GenomeNet

Database: Pfam
Entry: CP_ATPgrasp_1
LinkDB: CP_ATPgrasp_1
Original site: CP_ATPgrasp_1 
#=GF ID   CP_ATPgrasp_1
#=GF AC   PF04174.12
#=GF DE   A circularly permuted ATPgrasp 
#=GF PI   DUF407;
#=GF AU   Kerrison ND, Finn RD,Iyer LM, Abhiman S, Burroughs AM, Aravind L
#=GF SE   COG2308
#=GF GA   21.80 21.80;
#=GF TC   21.80 21.80;
#=GF NC   21.50 21.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   20023723
#=GF RT   Amidoligases with ATP-grasp, glutamine synthetase-like and
#=GF RT   acetyltransferase-like domains: synthesis of novel metabolites
#=GF RT   and peptide modifications of proteins.
#=GF RA   Iyer LM, Abhiman S, Maxwell Burroughs A, Aravind L;
#=GF RL   Mol Biosyst. 2009;5:1636-1660.
#=GF DR   INTERPRO; IPR007302;
#=GF CC   An ATP-grasp family that is present both as catalytically active
#=GF CC    and inactive versions. Contextual analysis suggests that  it
#=GF CC   functions in a distinct peptide synthesis/modification system 
#=GF CC   that additionally contains a transglutaminase, an NTN-hydrolase,
#=GF CC    the Alpha-E domain, and a transglutaminase fused N-terminal to
#=GF CC   a  circularly permuted COOH-NH2 ligase. The inactive forms are
#=GF CC   often  fused N-terminal to the Alpha-E domain [1].
#=GF SQ   73
#=GS A1A098_BIFAA/50-378       AC A1A098.1
#=GS D2Q8J9_BIFDB/56-384       AC D2Q8J9.1
#=GS X8F438_MYCUL/1-106        AC X8F438.1
#=GS A0A0A7I5B7_9BIFI/50-378   AC A0A0A7I5B7.1
#=GS A0A0M2JYY3_9MYCO/77-408   AC A0A0M2JYY3.1
#=GS V4J6W5_9GAMM/1-39         AC V4J6W5.1
#=GS A0A0K2RT91_9MICC/1-37     AC A0A0K2RT91.1
#=GS A0A0C1V3A0_9CYAN/75-278   AC A0A0C1V3A0.1
#=GS A0A087DR55_9BIFI/50-378   AC A0A087DR55.1
#=GS A0A132T4J2_9MYCO/98-429   AC A0A132T4J2.1
#=GS A0A132PPK2_9MYCO/109-440  AC A0A132PPK2.1
#=GS X8FE62_MYCUL/119-447      AC X8FE62.1
#=GS A0A087BWU9_9BIFI/1-303    AC A0A087BWU9.1
#=GS Q73XT6_MYCPA/99-430       AC Q73XT6.1
#=GS A0A045JNU1_MYCTX/100-431  AC A0A045JNU1.1
#=GS G4MEB0_9BURK/18-200       AC G4MEB0.1
#=GS D5PI09_9MYCO/130-458      AC D5PI09.1
#=GS A0A0G3IV56_9MYCO/98-429   AC A0A0G3IV56.1
#=GS A0A087E3Z1_9BIFI/50-378   AC A0A087E3Z1.1
#=GS A0A086ZMQ6_9BIFI/49-377   AC A0A086ZMQ6.1
#=GS A0A098U1C7_9BURK/25-169   AC A0A098U1C7.1
#=GS K5B859_MYCHD/77-408       AC K5B859.1
#=GS A0A087CZ17_9BIFI/50-378   AC A0A087CZ17.1
#=GS X1XRH5_ACYPI/1-43         AC X1XRH5.1
#=GS K0V1V1_MYCVA/98-429       AC K0V1V1.1
#=GS D4BQU0_BIFBR/63-391       AC D4BQU0.1
#=GS B6IMV0_RHOCS/77-408       AC B6IMV0.1
#=GS A0A0B2AQH2_9ACTN/95-426   AC A0A0B2AQH2.1
#=GS A0A0P9FD09_9CHLR/80-296   AC A0A0P9FD09.1
#=GS X8AUG3_MYCXE/124-252      AC X8AUG3.1
#=GS D0L0C4_HALNC/81-412       AC D0L0C4.1
#=GS A1UIW7_MYCSK/120-451      AC A1UIW7.1
#=GS A0A139V694_MYCPH/103-434  AC A0A139V694.1
#=GS Q8Y0C3_RALSO/108-439      AC Q8Y0C3.1
#=GS I3WJN8_BIFBI/50-378       AC I3WJN8.1
#=GS B2HMC8_MYCMM/100-431      AC B2HMC8.1
#=GS W9BGV0_9MYCO/93-424       AC W9BGV0.1
#=GS A0A024JX73_9MYCO/109-437  AC A0A024JX73.1
#=GS X8F632_MYCUL/27-125       AC X8F632.1
#=GS X7ZI94_MYCXE/103-258      AC X7ZI94.1
#=GS L1L8W1_9ACTN/76-144       AC L1L8W1.1
#=GS X5LRK9_9MYCO/100-431      AC X5LRK9.1
#=GS A0A024K1K1_9MYCO/103-434  AC A0A024K1K1.1
#=GS A0A087BQM3_9BIFI/50-378   AC A0A087BQM3.1
#=GS A0A087DK23_9BIFI/49-377   AC A0A087DK23.1
#=GS A0A0K2RT89_9MICC/1-58     AC A0A0K2RT89.1
#=GS Y2411_MYCTU/100-431       AC P9WLA9.1
#=GS D1NVA8_9BIFI/49-377       AC D1NVA8.1
#=GS A0A158M0I2_9BORD/75-146   AC A0A158M0I2.1
#=GS I0RR25_MYCXE/103-434      AC I0RR25.1
#=GS D5PHB4_9MYCO/99-430       AC D5PHB4.1
#=GS A0A0M1J1I9_9GAMM/18-83    AC A0A0M1J1I9.1
#=GS A0A172ULR0_9MYCO/106-437  AC A0A172ULR0.1
#=GS U5WKQ2_MYCKA/100-431      AC U5WKQ2.1
#=GS A0A087CG00_9BIFI/78-406   AC A0A087CG00.1
#=GS N0E4J3_9MICO/82-185       AC N0E4J3.1
#=GS A0A0C1TBZ4_9ACTN/95-332   AC A0A0C1TBZ4.1
#=GS Q0RH44_FRAAA/80-411       AC Q0RH44.1
#=GS V4JCW5_9GAMM/1-45         AC V4JCW5.1
#=GS L0J2B9_9MYCO/103-434      AC L0J2B9.1
#=GS A0A0Q2QXT1_MYCGO/100-431  AC A0A0Q2QXT1.1
#=GS A0A087A967_9BIFI/50-378   AC A0A087A967.1
#=GS B4EHB6_BURCJ/116-451      AC B4EHB6.1
#=GS A1TBY8_MYCVP/77-408       AC A1TBY8.1
#=GS Q6N7S9_RHOPA/71-403       AC Q6N7S9.1
#=GS X7Y2I1_MYCKA/100-431      AC X7Y2I1.1
#=GS Y605_MYCLE/106-437        AC Q49755.2
#=GS B2HNB5_MYCMM/115-443      AC B2HNB5.1
#=GS E2CP30_9RHOB/74-239       AC E2CP30.1
#=GS A0A0I9U5Q1_9MYCO/106-437  AC A0A0I9U5Q1.1
#=GS B8DV18_BIFA0/14-89        AC B8DV18.1
#=GS A0A0A1FRN5_9MYCO/113-444  AC A0A0A1FRN5.2
#=GS A0A100VU47_9MYCO/103-434  AC A0A100VU47.1
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D2Q8J9_BIFDB/56-384                  ...........................................................................................................PRIIESDEFDEMEAGLKQRVNALNAYLRDIY.S.....D...........K...........HAIKDGVVPEEYVYTSAG.Y.F.P...............Q.....V.N...G.V.....T.....P.......P......G..........G........V...............F.....AHIAGEDLVQG....Q.....D....G....K....WWVLEDNLRIPSGAS..YP..LFARDI.ERR..I...T.PRLFRDV..H.....VRD...N...R..D...YPRLLRKS........MD...............F................V.............S..........T...E............G.-........-.....-............-......IAV.VL..T....PGRYN.S....AF..FEHAYLAEKT...GAALAFPEDLE.V.V.D.N.....K.L.F.FL.....D.Y.....SG.K.R...hRVGVVYRR.L.SD.EYLDPFA..FN.P.D...S.V.I..GV.PGILSAYRAGNVAIVNAPGNGAADDKAIYY..........FV.PA...MI...R.Y...Y......L..GE..E.P.IL..QN...A.P....T.Y.MP..MFE..QD....RKE..........VLDRLG....E....LVI.....KD.....V....AE..A....G.............G....Y....G.....V.I.FG.S.S......L....DKAQREEMAD.RIK.AEPR.RFIAQ......................................................
X8F438_MYCUL/1-106                   ...........................................................................................................-------------------------------.-.....-...........-...........------------------.-.-.-...............-.....-.-...-.-.....-.....-.......-......-..........-........-...............-.....-----------....-.....-....-....-....---------------..--..------.---..-...-.-------..-.....---...-...-..-...--------........--...............-................-.............-..........-...-............-.-........-.....-............-......---.--..-....-----.-....--..----------...-----------.-.-.-.-.....-.-.-.--.....-.-.....--.-.-....--------.-.--.-------..--.-.-...-.M.L..GV.AGLVNAARAGNVVISSSIGNGVGDDKLVYT..........YV.PT...MI...E.Y...Y......L..RE..K.P.LL..AN...V.D....T.Y.RC..WLD..EE....REE..........VLDRLK....E....LVL.....KP.....V....EG..S....G.............A....T....A.....-.-.--.-.-......-....----------.---.----.-----scsartrrtrswprsarrfv..................................
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V4J6W5_9GAMM/1-39                    ...........................................................................................................-------------------------------.-.....-...........-...........------------------.-.-.-...............-.....-.-...-.-.....-.....-.......-......-..........-........-...............-.....-----------....-.....-....-....-....---------------..--..------.---..-...-.-------..-.....---...-...-..-...--------........--...............-................-.............-..........-...-............-.-........-.....-............-......---.ML..T....PGIYN.S....AY..FEHSYLAQQM...RAELVEGRDLF.V.D.D.D.....D.-.-.--.....-.-.....--.-.-....--------.-.--.-------..--.-.-...-.-.-..--.------------------------------..........--.--...--...-.-...-......-..--..-.-.--..--...-.-....-.-.--..---..--....---..........------....-....---.....--.....-....--..-....-.............-....-....-.....-.-.--.-.-......-....----------.---.----.-----cc....................................................
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A0A132PPK2_9MYCO/109-440             ...........................................................................................................PRVISAAEWSRLERGITQRVKALEMYLDDIY.G.....E...........Q...........EILRDGVIPRRLVTSCEH.F.H.R...............E.....A.A...G.I.....V.....P.......P......N..........G........V...............R.....IHVAGIDLIRD....A.....K....G....D....FRVLEDNLRSPSGVS..YV..MENRRT.MAR..V...F.PNLFATH..R.....VRA...V...G..D...YSSHLLRA........LR...............N................A.............A..........P...T............N.V........A.....D............P......TVV.VL..T....PGVYN.S....AY..FEHSLLARQM...GVELVEGRDLF.C.R.D.N.....A.V.Y.MR.....T.T.....EG.E.R....QVDVIYRR.I.DD.AFLDPMQ..FR.P.D...S.V.L..GV.AGLLNAARAGNVVISSAVGNGVGDDKLVYT..........YV.PT...II...E.Y...Y......L..GE..K.P.VL..AN...V.D....T.Y.RC..WLD..DE....REE..........VLDRID....E....LVI.....KP.....V....EG..S....G.............G....Y....G.....I.V.FG.P.D......A....SAKELTAIAK.KIR.SDPR.GWIAQ......................................................
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X7ZI94_MYCXE/103-258                 ...........................................................................................................PRVISAAEWARLERGITQRVTALEMYLDDIY.G.....D...........Q...........EILRDGVIPRRLVTSCEH.F.H.R...............Q.....A.A...G.I.....V.....P.......P......N..........G........V...............R.....IHVAGIDLIRD....Q.....R....G....N....FRVLEDNLRSPSGVS..YV..MENRRT.MAR..V...F.PNLFATH..R.....VRA...V...D..D...YAAHLLRA........LR...............N................S.............A..........A...T............N.E........A.....D............P......TVV.VL..T....PGS--.-....--..----------...-----------.-.-.-.-.....-.-.-.--.....-.-.....--.-.-....--------.-.--.-------..--.-.-...-.-.-..--.------------------------------..........--.--...--...-.-...-......-..--..-.-.--..--...-.-....-.-.--..---..--....---..........------....-....---.....--.....-....--..-....-.............-....-....-.....-.-.--.-.-......-....----------.---.----.-----ptp...................................................
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