.1
#=GS Q9GYT6_CAEEL/10-282     AC Q9GYT6.2
#=GS E3LL24_CAERE/422-492    AC E3LL24.1
#=GS O45789_CAEEL/1-272      AC O45789.1
#=GS E3LHG4_CAERE/177-240    AC E3LHG4.1
#=GS O45280_CAEEL/1-272      AC O45280.2
#=GS E3LHG4_CAERE/1-181      AC E3LHG4.1
#=GS A8WQ20_CAEBR/1-162      AC A8WQ20.2
#=GS G5EFL6_CAEEL/3-260      AC G5EFL6.1
#=GS E3MWM3_CAERE/1-265      AC E3MWM3.1
#=GS G0NEF3_CAEBE/1-214      AC G0NEF3.1
#=GS O45281_CAEEL/1-271      AC O45281.1
#=GS A8X2M8_CAEBR/1-178      AC A8X2M8.2
#=GS A8WQ26_CAEBR/346-411    AC A8WQ26.2
#=GS E3LL34_CAERE/1-270      AC E3LL34.1
#=GS O16260_CAEEL/1-272      AC O16260.1
#=GS G0NEH0_CAEBE/1-239      AC G0NEH0.1
#=GS A8Y0Y2_CAEBR/10-160     AC A8Y0Y2.1
#=GS A8X1Z2_CAEBR/182-277    AC A8X1Z2.1
#=GS O44696_CAEEL/2-263      AC O44696.2
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O16345_CAEEL/1-274                 ............................................................................MYFSGIFVTITAIGYAFITIFFCAK..LL.L.........D..IYWFKT..lKRSPDL.T.LF.Y.F...RF....L.M.DIL..Y.S...............I..T.....I.I...F.F.LLSI.LIT.........................T..T..S.F.EGF..sRLE.EiS...IF..V....L...FWAK....YMIG.S..T..RA..F.......L.AF..LI.ASDRTW................ATYFPLYFFN...Y.R..S.Y..I....PN....M.F..I...V.A.L..V..F.M.YPLI......DGSML..F.I....Y..CENVI.QIS.P...G.CKNAACVLSE..C..YS.LY..W.LAY..EKV.V.YT..SI.....IALSL.LLS..LKLY......VWNK............Y.K.N.LT...ISWE........LKR...............INR...LALIDTCIILVFGLIPPIIVSYT.....................--RNAFDYIGPINTSLKFLGYALESYLVSRNLRKHK.............................................................
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