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Database: Pfam
Entry: Cas_Csm6
LinkDB: Cas_Csm6
Original site: Cas_Csm6 
#=GF ID   Cas_Csm6
#=GF AC   PF09659.5
#=GF DE   CRISPR-associated protein (Cas_Csm6)
#=GF AU   TIGRFAMs, Coggill P
#=GF SE   TIGRFAMs
#=GF GA   21.40 21.40;
#=GF TC   23.90 23.10;
#=GF NC   19.80 18.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CC   Clusters of short DNA repeats with nonhomologous spacers, which
#=GF CC   are found at regular intervals in the genomes of
#=GF CC   phylogenetically distinct prokaryotic species, comprise a family
#=GF CC   with recognisable features. This family is known as CRISPR
#=GF CC   (short for Clustered, Regularly Interspaced Short Palindromic
#=GF CC   Repeats). A number of protein families appear only in
#=GF CC   association with these repeats and are designated Cas
#=GF CC   (CRISPR-Associated) proteins.
#=GF SQ   211
#=GS E2TCW8_MYCTU/61-181   AC E2TCW8.1
#=GS G4D1Y7_9FIRM/67-441   AC G4D1Y7.1
#=GS E1L892_9FIRM/61-437   AC E1L892.1
#=GS F9E057_STRSA/2-252    AC F9E057.1
#=GS G6A2V9_STRIT/1-249    AC G6A2V9.1
#=GS E2ZE75_9FIRM/62-440   AC E2ZE75.1
#=GS C9LM10_9FIRM/64-406   AC C9LM10.1
#=GS Q9A080_STRP1/2-253    AC Q9A080.1
#=GS F0I287_STRSA/343-436  AC F0I287.1
#=GS H8HAD9_STRPY/2-253    AC H8HAD9.1
#=GS F9P8E1_STRCV/1-249    AC F9P8E1.1
#=GS E2VXL2_MYCTU/61-408   AC E2VXL2.1
#=GS E2UPJ4_MYCTU/61-181   AC E2UPJ4.1
#=GS H8EVG9_MYCTE/61-110   AC H8EVG9.1
#=GS F3USI0_STRSA/2-252    AC F3USI0.1
#=GS Q2KM79_STRIN/4-252    AC Q2KM79.1
#=GS F2CL58_STRSA/2-252    AC F2CL58.1
#=GS Q8P1C1_STRP8/3-255    AC Q8P1C1.1
#=GS C5WH19_STRDG/2-255    AC C5WH19.1
#=GS E7GVE7_STRAP/2-249    AC E7GVE7.1
#=GS G7ZLS7_STAAU/68-421   AC G7ZLS7.1
#=GS D0RV92_9STRE/3-251    AC D0RV92.1
#=GS D5Z700_MYCTU/28-375   AC D5Z700.1
#=GS Q48U13_STRPM/3-255    AC Q48U13.1
#=GS F5RJ25_9FIRM/71-443   AC F5RJ25.1
#=GS G0VQ63_MEGEL/64-325   AC G0VQ63.1
#=GS F9EMW0_FUSNU/65-317   AC F9EMW0.1
#=GS H3W9B5_STAEP/67-421   AC H3W9B5.1
#=GS E4L3M5_9STRE/2-253    AC E4L3M5.1
#=GS G5KAJ7_9STRE/2-253    AC G5KAJ7.1
#=GS E2UPJ1_MYCTU/3-235    AC E2UPJ1.1
#=GS F8LX79_STRTR/59-298   AC F8LX79.1
#=GS E9FHM2_9STRE/36-404   AC E9FHM2.1
#=GS Q8K7V5_STRP3/9-208    AC Q8K7V5.1
#=GS A5U6H1_MYCTA/28-375   AC A5U6H1.1
#=GS F8Y135_STRAG/4-253    AC F8Y135.1
#=GS E7SBI8_9STRE/4-250    AC E7SBI8.1
#=GS E2TCW5_MYCTU/3-235    AC E2TCW5.1
#=GS Q0AW60_SYNWW/27-410   AC Q0AW60.1
#=GS D2EQD1_9STRE/1-346    AC D2EQD1.1
#=GS H8HTI9_MYCTU/61-408   AC H8HTI9.1
#=GS H8HVQ3_MYCTU/61-408   AC H8HVQ3.1
#=GS F2GLB6_MYCTU/61-408   AC F2GLB6.1
#=GS D7ETM7_MYCTU/1-91     AC D7ETM7.1
#=GS B4U3E4_STREM/12-265   AC B4U3E4.1
#=GS G5K2N3_9STRE/1-243    AC G5K2N3.1
#=GS E4SNY6_STRTN/7-389    AC E4SNY6.1
#=GS F9E8M1_STRSA/2-252    AC F9E8M1.1
#=GS I0R6A3_9FIRM/67-451   AC I0R6A3.1
#=GS C3WIC4_9FUSO/65-461   AC C3WIC4.1
#=GS E2NVP8_9FIRM/70-443   AC E2NVP8.1
#=GS D5X8I5_THEPJ/69-455   AC D5X8I5.1
#=GS E2U0P5_MYCTU/3-235    AC E2U0P5.1
#=GS F2C5X6_STRSA/100-352  AC F2C5X6.1
#=GS I0SF71_STRCV/1-249    AC I0SF71.1
#=GS F0FD49_STRSA/2-252    AC F0FD49.1
#=GS A4KK90_MYCTU/61-408   AC A4KK90.1
#=GS E1HCQ7_MYCTU/61-408   AC E1HCQ7.1
#=GS E3CDZ8_STRPA/2-251    AC E3CDZ8.1
#=GS F9EMV9_FUSNU/4-117    AC F9EMV9.1
#=GS F0IV59_STRSA/98-348   AC F0IV59.1
#=GS I0X164_STRIT/2-249    AC I0X164.1
#=GS F0I287_STRSA/98-351   AC F0I287.1
#=GS Q1JM68_STRPC/3-255    AC Q1JM68.1
#=GS C4G3M8_ABIDE/66-446   AC C4G3M8.1
#=GS F5L0N6_9FIRM/62-437   AC F5L0N6.1
#=GS D3HD24_STRG3/4-253    AC D3HD24.1
#=GS E2UWZ1_MYCTU/61-181   AC E2UWZ1.1
#=GS E0PWG7_STRPY/2-253    AC E0PWG7.1
#=GS F0IV67_STRSA/2-252    AC F0IV67.1
#=GS E8JMT2_STREI/4-253    AC E8JMT2.1
#=GS E2UCW2_MYCTU/61-181   AC E2UCW2.1
#=GS F2CCS7_STRSA/2-252    AC F2CCS7.1
#=GS E8KPB4_STRSA/2-252    AC E8KPB4.1
#=GS E2U0Q0_MYCTU/61-181   AC E2U0Q0.1
#=GS F2BIF1_STRSA/2-252    AC F2BIF1.1
#=GS H2A5Z6_STRMD/4-253    AC H2A5Z6.1
#=GS D5YIB9_MYCTU/28-375   AC D5YIB9.1
#=GS C3WS01_9FUSO/65-458   AC C3WS01.1
#=GS Q1J732_STRPF/3-255    AC Q1J732.1
#=GS Q878J6_STRPQ/2-253    AC Q878J6.1
#=GS F5X647_STRPX/4-253    AC F5X647.1
#=GS F3LB74_STRPO/2-252    AC F3LB74.1
#=GS Q7TXS9_MYCBO/28-303   AC Q7TXS9.1
#=GS Q3DCQ7_STRAG/4-253    AC Q3DCQ7.1
#=GS D6FNM7_MYCTU/28-303   AC D6FNM7.1
#=GS G6EPC8_STRTR/1-261    AC G6EPC8.1
#=GS E2VBY2_MYCTU/61-181   AC E2VBY2.1
#=GS F8LX80_STRTR/59-426   AC F8LX80.1
#=GS G9XD61_9FIRM/77-521   AC G9XD61.1
#=GS G5GF87_9FIRM/66-444   AC G5GF87.1
#=GS D5ZK07_MYCTU/28-375   AC D5ZK07.1
#=GS G0TFB9_MYCCP/28-375   AC G0TFB9.1
#=GS E2VBY0_MYCTU/3-235    AC E2VBY0.1
#=GS D4CPB9_9FIRM/50-431   AC D4CPB9.1
#=GS E2VKZ8_MYCTU/61-181   AC E2VKZ8.1
#=GS G5KGL3_9STRE/1-256    AC G5KGL3.1
#=GS G5H361_9FIRM/63-445   AC G5H361.1
#=GS D5XXF3_MYCTU/28-375   AC D5XXF3.1
#=GS C4FMU1_9FIRM/62-437   AC C4FMU1.1
#=GS C0ME47_STRS7/4-253    AC C0ME47.1
#=GS Q7D6I6_MYCTU/76-423   AC Q7D6I6.1
#=GS E6LHV2_9ENTE/65-429   AC E6LHV2.1
#=GS F3UH94_STRSA/2-252    AC F3UH94.1
#=GS E7S3X8_STRAG/3-257    AC E7S3X8.1
#=GS F0IM73_STRSA/2-252    AC F0IM73.1
#=GS Q1JHB3_STRPD/3-255    AC Q1JHB3.1
#=GS F2CCT9_STRSA/100-473  AC F2CCT9.1
#=GS F3UAR6_STRSA/2-252    AC F3UAR6.1
#=GS F5VF44_9LACO/1-347    AC F5VF44.1
#=GS C6DX24_MYCTK/61-408   AC C6DX24.1
#=GS F9M1P7_STRPA/2-251    AC F9M1P7.1
#=GS G9PWQ3_9BACT/93-469   AC G9PWQ3.1
#=GS Q03KS7_STRTD/142-196  AC Q03KS7.1
#=GS E8JZ92_9STRE/288-384  AC E8JZ92.1
#=GS F0FTR8_STRSA/2-252    AC F0FTR8.1
#=GS E8K4H5_STRPA/3-251    AC E8K4H5.1
#=GS Q5XCL1_STRP6/3-255    AC Q5XCL1.1
#=GS E7PZ07_STRDY/1-253    AC E7PZ07.1
#=GS C6SQ61_STRMN/1-252    AC C6SQ61.1
#=GS G9YKC4_9FIRM/62-440   AC G9YKC4.1
#=GS F0FJB1_STRSA/2-252    AC F0FJB1.1
#=GS B1SG09_9STRE/4-253    AC B1SG09.1
#=GS D3QEX8_STALH/67-223   AC D3QEX8.1
#=GS G7QU52_MYCBO/61-336   AC G7QU52.1
#=GS F9N3W8_9FIRM/62-444   AC F9N3W8.1
#=GS F2BRU3_STRSA/2-252    AC F2BRU3.1
#=GS E2TQ14_MYCTU/3-235    AC E2TQ14.1
#=GS E8JSH9_STRCR/2-250    AC E8JSH9.1
#=GS D3QEX9_STALH/1-111    AC D3QEX9.1
#=GS Q5LZX0_STRT1/7-389    AC Q5LZX0.1
#=GS F2C4P2_STRSA/2-252    AC F2C4P2.1
#=GS I0SDY6_STRAP/2-206    AC I0SDY6.1
#=GS E2WKV8_MYCTU/61-408   AC E2WKV8.1
#=GS F8DGJ3_STREP/3-251    AC F8DGJ3.1
#=GS E1JL64_9LACO/1-308    AC E1JL64.1
#=GS E6MH22_9FIRM/72-464   AC E6MH22.1
#=GS Q5HK94_STAEQ/67-421   AC Q5HK94.1
#=GS H8F7P2_STRPY/2-253    AC H8F7P2.1
#=GS E6J209_STRAP/1-249    AC E6J209.1
#=GS E2TQ19_MYCTU/76-196   AC E2TQ19.1
#=GS Q8E4Z1_STRA3/4-253    AC Q8E4Z1.1
#=GS F5U4E9_STREQ/1-253    AC F5U4E9.1
#=GS E8QAR9_STRED/1-163    AC E8QAR9.1
#=GS E3CH38_STRDO/1-253    AC E3CH38.1
#=GS C6JA15_9FIRM/68-434   AC C6JA15.1
#=GS F0VX92_STRG2/4-253    AC F0VX92.1
#=GS Q8DTU7_STRMU/1-252    AC Q8DTU7.1
#=GS A1KMG0_MYCBP/61-336   AC A1KMG0.1
#=GS H1SN09_STAAU/1-305    AC H1SN09.1
#=GS Q3DP73_STRAG/4-253    AC Q3DP73.1
#=GS D4S3I5_9FIRM/68-454   AC D4S3I5.1
#=GS F3B5S5_9FIRM/42-451   AC F3B5S5.1
#=GS H8HDU1_STRPY/2-253    AC H8HDU1.1
#=GS A8AXN3_STRGC/3-251    AC A8AXN3.1
#=GS C0M7X3_STRE4/4-254    AC C0M7X3.1
#=GS F5U0L9_STRAP/2-249    AC F5U0L9.1
#=GS E9ZMP8_MYCTU/70-417   AC E9ZMP8.1
#=GS F8IS23_STREC/12-264   AC F8IS23.1
#=GS A3CNA5_STRSV/2-252    AC A3CNA5.1
#=GS E2UCW1_MYCTU/3-235    AC E2UCW1.1
#=GS F9UWN6_MYCBO/61-336   AC F9UWN6.1
#=GS Q3D1Z6_STRAG/4-253    AC Q3D1Z6.1
#=GS Q1JC84_STRPB/3-255    AC Q1JC84.1
#=GS F0I708_STRSA/1-252    AC F0I708.1
#=GS F9NIG5_STREQ/1-253    AC F9NIG5.1
#=GS Q93RL2_STRAG/13-122   AC Q93RL2.1
#=GS B9DUJ9_STRU0/4-254    AC B9DUJ9.1
#=GS F1Z129_9STRE/4-254    AC F1Z129.1
#=GS E8JZ92_9STRE/59-315   AC E8JZ92.1
#=GS E0PJ58_STRGY/4-253    AC E0PJ58.1
#=GS Q03KS7_STRTD/1-144    AC Q03KS7.1
#=GS G5GX12_FUSNP/65-458   AC G5GX12.1
#=GS F0IV59_STRSA/344-436  AC F0IV59.1
#=GS G4R466_STRPY/2-253    AC G4R466.1
#=GS B5XL12_STRPZ/2-253    AC B5XL12.1
#=GS G6A9I9_STRIT/2-249    AC G6A9I9.1
#=GS C2EF77_9LACO/59-408   AC C2EF77.1
#=GS F0I2A0_STRSA/2-252    AC F0I2A0.1
#=GS Q5M4I1_STRT2/1-340    AC Q5M4I1.1
#=GS P71635_MYCTU/28-375   AC P71635.4
#=GS G5JR29_STRCG/1-253    AC G5JR29.1
#=GS C7G6B8_9FIRM/76-447   AC C7G6B8.1
#=GS H6P8L5_STRIC/4-253    AC H6P8L5.1
#=GS H6S5J1_MYCTU/28-375   AC H6S5J1.1
#=GS C1AFT1_MYCBT/61-336   AC C1AFT1.1
#=GS E4KQY9_9LACT/57-264   AC E4KQY9.1
#=GS H3UYT8_STAEP/67-421   AC H3UYT8.1
#=GS F5ZIN2_STRPW/4-254    AC F5ZIN2.1
#=GS F9LA52_STAEP/67-421   AC F9LA52.1
#=GS F3TXR6_STAEP/67-421   AC F3TXR6.1
#=GS E8LEC4_9FIRM/62-431   AC E8LEC4.1
#=GS F3SHG9_STRSA/2-252    AC F3SHG9.1
#=GS H4HKD3_STAAU/68-421   AC H4HKD3.1
#=GS D6FK47_MYCTU/28-375   AC D6FK47.1
#=GS Q3DSZ5_STRAG/4-253    AC Q3DSZ5.1
#=GS A2VLF1_MYCTU/61-408   AC A2VLF1.1
#=GS F5X0J4_STRG1/4-253    AC F5X0J4.1
#=GS A3CN94_STRSV/100-473  AC A3CN94.1
#=GS Q5M4I2_STRT2/7-38     AC Q5M4I2.1
#=GS Q3DB45_STRAG/4-253    AC Q3DB45.1
#=GS F3UXH6_STRSA/2-252    AC F3UXH6.1
#=GS G2N298_MYCTU/28-375   AC G2N298.1
#=GS Q8DZD1_STRA5/4-253    AC Q8DZD1.1
#=GS A5WR70_MYCTF/61-408   AC A5WR70.1
#=GS E2W8R8_MYCTU/61-408   AC E2W8R8.1
#=GS F8LX79_STRTR/292-384  AC F8LX79.1
#=GS D7EVG0_MYCTU/41-365   AC D7EVG0.1
#=GS E0PD78_STREI/4-253    AC E0PD78.1
#=GS E8JZ93_9STRE/58-426   AC E8JZ93.1
#=GS F2C5X6_STRSA/344-436  AC F2C5X6.1
E2TCW8_MYCTU/61-181              ............................................ETDVRIVTYTNPSV-.--HRFDLFVPVFRNHLVE.L...........SAEF..PDRTILLNTSSGTPAMQAALVAIN.V.FG.I.PR..TTAVQVSTPARA...lSKPGD..RE........SP...DA.YDLELM..WDAN.DDNQP.................GA.P.NRCFEA.T.SAALG--------------------------.-.-.--.......---------......-------....--...-.......-...-....-....-.-.--...--.--....-....-.-...--......--.-.---.-..-......-......-..-.-.-------......-------------------....-------.--..-....---....--..-.----......----.---...-.-...-.-...-...-.---...-..-.----....----.--..--.--.......-------..........-.-..------.--.....-....-..--..-..-.-.----....-....----.--------------------.----....--...---.--..-.-.--.-.-..........-------.....--.-----.-.--.-.-..-.---.-....-.-----------vn...............................
G4D1Y7_9FIRM/67-441              ............................................NVEIEII--KDESLE.EVQIFDNFYEIFRETLND.I...........HYKN..PNDEILLNISSGTPAMKNALFVLS.K.LG.N.YK..MKAIQVDTPTKA....ANRKF..E-........DN...DF.-DLDAVleIIAE.KSNE-.................NI.V.NRSREA.A.SNNFNYEIKRELIFSQLDSYNYSSALQIART.I.E.EM.......LSEKTMNLL......NAAYYRS....IL...N.......I...K....S....M.V.SF...LR.KA....D....E.D...FF......RI.K.G-D.G..-......E......D..I.L.EYFLYLK......TLKNKEMFLDLIRGITPLV....TELFILI.ID..K....NAD....--..I.KLKNy....wKYNY.GKK...H.Y...V.W...D...E.DKL...N..R.DEKG....REIV.NA..IK.SK.......-FPYFTY..........N.S..FIQNVH.LI.....E....I..IK..NerI.I.DNQK....I....LDLS.LEIRDVEGKLRNRAAHEIIR.IDDS....LI...KRE.SK..F.G.SD.E.I..........LDKI---.....FE.LMKLS.G.LE.I.G..N.NHY.D....S.YDLMNKKIKK-s................................
E1L892_9FIRM/61-437              ........................................adld------ITLIHTGLE.DVHRIDTLQPFVDHFYEM.L...........-SNY..PDAEILINLSSGTPQMKLIMSYLS.-.VE.H.DA..VRGIQVDSPQRG....SNRSE..AA........VH...DD.EDIDIV..IENN.FDDQE.................DS.E.NRCHEP.Q.MGYIKRNNIKQSLHTLITSYKYKEAISAYHSyK.R.SFe....dgVANDVLPLL......EHAQLRL....GL...D.......Y...D....G....A.L.QK...SR.KV....G....SiS...LS......SL.F.ANK.E..V......R......K..L.H.EFLMLME......VRLKQGQIEDFILKTTPFM....YELIRYY.FT..K....ELH....--..V.NWRQ......IEKK.TSK...G.I...R.L...D...M.VAF...E..K.QYPK....LYKS.--..WK.AN.......THTPFLQ..........E.L..QLSFYH.ML.....H....M..LE.eQ..D.I.VDSL....L....LKQL.KEIRRIEQKIRNKMAHEVVV.FTEQ....DI...CKA.AE..I.Q.SL.QsF..........LHQIKDV.....FF.II---.-.--.-.-..-.---.-....-.-----------tgqakqnkliydvinqyvleq............
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