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Database: Pfam
Entry: Cytochrom_D1
LinkDB: Cytochrom_D1
Original site: Cytochrom_D1 
#=GF ID   Cytochrom_D1
#=GF AC   PF02239.13
#=GF DE   Cytochrome D1 heme domain
#=GF PI   D1_heme; 
#=GF AU   Bateman A, Mian N
#=GF SE   Pfam-B_3322 (release 5.2)
#=GF GA   25.50 25.50;
#=GF TC   25.50 25.50;
#=GF NC   25.40 25.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9311786
#=GF RT   Haem-ligand switching during catalysis in crystals of a
#=GF RT   nitrogen-cycle enzyme. 
#=GF RA   Williams PA, Fulop V, Garman EF, Saunders NF, Ferguson SJ, Hajdu
#=GF RA   J; 
#=GF RL   Nature 1997;389:406-412.
#=GF DR   SCOP; 1aof; fa;
#=GF DR   SCOP; 1nir; fa;
#=GF DR   PROSITE; PDOC00169;
#=GF CC   Cytochrome cd1 (nitrite reductase) catalyses the conversion of 
#=GF CC   nitrite to nitric oxide in the nitrogen cycle. This family
#=GF CC   represents the d1 heme binding domain of cytochrome cd1, in
#=GF CC   which His/Tyr side  chains ligate the d1 heme iron of the active
#=GF CC   site in the oxidised  state [1].
#=GF SQ   325
#=GS I3Z5Y2_BELBD/82-282       AC I3Z5Y2.1
#=GS V5SGG5_9RHIZ/64-184       AC V5SGG5.1
#=GS U1ZSK0_9BURK/148-502      AC U1ZSK0.1
#=GS A7IB97_XANP2/154-274      AC A7IB97.1
#=GS D0MFM3_RHOM4/165-560      AC D0MFM3.1
#=GS A1B4Y8_PARDP/124-475      AC A1B4Y8.1
#=GS G8QI56_AZOSU/147-523      AC G8QI56.1
#=GS A0A090AIJ3_9GAMM/230-364  AC A0A090AIJ3.1
#=GS H1XRF2_9BACT/184-366      AC H1XRF2.1
#=GS C5GKH5_AJEDR/183-331      AC C5GKH5.1
#=GS C7RJ57_ACCPU/22-382       AC C7RJ57.1
#=GS C7RR96_ACCPU/157-555      AC C7RR96.1
#=GS Q2VZK6_MAGSA/170-563      AC Q2VZK6.1
#=GS S6BI92_PSERE/60-179       AC S6BI92.1
#=GS I3ZMS7_TERRK/143-290      AC I3ZMS7.1
#=GS C4K9Z4_THASP/156-555      AC C4K9Z4.1
#=GS F8J8S4_HYPSM/16-102       AC F8J8S4.1
#=GS H8GI58_METAL/65-178       AC H8GI58.1
#=GS A1WMN3_VEREI/213-336      AC A1WMN3.1
#=GS B6BHD9_SULGG/32-377       AC B6BHD9.1
#=GS Q5P7W7_AROAE/31-392       AC Q5P7W7.1
#=GS G2J1R6_PSEUL/162-554      AC G2J1R6.1
#=GS K0C306_CYCSP/58-164       AC K0C306.1
#=GS A0A0A8JZD1_9RHIZ/154-274  AC A0A0A8JZD1.1
#=GS W0TRC9_9GAMM/24-385       AC W0TRC9.1
#=GS B2V826_SULSY/17-353       AC B2V826.1
#=GS S6AEM5_9PROT/25-386       AC S6AEM5.1
#=GS C5AQ98_METEA/141-262      AC C5AQ98.1
#=GS H0Q2D1_9RHOO/37-398       AC H0Q2D1.1
#=GS A1U5D0_MARHV/176-569      AC A1U5D0.1
#=GS A1VVZ2_POLNA/96-221       AC A1VVZ2.1
#=GS W0SKK2_9RHOO/155-553      AC W0SKK2.1
#=GS E8UZZ8_TERSS/113-241      AC E8UZZ8.1
#=GS H8GG81_METAL/157-510      AC H8GG81.1
#=GS A9I7E3_BORPD/156-555      AC A9I7E3.1
#=GS B1LYY7_METRJ/66-179       AC B1LYY7.1
#=GS Q0JYW5_CUPNH/156-549      AC Q0JYW5.1
#=GS Q1LII2_RALME/151-544      AC Q1LII2.1
#=GS D3DFL1_HYDTT/17-348       AC D3DFL1.1
#=GS Q5LTA1_RUEPO/64-177       AC Q5LTA1.1
#=GS B4U7C1_HYDS0/18-352       AC B4U7C1.1
#=GS F9ZZH2_METMM/143-510      AC F9ZZH2.1
#=GS S8B416_PENO1/208-347      AC S8B416.1
#=GS Q2W7G9_MAGSA/58-419       AC Q2W7G9.1
#=GS A0A0A8EDD8_9ACTN/190-314  AC A0A0A8EDD8.1
#=GS G0RB34_HYPJQ/675-816      AC G0RB34.1
#=GS A1U5C8_MARHV/32-395       AC A1U5C8.1
#=GS H5WSG9_9BURK/248-354      AC H5WSG9.1
#=GS D5MMZ3_9BACT/153-275      AC D5MMZ3.1
#=GS E1VR48_9GAMM/181-580      AC E1VR48.1
#=GS A1W604_ACISJ/100-222      AC A1W604.1
#=GS G2J1R9_PSEUL/2-364        AC G2J1R9.1
#=GS L8FWB7_PSED2/676-803      AC L8FWB7.1
#=GS Q30P22_SULDN/138-540      AC Q30P22.1
#=GS Q47AX7_DECAR/158-556      AC Q47AX7.1
#=GS Q88JI0_PSEPK/68-182       AC Q88JI0.1
#=GS Q0BVQ2_GRABC/22-142       AC Q0BVQ2.1
#=GS A1VVZ2_POLNA/218-343      AC A1VVZ2.1
#=GS E6TQU9_BACCJ/204-328      AC E6TQU9.1
#=GS D5MIV5_9BACT/151-541      AC D5MIV5.1
#=GS B2V830_SULSY/142-548      AC B2V830.1
#=GS C0QTT7_PERMH/17-352       AC C0QTT7.1
#=GS A1W760_ACISJ/325-533      AC A1W760.1
#=GS A8LM04_DINSH/181-578      AC A8LM04.1
#=GS S6AI74_9PROT/178-571      AC S6AI74.1
#=GS H0Q2D4_9RHOO/177-571      AC H0Q2D4.1
#=GS Q8TQF3_METAC/52-175       AC Q8TQF3.1
#=GS S6AJ24_PSERE/216-322      AC S6AJ24.1
#=GS W0SKK1_9RHOO/22-382       AC W0SKK1.1
#=GS Q2SE02_HAHCH/40-410       AC Q2SE02.1
#=GS A9I7H9_BORPD/129-485      AC A9I7H9.1
#=GS Q8PZU9_METMA/123-246      AC Q8PZU9.1
#=GS A6L9N5_PARD8/79-196       AC A6L9N5.1
#=GS E0UR75_SULAO/21-363       AC E0UR75.1
#=GS Q9I609_PSEAE/128-484      AC Q9I609.1
#=GS G8PQK0_PSEUV/142-534      AC G8PQK0.1
#=GS C4K9Y9_THASP/37-397       AC C4K9Y9.1
#=GS E1VR45_9GAMM/38-399       AC E1VR45.1
#=GS C0QTT4_PERMH/150-542      AC C0QTT4.1
#=GS Q16BT0_ROSDO/194-302      AC Q16BT0.1
#=GS N6YM25_9RHOO/156-555      AC N6YM25.1
#=GS C1GW98_PARBA/249-391      AC C1GW98.2
#=GS A4VLU1_PSEU5/67-180       AC A4VLU1.1
#=GS Q1LLL7_RALME/24-385       AC Q1LLL7.1
#=GS C3KNX1_RHISN/71-173       AC C3KNX1.1
#=GS B4U7B9_HYDS0/127-462      AC B4U7B9.1
#=GS G0A7F2_METMM/71-175       AC G0A7F2.1
#=GS Q82BG1_STRAW/42-181       AC Q82BG1.1
#=GS D5V716_ARCNC/58-170       AC D5V716.1
#=GS Q74DR2_GEOSL/192-317      AC Q74DR2.1
#=GS A8LM01_DINSH/29-383       AC A8LM01.1
#=GS A2DH20_TRIVA/125-272      AC A2DH20.1
#=GS NIRF_PSEAE/24-387         AC Q51480.1
#=GS W0PEP2_9BURK/23-143       AC W0PEP2.1
#=GS Q47WE3_COLP3/306-533      AC Q47WE3.1
#=GS Q15UQ9_PSEA6/70-185       AC Q15UQ9.1
#=GS Q6LII0_PHOPR/3-152        AC Q6LII0.1
#=GS B4U7B8_HYDS0/153-543      AC B4U7B8.1
#=GS Q88BZ1_PSEPK/246-365      AC Q88BZ1.1
#=GS I7BJM2_NATSJ/58-429       AC I7BJM2.1
#=GS A4VQB5_PSEU5/137-493      AC A4VQB5.1
#=GS Q47WF2_COLP3/145-537      AC Q47WF2.1
#=GS K0I8N1_9BURK/196-322      AC K0I8N1.1
#=GS U7FZC7_9RHOB/169-566      AC U7FZC7.1
#=GS C6HJ68_AJECH/194-344      AC C6HJ68.1
#=GS B6BHE2_SULGG/138-540      AC B6BHE2.1
#=GS C6W4K5_DYAFD/148-276      AC C6W4K5.1
#=GS F2J4Q9_POLGS/306-509      AC F2J4Q9.1
#=GS G2IZ91_PSEUL/63-181       AC G2IZ91.1
#=GS G8M9Q5_9BURK/5-312        AC G8M9Q5.1
#=GS K9QEP3_9NOSO/544-757      AC K9QEP3.1
#=GS A1B4Y3_PARDP/23-379       AC A1B4Y3.1
#=GS C6X8E1_METGS/11-107       AC C6X8E1.1
#=GS W0SGB5_9RHOO/130-516      AC W0SGB5.1
#=GS B1Y7X6_LEPCP/310-516      AC B1Y7X6.1
#=GS Q4KEL8_PSEF5/63-177       AC Q4KEL8.1
#=GS Q47AS9_DECAR/178-571      AC Q47AS9.1
#=GS Q5LL01_RUEPO/271-494      AC Q5LL01.1
#=GS C7NEZ7_KYTSD/308-443      AC C7NEZ7.1
#=GS E0UR78_SULAO/138-539      AC E0UR78.1
#=GS G8PQJ7_PSEUV/126-291      AC G8PQJ7.1
#=GS U7G2Q3_9RHOB/126-289      AC U7G2Q3.1
#=GS G8P118_GRAMM/193-336      AC G8P118.1
#=GS H8GI00_METAL/26-145       AC H8GI00.1
#=GS A0A024HFL4_PSEKB/145-285  AC A0A024HFL4.1
#=GS U5Q834_9BACT/69-227       AC U5Q834.1
#=GS U7G2Q5_9RHOB/23-377       AC U7G2Q5.1
#=GS L0DWG1_THIND/142-497      AC L0DWG1.1
#=GS Q2SE04_HAHCH/196-589      AC Q2SE04.1
#=GS B1M2C6_METRJ/147-269      AC B1M2C6.1
#=GS B1LX95_METRJ/171-294      AC B1LX95.1
#=GS A1W604_ACISJ/225-344      AC A1W604.1
#=GS A6X3Y4_OCHA4/214-435      AC A6X3Y4.1
#=GS Q1LII5_RALME/129-484      AC Q1LII5.1
#=GS W0TRW7_9GAMM/154-516      AC W0TRW7.1
#=GS A0A090AIH6_9GAMM/49-410   AC A0A090AIH6.1
#=GS B9TH65_RICCO/1-142        AC B9TH65.1
#=GS G7ZDH8_AZOL4/66-176       AC G7ZDH8.1
#=GS E6TYX8_BACCJ/201-286      AC E6TYX8.1
#=GS N4VAF4_COLOR/688-814      AC N4VAF4.1
#=GS B2V829_SULSY/121-463      AC B2V829.1
#=GS W8RGH2_PSEST/9-83         AC W8RGH2.1
#=GS A6Q5Z0_NITSB/141-547      AC A6Q5Z0.1
#=GS G8PWM0_PSEFL/161-554      AC G8PWM0.1
#=GS D7A8S5_STAND/197-338      AC D7A8S5.1
#=GS D5CQY1_SIDLE/179-572      AC D5CQY1.1
#=GS H0Q2C6_9RHOO/135-512      AC H0Q2C6.1
#=GS A4YV38_BRASO/29-237       AC A4YV38.1
#=GS A4VQA4_PSEU5/23-386       AC A4VQA4.1
#=GS E6TQU9_BACCJ/84-218       AC E6TQU9.1
#=GS D7DKV7_METV0/6-101        AC D7DKV7.1
#=GS Q5P7W3_AROAE/179-573      AC Q5P7W3.1
#=GS F2J4R4_POLGS/24-378       AC F2J4R4.1
#=GS Q465V8_METBF/468-591      AC Q465V8.1
#=GS L0DY63_THIND/309-702      AC L0DY63.1
#=GS B1Y092_LEPCP/7-132        AC B1Y092.1
#=GS G2LH91_CHLTF/210-331      AC G2LH91.1
#=GS K0JV37_SACES/40-174       AC K0JV37.1
#=GS B8EMC6_METSB/200-322      AC B8EMC6.1
#=GS S6A9J4_9PROT/141-535      AC S6A9J4.1
#=GS E6X0L1_NITSE/19-366       AC E6X0L1.1
#=GS E8N154_ANATU/293-684      AC E8N154.1
#=GS U5RRC8_9CLOT/110-250      AC U5RRC8.1
#=GS A6Q5Y7_NITSB/16-365       AC A6Q5Y7.1
#=GS A4VQA9_PSEU5/156-555      AC A4VQA9.1
#=GS N6YMT6_9RHOO/177-570      AC N6YMT6.1
#=GS L0JNU3_NATP1/230-601      AC L0JNU3.1
#=GS C6X8E1_METGS/218-346      AC C6X8E1.1
#=GS B2U9J2_RALPJ/146-301      AC B2U9J2.1
#=GS A1U5D7_MARHV/140-495      AC A1U5D7.1
#=GS A0A0B4Y3Z3_9PROT/130-510  AC A0A0B4Y3Z3.1
#=GS B1Y7J8_LEPCP/225-337      AC B1Y7J8.1
#=GS B1Y7X0_LEPCP/31-392       AC B1Y7X0.1
#=GS W0TQA4_9GAMM/131-504      AC W0TQA4.1
#=GS Q169Z7_ROSDO/24-378       AC Q169Z7.1
#=GS Q8ZST1_PYRAE/312-540      AC Q8ZST1.1
#=GS X6LXS0_RETFI/40-144       AC X6LXS0.1
#=GS G3J8A7_CORMM/677-805      AC G3J8A7.1
#=GS F8JAE5_HYPSM/117-239      AC F8JAE5.1
#=GS A6TT94_ALKMQ/86-210       AC A6TT94.1
#=GS Q89L42_BRADU/21-138       AC Q89L42.1
#=GS G8QHU9_AZOSU/32-392       AC G8QHU9.1
#=GS E1VR41_9GAMM/142-312      AC E1VR41.1
#=GS G9MSY6_HYPVG/676-807      AC G9MSY6.1
#=GS Q46D35_METBF/657-767      AC Q46D35.1
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        AC P24474.1
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1NNO B; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1HZU A; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1N15 B; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1NNO A; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1N50 A; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1BL9 B; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1GJQ A; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1NIR B; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1N90 B; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1N50 B; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1N90 A; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1BL9 A; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1GJQ B; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1N15 A; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1HZV A; 145-538;
#=GS NIRS_PSEAE/170-563        DR PDB; 1NIR A; 145-538;
#=GS M1FDL6_9ALTE/62-170       AC M1FDL6.1
#=GS A8MGR7_ALKOO/199-332      AC A8MGR7.1
#=GS G8PKD6_PSEUV/126-506      AC G8PKD6.1
#=GS G8PJP6_PSEUV/26-388       AC G8PJP6.1
#=GS A1W760_ACISJ/150-312      AC A1W760.1
#=GS G8TN03_NIAKG/106-293      AC G8TN03.1
#=GS Q3SML5_THIDA/177-570      AC Q3SML5.1
#=GS I1YIQ3_METFJ/185-305      AC I1YIQ3.1
#=GS Q12EB1_POLSJ/218-343      AC Q12EB1.1
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#=GS G2LH91_CHLTF/90-207       AC G2LH91.1
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