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Database: Pfam
Entry: Bet_v_1
LinkDB: Bet_v_1
Original site: Bet_v_1 
#=GF ID   Bet_v_1
#=GF AC   PF00407.17
#=GF DE   Pathogenesis-related protein Bet v I family
#=GF PI   Bet_v_I; 
#=GF AU   Finn RD, Radauer C
#=GF SE   Prosite
#=GF GA   20.80 20.80;
#=GF TC   20.80 20.80;
#=GF NC   20.70 20.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF WK   Bet_v_I_allergen
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9417891
#=GF RT   The potential of Betv1 homologues, a nuclear multigene family,
#=GF RT   as phylogenetic markers in flowering plants. 
#=GF RA   Wen J, Vanek-Krebitz M, Hoffmann-Sommergruber K, Scheiner O,
#=GF RA   Breiteneder H; 
#=GF RL   Mol Phylogenet Evol. 1997;8:317-333.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   18922149
#=GF RT   The Bet v 1 fold: an ancient, versatile scaffold for binding of
#=GF RT   large, hydrophobic ligands. 
#=GF RA   Radauer C, Lackner P, Breiteneder H; 
#=GF RL   BMC Evol Biol. 2008;8:286.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   9874249
#=GF RT   Purification and cDNA cloning of cytokinin-specific binding
#=GF RT   protein from mung bean (Vigna radiata). 
#=GF RA   Fujimoto Y, Nagata R, Fukasawa H, Yano K, Azuma M, Iida A,
#=GF RA   Sugimoto S, Shudo K, Hashimoto Y; 
#=GF RL   Eur J Biochem. 1998;258:794-802.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   15447655
#=GF RT   Molecular cloning and characterization of norcoclaurine
#=GF RT   synthase, an enzyme catalyzing the first committed step in
#=GF RT   benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis. 
#=GF RA   Samanani N, Liscombe DK, Facchini PJ; 
#=GF RL   Plant J. 2004;40:302-313.
#=GF RN   [5]
#=GF RM   15447655
#=GF RT   Molecular cloning and characterization of norcoclaurine
#=GF RT   synthase, an enzyme catalyzing the first committed step in
#=GF RT   benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis. 
#=GF RA   Samanani N, Liscombe DK, Facchini PJ; 
#=GF RL   Plant J. 2004;40:302-313.
#=GF DR   INTERPRO; IPR000916;
#=GF DR   PROSITE; PDOC00437;
#=GF DR   PRINTS; PR00634;
#=GF DR   SCOP; 1btv; fa;
#=GF CC   This family is named after Bet v 1, the major birch pollen
#=GF CC   allergen. This protein belongs to family 10 of plant
#=GF CC   pathogenesis-related proteins (PR-10), cytoplasmic proteins of
#=GF CC   15-17 kd that are wide-spread among dicotyledonous plants [1].
#=GF CC   In recent years, a number of diverse plant proteins with low
#=GF CC   sequence similarity to Bet v 1 was identified. A classification
#=GF CC   by sequence similarity yielded several subfamilies related to
#=GF CC   PR-10 [2]: - Pathogenesis-related proteins PR-10: These proteins
#=GF CC   were identified as major tree pollen allergens in birch and
#=GF CC   related species (hazel, alder), as plant food allergens
#=GF CC   expressed in high levels in fruits, vegetables and seeds (apple,
#=GF CC   celery, hazelnut), and as pathogenesis-related proteins whose
#=GF CC   expression is induced by pathogen infection, wounding, or
#=GF CC   abiotic stress. Hyp-1 (Swiss:Q8H1L1), an enzyme involved in the
#=GF CC   synthesis of the bioactive naphthodianthrone hypericin in St.
#=GF CC   John's wort (Hypericum perforatum) also belongs to this family.
#=GF CC   Most of these proteins were found in dicotyledonous plants. In
#=GF CC   addition, related sequences were identified in monocots and
#=GF CC   conifers. - Cytokinin-specific binding proteins: These legume
#=GF CC   proteins bind cytokinin plant hormones [3]. - (S)-Norcoclaurine
#=GF CC   synthases are enzymes catalysing the condensation of dopamine
#=GF CC   and 4-hydroxyphenylacetaldehyde to (S)-norcoclaurine, the first
#=GF CC   committed step in the biosynthesis of benzylisoquinoline
#=GF CC   alkaloids such as morphine [4]. -Major latex proteins and
#=GF CC   ripening-related proteins are proteins of unknown biological
#=GF CC   function that were first discovered in the latex of opium poppy
#=GF CC   (Papaver somniferum) and later found to be upregulated during
#=GF CC   ripening of fruits such as strawberry and cucumber [5]. The
#=GF CC   occurrence of Bet v 1-related proteins is confined to seed
#=GF CC   plants with the exception of a cytokinin-binding protein from
#=GF CC   the moss Physcomitrella patens (Swiss:Q9AXI3).
#=GF SQ   1458
#=GS Y1401_ARATH/78-139        AC P0C0B1.1
#=GS A0A0B0NY72_GOSAR/5-156    AC A0A0B0NY72.1
#=GS K4CRT2_SOLLC/3-151        AC K4CRT2.1
#=GS A3CIC2_ORYSJ/1-125        AC A3CIC2.1
#=GS A0A0J8BSZ1_BETVU/1-92     AC A0A0J8BSZ1.1
#=GS V4S747_9ROSI/1-154        AC V4S747.1
#=GS M1CVY8_SOLTU/148-297      AC M1CVY8.1
#=GS K4CQ40_SOLLC/2-151        AC K4CQ40.1
#=GS A2XFP6_ORYSI/2-155        AC A2XFP6.1
#=GS A0A0A0LA34_CUCSA/2-154    AC A0A0A0LA34.1
#=GS V4K9L2_EUTSA/1-68         AC V4K9L2.1
#=GS A0A059AMU9_EUCGR/1-143    AC A0A059AMU9.1
#=GS M1CSU7_SOLTU/1-118        AC M1CSU7.1
#=GS A0A0D2REG8_GOSRA/1-158    AC A0A0D2REG8.1
#=GS F4I6Y3_ARATH/183-247      AC F4I6Y3.1
#=GS A0A0E0BTY7_9ORYZ/1-153    AC A0A0E0BTY7.1
#=GS A0A078JG91_BRANA/2-151    AC A0A078JG91.1
#=GS M0ZNM3_SOLTU/3-151        AC M0ZNM3.1
#=GS F6HFH1_VITVI/2-64         AC F6HFH1.1
#=GS I1PP98_ORYGL/1-155        AC I1PP98.1
#=GS M1C4P0_SOLTU/2-145        AC M1C4P0.1
#=GS A0A067JYK4_JATCU/1-152    AC A0A067JYK4.1
#=GS M0VJI6_HORVD/1-89         AC M0VJI6.1
#=GS W5DZQ9_WHEAT/38-191       AC W5DZQ9.1
#=GS A0A0B0PGA7_GOSAR/1-154    AC A0A0B0PGA7.1
#=GS A0A0J8D0F0_BETVU/14-109   AC A0A0J8D0F0.1
#=GS A0A059AM85_EUCGR/1-155    AC A0A059AM85.1
#=GS A0A0A0L7W1_CUCSA/1-152    AC A0A0A0L7W1.1
#=GS B9RZJ8_RICCO/1-165        AC B9RZJ8.1
#=GS A0A0A0KMJ4_CUCSA/20-169   AC A0A0A0KMJ4.1
#=GS SAM22_SOYBN/1-154         AC P26987.1
#=GS SAM22_SOYBN/1-154         DR PDB; 2K7H A; 1-153;
#=GS A0A022QYE7_ERYGU/1-155    AC A0A022QYE7.1
#=GS M0UTI5_HORVD/3-157        AC M0UTI5.1
#=GS A0A078F8S4_BRANA/66-228   AC A0A078F8S4.1
#=GS M1C4P4_SOLTU/2-147        AC M1C4P4.1
#=GS PRS1_SOLTU/1-150          AC P17641.1
#=GS V4L3Q8_EUTSA/32-119       AC V4L3Q8.1
#=GS A0A067JYJ9_JATCU/50-140   AC A0A067JYJ9.1
#=GS V4RFS3_9ROSI/1-140        AC V4RFS3.1
#=GS A0A0A0L7N6_CUCSA/2-153    AC A0A0A0L7N6.1
#=GS Q10MP7_ORYSJ/2-155        AC Q10MP7.1
#=GS A0A059D656_EUCGR/85-169   AC A0A059D656.1
#=GS A0A0J8CKD4_BETVU/2-151    AC A0A0J8CKD4.1
#=GS A0A059B5A1_EUCGR/1-155    AC A0A059B5A1.1
#=GS A0A059BEC1_EUCGR/3-145    AC A0A059BEC1.1
#=GS A0A059BFB8_EUCGR/2-148    AC A0A059BFB8.1
#=GS R0IFR8_9BRAS/12-163       AC R0IFR8.1
#=GS V4S743_9ROSI/1-155        AC V4S743.1
#=GS D7LLS2_ARALL/2-151        AC D7LLS2.1
#=GS A0A022QXQ9_ERYGU/1-117    AC A0A022QXQ9.1
#=GS D7U2D6_VITVI/5-110        AC D7U2D6.1
#=GS A0A0D9Y077_9ORYZ/180-333  AC A0A0D9Y077.1
#=GS M1AFT0_SOLTU/3-151        AC M1AFT0.1
#=GS A0A0D2WAC3_GOSRA/5-156    AC A0A0D2WAC3.1
#=GS A0A022RVK4_ERYGU/1-157    AC A0A022RVK4.1
#=GS Q93WB5_ARATH/2-151        AC Q93WB5.1
#=GS M1ACY4_SOLTU/3-87         AC M1ACY4.1
#=GS A0A087HHB2_ARAAL/9-160    AC A0A087HHB2.1
#=GS M5XMM6_PRUPE/1-154        AC M5XMM6.1
#=GS W5ANW7_WHEAT/1-154        AC W5ANW7.1
#=GS K7L3M0_SOYBN/1-154        AC K7L3M0.1
#=GS U5G999_POPTR/1-155        AC U5G999.1
#=GS A0A078DT56_BRANA/79-135   AC A0A078DT56.1
#=GS D7KYF8_ARALL/6-158        AC D7KYF8.1
#=GS A0A059B578_EUCGR/1-139    AC A0A059B578.1
#=GS F2CYI2_HORVD/1-154        AC F2CYI2.1
#=GS B9T7P9_RICCO/1-119        AC B9T7P9.1
#=GS S1SIE9_THECC/1-136        AC S1SIE9.1
#=GS M5W0Z5_PRUPE/7-106        AC M5W0Z5.1
#=GS T1LDJ2_TRIUA/2-156        AC T1LDJ2.1
#=GS W5H7R8_WHEAT/3-92         AC W5H7R8.1
#=GS M5Y306_PRUPE/28-124       AC M5Y306.1
#=GS A9RZA3_PHYPA/1-147        AC A9RZA3.1
#=GS M1AUH0_SOLTU/2-67         AC M1AUH0.1
#=GS C5WMM0_SORBI/2-155        AC C5WMM0.1
#=GS R0FQQ8_9BRAS/2-151        AC R0FQQ8.1
#=GS A0A059D7M0_EUCGR/2-150    AC A0A059D7M0.1
#=GS K4CY10_SOLLC/1-149        AC K4CY10.1
#=GS A0A078JRC3_BRANA/2-151    AC A0A078JRC3.1
#=GS A0A059BFW1_EUCGR/3-151    AC A0A059BFW1.1
#=GS M1DNR1_SOLTU/2-148        AC M1DNR1.1
#=GS M1CYU9_SOLTU/2-56         AC M1CYU9.1
#=GS W5B796_WHEAT/2-155        AC W5B796.1
#=GS K7MG18_SOYBN/1-83         AC K7MG18.1
#=GS A0A0D2TAM2_GOSRA/1-154    AC A0A0D2TAM2.1
#=GS V7CP13_PHAVU/1-154        AC V7CP13.1
#=GS R0HLV9_9BRAS/2-151        AC R0HLV9.1
#=GS V7B252_PHAVU/42-195       AC V7B252.1
#=GS A0A087FYV3_ARAAL/2-86     AC A0A087FYV3.1
#=GS A0A0D2UVW1_GOSRA/1-154    AC A0A0D2UVW1.1
#=GS M0X653_HORVD/7-98         AC M0X653.1
#=GS A0A059B5B5_EUCGR/1-152    AC A0A059B5B5.1
#=GS B9RTD1_RICCO/1-59         AC B9RTD1.1
#=GS M4CDM8_BRARP/71-135       AC M4CDM8.1
#=GS M1ACY1_SOLTU/148-296      AC M1ACY1.1
#=GS R0IKH1_9BRAS/1-146        AC R0IKH1.1
#=GS D7KYF1_ARALL/164-315      AC D7KYF1.1
#=GS A0A0B0MAJ7_GOSAR/1-154    AC A0A0B0MAJ7.1
#=GS A0A061F678_THECC/23-172   AC A0A061F678.1
#=GS A0A022QZ44_ERYGU/2-149    AC A0A022QZ44.1
#=GS A0A0A0KIU4_CUCSA/2-151    AC A0A0A0KIU4.1
#=GS A0A078JUA6_BRANA/1-111    AC A0A078JUA6.1
#=GS Q941R7_ARATH/7-158        AC Q941R7.1
#=GS O23267_ARATH/2-151        AC O23267.1
#=GS A0A0D3FHF5_9ORYZ/2-155    AC A0A0D3FHF5.1
#=GS A0A067JBV9_JATCU/2-152    AC A0A067JBV9.1
#=GS V4UGP0_9ROSI/2-152        AC V4UGP0.1
#=GS M5XM39_PRUPE/1-155        AC M5XM39.1
#=GS K4C0V0_SOLLC/2-57         AC K4C0V0.1
#=GS A0A078HVT1_BRANA/2-146    AC A0A078HVT1.1
#=GS K4CQ30_SOLLC/3-150        AC K4CQ30.1
#=GS A0A059B6E8_EUCGR/1-154    AC A0A059B6E8.1
#=GS G7IMZ0_MEDTR/1-154        AC G7IMZ0.1
#=GS B2WS86_9BRAS/2-151        AC B2WS86.1
#=GS E6YBW4_SOYBN/1-154        AC E6YBW4.1
#=GS V7AZF3_PHAVU/32-186       AC V7AZF3.1
#=GS A0A059ALU2_EUCGR/1-155    AC A0A059ALU2.1
#=GS A0A087FYV3_ARAAL/82-134   AC A0A087FYV3.1
#=GS M7Z7W7_TRIUA/2-89         AC M7Z7W7.1
#=GS A0A0D2RGF9_GOSRA/1-156    AC A0A0D2RGF9.1
#=GS Q2QNS7_ORYSJ/1-153        AC Q2QNS7.1
#=GS R0GNR6_9BRAS/2-148        AC R0GNR6.1
#=GS K4CRT1_SOLLC/9-101        AC K4CRT1.1
#=GS M1CYU9_SOLTU/46-135       AC M1CYU9.1
#=GS A0A0B0N2X4_GOSAR/1-158    AC A0A0B0N2X4.1
#=GS M0YJN2_HORVD/1-154        AC M0YJN2.1
#=GS A0A022QWT5_ERYGU/1-118    AC A0A022QWT5.1
#=GS A0A0E0KUK4_ORYPU/1-155    AC A0A0E0KUK4.1
#=GS I1R742_ORYGL/1-153        AC I1R742.1
#=GS B5B3P8_WHEAT/2-155        AC B5B3P8.1
#=GS A0A0D2VP97_GOSRA/1-130    AC A0A0D2VP97.1
#=GS V7CBQ7_PHAVU/1-66         AC V7CBQ7.1
#=GS M0UCN1_MUSAM/51-205       AC M0UCN1.1
#=GS U5D556_AMBTC/1-153        AC U5D556.1
#=GS K4AG22_SETIT/2-156        AC K4AG22.1
#=GS A0A0A0KJB3_CUCSA/2-153    AC A0A0A0KJB3.1
#=GS G7I986_MEDTR/2-147        AC G7I986.1
#=GS M5XNT6_PRUPE/1-155        AC M5XNT6.1
#=GS A0A078GA03_BRANA/22-118   AC A0A078GA03.1
#=GS A0A0B0NCH7_GOSAR/1-131    AC A0A0B0NCH7.1
#=GS G7L8G2_MEDTR/2-151        AC G7L8G2.1
#=GS D7KMP3_ARALL/9-150        AC D7KMP3.1
#=GS A0A058ZS21_EUCGR/3-151    AC A0A058ZS21.1
#=GS A0A061EWI6_THECC/1-155    AC A0A061EWI6.1
#=GS B9TBB9_RICCO/1-71         AC B9TBB9.1
#=GS A0A061EPN8_THECC/1-155    AC A0A061EPN8.1
#=GS A0A059DBZ7_EUCGR/1-148    AC A0A059DBZ7.1
#=GS I1PP99_ORYGL/1-160        AC I1PP99.1
#=GS A0A0D3A5P6_BRAOL/2-161    AC A0A0D3A5P6.1
#=GS W9RL38_9ROSA/1-155        AC W9RL38.1
#=GS U7E0A5_POPTR/1-67         AC U7E0A5.1
#=GS R0GK34_9BRAS/2-152        AC R0GK34.1
#=GS W5A8I9_WHEAT/2-155        AC W5A8I9.1
#=GS A0A059D656_EUCGR/2-69     AC A0A059D656.1
#=GS A0A0E0MNG2_ORYPU/169-321  AC A0A0E0MNG2.1
#=GS S8BW38_9LAMI/9-151        AC S8BW38.1
#=GS W5FN16_WHEAT/3-161        AC W5FN16.1
#=GS A0A0A0KIV5_CUCSA/2-152    AC A0A0A0KIV5.1
#=GS M1AUH2_SOLTU/2-77         AC M1AUH2.1
#=GS A0A067E917_CITSI/1-150    AC A0A067E917.1
#=GS F6H6U9_VITVI/37-191       AC F6H6U9.1
#=GS B9NCK0_POPTR/1-144        AC B9NCK0.1
#=GS M1AH20_SOLTU/2-138        AC M1AH20.1
#=GS R0ICE9_9BRAS/5-156        AC R0ICE9.1
#=GS I3T9Y8_MEDTR/2-153        AC I3T9Y8.1
#=GS A0A059B6G4_EUCGR/1-154    AC A0A059B6G4.1
#=GS R0FRR2_9BRAS/2-151        AC R0FRR2.1
#=GS A0A0D3FZL1_9ORYZ/1-155    AC A0A0D3FZL1.1
#=GS I1KVZ9_SOYBN/2-152        AC I1KVZ9.1
#=GS M4CUQ0_BRARP/66-228       AC M4CUQ0.1
#=GS V4K9Y9_EUTSA/2-147        AC V4K9Y9.1
#=GS F6H6U6_VITVI/1-138        AC F6H6U6.1
#=GS A0A059DBH9_EUCGR/1-124    AC A0A059DBH9.1
#=GS A0A0D3CZP7_BRAOL/66-217   AC A0A0D3CZP7.1
#=GS A0A072USL1_MEDTR/1-155    AC A0A072USL1.1
#=GS A0A067KVI0_JATCU/1-161    AC A0A067KVI0.1
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#=GS K4BNT2_SOLLC/2-147        AC K4BNT2.1
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#=GS M4CDM8_BRARP/1-75         AC M4CDM8.1
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#=GS Q941R8_ARATH/7-75         AC Q941R8.1
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A0A0B0NY72_GOSAR/5-156               ...............................................................................ALTGKIEADVEIK.S.S.P..G...Q.FHEM.FAH...K..P.H.H.V.H.H..TC.YD..K.IQGC.DL.L..EG.E..W...G...KV....GTII..S.......W...RY..........V.............H.....D.............G....K....A.K.VS..KQL..V.EAIDPSKN.LITFREI..E...G.D...Q..L..K...E.Y.KS...F.V.A.T...L..Q...AS....P...KN...K.............G...S...gS.IVHWTVE..YE...K...L...H..H...G...I......A..H.PE..T..LLQ.F......LV...DA....SKDIDAHLT--qp....................................................................
K4CRT2_SOLLC/3-151                   ..........................................................................lksvl------CAKIEMK.A.N.K..D...V.FHDV.FTN...K..P.H.H.V.S.T..MC.PL..H.IQGC.EL.L..EG.V..F...G...TV....GSKI..C.......W...TY..........I.............L.....E.............G....E....K.K.IS..KQV..V.ETVDHETK.VLTFKEF..E...G.D...L..V..N...K.Y.DN...F.K.A.T...L..R...IE....T...KD...E.............-...I....D.LVSWTME..YE...R...P...N..E...N...V......P..E.LV..N..LLD.F......VV...GM....TKGIDDHH---vkm...................................................................
A3CIC2_ORYSJ/1-125                   ...................................................................mpkvcagfvddi-------------.-.-.-..-...-.----.---...-..-.-.-.-.-.-..--.--..-.----.-V.V..EG.N..G...G...PG....-TIY..T.......M...KL..........N.............P.....D............aG....V....G.N.TY..KTR..V.AVCDNAAR.VLKSEVL..E...A.E...S..K..V...G.K.LK...S.H.S.T...E..T...KL...eG...TG...D.............G...S....C.VAKLKVE..YE...L...A...D..G...S...S......L..S.PE..Q..EKT.M......VDgyfGM....LKMMEAYLAA-h.....................................................................
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