GenomeNet

Database: Pfam
Entry: ABC_tran_2
LinkDB: ABC_tran_2
Original site: ABC_tran_2 
#=GF ID   ABC_tran_2
#=GF AC   PF16949.3
#=GF DE   Putative ATP-binding cassette
#=GF AU   Coggill P
#=GF SE   HMMER:E8R692-TCDB
#=GF GA   25.70 25.70;
#=GF TC   26.00 25.70;
#=GF NC   25.40 25.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   ATP-binding_cassette_transporter
#=GF DR   INTERPRO; IPR031599;
#=GF DR   TC; 3.A.1;
#=GF CC   This is a family of putative two component ABC exporters. This
#=GF CC   is the membrane protein of approximately 573 residues and twelve
#=GF CC   transmembrane domains. It is encoded adjacent to an ATPase.
#=GF SQ   132
#=GS E3GJB4_EUBLK/27-552      AC E3GJB4.1
#=GS H3NMZ7_9FIRM/27-558      AC H3NMZ7.1
#=GS F0T1F5_SYNGF/44-583      AC F0T1F5.1
#=GS I0JK46_HALH3/22-528      AC I0JK46.1
#=GS A0A094WS05_BACAO/16-290  AC A0A094WS05.1
#=GS C6LJL1_9FIRM/25-476      AC C6LJL1.1
#=GS D8F554_9DELT/22-565      AC D8F554.1
#=GS R6DDG9_9CLOT/31-521      AC R6DDG9.1
#=GS G8LX28_CLOCD/24-543      AC G8LX28.1
#=GS C8VYX7_DESAS/34-576      AC C8VYX7.1
#=GS H1BJM0_9FIRM/23-533      AC H1BJM0.1
#=GS Q8RBG9_CALS4/48-549      AC Q8RBG9.1
#=GS A0A0F7JSG7_9DEIO/31-563  AC A0A0F7JSG7.1
#=GS L0DNC7_SINAD/35-580      AC L0DNC7.1
#=GS A0A094YZ46_BACAO/1-228   AC A0A094YZ46.1
#=GS C1A6K7_GEMAT/35-572      AC C1A6K7.1
#=GS E6UC22_RUMA7/33-327      AC E6UC22.1
#=GS A9KQ52_CLOPH/24-500      AC A9KQ52.1
#=GS C2W9X7_BACCE/17-454      AC C2W9X7.1
#=GS I7J4Y9_9CLOT/28-546      AC I7J4Y9.1
#=GS A8MJK3_ALKOO/32-549      AC A8MJK3.1
#=GS F3ZZ68_MAHA5/27-545      AC F3ZZ68.1
#=GS C2WDK7_BACCE/23-230      AC C2WDK7.1
#=GS K6U580_9CLOT/20-531      AC K6U580.1
#=GS I4C163_DESTA/23-568      AC I4C163.1
#=GS G7WAR9_DESOD/40-551      AC G7WAR9.1
#=GS C0QMC6_DESAH/36-573      AC C0QMC6.1
#=GS H6LCM3_ACEWD/30-546      AC H6LCM3.1
#=GS A0A0H3J460_CLOPA/24-533  AC A0A0H3J460.1
#=GS I4EK93_9CHLR/34-589      AC I4EK93.1
#=GS A0A024QFK1_9BACI/22-535  AC A0A024QFK1.1
#=GS F6CIC3_DESK7/43-516      AC F6CIC3.1
#=GS F5SFZ5_9BACL/29-525      AC F5SFZ5.1
#=GS B5Y6I5_COPPD/40-566      AC B5Y6I5.1
#=GS A0A0M9E8N7_9DELT/19-559  AC A0A0M9E8N7.1
#=GS W0E6K0_9FIRM/21-536      AC W0E6K0.1
#=GS R5WSX3_9DELT/24-552      AC R5WSX3.1
#=GS Q81B60_BACCR/21-465      AC Q81B60.1
#=GS A0A0G1J8X0_9BACT/27-498  AC A0A0G1J8X0.1
#=GS K4L7C7_9FIRM/36-561      AC K4L7C7.1
#=GS A7GQH5_BACCN/21-455      AC A7GQH5.1
#=GS R5LEN0_9FIRM/27-505      AC R5LEN0.1
#=GS Q1NUK5_9DELT/25-543      AC Q1NUK5.1
#=GS Q8XNM7_CLOPE/28-526      AC Q8XNM7.1
#=GS Q8CUJ3_OCEIH/18-524      AC Q8CUJ3.1
#=GS B4D3C0_9BACT/40-578      AC B4D3C0.1
#=GS R7JTX2_9FIRM/31-369      AC R7JTX2.1
#=GS A6LTL3_CLOB8/27-508      AC A6LTL3.1
#=GS R4KEN1_CLOPA/24-533      AC R4KEN1.1
#=GS D3PPX1_MEIRD/18-551      AC D3PPX1.1
#=GS Q97MC9_CLOAB/35-548      AC Q97MC9.1
#=GS C2X0X6_BACCE/9-454       AC C2X0X6.1
#=GS D1CHW3_THET1/65-521      AC D1CHW3.1
#=GS R2SQP8_9ENTE/35-426      AC R2SQP8.1
#=GS B5CRR3_9FIRM/27-518      AC B5CRR3.1
#=GS K1Y9J1_9BACT/23-519      AC K1Y9J1.1
#=GS A0A061A8Z7_9MOLU/41-207  AC A0A061A8Z7.1
#=GS S0ESY0_CHTCT/22-544      AC S0ESY0.1
#=GS F3ALN5_9FIRM/24-497      AC F3ALN5.1
#=GS A0A075LNK8_9BACI/21-537  AC A0A075LNK8.1
#=GS A0A0A1MDA9_9BACI/19-524  AC A0A0A1MDA9.1
#=GS K1Y4R1_9BACT/2-251       AC K1Y4R1.1
#=GS Q81N31_BACAN/21-465      AC Q81N31.1
#=GS K2ANV9_9BACT/21-577      AC K2ANV9.1
#=GS A0A0C7NJV8_9BACT/28-491  AC A0A0C7NJV8.1
#=GS A0A059NW85_9BACI/20-541  AC A0A059NW85.1
#=GS K2CCG6_9BACT/1-296       AC K2CCG6.1
#=GS H8GUE9_DEIGI/1-492       AC H8GUE9.1
#=GS A0A0G1JG78_9BACT/25-473  AC A0A0G1JG78.1
#=GS M1MNL7_9CLOT/23-476      AC M1MNL7.1
#=GS R7F8Z6_9CLOT/16-462      AC R7F8Z6.1
#=GS K2BN00_9BACT/18-369      AC K2BN00.1
#=GS B8FBD4_DESAA/24-562      AC B8FBD4.1
#=GS D6Z3G3_DESAT/25-550      AC D6Z3G3.1
#=GS A0A0G0R3H4_9BACT/17-546  AC A0A0G0R3H4.1
#=GS R6WYR8_9CLOT/32-334      AC R6WYR8.1
#=GS A0A0G0DU59_9BACT/24-497  AC A0A0G0DU59.1
#=GS J7IPE5_DESMD/43-575      AC J7IPE5.1
#=GS C5CI19_KOSOT/8-235       AC C5CI19.1
#=GS A8ZSQ0_DESOH/19-562      AC A8ZSQ0.1
#=GS C0GEI0_9FIRM/43-540      AC C0GEI0.1
#=GS Q188H1_PEPD6/25-521      AC Q188H1.1
#=GS C8WMK1_EGGLE/46-508      AC C8WMK1.1
#=GS R7G696_9FIRM/21-536      AC R7G696.1
#=GS R6YJ63_9FIRM/29-185      AC R6YJ63.1
#=GS A9BH46_PETMO/26-533      AC A9BH46.1
#=GS R7DLV7_9FIRM/32-527      AC R7DLV7.1
#=GS D6TMM1_9CHLR/33-559      AC D6TMM1.1
#=GS A0A0A0X1U0_9SPIO/78-589  AC A0A0A0X1U0.1
#=GS C5CIE3_KOSOT/29-494      AC C5CIE3.1
#=GS E0S2V3_BUTPB/26-317      AC E0S2V3.1
#=GS A0A0G2ZFJ9_9BACT/28-538  AC A0A0G2ZFJ9.1
#=GS R7IK17_9FIRM/29-572      AC R7IK17.1
#=GS E4U969_OCEP5/12-537      AC E4U969.1
#=GS A0A0A1MFA6_9BACI/19-450  AC A0A0A1MFA6.1
#=GS Q24XL1_DESHY/1-518       AC Q24XL1.1
#=GS D3FXU1_BACPE/18-537      AC D3FXU1.1
#=GS C0GFQ5_9FIRM/29-542      AC C0GFQ5.1
#=GS Q1NK54_9DELT/25-543      AC Q1NK54.1
#=GS K2C903_9BACT/38-588      AC K2C903.1
#=GS K2BVY5_9BACT/2-203       AC K2BVY5.1
#=GS L0F921_DESDL/38-544      AC L0F921.1
#=GS Q0AVC1_SYNWW/31-552      AC Q0AVC1.1
#=GS B2A6N2_NATTJ/29-559      AC B2A6N2.1
#=GS B8CYB0_HALOH/24-517      AC B8CYB0.1
#=GS A6TLI1_ALKMQ/35-544      AC A6TLI1.1
#=GS U5MQW6_CLOSA/21-538      AC U5MQW6.1
#=GS R7F7A0_9CLOT/22-467      AC R7F7A0.1
#=GS Q67SZ1_SYMTH/24-536      AC Q67SZ1.1
#=GS E8U7N4_DEIML/19-554      AC E8U7N4.1
#=GS E8R692_ISOPI/76-623      AC E8R692.1
#=GS D1C7A4_SPHTD/19-527      AC D1C7A4.1
#=GS A0A0F2JI10_9FIRM/21-539  AC A0A0F2JI10.1
#=GS A0A0B7MHW9_9FIRM/29-545  AC A0A0B7MHW9.1
#=GS A0A0E3M9L4_CLOSL/25-549  AC A0A0E3M9L4.1
#=GS R7FKB7_9CLOT/26-453      AC R7FKB7.1
#=GS R5IRL9_9FIRM/347-531     AC R5IRL9.1
#=GS Q899E1_CLOTE/18-535      AC Q899E1.1
#=GS D6E7M4_9ACTN/39-473      AC D6E7M4.1
#=GS B8I503_CLOCE/24-532      AC B8I503.1
#=GS A0A0H4KH20_9BACI/18-519  AC A0A0H4KH20.1
#=GS J3AVQ9_9BACL/29-525      AC J3AVQ9.1
#=GS A0A0M1UTQ3_CLOSO/26-521  AC A0A0M1UTQ3.1
#=GS I8UH61_9BACI/26-537      AC I8UH61.1
#=GS R6UYC6_9FIRM/22-537      AC R6UYC6.1
#=GS C1D1P1_DEIDV/26-560      AC C1D1P1.1
#=GS U5RTD0_9CLOT/23-548      AC U5RTD0.1
#=GS B9XQA9_PEDPL/37-581      AC B9XQA9.1
#=GS I4D378_DESAJ/39-537      AC I4D378.1
#=GS A0A0G1R589_9BACT/23-558  AC A0A0G1R589.1
#=GS D7BEV8_MEISD/40-556      AC D7BEV8.1
#=GS A0A0A7KE98_9DEIO/34-563  AC A0A0A7KE98.1
E3GJB4_EUBLK/27-552                 .........................................................................nnkkaflkqvglpvlvlvamlp--------------------.--...-...LY.GLYV.A.YM...AMM..Y..TgMAA........IG.--........QV.S.....V..L.L....PM.A.YT.V.I.S.V..V..I.....I.FFGL.A.Y....I.M....A...EF.YF.SG..SVEMLLPLPIKPRNIIIGKFGS.IIF.M.E...V...L..L..S.A.AL.MLPPAVI....Y....GMGQ.G..MGIL.YYM..M.A.L..I.VIV.IL.PV.LP...LA..LET..L...L...IML...LMRS...NS....F....K..GKK...D.V...F.Q....I...V....A.L...F..A.V.LA..F......F....LG.L..QMY...L..S.....S.MAGgS.D.D.PM....TMVN.S.M.L...A....DngylL.KT..I....T.R.M.....Y....P..V.S..L.LV.A..Q.SL.NSI..T..L..TGML.-S.LL.GLFILT.A.-A..AFA..LM.V-...-...FVG.ERVYVKG-..--LISG..KESG..RGK.KALS---.................................VTKLQKAL.S.....HRSA..PALAVFKMDMRLLLRT.....PI....Y....F....F....N.....N....V.....S...I...V....VV...V..PL..VF..L...........M.....S.........M......F.......F..G...K...SggmdimtL.........V...S.....D...F...Y....K..A...A.......P.......D.......A......M......N...........L..I..L....IvV.F..M...F..F.GS.I.....A...C.T...T..A.........TT........FSR..EGKNIWLTCIVPVRPLDQMIGR....GLSA..L.CI....Q....L...LGI..V....FTL.IL..LAFIT..PLTL.G..T..V.V..V..S..L..V..L..GT....I.G..SF...PL.LA.F.GLI.V..DM..MR..PLL........N.WD.....N........P....Q.K.A.....V.KnN.MNV.MIA..MMV.GWV...Y.MLLV...VGISAA..TGF---....----..------...---..---...---...-----.-----....----------------fiapvfgysffavvsivisvlllmvvkkhl.......................................................................................................................................................
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