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Database: Pfam
Entry: Apolipoprotein
LinkDB: Apolipoprotein
Original site: Apolipoprotein 
#=GF ID   Apolipoprotein
#=GF AC   PF01442.16
#=GF DE   Apolipoprotein A1/A4/E domain
#=GF AU   Bateman A
#=GF SE   Prodom_1521 (release 99.1)
#=GF GA   90.00 5.00;
#=GF TC   90.90 6.20;
#=GF NC   89.50 -999999.99;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   2063194
#=GF RT   Three-dimensional structure of the LDL receptor-binding domain
#=GF RT   of human apolipoprotein E. 
#=GF RA   Wilson C, Wardell MR, Weisgraber KH, Mahley RW, Agard DA; 
#=GF RL   Science 1991;252:1817-1822.
#=GF DR   INTERPRO; IPR000074;
#=GF DR   SCOP; 1oef; fa;
#=GF CC   These proteins contain several 22 residue repeats which form a
#=GF CC   pair of alpha helices. This family includes: Swiss:P02647
#=GF CC   Apolipoprotein A-I. Swiss:P06727 Apolipoprotein A-IV.
#=GF CC   Swiss:P02649 Apolipoprotein E.
#=GF SQ   1823
#=GS E9JCX9_SOLIN/52-261         AC E9JCX9.1
#=GS G8PSY0_PSEUV/1724-1961      AC G8PSY0.1
#=GS Q2K7R6_RHIEC/1005-1119      AC Q2K7R6.1
#=GS Q2K7R6_RHIEC/1202-1395      AC Q2K7R6.1
#=GS A0A0F5FP37_9RHIZ/573-758    AC A0A0F5FP37.1
#=GS E2CMQ5_9RHOB/464-641        AC E2CMQ5.1
#=GS W5K2L3_ASTMX/66-255         AC W5K2L3.1
#=GS T1IXL2_STRMM/1910-2095      AC T1IXL2.1
#=GS H9G5E8_ANOCA/64-257         AC H9G5E8.1
#=GS E2A638_CAMFO/3518-3697      AC E2A638.1
#=GS A4HRT8_LEIIN/599-726        AC A4HRT8.1
#=GS H3BVN8_TETNG/78-207         AC H3BVN8.1
#=GS H2FLK4_CAEEL/160-359        AC H2FLK4.1
#=GS L5LTG8_MYODS/881-1043       AC L5LTG8.1
#=GS G0GDP3_SPITZ/644-831        AC G0GDP3.1
#=GS G0NF79_CAEBE/3-120          AC G0NF79.1
#=GS F7QQE2_9BRAD/484-642        AC F7QQE2.1
#=GS J2KUI2_9RHIZ/466-632        AC J2KUI2.1
#=GS K7EUP9_PONAB/244-412        AC K7EUP9.1
#=GS E3LIT3_CAERE/422-613        AC E3LIT3.1
#=GS W5NW13_SHEEP/96-267         AC W5NW13.1
#=GS Q3STP3_NITWN/1164-1382      AC Q3STP3.1
#=GS APOE_RAT/73-284             AC P02650.2
#=GS Q89HV2_BRADU/1093-1270      AC Q89HV2.1
#=GS L5L722_PTEAL/1123-1290      AC L5L722.1
#=GS A0A0J6TEN7_9RHIZ/757-924    AC A0A0J6TEN7.1
#=GS L5MGD7_MYODS/1243-1414      AC L5MGD7.1
#=GS H3EW08_PRIPA/693-816        AC H3EW08.1
#=GS G0PIE3_CAEBE/775-923        AC G0PIE3.1
#=GS Q1YI78_AURMS/289-490        AC Q1YI78.1
#=GS G5EEF0_CAEEL/2-201          AC G5EEF0.1
#=GS B0ULS9_METS4/584-729        AC B0ULS9.1
#=GS J9JHP1_CANLF/782-936        AC J9JHP1.1
#=GS F1N3Q7_BOVIN/61-253         AC F1N3Q7.1
#=GS E9JCX9_SOLIN/1696-1882      AC E9JCX9.1
#=GS Q219B9_RHOPB/451-635        AC Q219B9.1
#=GS A8WYJ1_CAEBR/149-335        AC A8WYJ1.2
#=GS L5MGD7_MYODS/283-472        AC L5MGD7.1
#=GS O51465_BORBU/421-651        AC O51465.1
#=GS B9R0P5_LABAD/1501-1685      AC B9R0P5.1
#=GS A0A0F5FM90_9RHIZ/534-673    AC A0A0F5FM90.1
#=GS APOA4_PIG/61-253            AC O46409.1
#=GS E9ACH4_LEIMA/1503-1632      AC E9ACH4.1
#=GS APOA1_PANTR/69-262          AC P0DJG0.1
#=GS A0A0J6TEN7_9RHIZ/592-782    AC A0A0J6TEN7.1
#=GS B6JBE6_OLICO/912-1082       AC B6JBE6.1
#=GS G6YJX9_9RHIZ/863-1052       AC G6YJX9.1
#=GS Q0G028_9RHIZ/544-686        AC Q0G028.1
#=GS I4Z2Y8_9RHIZ/442-546        AC I4Z2Y8.1
#=GS L5MGD7_MYODS/875-1025       AC L5MGD7.1
#=GS A0A0N0E7B0_9RHOB/956-1132   AC A0A0N0E7B0.1
#=GS A9CJ72_AGRFC/1291-1439      AC A9CJ72.1
#=GS A0A0G2ZR61_9DELT/6-137      AC A0A0G2ZR61.1
#=GS H2FLK7_CAEEL/208-413        AC H2FLK7.1
#=GS Q92K98_RHIME/1038-1157      AC Q92K98.1
#=GS G6YJX9_9RHIZ/1038-1207      AC G6YJX9.1
#=GS A4H3J9_LEIBR/375-448        AC A4H3J9.1
#=GS G6YJX9_9RHIZ/1299-1444      AC G6YJX9.1
#=GS A0A0D5LTK4_9RHIZ/400-598    AC A0A0D5LTK4.1
#=GS L5MGD7_MYODS/514-669        AC L5MGD7.1
#=GS W4VVL6_ATTCE/1948-2128      AC W4VVL6.1
#=GS K2QF42_9RHIZ/644-798        AC K2QF42.1
#=GS C0QY77_BRAHW/5997-6303      AC C0QY77.1
#=GS F6XU42_MACMU/223-387        AC F6XU42.1
#=GS L5MGD7_MYODS/925-1065       AC L5MGD7.1
#=GS A0A090G7E4_9RHIZ/1486-1670  AC A0A090G7E4.1
#=GS H7EH05_9SPIO/1613-1819      AC H7EH05.1
#=GS H2FLK8_CAEEL/1192-1366      AC H2FLK8.1
#=GS L5MGD7_MYODS/1607-1718      AC L5MGD7.1
#=GS G1L582_AILME/71-251         AC G1L582.1
#=GS H7EH05_9SPIO/468-635        AC H7EH05.1
#=GS I0XBH1_9SPIO/582-737        AC I0XBH1.1
#=GS H3B4D6_LATCH/222-364        AC H3B4D6.1
#=GS H7EGX4_9SPIO/1098-1275      AC H7EGX4.1
#=GS F6V8D1_XENTR/70-263         AC F6V8D1.1
#=GS J9JHP1_CANLF/1129-1282      AC J9JHP1.1
#=GS APOA4_PAPAN/275-399         AC Q28758.1
#=GS A0A0F5PW42_9RHIZ/981-1231   AC A0A0F5PW42.1
#=GS W5KQL1_ASTMX/212-356        AC W5KQL1.1
#=GS C0QY77_BRAHW/4024-4186      AC C0QY77.1
#=GS A0A0B4J2H6_PAPAN/69-262     AC A0A0B4J2H6.1
#=GS H2RPS2_TAKRU/69-256         AC H2RPS2.1
#=GS H3B4D6_LATCH/61-245         AC H3B4D6.1
#=GS L5MGD7_MYODS/1373-1481      AC L5MGD7.1
#=GS A0A0N1J1P7_9DELT/228-377    AC A0A0N1J1P7.1
#=GS A0A091DLF4_FUKDA/52-264     AC A0A091DLF4.1
#=GS F7QQE2_9BRAD/160-346        AC F7QQE2.1
#=GS E8TC23_MESCW/1673-1873      AC E8TC23.1
#=GS G6YJX9_9RHIZ/1621-1824      AC G6YJX9.1
#=GS U7G7S1_9RHOB/1402-1581      AC U7G7S1.1
#=GS L5LTG8_MYODS/1004-1163      AC L5LTG8.1
#=GS G4REU2_PELHB/224-342        AC G4REU2.1
#=GS B8IEM9_METNO/338-506        AC B8IEM9.1
#=GS A0A093B942_CHAPE/54-247     AC A0A093B942.1
#=GS J5PVQ6_9RHOB/1575-1689      AC J5PVQ6.1
#=GS H2RAR8_PANTR/81-292         AC H2RAR8.1
#=GS G3NRQ2_GASAC/65-261         AC G3NRQ2.1
#=GS F2J3B8_POLGS/387-587        AC F2J3B8.1
#=GS A0A0P7UBI8_9TELE/425-612    AC A0A0P7UBI8.1
#=GS K2QF42_9RHIZ/1250-1443      AC K2QF42.1
#=GS A0A0F5Q6A1_9RHIZ/1146-1285  AC A0A0F5Q6A1.1
#=GS A7IMV2_XANP2/462-654        AC A7IMV2.1
#=GS L5L722_PTEAL/1291-1451      AC L5L722.1
#=GS A1QZU7_BORT9/717-922        AC A1QZU7.1
#=GS G1L582_AILME/240-417        AC G1L582.1
#=GS A6X0S3_OCHA4/877-1028       AC A6X0S3.1
#=GS C0QY77_BRAHW/5744-5987      AC C0QY77.1
#=GS Q92K98_RHIME/1700-1873      AC Q92K98.1
#=GS B0KWR0_CALJA/244-395        AC B0KWR0.1
#=GS Q1YI78_AURMS/1356-1551      AC Q1YI78.1
#=GS A2FTZ2_TRIVA/66-388         AC A2FTZ2.1
#=GS B7NZM0_RABIT/15-60          AC B7NZM0.1
#=GS B9JWH5_AGRVS/1519-1714      AC B9JWH5.1
#=GS K2QF42_9RHIZ/1131-1266      AC K2QF42.1
#=GS A0A091DG24_FUKDA/16-60      AC A0A091DG24.1
#=GS G0GDP3_SPITZ/368-518        AC G0GDP3.1
#=GS Q0G028_9RHIZ/690-868        AC Q0G028.1
#=GS B1LTJ7_METRJ/713-888        AC B1LTJ7.1
#=GS E8TC23_MESCW/1095-1290      AC E8TC23.1
#=GS APOA4_PAPAN/182-351         AC Q28758.1
#=GS K7GW28_CAEJA/527-645        AC K7GW28.1
#=GS A0A0F5FM90_9RHIZ/637-775    AC A0A0F5FM90.1
#=GS W6RAL5_9RHIZ/271-453        AC W6RAL5.1
#=GS E9ACH4_LEIMA/1213-1330      AC E9ACH4.1
#=GS A8I871_AZOC5/797-991        AC A8I871.1
#=GS M3XYH5_MUSPF/132-278        AC M3XYH5.1
#=GS L5M0Q1_MYODS/1-129          AC L5M0Q1.1
#=GS B1LTJ7_METRJ/1042-1235      AC B1LTJ7.1
#=GS C0QY77_BRAHW/77-280         AC C0QY77.1
#=GS C5ASQ7_METEA/1542-1743      AC C5ASQ7.1
#=GS I3K835_ORENI/67-259         AC I3K835.1
#=GS Q0G028_9RHIZ/1480-1645      AC Q0G028.1
#=GS H2FLK8_CAEEL/49-265         AC H2FLK8.1
#=GS K0W427_9RHIZ/1608-1790      AC K0W427.1
#=GS H2MLX9_ORYLA/67-262         AC H2MLX9.1
#=GS Q6N2U0_RHOPA/974-1164       AC Q6N2U0.1
#=GS APOA1_PONAB/69-262          AC P0DJG1.1
#=GS APOA1_CANLF/68-261          AC P02648.2
#=GS K2QF42_9RHIZ/1559-1723      AC K2QF42.1
#=GS C6XGJ9_LIBAP/187-371        AC C6XGJ9.1
#=GS K0W427_9RHIZ/289-484        AC K0W427.1
#=GS U6NJJ6_HAECO/648-852        AC U6NJJ6.1
#=GS A9D6H7_HOEPD/929-1087       AC A9D6H7.1
#=GS G1TX15_RABIT/59-268         AC G1TX15.1
#=GS F4WT31_ACREC/6647-6833      AC F4WT31.1
#=GS F4WT31_ACREC/2525-2687      AC F4WT31.1
#=GS E9ACH4_LEIMA/203-334        AC E9ACH4.1
#=GS Q98M03_RHILO/1486-1651      AC Q98M03.1
#=GS A0A0J6TEN7_9RHIZ/456-591    AC A0A0J6TEN7.1
#=GS Q1YI78_AURMS/1257-1452      AC Q1YI78.1
#=GS F4WT31_ACREC/4931-5126      AC F4WT31.1
#=GS APOA4_CANLF/268-360         AC E2RE76.2
#=GS L5MGD7_MYODS/1409-1580      AC L5MGD7.1
#=GS W6RAL5_9RHIZ/938-1089       AC W6RAL5.1
#=GS B8ETT5_METSB/1835-2111      AC B8ETT5.1
#=GS K7GW30_CAEJA/210-400        AC K7GW30.1
#=GS A0A0D5LTK4_9RHIZ/774-978    AC A0A0D5LTK4.1
#=GS J7QLQ6_METSZ/660-842        AC J7QLQ6.1
#=GS H2NZ64_PONAB/81-292         AC H2NZ64.1
#=GS A0A0F5Q6A1_9RHIZ/192-377    AC A0A0F5Q6A1.1
#=GS A6X0S3_OCHA4/814-967        AC A6X0S3.1
#=GS Q1QNQ4_NITHX/452-642        AC Q1QNQ4.1
#=GS L5MGD7_MYODS/480-636        AC L5MGD7.1
#=GS K7EUP9_PONAB/11-60          AC K7EUP9.1
#=GS M3WFW9_FELCA/251-309        AC M3WFW9.1
#=GS E0MKI3_9RHOB/162-332        AC E0MKI3.1
#=GS J7QLQ6_METSZ/173-364        AC J7QLQ6.1
#=GS H7EGV9_9SPIO/326-514        AC H7EGV9.1
#=GS A9D6H7_HOEPD/215-387        AC A9D6H7.1
#=GS G3WJV1_SARHA/263-361        AC G3WJV1.1
#=GS Q6N2U0_RHOPA/513-695        AC Q6N2U0.1
#=GS Q92K98_RHIME/897-1058       AC Q92K98.1
#=GS F6TDB8_MONDO/61-253         AC F6TDB8.2
#=GS L5L722_PTEAL/926-1094       AC L5L722.1
#=GS H2RQ07_TAKRU/82-285         AC H2RQ07.1
#=GS B0ULS9_METS4/1594-1745      AC B0ULS9.1
#=GS A0A0F5FM90_9RHIZ/370-535    AC A0A0F5FM90.1
#=GS H2MFX3_ORYLA/79-263         AC H2MFX3.1
#=GS I3K841_ORENI/64-247         AC I3K841.1
#=GS A0A0N1B2I5_9BRAD/495-647    AC A0A0N1B2I5.1
#=GS A4HRT8_LEIIN/288-412        AC A4HRT8.1
#=GS APOA5_RAT/52-259            AC Q9QUH3.1
#=GS H2U2B3_TAKRU/79-265         AC H2U2B3.1
#=GS H2FLK7_CAEEL/590-834        AC H2FLK7.1
#=GS G0PIE3_CAEBE/209-345        AC G0PIE3.1
#=GS Q0G028_9RHIZ/589-775        AC Q0G028.1
#=GS F2NXY6_TRES6/311-500        AC F2NXY6.1
#=GS B2IHR8_BEII9/602-757        AC B2IHR8.1
#=GS V4AF92_LOTGI/385-661        AC V4AF92.1
#=GS APOA1_AILME/68-261          AC D2HC77.1
#=GS H7EGX4_9SPIO/1465-1666      AC H7EGX4.1
#=GS C0QY77_BRAHW/3446-3647      AC C0QY77.1
#=GS G0NF78_CAEBE/137-280        AC G0NF78.1
#=GS G1LPZ5_AILME/10-60          AC G1LPZ5.1
#=GS G7PP10_MACFA/264-317        AC G7PP10.1
#=GS H0WBC9_CAVPO/267-358        AC H0WBC9.1
#=GS G5EFU3_CAEEL/4-202          AC G5EFU3.1
#=GS APOA4_RAT/183-330           AC P02651.2
#=GS J2KUI2_9RHIZ/1767-1968      AC J2KUI2.1
#=GS J2KUI2_9RHIZ/590-779        AC J2KUI2.1
#=GS H7EGX4_9SPIO/747-935        AC H7EGX4.1
#=GS A0A088A5I7_APIME/5121-5226  AC A0A088A5I7.1
#=GS H0HW41_9RHIZ/204-349        AC H0HW41.1
#=GS A0A0H2UHP7_RAT/76-283       AC A0A0H2UHP7.1
#=GS B2IHR8_BEII9/339-525        AC B2IHR8.1
#=GS F4WT31_ACREC/4574-4756      AC F4WT31.1
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#=GS E8TC23_MESCW/1050-1244      AC E8TC23.1
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#=GS A0A0F5FM90_9RHIZ/191-381    AC A0A0F5FM90.1
#=GS O51465_BORBU/1284-1506      AC O51465.1
#=GS C3MDB4_RHISN/474-689        AC C3MDB4.1
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#=GS C0QY77_BRAHW/6556-6759      AC C0QY77.1
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#=GS Q3STP3_NITWN/755-927        AC Q3STP3.1
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#=GS Q219B9_RHOPB/729-882        AC Q219B9.1
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#=GS U7G7S1_9RHOB/1186-1382      AC U7G7S1.1
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#=GS A0A0H2UHP7_RAT/280-338      AC A0A0H2UHP7.1
#=GS T1IXL2_STRMM/586-791        AC T1IXL2.1
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#=GS H2FLK3_CAEEL/596-799        AC H2FLK3.1
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#=GS C0QY77_BRAHW/3397-3479      AC C0QY77.1
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#=GS E9JCX9_SOLIN/2798-2987      AC E9JCX9.1
#=GS E2C1X2_HARSA/4726-4915      AC E2C1X2.1
#=GS G3WCV9_SARHA/263-432        AC G3WCV9.1
#=GS L5LTG8_MYODS/5-163          AC L5LTG8.1
#=GS B0ULS9_METS4/1423-1596      AC B0ULS9.1
#=GS B0KWR0_CALJA/11-60          AC B0KWR0.1
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#=GS G1R6X2_NOMLE/11-60          AC G1R6X2.1
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