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Database: Pfam
Entry: Cytochrom_D1
LinkDB: Cytochrom_D1
Original site: Cytochrom_D1 
#=GF ID   Cytochrom_D1
#=GF AC   PF02239.14
#=GF DE   Cytochrome D1 heme domain
#=GF PI   D1_heme; 
#=GF AU   Bateman A, Mian N
#=GF SE   Pfam-B_3322 (release 5.2)
#=GF GA   25.50 25.50;
#=GF TC   25.50 25.50;
#=GF NC   25.40 25.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9311786
#=GF RT   Haem-ligand switching during catalysis in crystals of a
#=GF RT   nitrogen-cycle enzyme. 
#=GF RA   Williams PA, Fulop V, Garman EF, Saunders NF, Ferguson SJ, Hajdu
#=GF RA   J; 
#=GF RL   Nature 1997;389:406-412.
#=GF DR   SCOP; 1aof; fa;
#=GF DR   SCOP; 1nir; fa;
#=GF DR   PROSITE; PDOC00169;
#=GF CC   Cytochrome cd1 (nitrite reductase) catalyses the conversion of 
#=GF CC   nitrite to nitric oxide in the nitrogen cycle. This family
#=GF CC   represents the d1 heme binding domain of cytochrome cd1, in
#=GF CC   which His/Tyr side  chains ligate the d1 heme iron of the active
#=GF CC   site in the oxidised  state [1].
#=GF SQ   478
#=GS U1ZSK0_9BURK/148-502      AC U1ZSK0.1
#=GS I3Z5Y2_BELBD/82-282       AC I3Z5Y2.1
#=GS V5SGG5_9RHIZ/64-184       AC V5SGG5.1
#=GS A7IB97_XANP2/154-274      AC A7IB97.1
#=GS G8QI56_DECSP/147-523      AC G8QI56.1
#=GS A0A090AIJ3_9GAMM/230-364  AC A0A090AIJ3.1
#=GS H1XRF2_9BACT/184-366      AC H1XRF2.1
#=GS C5GKH5_AJEDR/183-331      AC C5GKH5.1
#=GS A0A0K1QR27_PSEFL/256-346  AC A0A0K1QR27.1
#=GS Q8TPR8_METAC/603-734      AC Q8TPR8.1
#=GS S6BI92_PSERE/60-179       AC S6BI92.1
#=GS A1WMN3_VEREI/213-336      AC A1WMN3.1
#=GS B6BHD9_SULGG/32-377       AC B6BHD9.1
#=GS Q5P7W7_AROAE/31-392       AC Q5P7W7.1
#=GS G2J1R6_PSEUL/162-554      AC G2J1R6.1
#=GS K0C306_CYCSP/58-164       AC K0C306.1
#=GS A0A0A8JZD1_9RHIZ/154-274  AC A0A0A8JZD1.1
#=GS I3IQ20_9BACT/218-365      AC I3IQ20.1
#=GS C5AQ98_METEA/141-262      AC C5AQ98.1
#=GS H0Q2D1_9RHOO/37-398       AC H0Q2D1.1
#=GS A1U5D0_MARHV/176-569      AC A1U5D0.1
#=GS W0SKK2_9RHOO/155-553      AC W0SKK2.1
#=GS E8UZZ8_TERSS/113-241      AC E8UZZ8.1
#=GS A0A0M8SFM6_9ACTN/137-301  AC A0A0M8SFM6.1
#=GS Q0JYW5_CUPNH/156-549      AC Q0JYW5.1
#=GS J2CRD1_9SPHN/67-178       AC J2CRD1.1
#=GS D3DFL1_HYDTT/17-348       AC D3DFL1.1
#=GS F9ZZH2_METMM/143-510      AC F9ZZH2.1
#=GS B4U7C1_HYDS0/18-352       AC B4U7C1.1
#=GS D3P073_AZOS1/65-171       AC D3P073.1
#=GS Q2W7G9_MAGSA/58-419       AC Q2W7G9.1
#=GS G0RB34_HYPJQ/675-816      AC G0RB34.1
#=GS A1U5C8_MARHV/32-395       AC A1U5C8.1
#=GS D5MMZ3_9BACT/153-275      AC D5MMZ3.1
#=GS D0CP53_RUELI/161-553      AC D0CP53.1
#=GS A1W604_ACISJ/100-222      AC A1W604.1
#=GS G2J1R9_PSEUL/2-364        AC G2J1R9.1
#=GS Q47AX7_DECAR/158-556      AC Q47AX7.1
#=GS Q30P22_SULDN/138-540      AC Q30P22.1
#=GS F4GGE3_ALIDK/100-222      AC F4GGE3.1
#=GS E6TQU9_BACCJ/204-328      AC E6TQU9.1
#=GS I7AA04_PSEST/23-386       AC I7AA04.1
#=GS B2V830_SULSY/142-548      AC B2V830.1
#=GS C0QTT7_PERMH/17-352       AC C0QTT7.1
#=GS S6AI74_9PROT/178-571      AC S6AI74.1
#=GS H0Q2D4_9RHOO/177-571      AC H0Q2D4.1
#=GS Q8TQF3_METAC/52-175       AC Q8TQF3.1
#=GS Q2SE02_HAHCH/40-410       AC Q2SE02.1
#=GS A9I7H9_BORPD/129-485      AC A9I7H9.1
#=GS E0UR75_SULAO/21-363       AC E0UR75.1
#=GS Q9I609_PSEAE/128-484      AC Q9I609.1
#=GS F5T1D5_9GAMM/148-323      AC F5T1D5.1
#=GS C0N5T1_9GAMM/147-290      AC C0N5T1.1
#=GS C4K9Y9_THASP/37-397       AC C4K9Y9.1
#=GS Q16BT0_ROSDO/194-302      AC Q16BT0.1
#=GS N6YM25_9RHOO/156-555      AC N6YM25.1
#=GS C1GW98_PARBA/249-391      AC C1GW98.2
#=GS A0A0K1QU51_PSEFL/61-172   AC A0A0K1QU51.1
#=GS Q1LLL7_CUPMC/24-385       AC Q1LLL7.1
#=GS G0A7F2_METMM/71-175       AC G0A7F2.1
#=GS A0A0L0N431_9HYPO/744-875  AC A0A0L0N431.1
#=GS W5YT37_9ALTE/66-175       AC W5YT37.1
#=GS A8LM01_DINSH/29-383       AC A8LM01.1
#=GS A2DH20_TRIVA/125-272      AC A2DH20.1
#=GS A0A0K1QSW8_PSEFL/24-387   AC A0A0K1QSW8.1
#=GS W0PEP2_9BURK/23-143       AC W0PEP2.1
#=GS Q6LII0_PHOPR/3-152        AC Q6LII0.1
#=GS B4U7B8_HYDS0/153-543      AC B4U7B8.1
#=GS Q88BZ1_PSEPK/246-365      AC Q88BZ1.1
#=GS A4VQB5_PSEU5/137-493      AC A4VQB5.1
#=GS Q47WF2_COLP3/145-537      AC Q47WF2.1
#=GS A8UXC3_9AQUI/143-544      AC A8UXC3.1
#=GS B6BHE2_SULGG/138-540      AC B6BHE2.1
#=GS C6W4K5_DYAFD/148-276      AC C6W4K5.1
#=GS K5YD42_9PSED/67-181       AC K5YD42.1
#=GS A1B4Y3_PARDP/23-379       AC A1B4Y3.1
#=GS C6X8E1_METGS/11-107       AC C6X8E1.1
#=GS Q4KEL8_PSEF5/63-177       AC Q4KEL8.1
#=GS Q5LL01_RUEPO/271-494      AC Q5LL01.1
#=GS F4GGE3_ALIDK/221-344      AC F4GGE3.1
#=GS K2F532_9BACT/213-606      AC K2F532.1
#=GS U7G2Q3_9RHOB/126-289      AC U7G2Q3.1
#=GS H8GI00_METAL/26-145       AC H8GI00.1
#=GS A0A024HFL4_PSEKB/145-285  AC A0A024HFL4.1
#=GS U7G2Q5_9RHOB/23-377       AC U7G2Q5.1
#=GS L0DWG1_THIND/142-497      AC L0DWG1.1
#=GS Q2SE04_HAHCH/196-589      AC Q2SE04.1
#=GS B1LX95_METRJ/171-294      AC B1LX95.1
#=GS A1W604_ACISJ/225-344      AC A1W604.1
#=GS A6X3Y4_OCHA4/214-435      AC A6X3Y4.1
#=GS A0A090AIH6_9GAMM/49-410   AC A0A090AIH6.1
#=GS B9TH65_RICCO/1-142        AC B9TH65.1
#=GS I7AA07_PSEST/155-554      AC I7AA07.1
#=GS K5XHR9_9PSED/60-437       AC K5XHR9.1
#=GS A0A0N1B7M5_9PROT/2-322    AC A0A0N1B7M5.1
#=GS F4GBE2_ALIDK/174-569      AC F4GBE2.1
#=GS B2V829_SULSY/121-463      AC B2V829.1
#=GS A6Q5Z0_NITSB/141-547      AC A6Q5Z0.1
#=GS A0A094BZ58_9PEZI/676-803  AC A0A094BZ58.1
#=GS G8PWM0_PSEFL/161-554      AC G8PWM0.1
#=GS F4GBE0_ALIDK/36-397       AC F4GBE0.1
#=GS D5CQY1_SIDLE/179-572      AC D5CQY1.1
#=GS H0Q2C6_9RHOO/135-512      AC H0Q2C6.1
#=GS A4YV38_BRASO/29-237       AC A4YV38.1
#=GS A4VQA4_PSEU5/23-386       AC A4VQA4.1
#=GS E6TQU9_BACCJ/84-218       AC E6TQU9.1
#=GS C2W5X7_BACCE/97-236       AC C2W5X7.1
#=GS F2J4R4_POLGS/24-378       AC F2J4R4.1
#=GS Q465V8_METBF/468-591      AC Q465V8.1
#=GS L0DY63_THIND/309-702      AC L0DY63.1
#=GS A0A0F4QSD4_9GAMM/176-569  AC A0A0F4QSD4.1
#=GS B1Y092_LEPCP/7-132        AC B1Y092.1
#=GS A0A0M8VIF1_9ACTN/88-203   AC A0A0M8VIF1.1
#=GS A0A0F3IJ23_9GAMM/22-383   AC A0A0F3IJ23.1
#=GS A0A0F3GSJ1_9BACT/154-239  AC A0A0F3GSJ1.1
#=GS S6A9J4_9PROT/141-535      AC S6A9J4.1
#=GS E6X0L1_NITSE/19-366       AC E6X0L1.1
#=GS E8N154_ANATU/293-684      AC E8N154.1
#=GS L0JNU3_NATP1/230-601      AC L0JNU3.1
#=GS C6X8E1_METGS/218-346      AC C6X8E1.1
#=GS F4GBD6_ALIDK/314-522      AC F4GBD6.1
#=GS B1Y7J8_LEPCP/225-337      AC B1Y7J8.1
#=GS B1Y7X0_LEPCP/31-392       AC B1Y7X0.1
#=GS W0TQA4_9GAMM/131-504      AC W0TQA4.1
#=GS F4GEM3_ALIDK/189-311      AC F4GEM3.1
#=GS X6LXS0_RETFI/40-144       AC X6LXS0.1
#=GS G3J8A7_CORMM/677-805      AC G3J8A7.1
#=GS F8JAE5_HYPSM/117-239      AC F8JAE5.1
#=GS A6TT94_ALKMQ/86-210       AC A6TT94.1
#=GS Q89L42_BRADU/21-138       AC Q89L42.1
#=GS G8QHU9_DECSP/32-392       AC G8QHU9.1
#=GS G9MSY6_HYPVG/676-807      AC G9MSY6.1
#=GS A0A0K8NVY9_9BURK/107-187  AC A0A0K8NVY9.1
#=GS A0A094HZX4_9PEZI/106-298  AC A0A094HZX4.1
#=GS G8PKD6_PSEUV/126-506      AC G8PKD6.1
#=GS A0A0D6JBZ3_9RHIZ/59-180   AC A0A0D6JBZ3.1
#=GS G8PJP6_PSEUV/26-388       AC G8PJP6.1
#=GS Q3SML5_THIDA/177-570      AC Q3SML5.1
#=GS I1YIQ3_METFJ/185-305      AC I1YIQ3.1
#=GS C6J106_9BACL/132-368      AC C6J106.1
#=GS U7G2Q3_9RHOB/304-506      AC U7G2Q3.1
#=GS N0B4L4_9RHIZ/24-126       AC N0B4L4.1
#=GS Q16A00_ROSDO/163-560      AC Q16A00.1
#=GS C4K9Y4_THASP/152-538      AC C4K9Y4.1
#=GS F2TKX7_AJEDA/194-342      AC F2TKX7.2
#=GS A0A0F7K3R7_9GAMM/133-525  AC A0A0F7K3R7.1
#=GS Q483Z3_COLP3/71-195       AC Q483Z3.1
#=GS Q47AY1_DECAR/22-382       AC Q47AY1.1
#=GS H8GG84_METAL/58-419       AC H8GG84.1
#=GS S9V2T1_9TRYP/14-291       AC S9V2T1.1
#=GS C6J105_9BACL/204-330      AC C6J105.1
#=GS D7A1P3_STAND/152-271      AC D7A1P3.1
#=GS A9BMU1_DELAS/279-401      AC A9BMU1.1
#=GS Q2BNR4_NEPCE/68-193       AC Q2BNR4.1
#=GS D5MMZ3_9BACT/31-148       AC D5MMZ3.1
#=GS R4YN04_OLEAN/143-509      AC R4YN04.1
#=GS E9T819_RHOHA/54-179       AC E9T819.1
#=GS C5CPS5_VARPS/11-135       AC C5CPS5.1
#=GS G8QJX0_DECSP/143-541      AC G8QJX0.1
#=GS V6F2A6_9PROT/141-535      AC V6F2A6.1
#=GS A0A0E3P039_9EURY/552-674  AC A0A0E3P039.1
#=GS Q47WE3_COLP3/147-321      AC Q47WE3.1
#=GS B2JX66_BURP8/173-330      AC B2JX66.1
#=GS A0A0F2RR39_9PROT/24-386   AC A0A0F2RR39.1
#=GS N6YM36_9RHOO/86-472       AC N6YM36.1
#=GS NIRS_PARDP/192-591        AC Q51700.1
#=GS F0UBM8_AJEC8/194-344      AC F0UBM8.1
#=GS K2ADT7_9BACT/315-516      AC K2ADT7.1
#=GS A0A0F7VGV9_9EURO/208-347  AC A0A0F7VGV9.1
#=GS B1KEG2_SHEWM/63-184       AC B1KEG2.1
#=GS H2CE97_9LEPT/262-651      AC H2CE97.1
#=GS C1G4F4_PARBD/259-405      AC C1G4F4.2
#=GS D3DFL5_HYDTT/151-546      AC D3DFL5.1
#=GS A0A0F3KHI8_9NEIS/35-397   AC A0A0F3KHI8.1
#=GS D4Z775_SPHJU/68-180       AC D4Z775.1
#=GS W4G0G0_9STRA/267-372      AC W4G0G0.1
#=GS S6BDF3_9GAMM/23-384       AC S6BDF3.1
#=GS Q01VU5_SOLUE/251-373      AC Q01VU5.1
#=GS A0A0K1QSY5_PSEFL/165-558  AC A0A0K1QSY5.1
#=GS Q0JYW3_CUPNH/45-406       AC Q0JYW3.1
#=GS A0A0F2S4D4_9PROT/69-170   AC A0A0F2S4D4.1
#=GS A4SYB0_POLSQ/207-342      AC A4SYB0.1
#=GS B1Y7X6_LEPCP/135-307      AC B1Y7X6.1
#=GS H2CEA0_9LEPT/48-411       AC H2CEA0.1
#=GS Q5LL01_RUEPO/114-280      AC Q5LL01.1
#=GS H0I207_9RHIZ/55-145       AC H0I207.1
#=GS G8QCM7_PSEFL/133-489      AC G8QCM7.1
#=GS A9I7F8_BORPD/23-386       AC A9I7F8.1
#=GS H5WUA6_9BURK/174-568      AC H5WUA6.1
#=GS I6Z1C3_PSEST/141-497      AC I6Z1C3.1
#=GS V6F2S9_9PROT/168-546      AC V6F2S9.1
#=GS A6Q6V0_SULNB/19-363       AC A6Q6V0.1
#=GS Q2W7H6_MAGSA/141-535      AC Q2W7H6.1
#=GS F2LBS1_BURGS/25-324       AC F2LBS1.1
#=GS A0A0F2RM76_9RHOB/154-293  AC A0A0F2RM76.1
#=GS A0A093X2E7_9PEZI/91-277   AC A0A093X2E7.1
#=GS C0QTT5_PERMH/125-464      AC C0QTT5.1
#=GS G8PQJ7_PSEUV/297-501      AC G8PQJ7.1
#=GS Q0JYV8_CUPNH/130-490      AC Q0JYV8.1
#=GS U1YG21_9BURK/21-381       AC U1YG21.1
#=GS Q12EB1_POLSJ/97-212       AC Q12EB1.1
#=GS A0A0M8VIF1_9ACTN/40-159   AC A0A0M8VIF1.1
#=GS A0A0F2R7Y4_9PSED/156-555  AC A0A0F2R7Y4.1
#=GS A1W767_ACISJ/174-569      AC A1W767.1
#=GS G2FJG6_9GAMM/26-392       AC G2FJG6.1
#=GS C5T6S7_ACIDE/340-548      AC C5T6S7.1
#=GS A0A0G3A1D1_9DELT/234-350  AC A0A0G3A1D1.1
#=GS Q1LI23_CUPMC/151-506      AC Q1LI23.1
#=GS A0A0F2RMP8_9PROT/183-576  AC A0A0F2RMP8.1
#=GS G3IYU5_9GAMM/21-382       AC G3IYU5.1
#=GS F5ZAA1_ALTSS/69-188       AC F5ZAA1.1
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